Нуклеолин - Nucleolin

NCL
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2FC8, 2FC9, 2KRR
Идентификаторы
Псевдонимы	NCL, C23, нуклеолин, Nsr1
Внешние идентификаторы	OMIM: 164035 MGI: 97286 ГомолоГен: 136488 Генные карты: NCL
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q37.1 Начинать 231,453,531 бп[1] Конец 231,483,641 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 C5 | 1 43,94 см Начинать 86,344,719 бп[2] Конец 86,359,400 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание теломерной ДНК • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • идентичное связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание ДНК-топоизомеразы • Связывание мРНК 5'-UTR Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • нуклеоплазма • клеточная кора • ядрышко • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина • внеклеточная экзосома • ядро клетки • рибонуклеопротеин Биологический процесс • положительная регуляция транскрипции ядерного транскрипта большой рРНК с промотора РНК-полимеразы I. • ангиогенез • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • отрицательное регулирование перевода • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4691	17975
Ансамбль	ENSG00000115053	ENSMUSG00000026234
UniProt	P19338	P09405
RefSeq (мРНК)	NM_005381	NM_010880
RefSeq (белок)	NP_005372	NP_035010
Расположение (UCSC)	Chr 2: 231.45 - 231.48 Мб	Chr 1: 86.34 - 86.36 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеолин это белок что у людей кодируется NCL ген.^[5][6]

Ген

Ген NCL человека расположен на хромосома 2 и состоит из 14 экзоны с 13 интроны и занимает около 11 КБ. Интрон 11 гена NCL кодирует малая ядрышковая РНК, получивший название U20.^[7]

Функция

Нуклеолин является основным ядрышковым белком растущих эукариотических клеток. Обнаружено, что он связан с внутриядерным хроматином и прерибосомными частицами. Он вызывает деконденсацию хроматина за счет связывания с гистоном H1. Считается, что он играет роль в транскрипции пре-рРНК и сборке рибосом. Может играть роль в процессе удлинения транскрипции. Связывает олигонуклеотиды РНК с 5'-UUAGGG-3 'повторами более прочно, чем с 5'-TTAGGG-3' повторами теломерной одноцепочечной ДНК.

Нуклеолин также может действовать как коактиватор транскрипции с фактором транскрипции второго промотора куриного овальбумина (COUP-TFII ).^[8]

Клиническое значение

Мидкин и плейотропин связываются с нуклеолином на клеточной поверхности как рецептор с низким сродством. Это связывание может ингибировать ВИЧ-инфекцию.^[9][10]

Нуклеолин на поверхности клетки является рецептором для Респираторно-синцитиальный вирус (RSV) слитый белок.^[11] Было показано, что вмешательство во взаимодействие слитого белка нуклеолина и RSV оказывает терапевтическое действие против инфекции RSV в культурах клеток и на животных моделях.^{[12][13][14][15]}

Взаимодействия

Было показано, что нуклеолин взаимодействовать с:

