Пероксиредоксин 2 - Peroxiredoxin 2

PRDX2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1QMV
Идентификаторы
Псевдонимы	PRDX2, HEL-S-2a, NKEF-B, NKEFB, PRP, PRX2, PRXII, PTX1, TDPX1, TPX1, TSA, пероксиредоксин 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 600538 MGI: 109486 ГомолоГен: 21182 Генные карты: PRDX2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19п13.13 Начните 12,796,820 бп[1] Конец 12,801,800 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 C3 | 8 41,4 см Начните 84,969,587 бп[2] Конец 84,974,834 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • антиоксидантная активность • активность пероксиредоксина • пероксидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность тиоредоксинпероксидазы Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточная экзосома • цитозоль Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция апоптотического процесса • окислительно-восстановительный процесс • катаболический процесс перекиси водорода • окислительно-восстановительный гомеостаз клеток • ответ на окислительный стресс • клеточный ответ на окислительный стресс • удаление супероксидных радикалов • активация активности MAPK • респираторный взрыв, участвующий в воспалительной реакции • регулирование процесса обмена перекиси водорода • положительная регуляция свертывания крови • отрицательная регуляция сигнального пути, опосредованного липополисахаридами • отрицательная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • ответ на липополисахарид • Пролиферация Т-клеток • метаболический процесс перекиси водорода • отрицательная регуляция дифференцировки Т-клеток • развитие тимуса • гомеостаз числа клеток • отрицательная регуляция метаболического процесса активных форм кислорода • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути в отсутствие лиганда • активация лейкоцитов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7001	21672
Ансамбль	ENSG00000167815	ENSMUSG00000005161
UniProt	P32119	Q61171
RefSeq (мРНК)	NM_181738 NM_005809 NM_181737	NM_011563 NM_001317385
RefSeq (белок)	NP_005800	NP_001304314 NP_035693
Расположение (UCSC)	Chr 19: 12,8 - 12,8 Мб	Chr 8: 84.97 - 84.97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Пероксиредоксин-2 это белок что у людей кодируется PRDX2 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член пероксиредоксин семья антиоксидантов ферменты, которые восстанавливают перекись водорода и алкилгидропероксиды. Кодируемый белок может играть антиоксидантную защитную роль в клетках и может способствовать противовирусной активности CD8 (+) Т-клеток. Этот белок может иметь пролиферативный эффект и играть роль в развитии или прогрессировании рака. Кристаллическая структура этого белка была разрешена до 0,27 нм (= 2,7 ангстрем). Для этого гена были идентифицированы варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167815 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005161 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пал П., Бергер Р., Харт И., Чае Х.З., Ри С.Г., Паттерсон Д. (август 1995 г.). «Локализация TDPX1, человеческого гомолога дрожжевого гена тиоредоксин-зависимой пероксидредуктазы (TPX), на хромосоме 13q12». Геномика. 26 (3): 602–6. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80183-М. PMID  7607688.
6. «Энтрез Ген: пероксиредоксин 2 PRDX2».

