Белок группы высокой подвижности HMG14 и HMG17 - High mobility group protein HMG14 and HMG17
| HMG14 и HMG17 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | HMG14_17 | ||||||||
| Pfam | PF01101 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000079 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00307 | ||||||||
| |||||||||
Белок группы высокой подвижности HMG14 и HMG17 также известный как нуклеосомный связывающий домен это семейство эволюционно родственных белков.
Белки группы высокой подвижности (HMG) представляют собой семейство не-гистон компоненты в хроматин. HMG14 и HMG17 являются очень похожими белками из примерно 100 аминокислотных остатков; последовательность куриного HMG14 почти так же похожа на куриную HMG17, как и на полипептиды HMG14 млекопитающих.[1] Белки связываются с внутренней стороной нуклеосомной ДНК, изменяя взаимодействие между ДНК и октамер гистонов. Считается, что они могут быть вовлечены в процесс, который придает специфические конформации хроматина транскрибируемым участкам генома.[2]
Подпись SMART описывает нуклеосомный связывающий домен, который облегчает связывание белков с нуклеосомами в хроматине. Этот домен чаще всего встречается в белках группы высокой подвижности (HMG), HMG14 и HMG17, однако он также обнаруживается в других белках, которые связываются с нуклеосомами, например НБП-45. NBP-45 представляет собой нуклеосомный связывающий белок, впервые идентифицированный у мышей,[3] который связан с HMG14 и HMG17. NBP-45 специфически связывается с частицами ядра нуклеосомы и может действовать как активатор транскрипции. Эти данные привели к предположению, что этот домен, общий для NBP-45, HMG14 и HMG17, отвечает за связывание белков с нуклеосомами в хроматине.
Примеры
Белки человека, содержащие этот домен, включают:
Рекомендации
- ^ Доджсон Дж. Б., Браун Д. Л., Блэк А. Дж. (1988). «Клоны кДНК куриного хромосомного белка HMG-14 и HMG-17: выделение, характеристика и сравнение последовательностей». Ген. 63 (2): 287–295. Дои:10.1016 / 0378-1119 (88) 90532-Х. PMID 3384337.
- ^ Гонсалес Ф.Дж., Бустин М., Ландсман Д., Соарес Н. (1986). «Хромосомный белок HMG-17. Полная последовательность кДНК человека и доказательства мультигенного семейства». J. Biol. Chem. 261 (16): 7479–7484. PMID 3754870.
- ^ Бустин М, Ландсман Д, Ширакава Х, Постников Ю.В. (2000). «NBP-45, новый нуклеосомный связывающий белок с тканеспецифической и регулируемой в процессе развития экспрессией». J. Biol. Chem. 275 (9): 6368–6374. Дои:10.1074 / jbc.275.9.6368. PMID 10692437.