• CSNK2A2,^[16]
• Центаврин, альфа 1,^[17]
• HuR,^[18]
• NPM1,^[19]
• P53,^[20]
• PPP1CB,^[21]
• S100A11,^[22]
• Антиген B синдрома Шегрена,^[23]
• ТОП1,^[24][25] и
• Обратная транскриптаза теломеразы.^[26]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115053 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026234 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шривастава М., Макбрайд О.В., Флеминг П.Дж., Поллард Г.Б., Бернс А.Л. (сентябрь 1990 г.). «Геномная организация и хромосомная локализация гена нуклеолина человека». Журнал биологической химии. 265 (25): 14922–31. PMID  2394707.
6. Эрард М.С., Беленгер П., Кайзерг-Феррер М., Панталони А., Амальрик Ф. (август 1988 г.). «Главный ядрышковый белок, нуклеолин, вызывает деконденсацию хроматина путем связывания с гистоном H1». Европейский журнал биохимии / FEBS. 175 (3): 525–30. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1988.tb14224.x. PMID  3409881.
7. «Ген Энтреза: нуклеолин NCL».
8. Личфилд Л.М., Риггс К.А., Хокенберри А.М., Оливер Л.Д., Барнхарт К.Г., Кай Дж., Пирс В.М., Иванова М.М., Бейтс П.Дж., Аппана С.Н., Датта С., Кулеша П., Макбрайан Дж., Янг Л.С., Клиндж К.М. (май 2012 г.). «Идентификация и характеристика нуклеолина как коактиватора COUP-TFII транскрипции β рецептора ретиноевой кислоты в клетках рака груди». PLOS ONE. 7 (5): e38278. Bibcode:2012PLoSO ... 738278L. Дои:10.1371 / journal.pone.0038278. ЧВК  3365040. PMID  22693611.
9. Саид Э.А., Краст Б., Нисол С., Сваб Дж., Бриан Дж. П., Ованесиан А.Г. (октябрь 2002 г.). «Мидкин цитокина против ВИЧ связывает нуклеолин, экспрессируемый на клеточной поверхности, как рецептор с низким сродством». Журнал биологической химии. 277 (40): 37492–502. Дои:10.1074 / jbc.M201194200. PMID  12147681. S2CID  41621217.
10. Саид Э.А., Courty J, Svab J, Delbé J, Krust B, Hovanessian AG (сентябрь 2005 г.). «Плейотропин подавляет ВИЧ-инфекцию, связывая нуклеолин, экспрессируемый на клеточной поверхности». Журнал FEBS. 272 (18): 4646–59. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2005.04870.x. PMID  16156786. S2CID  21153881.
11. Тайяри Ф., Марчант Д., Мораес Т.Дж., Дуан В., Мастранджело П., Хегеле Р.Г. (сентябрь 2011 г.). «Идентификация нуклеолина как клеточного рецептора респираторно-синцитиального вируса человека». Природа Медицина. 17 (9): 1132–5. Дои:10,1038 / нм.2444. PMID  21841784. S2CID  205388029.
12. Билавчук Л.М., Griffiths CD, Дженсен Л.Д., Элавар Ф., Марчант DJ (август 2017 г.). «Восприимчивость респираторно-синцитиального вируса к блокированию нуклеолиновых рецепторов и нейтрализации антител зависит от метода очистки вируса». Вирусы. 9 (8): 207. Дои:10.3390 / v9080207. ЧВК  5580464. PMID  28771197.
13. Mastrangelo P, Hegele RG (ноябрь 2012 г.). «Рецептор слияния RSV: не то, что все ожидали». Микробы и инфекции / Institut Pasteur. 14 (13): 1205–10. Дои:10.1016 / j.micinf.2012.07.015. PMID  22884716.
14. Mastrangelo P, Hegele RG (март 2013 г.). «RSV fusion: время для новой модели». Вирусы. 5 (3): 873–85. Дои:10.3390 / v5030873. ЧВК  3705301. PMID  23518574.
15. Shakeri A, Mastrangelo P, Griffin JK, Moraes TJ, Hegele RG (ноябрь 2014 г.). «Экспрессия рецептора респираторно-синцитиального вируса у мышей и вирусный тропизм». Гистология и гистопатология. 30 (30): 401–411. Дои:10.14670 / HH-30.401. PMID  25374027.
