Хромодомен - Chromodomain

Хромодомен
PDB 1pfb EBI.jpg
Строение поликомбового хромодомена.[1]
Идентификаторы
СимволХромодомен
PfamPF00385
ИнтерПроIPR000953
УМНАЯSM00298
PROSITEPS50013
SCOP21pfb / Объем / СУПФАМ
CDDcd00024

А хромодомен (chrоматин оорганизация месотличаться[2]) это белок структурная область около 40–50 аминокислота остатки, обычно встречающиеся в белках, связанных с ремоделированием и манипулированием хроматин. Домен очень консервированный среди растений и животных и представлен в большом количестве различных белков во многих геномы, например, мышь. Некоторые хромодомены, содержащие гены иметь несколько альтернативное сращивание изоформы, которые полностью исключают хромодомен.[3] В млекопитающие, белки, содержащие хромодомены, отвечают за аспекты генная регуляция связанных с ремоделированием хроматина и образованием гетерохроматин регионы.[4] Белки, содержащие хромодомены, также связывают метилированный гистоны[5][6] и появиться в РНК-индуцированное подавление транскрипции сложный.[7] В модификациях гистонов хромодомены очень консервативны. Они функционируют путем идентификации и связывания метилированных лизин остатки, которые существуют на поверхности белков хроматина и тем самым регулируют транскрипцию генов.[8]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Мин Дж, Чжан И, Сюй Р.М. (август 2003 г.). «Структурная основа для специфического связывания хромодомена Polycomb с гистоном H3, метилированным по Lys 27». Genes Dev. 17 (15): 1823–8. Дои:10.1101 / gad.269603. ЧВК  196225. PMID  12897052.
  2. ^ Мессмер С., Франке А., Паро Р. (июль 1992 г.). «Анализ функциональной роли хромо-домена Polycomb у Drosophila melanogaster». Genes Dev. 6 (7): 1241–1254. Дои:10.1101 / gad.6.7.1241. PMID  1628830.
  3. ^ Таджул-Арифин К., Тисдейл Р., Раваси Т., Хьюм Д.А., Мэттик Дж. С. (2003). «Идентификация и анализ хромодомен-содержащих белков, кодируемых в транскриптоме мыши». Genome Res. 13 (6B): 1416–1429. Дои:10.1101 / гр.1015703. ЧВК  403676. PMID  12819141.
  4. ^ Джонс Д. О., Коуэлл И. Г., Сингх П. Б. (2000). «Белки хромодомена млекопитающих: их роль в организации и экспрессии генома». BioEssays. 22 (2): 124–37. CiteSeerX  10.1.1.575.6410. Дои:10.1002 / (SICI) 1521-1878 (200002) 22: 2 <124 :: AID-BIES4> 3.0.CO; 2-E. PMID  10655032.
  5. ^ Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR, Callaghan J, Bannister A, Kouzarides T, Murzin AG, Murzina NV, Laue ED (2002). «Структура хромодомена HP1, связанного с гистоном H3, метилированным по лизину 9». Природа. 416 (6876): 103–7. Дои:10.1038 / природа722. PMID  11882902. S2CID  4423019.
  6. ^ Джейкобс С.А., Хорасанизаде С (2002). «Структура хромодомена HP1, связанного с хвостом лизин-9-метилированного гистона H3». Наука. 295 (5562): 2080–3. Дои:10.1126 / science.1069473. PMID  11859155. S2CID  38589662.
  7. ^ Вердел А., Джиа С., Гербер С., Сугияма Т., Гайги С., Гревал С.И., Моазед Д. (2004). «РНКи-опосредованное нацеливание на гетерохроматин комплексом RITS». Наука. 303 (5658): 672–6. Дои:10.1126 / science.1093686. ЧВК  3244756. PMID  14704433.
  8. ^ Яп К.Л., Чжоу М.М. (март 2011 г.). «Структура и механизмы распознавания метилирования лизина хромодоменом при транскрипции генов». Биохимия. 50 (12): 1966–80. Дои:10.1021 / bi101885m. ЧВК  3062707. PMID  21288002.

внешняя ссылка