HNRNPA0 - HNRNPA0

HNRNPA0
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPA0, HNRPA0, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A0
Внешние идентификаторы	OMIM: 609409 MGI: 1924384 ГомолоГен: 136809 Генные карты: HNRNPA0
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q31.2 Начинать 137,745,651 бп[1] Конец 137,754,363 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 B1 Начинать 58,125,879 бп[2] Конец 58,128,556 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание протеинкиназы • связывание нуклеиновой кислоты • Привязка элементов AU-rich • Связывание РНК • связывание мРНК • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • рибонуклеопротеин Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • 3'-UTR-опосредованная стабилизация мРНК • воспалительная реакция • ответ на липополисахарид • Метаболический процесс РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10949	77134
Ансамбль	ENSG00000177733	ENSMUSG00000007836
UniProt	Q13151	Q9CX86
RefSeq (мРНК)	NM_006805	NM_029872
RefSeq (белок)	NP_006796	NP_084148
Расположение (UCSC)	Chr 5: 137,75 - 137,75 Мб	Chr 13: 58.13 - 58.13 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A0 это белок что у людей кодируется HNRNPA0 ген.^[5][6]

Этот ген принадлежит к подсемейству A / B повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеидов (hnRNPs ). HnRNPs являются РНК связывающие белки и они образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA ). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. Хотя все hnRNP присутствуют в ядро, некоторые, кажется, курсируют между ядром и цитоплазма. Белки hnRNP обладают отчетливыми свойствами связывания нуклеиновых кислот. Белок, кодируемый этим геном, имеет два повтора квази-RRM домены, которые связывают РНК, за которыми следует глицин -богатые C-конец.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000177733 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000007836 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Майер В. Э., Стейтц Дж. А. (декабрь 1995 г.). «Выделение и характеристика нового белка hnRNP с низким содержанием: A0». РНК. 1 (2): 171–82. ЧВК  1369071. PMID  7585247.
6. «Ген Entrez: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин A0 HNRPA0».

дальнейшее чтение

• Доусон SJ, Белый LA (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». J. Инфекция. 24 (3): 317–20. Дои:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID  1602151.
• Кросс С.Х., Чарльтон Дж. А., Нэн Х, Берд А. П. (1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки для связывания метилированной ДНК». Nat. Genet. 6 (3): 236–44. Дои:10.1038 / ng0394-236. PMID  8012384. S2CID  12847618.
• Ли С.Х., Макиннис М.Г., Марголис Р.Л. и др. (1993). «Новый триплетный повтор, содержащий гены в человеческом мозге: клонирование, экспрессия и полиморфизм длины». Геномика. 16 (3): 572–9. Дои:10.1006 / geno.1993.1232. PMID  8325628.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Хиллер Л.Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Genome Res. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID  8889549.
• Лай Ф., Годли Л.А., Джослин Дж. И др. (2001). «Карта транскриптов и сравнительный анализ 1,5-мегабайтного обычно удаленного сегмента человеческого 5q31 при злокачественных миелоидных заболеваниях с del (5q)». Геномика. 71 (2): 235–45. Дои:10.1006 / geno.2000.6414. PMID  11161817.
• Руссо С., Моррис Н., Пегги М. и др. (2003). «Ингибирование SAPK2a / p38 предотвращает фосфорилирование hnRNP A0 с помощью MAPKAP-K2 и его взаимодействие с мРНК цитокинов». EMBO J. 21 (23): 6505–14. Дои:10.1093 / emboj / cdf639. ЧВК  136943. PMID  12456657.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Онг С.Е., Миттлер Г., Манн М. (2005). «Идентификация и количественная оценка сайтов метилирования in vivo тяжелым метиловым SILAC». Nat. Методы. 1 (2): 119–26. Дои:10.1038 / nmeth715. PMID  15782174. S2CID  6654604.