16. Ли Д., Добровольская Г., Кребс Э. Г. (июнь 1996 г.). «Физическая ассоциация казеинкиназы 2 с нуклеолином». Журнал биологической химии. 271 (26): 15662–8. Дои:10.1074 / jbc.271.26.15662. PMID  8663258. S2CID  10750338.
17. Дюбуа Т., Земликова Е., Хауэлл С., Эйткен А. (февраль 2003 г.). «Центаурин-альфа 1 ассоциирует in vitro и in vivo с нуклеолином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 301 (2): 502–8. Дои:10.1016 / s0006-291x (02) 03010-3. PMID  12565890.
18. Томинага К., Срикантан С., Ли Е.К., Субаран С.С., Мартиндейл Дж.Л., Абдельмохсен К., Гороспе М. (октябрь 2011 г.). «Конкурентная регуляция экспрессии нуклеолина с помощью HuR и miR-494». Молекулярная и клеточная биология. 31 (20): 4219–31. Дои:10.1128 / MCB.05955-11. ЧВК  3187287. PMID  21859890.
19. Ли Ю.П., Буш Р.К., Вальдес Б.К., Буш Х. (апрель 1996 г.). «C23 взаимодействует с B23, предполагаемым белком, связывающим сигнал ядрышковой локализации». Европейский журнал биохимии / FEBS. 237 (1): 153–8. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0153n.x. PMID  8620867.
20. Даниели Ю., Димитрова Д.Д., Боровец Ю.А. (август 2002 г.). «Стресс-зависимая мобилизация нуклеолина, опосредованная образованием комплекса р53-нуклеолин». Молекулярная и клеточная биология. 22 (16): 6014–22. Дои:10.1128 / mcb.22.16.6014-6022.2002. ЧВК  133981. PMID  12138209.
21. Моримото Х., Окамура Х., Ханеджи Т. (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие протеинфосфатазы 1 дельта с нуклеолином в остеобластических клетках человека». Журнал гистохимии и цитохимии. 50 (9): 1187–93. Дои:10.1177/002215540205000905. PMID  12185196. S2CID  24950287.
22. Сакагути М., Миядзаки М., Такаиши М., Сакагути Ю., Макино Э., Катаока Н., Ямада Х., Намба М., Хах Нью-Хэмпшир (ноябрь 2003 г.). «S100C / A11 является ключевым медиатором Ca (2 +) - индуцированного ингибирования роста эпидермальных кератиноцитов человека». Журнал клеточной биологии. 163 (4): 825–35. Дои:10.1083 / jcb.200304017. ЧВК  2173690. PMID  14623863.
23. Fouraux MA, Bouvet P, Verkaart S, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (июль 2002 г.). «Нуклеолин связывается с подмножеством комплексов рибонуклеопротеинов Ro человека». Журнал молекулярной биологии. 320 (3): 475–88. Дои:10.1016 / с0022-2836 (02) 00518-1. PMID  12096904.
24. Халуска П., Салим А., Эдвардс Т.К., Рубин Э.Х. (апрель 1998 г.). «Взаимодействие между N-концом человеческой топоизомеразы I и большим Т-антигеном SV40». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (7): 1841–7. Дои:10.1093 / nar / 26.7.1841. ЧВК  147454. PMID  9512561.
25. Бхарти А. К., Олсон М. О., Куфе Д. В., Рубин Е. Х. (январь 1996 г.). «Идентификация сайта связывания нуклеолина в топоизомеразе I человека». Журнал биологической химии. 271 (4): 1993–7. Дои:10.1074 / jbc.271.4.1993. PMID  8567649. S2CID  25059254.
26. Хурц С., Масутоми К., Делгермаа Л., Араи К., Оиси Н., Мидзуно Н., Хаяси Н., Хан В. К., Мураками С. (декабрь 2004 г.). «Нуклеолин взаимодействует с теломеразой». Журнал биологической химии. 279 (49): 51508–15. Дои:10.1074 / jbc.M407643200. PMID  15371412. S2CID  41394148.