дальнейшее чтение

• Яо И., Тейлор М., Дэйви Ф., Рени, Эйтон Дж., Кут П., Чен Х, Ян С.Д. и Ганн-Мур Ф.Дж. (2007). «Взаимодействие связывающей амилоид алкогольдегидрогеназы / Aβ опосредует повышающую регуляцию пероксиредоксина II в мозге пациентов с болезнью Альцгеймера и на модели трансгенных мышей с болезнью Альцгеймера». Молекулярная и клеточная неврология. 35 (2): 377–82. Дои:10.1016 / j.mcn.2007.03.013. PMID  17490890. S2CID  2415008.
• Расмуссен Х. Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез. 13 (12): 960–9. Дои:10.1002 / elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
• Шау Х, Баттерфилд Л. Х., Чиу Р., Ким А. (1994). «Клонирование и анализ последовательности генов-кандидатов человеческого фактора увеличения естественных киллеров». Иммуногенетика. 40 (2): 129–34. Дои:10.1007 / BF00188176. PMID  8026862. S2CID  7778993.
• Чае Х.З., Робисон К., Пул Л.Б. и др. (1994). «Клонирование и секвенирование тиол-специфического антиоксиданта из мозга млекопитающих: алкилгидропероксидредуктаза и тиол-специфический антиоксидант определяют большое семейство антиоксидантных ферментов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (15): 7017–21. Дои:10.1073 / пнас.91.15.7017. ЧВК  44329. PMID  8041738.
• Лим Ю.С., Ча М.К., Юн С.Х. и др. (1994). «Очистка и характеристика тиол-специфического антиоксидантного белка из красных кровяных телец человека: новый тип антиоксидантного белка». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 199 (1): 199–206. Дои:10.1006 / bbrc.1994.1214. PMID  8123012.
• Лим Ю.С., Ча МК, Ким Х.К., Ким И.Х. (1994). «Тиол-специфический антиоксидантный белок из человеческого мозга: клонирование гена и анализ консервативных цистеиновых областей». Ген. 140 (2): 279–84. Дои:10.1016/0378-1119(94)90558-4. PMID  8144038.
• Голаз О., Хьюз Г.Дж., Фрутигер С. и др. (1994). "Карты белков плазмы и красных кровяных телец: обновление 1993". Электрофорез. 14 (11): 1223–31. Дои:10.1002 / elps.11501401183. PMID  8313871. S2CID  21447827.
• Ча МК, Ким И.Х. (1996). «Глутатион-связанная тиолпероксидазная активность человеческого сывороточного альбумина: возможная антиоксидантная роль сывороточного альбумина в плазме крови». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 222 (2): 619–25. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0793. PMID  8670254.
• Джи Х., Рид Г.Е., Мориц Р.Л. и др. (1997). «Двумерная база данных гелей белков карциномы толстой кишки человека». Электрофорез. 18 (3–4): 605–13. Дои:10.1002 / elps.1150180344. PMID  9150948. S2CID  25454450.
• Ван З.М., Лю Ц., Дзиарски Р. (2000). «Хемокины являются основными провоспалительными медиаторами в моноцитах человека, активированных Staphylococcus aureus, пептидогликаном и эндотоксином». J. Biol. Chem. 275 (27): 20260–7. Дои:10.1074 / jbc.M909168199. PMID  10751418.
• Ча МК, Юн СН, Ким И.Х. (2000). «Взаимодействие человеческого тиол-специфического антиоксидантного белка 1 с плазматической мембраной эритроцитов». Биохимия. 39 (23): 6944–50. Дои:10.1021 / bi000034j. PMID  10841776.
• Шредер Э., Литтлчайлд Я.А., Лебедев А.А. и др. (2000). «Кристаллическая структура декамерного 2-Cys пероксиредоксина из эритроцитов человека с разрешением 1,7 A». Структура. 8 (6): 605–15. Дои:10.1016 / S0969-2126 (00) 00147-7. PMID  10873855.
• Харрис Дж. Р., Шредер Э., Исупов М. Н. и др. (2001). «Сравнение декамерной структуры пероксиредоксина-II методами просвечивающей электронной микроскопии и рентгеновской кристаллографии». Биохим. Биофиз. Acta. 1547 (2): 221–34. Дои:10.1016 / s0167-4838 (01) 00184-4. PMID  11410278.
• Но Д.Й., Ан С.Дж., Ли Р.А. и др. (2001). «Сверхэкспрессия пероксиредоксина при раке груди человека». Противораковый Res. 21 (3B): 2085–90. PMID  11497302.
• Ким С.Х., Фунтулакис М., Кэрнс Н., Любек Г. (2002). «Уровни протеина подтипов пероксиредоксина человека в головном мозге пациентов с болезнью Альцгеймера и синдромом Дауна». J. Neural Transm. Дополнение (61): 223–35. Дои:10.1007/978-3-7091-6262-0_18. ISBN  978-3-211-83704-7. PMID  11771746.
• Рабийо Т., Хеллер М., Гаснье Ф. и др. (2002). «Протеомический анализ клеточного ответа на окислительный стресс. Доказательства избыточного окисления пероксиредоксинов in vivo в их активном центре». J. Biol. Chem. 277 (22): 19396–401. Дои:10.1074 / jbc.M106585200. PMID  11904290.
• Анахори Т., Дешо Х., Беннес Р. и др. (2002). «Идентификация новых белков в фолликулярной жидкости зрелых фолликулов человека». Электрофорез. 23 (7–8): 1197–202. Дои:10.1002 / 1522-2683 (200204) 23: 7/8 <1197 :: AID-ELPS1197> 3.0.CO; 2-2. PMID  11981869.
• Шен К., Натан С. (2002). «Неизбыточная антиоксидантная защита множеством двухцистеиновых пероксиредоксинов в клетках рака простаты человека». Мол. Med. 8 (2): 95–102. Дои:10.1007 / BF03402079. ЧВК  2039972. PMID  12080185.
• Гейбен-Линн Р., Курсар М., Браун Н.В. и др. (2003). «Противовирусная активность ВИЧ-1 рекомбинантных факторов, усиливающих естественные клетки-киллеры, NKEF-A и NKEF-B, членов семейства пероксиредоксинов». J. Biol. Chem. 278 (3): 1569–74. Дои:10.1074 / jbc.M209964200. PMID  12421812.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.