Полиомавирус STL - STL polyomavirus

Полиомавирус человека 11
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство:Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Класс:Papovaviricetes
Порядок:Сеполивиралес
Семья:Polyomaviridae
Род:Дельтаполиомавирус
Виды:
Полиомавирус человека 11

Полиомавирус STL (STLPyV, также известен как Полиомавирус Сент-Луиса или Полиомавирус человека 11) это вирус из полиомавирус семья, которая заражает человека хозяева. Впервые о нем сообщили в 2013 году, и он наиболее тесно связан с Полиомавирус MW.[1] Выявлен в основном в образцы стула от детей и был обнаружен в различных географических точках.[2]

Открытие

Полиомавирус STL был впервые обнаружен в 2013 г. образец кала от здорового ребенка в Малави; затем та же исследовательская группа обнаружила вирус в кале у детей в Гамбия и Сент-Луис, штат Миссури (в честь которого был назван вирус).[1] Обозначение «полиомавирус STL» было включено в Международный комитет по таксономии вирусов предложена классификация полиомавирусов. Это был 11-й обнаруженный полиомавирус человека.[3]

Геном

Организация STLPyV геном типичен для полиомавирусов. Приблизительно 4,8 пары килобаз по длине он содержит гены небольшой опухолевый антиген и большой опухолевый антиген, новый дополнительный опухолевый антиген и три белки вирусной оболочки, VP1, VP2 и VP3.[1] Это наиболее тесно связано с Полиомавирус MW, также впервые изолированного от ребенка в Малави.[4] Различные изоляты STLPyV имеют относительно большое количество вариаций последовательности, примерно до 5%; эта модель похожа на MWPyV и гораздо лучше охарактеризована BK полиомавирус.[1][4][5]

Отличительной особенностью генома STLPyV является его альтернативно сращенный опухолевый антиген; В дополнение к малым и большим опухолевым антигенам, высоко консервативным в полиомавирусах, STLPyV также экспрессирует третий опухолевый антиген, обозначенный 229T, который содержит новое слияние частей последовательностей малых и больших опухолевых антигенов.[1]

Таксономия

Среди полиомавирусов человека STLPyV наиболее близок к MWPyV; как и MWPyV, это геном предполагает различное происхождение большого опухолевого антигена и главного капсидного белка VP1, подразумевая, что вирус мог развиться от предкового рекомбинация мероприятие.[1][4]

В таксономическом обновлении группы полиомавирусов 2015 г. Международный комитет по таксономии вирусов классифицировал STLPyV в род Дельтаполиомавирусы, чья типовой вид является Полиомавирус человека 6. В эту группу входят всего четыре вируса, каждый из которых поражает человека: HPyV6, HPyV7, Полиомавирус MW, и полиомавирус STL.[3]

Распространенность

Все известные полиомавирусы человека довольно распространены среди здорового взрослого населения и обычно протекают бессимптомно. В исследовании, посвященном полиомавирусу серологическая распространенность, или преобладание обнаруживаемых антитела против вирусных белков, указывающих либо на прошлое, либо на настоящее воздействие у иммунокомпетентных взрослых, оценка распространенности STLPyV составляла примерно 70% с возрастным распределением, соответствующим передаче материнские антитела в сочетании с ранней детской инфекцией.[6] Исследования наличия вирусной ДНК, указывающие на активную репликацию вируса, предполагают распространенность STLPyV в диапазоне 1-2% детей.[1][2][7]

использованная литература

  1. ^ а б c d е ж г Lim, Efrem S .; Рейес, Алехандро; Антонио, Мартин; Саха, Дебасиш; Икумапайи, Усман Н .; Адейеми, Митчелл; Стайн, О. Колин; Скелтон, Ребекка; Бреннан, Дэниел С.; Mkakosya, Rajhab S .; Manary, Mark J .; Гордон, Джеффри I .; Ван, Дэвид (февраль 2013 г.). «Открытие полиомавируса STL, полиомавируса предкового рекомбинантного происхождения, который кодирует уникальный Т-антиген путем альтернативного сплайсинга». Вирусология. 436 (2): 295–303. Дои:10.1016 / j.virol.2012.12.005. ЧВК  3693558. PMID  23276405.
  2. ^ а б Элерс, Бернхард; Виланд, Ульрике (август 2013 г.). «Новые полиомавирусы человека HPyV6, 7, 9 и более». APMIS. 121 (8): 783–795. Дои:10.1111 / apm.12104. PMID  23656581.
  3. ^ а б Группа по изучению полиомавирусов Международного комитета по таксономии вирусов; Кальвиньяк-Спенсер, S; Фельткамп, MC; Догерти, доктор медицины; Moens, U; Рамквист, Т; Johne, R; Элерс, Б. (29 февраля 2016 г.). «Обновление таксономии семейства Polyomaviridae». Архив вирусологии. 161: 1739–50. Дои:10.1007 / s00705-016-2794-у. PMID  26923930.
  4. ^ а б c Siebrasse, E. A .; Reyes, A .; Lim, E. S .; Zhao, G .; Mkakosya, R. S .; Manary, M. J .; Gordon, J. I .; Ван, Д. (2012). «Идентификация полиомавируса MW, нового полиомавируса в стуле человека». Журнал вирусологии. 86 (19): 10321–6. Дои:10.1128 / JVI.01210-12. ЧВК  3457274. PMID  22740408.
  5. ^ Рокетт, Ребекка Дж .; Sloots, Theo P .; Боуз, Шарлин; О’Нил, Николас; Е, Суйфан; Робсон, Дженни; В то время как, Дэвид М .; Ламберт, Стивен Б .; Ван, Дэвид; Ниссен, Майкл Д .; Бялашевич, Северин; Цю, Цзяньминь (8 мая 2013 г.). «Обнаружение новых полиомавирусов, TSPyV, HPyV6, HPyV7, HPyV9 и MWPyV в кале, моче, крови, респираторных мазках и цереброспинальной жидкости». PLoS ONE. 8 (5): e62764. Дои:10.1371 / journal.pone.0062764. ЧВК  3648528. PMID  23667518.
  6. ^ Lim, Efrem S .; Meinerz, Natalie M .; Прими, Блейк; Ван, Дэвид; Гарси, Роберт Л. (сентябрь 2014 г.). «Распространенное воздействие полиомавируса STL в детстве». Возникающие инфекционные заболевания. 20 (9): 1559–61. Дои:10.3201 / eid2009.140561. ЧВК  4178396. PMID  25148144.
  7. ^ Любить; Чжан, Чи; Чжао, Жун; Сюэ, Инь; Ян, Цзянь; Пэн, Цзюньпин; Цзинь, Ци (май 2015 г.). «Распространенность полиомавируса STL в образцах стула китайских детей». Журнал клинической вирусологии. 66: 19–23. Дои:10.1016 / j.jcv.2015.02.017. PMID  25866330.