Мир-127 - mir-127

мир-127
МиР-127 вторичная структура.png
Вторичная структура микроРНК miR-127 и сохранение последовательности
Идентификаторы
Символмир-127
РфамRF00676
Семейство miRBaseMIPF0000080
NCBI Gene406914
HGNC31509
OMIM611709
Прочие данные
РНК типмикроРНК
Домен (ы)Эукариоты;
PDB структурыPDBe

mir-127 микроРНК короткий некодирующая РНК молекула с интересной перекрывающейся структурой генов. miR-127 регулирует уровни экспрессии генов, участвующих в развитии легких, формировании плаценты и апоптоз. Аберрантная экспрессия miR-127 была связана с различными видами рака.

Структура гена

pri-miR-127 происходит из отдельного, но перекрывающегося кластера консервативных генов, кодирующего miR-433/127. miR-127 и miR-433 перекрываются в направлении 5'-3 '.[1] Хотя локусы можно найти на разных хромосомах у разных видов, структура сохранилась. У млекопитающих, включая человека, шимпанзе, лошадь, собаку, обезьяну, крысу, корову и мышь, множественное выравнивание последовательностей (MSA) между miR-433 и miR127 показали 95-100% сходства с сохраненным расстоянием между miR-433 и miR-127 от 986 до 1007 п.н. Более того, вышестоящие элементы ответа в промоторах miR-433/127, включая элемент ответа рецепторов, связанных с эстрогеном (ERRE), были законсервированы среди вышеуказанных видов. Данные предполагают, что локусы miR-433/127, возможно, произошли от общего гена происхождения.[2]

Регулирование транскрипции

Сайты связывания факторов транскрипции, расположенные выше предшественника miRNA, играют роль в регуляции транскрипции. Активация промоторов miR-127 и miR-433 опосредуется гамма-рецептор, связанный с эстрогеном (ERRgamma, NR3B3), которые физически связываются с их эндогенными промоторами. Торможение регулируется Малый гетеродимерный партнер (SHP), который действует в транс.[3] Хотя miR-127 и miR-433 имеют общие регуляторные элементы, у них есть независимые промоторы, и наблюдается их дифференциальный паттерн экспрессии.[4]

Функциональные роли

Подавление импринтированного гена Rtl1

Rtl1 является ключевым геном в формировании плаценты, а потеря или сверхэкспрессия Rlt1 привели к поздней эмбриональной или неонатальной летальности у мышей.[5] miR-127 располагается рядом с островками CpG в импринтированной области, кодирующей rtl1, и обычно транскрибируется в антисмысловой ориентации по отношению к гену. Эктопическая экспрессия miR-127 приводила к снижению экспрессии Rtl1 в клетках Hela человека и Heppa-1 мыши.

Эксперименты, проведенные на мышах, показали, что Rtl1 транскрибируется только с отцовской хромосомы, тогда как материнский аллель деградирует. miR-127 и miR-136, однако, только матерински экспрессируются в соматических клетках и, таким образом, играют роль в антисмысловой регуляции импринтинга Rtl1. Статус аберрантного метилирования Rtl1 и miR-127 показал, что эпигенетическое программирование также участвует в процессе.[2]

Контроль развития легких плода

miR-127 высоко экспрессируется на поздних стадиях развития плода. Нарушение системы за счет сверхэкспрессии miR-127 в системе культивирования органов легких плода приводит к дефектному развитию, что проявляется в снижении количества терминальных зачатков и различного размера зачатков.[6]

Роль в болезни

Диффузная В-клеточная лимфома большого размера

Активная регуляция miR-127 вызывала подавление Белок В-клеточной лимфомы 6, протоонкоген, который обычно гипермутируется в диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLCL).[7][8] Более того, дифференциальная экспрессия miR-127 была обнаружена в разных типах DLCL. Уровни miR-127 были значительно выше в DLCL яичек по сравнению с DLCL узловой и центральной нервной системы, подразумевая различную биологическую сущность DLCL в разных местах.[9]