дальнейшее чтение

• Tuteja R, Tuteja N (1999). «Нуклеолин: многофункциональный основной ядрышковый фосфопротеин». Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии. 33 (6): 407–36. Дои:10.1080/10409239891204260. PMID  9918513.
• Пастернак М.С., Блейер К.Дж., Макинерни Т.Н. (август 1991 г.). «Связывание гранзима А с белками клетки-мишени. Гранзим А связывается и расщепляет нуклеолин in vitro». Журнал биологической химии. 266 (22): 14703–8. PMID  1860869.
• Беленгер П., Кайзерг-Феррер М., Лаббе Дж. К., Доре М., Амальрик Ф. (июль 1990 г.). «Митоз-специфическое фосфорилирование нуклеолина протеинкиназой p34cdc2». Молекулярная и клеточная биология. 10 (7): 3607–18. Дои:10.1128 / MCB.10.7.3607. ЧВК  360797. PMID  2192260.
• Шривастава М., Флеминг П.Дж., Поллард Х.Б., Бернс А.Л. (июнь 1989 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК нуклеолина человека». Письма FEBS. 250 (1): 99–105. Дои:10.1016/0014-5793(89)80692-1. PMID  2737305. S2CID  8690886.
• Тутежа Н., Хуанг Н.В., Скопач Д., Тутежа Р., Хрватич С., Чжан Дж., Понгор С., Джозеф Г., Фаучер К., Амальрик Ф. (июль 1995 г.). «ДНК-геликаза IV человека представляет собой нуклеолин, РНК-геликазу, модулируемую фосфорилированием». Ген. 160 (2): 143–8. Дои:10.1016 / 0378-1119 (95) 00207-М. PMID  7642087.
• Джордан П., Хейд Х, Кинзель В., Кюблер Д. (декабрь 1994 г.). «Основные протеиновые субстраты эктопротеинкиназы, расположенные на поверхности клетки, являются гомологами известных ядерных белков». Биохимия. 33 (49): 14696–706. Дои:10.1021 / bi00253a007. PMID  7993898.
• Николозо М., Кайзерг-Феррер М., Мишо Б., Азум М.С., Bachellerie JP (сентябрь 1994 г.). «U20, новая небольшая ядрышковая РНК, кодируется в интроне гена нуклеолина у млекопитающих». Молекулярная и клеточная биология. 14 (9): 5766–76. Дои:10.1128 / mcb.14.9.5766. ЧВК  359102. PMID  8065311.
• Исикава Ф., Матунис М.Дж., Дрейфус Г., Чех Т.Р. (июль 1993 г.). «Ядерные белки, которые связывают последовательность 3 'сайта сплайсинга пре-мРНК r (UUAG / G) и последовательность теломерной ДНК человека d (TTAGGG) n». Молекулярная и клеточная биология. 13 (7): 4301–10. Дои:10.1128 / MCB.13.7.4301. ЧВК  359985. PMID  8321232.
• Эггерт М., Моус С.К., Трипье Д., Арнольд Р., Мишель Дж., Никель Дж., Шмидт С., Беато М., Ренкавиц Р. (декабрь 1995 г.). «Фракция, обогащенная новым белком, взаимодействующим с рецептором глюкокортикоидов, стимулирует рецептор-зависимую транскрипцию in vitro». Журнал биологической химии. 270 (51): 30755–9. Дои:10.1074 / jbc.270.51.30755. PMID  8530516. S2CID  25642912.
• Бхарти А. К., Олсон М. О., Куфе Д. В., Рубин Е. Х. (январь 1996 г.). «Идентификация сайта связывания нуклеолина в топоизомеразе I человека». Журнал биологической химии. 271 (4): 1993–7. Дои:10.1074 / jbc.271.4.1993. PMID  8567649. S2CID  25059254.
• Ли Ю.П., Буш Р.К., Вальдес Б.К., Буш Х. (апрель 1996 г.). «C23 взаимодействует с B23, предполагаемым белком, связывающим сигнал ядрышковой локализации». Европейский журнал биохимии / FEBS. 237 (1): 153–8. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0153n.x. PMID  8620867.
• Ли Д., Добровольская Г., Кребс Э. Г. (июнь 1996 г.). «Физическая ассоциация казеинкиназы 2 с нуклеолином». Журнал биологической химии. 271 (26): 15662–8. Дои:10.1074 / jbc.271.26.15662. PMID  8663258. S2CID  10750338.
• Чжоу Г., Сейбенхенер М.Л., Вутен М.В. (декабрь 1997 г.). «Нуклеолин представляет собой субстрат протеинкиназы C-zeta. Связь между сигнализацией клеточной поверхности и ядром в клетках PC12». Журнал биологической химии. 272 (49): 31130–7. Дои:10.1074 / jbc.272.49.31130. PMID  9388266.
• Халуска П., Салим А., Эдвардс Т.К., Рубин Э.Х. (апрель 1998 г.). «Взаимодействие между N-концом человеческой топоизомеразы I и большим Т-антигеном SV40». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (7): 1841–7. Дои:10.1093 / nar / 26.7.1841. ЧВК  147454. PMID  9512561.
• Борггрефе Т., Вабл М., Ахмедов А.Т., Джессбергер Р. (июль 1998 г.). «Комплекс рекомбинации ДНК, специфичный для В-клеток». Журнал биологической химии. 273 (27): 17025–35. Дои:10.1074 / jbc.273.27.17025. PMID  9642267. S2CID  24347735.
• Larrucea S, González-Rubio C, Cambronero R, Ballou B, Bonay P, López-Granados E, Bouvet P, Fontán G, Fresno M, López-Trascasa M (ноябрь 1998 г.). «Клеточная адгезия, опосредованная фактором J, ингибитором комплемента. Доказательства участия нуклеолина». Журнал биологической химии. 273 (48): 31718–25. Дои:10.1074 / jbc.273.48.31718. PMID  9822633. S2CID  8004314.
• Parada CA, Roeder RG (июль 1999 г.). «Новый комплекс, содержащий РНК-полимеразу II, усиливает транскрипцию ВИЧ-1, усиленную Tat». Журнал EMBO. 18 (13): 3688–701. Дои:10.1093 / emboj / 18.13.3688. ЧВК  1171446. PMID  10393184.