Малый ядерный рибонуклеопротеиновый полипептид C - Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C

SNRPC
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2VRD, 3CW1, 4PJO
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPC, U1C, Yhc1, полипептид C малого ядерного рибонуклеопротеина
Внешние идентификаторы	OMIM: 603522 ГомолоГен: 136764 Генные карты: SNRPC
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.31 Начните 34,757,505 бп[1] Конец 34,773,857 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание одноцепочечной РНК • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание мяРНК U1 • Связывание с сайтом 5'-сплайсинга пре-мРНК • Связывание U1 snRNP • Связывание РНК • связывание мРНК Сотовый компонент • Тело Кахала • пресплицеосома • U1 snRNP • ядро клетки • комплекс обязательств • нуклеоплазма • Пресплицеосома U2-типа Биологический процесс • сплайсосомальная сборка snRNP • Распознавание сайта 5'-сплайсинга мРНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6631	н / д
Ансамбль	ENSG00000124562	н / д
UniProt	P09234	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_003093	н / д
RefSeq (белок)	NP_003084	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 6: 34,76 - 34,77 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

U1 малый ядерный рибонуклеопротеин C это белок что у людей кодируется SNRPC ген.^[3][4][5]

Взаимодействия

Было показано, что полипептид C малого ядерного рибонуклеопротеина взаимодействовать с участием Точка перелома саркомы Юинга область 1.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124562 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Sillekens PT, Beijer RP, Habets WJ, van Venrooij WJ (сентябрь 1988 г.). «Человеческий U1 snRNP-специфический белок C: полная последовательность кДНК и белка и идентификация мультигенного семейства у млекопитающих». Исследования нуклеиновых кислот. 16 (17): 8307–21. Дои:10.1093 / nar / 16.17.8307. ЧВК  338560. PMID  2971157.
4. Gunnewiek JM, van Aarssen Y, Wassenaar R, Legrain P, van Venrooij WJ, Nelissen RL (декабрь 1995 г.). «Гомодимеризация человеческого U1 snRNP-специфического белка C». Исследования нуклеиновых кислот. 23 (23): 4864–71. Дои:10.1093 / nar / 23.23.4864. ЧВК  307476. PMID  8532530.
5. «Ген Entrez: полипептид C малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPC».
6. Knoop LL, Baker SJ (август 2000 г.). «Фактор сплайсинга U1C репрессирует трансактивацию, опосредованную EWS / FLI». Журнал биологической химии. 275 (32): 24865–71. Дои:10.1074 / jbc.M001661200. PMID  10827180.

дальнейшее чтение

• Ямамото К., Миура Х, Морой Й, Ёсиноя С., Гото М., Нисиока К., Миямото Т. (январь 1988 г.). «Выделение и характеристика комплементарной ДНК, экспрессирующей полипептид малого ядерного рибонуклеопротеина C U1 человека». Журнал иммунологии. 140 (1): 311–7. PMID  2961811.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Нелиссен Р.Л., Ганневик Дж. М., Ламбермон М. Х., Ван Венройдж В. Дж. (Январь 1997 г.). «Клонирование и характеристика двух процессированных псевдогенов и кДНК для мышиного U1 snRNP-специфического белка C». Ген. 184 (2): 273–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00612-9. PMID  9031639.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Dumortier H, Klein Gunnewiek J, Roussel JP, van Aarssen Y, Briand JP, van Venrooij WJ, Muller S (декабрь 1998 г.). «По крайней мере три линейных участка, но не домен цинкового пальца белка U1C, экспонируются на поверхности белка в растворе и на сплайсосомной частице snRNP U1 человека». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (23): 5486–91. Дои:10.1093 / nar / 26.23.5486. ЧВК  147990. PMID  9826776.
• Шарру Б., Пеллиццони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (март 2000 г.). «Gemin4. Новый компонент комплекса SMN, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках». Журнал клеточной биологии. 148 (6): 1177–86. Дои:10.1083 / jcb.148.6.1177. ЧВК  2174312. PMID  10725331.
• Knoop LL, Baker SJ (август 2000 г.). «Фактор сплайсинга U1C репрессирует трансактивацию, опосредованную EWS / FLI». Журнал биологической химии. 275 (32): 24865–71. Дои:10.1074 / jbc.M001661200. PMID  10827180.
• Пеллиццони Л., Баккон Дж., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (Март 2002 г.). «Очистка естественного выживания комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента». Журнал биологической химии. 277 (9): 7540–5. Дои:10.1074 / jbc.M110141200. PMID  11748230.
• Förch P, Puig O, Martínez C, Séraphin B, Valcárcel J (декабрь 2002 г.). «Регулятор сплайсинга TIA-1 взаимодействует с U1-C, способствуя привлечению U1 snRNP к 5 'сайтам сплайсинга». Журнал EMBO. 21 (24): 6882–92. Дои:10.1093 / emboj / cdf668. ЧВК  139089. PMID  12486009.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.