Гепатоцеллюлярная карцинома

Ингибирование экспрессии miR-127 связано с гепатоцеллюлярной карциномой. Механистическая связь была подтверждена изменением белка BCL6, на который нацелен miR-127.[10]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Песня G, Ван Л. (2008). Вольф, Жан-Николя (ред.). «MiR-433 и miR-127 возникают из независимых перекрывающихся первичных транскриптов, кодируемых локусом miR-433-127». PLoS ONE. 3 (10): e3574. Дои:10.1371 / journal.pone.0003574. ЧВК  2570487. PMID  18974780.
  2. ^ а б Песня G, Ван L (2009). Тора, Ласло (ред.). «Консервативная структура гена и регуляция экспрессии miR-433 и miR-127 у млекопитающих». PLoS ONE. 4 (11): e7829. Дои:10.1371 / journal.pone.0007829. ЧВК  2778354. PMID  19946636.
  3. ^ Ван Л., Лю Дж., Саха П. и др. (Октябрь 2005 г.). «Орфанный ядерный рецептор SHP регулирует экспрессию PGC-1alpha и выработку энергии в коричневых адипоцитах». Cell Metab. 2 (4): 227–38. Дои:10.1016 / j.cmet.2005.08.010. PMID  16213225.
  4. ^ Сонг Джи, Ван Л (октябрь 2008 г.). "Механизм транскрипции парных генов miR-433 и miR-127 ядерными рецепторами SHP и ERRgamma". Нуклеиновые кислоты Res. 36 (18): 5727–35. Дои:10.1093 / nar / gkn567. ЧВК  2566885. PMID  18776219.
  5. ^ Секита Ю., Вагацума Х., Накамура К. и др. (Февраль 2008 г.). «Роль импринтированного гена, полученного из ретротранспозона, Rtl1, в фето-материнском интерфейсе плаценты мыши». Nat. Genet. 40 (2): 243–8. Дои:10.1038 / нг.2007.51. PMID  18176565.
  6. ^ Бхаскаран М., Ван И, Чжан Х и др. (Май 2009 г.). «МикроРНК-127 модулирует развитие легких плода». Physiol. Геномика. 37 (3): 268–78. Дои:10.1152 / физиолгеномика.90268.2008. ЧВК  2685501. PMID  19439715.
  7. ^ Лу Дж., Гетц Дж., Миска Е.А. и др. (Июнь 2005 г.). «Профили экспрессии микроРНК классифицируют рак человека». Природа. 435 (7043): 834–8. Дои:10.1038 / природа03702. PMID  15944708.
  8. ^ Сайто Ю., Лян Дж., Эггер Дж. И др. (Июнь 2006 г.). «Специфическая активация микроРНК-127 с подавлением протоонкогена BCL6 лекарствами, модифицирующими хроматин, в раковых клетках человека». Раковая клетка. 9 (6): 435–43. Дои:10.1016 / j.ccr.2006.04.020. PMID  16766263.
  9. ^ Робертус Дж. Л., Хармс Дж., Блокзейл Т. и др. (Апрель 2009 г.). «Специфическая экспрессия miR-17-5p и miR-127 в диффузной большой B-клеточной лимфоме яичек и центральной нервной системы». Мод. Патол. 22 (4): 547–55. Дои:10.1038 / modpathol.2009.10. PMID  19287466.
  10. ^ Трындяк В.П., Росс С.А., Беланд Ф.А., Погрибный И.П. (июнь 2009 г.). «Подавление микроРНК miR-34a, miR-127 и miR-200b в печени крыс во время гепатоканцерогенеза, индуцированного диетой с дефицитом метил» (PDF). Мол. Канцероген. 48 (6): 479–87. Дои:10.1002 / mc.20484. PMID  18942116.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка