Белки группы триторакса - Trithorax-group proteins
Белки группы триторакса (TrxG) представляют собой гетерогенный набор белков, основное действие которых заключается в поддержании экспрессия гена. Их можно разделить на три общих класса в зависимости от молекулярной функции:
- гистон -модифицирующие белки TrxG
- ремоделирование хроматина Белки TrxG
- Связывание с ДНК Белки TrxG,
плюс другие белки TrxG, не отнесенные к первым трем классам.[1]
Открытие
Член-основатель белков TrxG, trithorax (trx), был открыт ~ 1978 г. Филип Ингхэм в рамках своей докторской диссертации, будучи аспирантом лаборатории J.R.S. Строгать на Университет Сассекса.[2] Гистон-лизин N-метилтрансфераза 2A является человеческим гомологом trx.[2]
имя | Символ (ы) |
---|---|
отсутствуют, маленькие или гомеотические диски 1 | ясень1 |
отсутствуют, маленькие или гомеотические диски 2 | пепел 2 |
Брахма | brm |
Брахма-ассоциированный белок 55 кДа | Bap55 |
Связанный с Брахмой белок 60 кДа | Bap60 |
Далао | Далао |
домино | дом |
Усилитель биторакса | E (bx) |
усилитель желтого 3 | САЙП или е (у) 3 |
веко | Эльд или Оса |
женский бесплодный (1) гомеотический | fs (1) h |
граппа | gpp |
Имитация SWI | Iswi |
кисмет | поцелуй |
маленькие имагинальные диски | крышка |
лола нравится | лолал |
модификатор ЦРТ 4 | mod (mdg4), E (var) 3-93D или doom |
Мойра | мор |
Фактор ремоделирования нуклеосом-38 кДа | Нурф38 |
триторакс | trx |
Триторакс как | Trl |
Повсеместно транскрибируемый тетратрикопептидный повтор, Х-хромосома | Utx |
Verthandi | vtd |
зесте | z |
В таблице приведены названия членов TrxG дрозофилы. Гомологи у других видов могут иметь другие названия.
Функция
Белки группы триторакса обычно функционируют в виде больших комплексов, образованных с другими белками. Комплексы, образованные белками TrxG, делятся на две группы: гистон-модифицирующие комплексы и АТФ -зависимые комплексы ремоделирования хроматина. Основная функция белков TrxG, наряду с группа поликомб (PcG) белков, регулирует экспрессию генов. В то время как белки PcG обычно связаны с подавление гена, Белки TrxG чаще всего связаны с активация гена. Комплекс триторакс активирует транскрипцию генов, индуцируя триметилирование лизина 4 гистона H3 (H3K4me3 ) в определенных участках хроматина, распознаваемых комплексом.[1] Домен Ash1 участвует в метилировании H3K36. Комплекс Trithorax также взаимодействует с CBP (CREB-связывающий белок), который представляет собой актеилтрансферазу для ацетилирования H3K27[3]. Активация этого гена усиливается ацетилирование гистона H4. Действия белков TrxG часто описываются как «антагонистические» функции белков PcG.[4] Помимо регуляции генов, данные свидетельствуют о том, что белки TrxG также участвуют в других процессах, включая апоптоз, рак и стрессовые реакции.[5][6][7]
Роль в развитии
Во время развития белки TrxG поддерживают активацию необходимых генов, особенно Hox-гены после истощения материнских факторов.[8] Это достигается за счет сохранения эпигенетический знаки, в частности H3K4me3, установлены факторами, предоставленными материнской компанией.[9] Белки TrxG также участвуют в Инактивация Х-хромосомы, что происходит на ранней стадии эмбриогенез.[10] По состоянию на 2011 г.[Обновить] неясно, требуется ли активность TrxG в каждой клетке на протяжении всего развития организма или только на определенных стадиях в определенных типах клеток.[11]
Смотрите также
- HIstome
- Гистонацетилтрансфераза
- Гистоновые деацетилазы
- Гистоновая метилтрансфераза
- Ферменты, модифицирующие гистоны
- Нуклеосома
- Путь PRMT4
использованная литература
- ^ а б Schuettengruber B, Chourrout D, Vervoort M, Leblanc B, Cavalli G (февраль 2007 г.). «Регуляция генома белками polycomb и trithorax». Ячейка. 128 (4): 735–45. Дои:10.1016 / j.cell.2007.02.009. PMID 17320510.
- ^ а б Ingham PW (1998). «Триторакс и регуляция экспрессии гомеотических генов у дрозофилы: историческая перспектива». Int. J. Dev. Биол. 42 (3): 423–9. PMID 9654027.
- ^ Гейслер, Сара Дж .; Паро, Ренато (01.09.2015). «Групповое регулирование Trithorax и Polycomb: рассказ о противоположных действиях». Разработка. 142 (17): 2876–2887. Дои:10.1242 / dev.120030. ISSN 0950-1991. PMID 26329598.
- ^ Гримо К., Негре Н., Кавалли Г. (2006). «От генетики к эпигенетике: сказка о генах группы Поликомб и группы триторакса». Хромосома Res. 14 (4): 363–75. Дои:10.1007 / s10577-006-1069-у. PMID 16821133.
- ^ Тяги С., Герр В. (октябрь 2009 г.). «E2F1 опосредует повреждение ДНК и апоптоз через HCF-1 и семейство гистоновых метилтрансфераз MLL». EMBO J. 28 (20): 3185–95. Дои:10.1038 / emboj.2009.258. ЧВК 2771094. PMID 19763085.
- ^ Зибольд А.П., Банерджи Р., Ти Ф, Поцелуй Д.Л., Московиц Дж., Харт П.Дж. (январь 2010 г.). «Polycomb Repressive Complex 2 и Trithorax модулируют продолжительность жизни и стрессоустойчивость дрозофилы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 107 (1): 169–74. Дои:10.1073 / pnas.0907739107. ЧВК 2806727. PMID 20018689.
- ^ Багчи А., Папазоглу С., Ву И, Капурсо Д., Бродт М., Фрэнсис Д., Бредель М., Фогель Х., Миллс А.А. (февраль 2007 г.). «CHD5 является опухолевым супрессором 1p36 человека». Ячейка. 128 (3): 459–75. Дои:10.1016 / j.cell.2006.11.052. PMID 17289567.
- ^ Брок Х.В., Фишер С.Л. (март 2005 г.). «Поддержание паттернов экспрессии генов». Dev. Dyn. 232 (3): 633–55. Дои:10.1002 / dvdy.20298. PMID 15704101.
- ^ Сошникова Н. (август 2011). «Динамика активности Polycomb и Trithorax в процессе разработки». Исследование врожденных пороков, часть A: клиническая и молекулярная тератология. 91 (8): 781–7. Дои:10.1002 / bdra.20774. PMID 21290568.
- ^ Пуллирш Д., Хертель Р., Кисимото Х., Либ М., Штайнер Г., Вутц А. (март 2010 г.). «Белки группы Trithorax Ash2l и Saf-A рекрутируются в неактивную Х-хромосому в начале стабильной инактивации Х-хромосомы». Разработка. 137 (6): 935–43. Дои:10.1242 / dev.035956. ЧВК 2834461. PMID 20150277.
- ^ Schuettengruber B, Martinez AM, Iovino N, Cavalli G (декабрь 2011 г.). «Белки группы Trithorax: включение генов и поддержание их активности». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol. 12 (12): 799–814. Дои:10.1038 / nrm3230. HDL:21.11116/0000-0006-0774-0. PMID 22108599.
внешние ссылки
- Страница Polycomb и Trithorax лаборатории Cavalli Эта страница содержит полезную информацию о белках Polycomb и trithorax в форме введения, ссылки на опубликованные обзоры, список белков Polycomb и trithorax, иллюстративные слайды Power Point и ссылку на браузер генома, показывающий распределение этих белков по всему геному у Drosophila melanogaster.
- Интерактивная муха - Общество биологии развития