HLA-B46 - HLA-B46
 | Эта статья может быть слишком техническим для большинства читателей, чтобы понять. Пожалуйста помогите улучшить это к сделать понятным для неспециалистов, не снимая технических деталей. (Май 2017 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
главный комплекс гистосовместимости (человек), класс I, B46 | ||
| Аллели | В * 4601 | |
| Структура (Видеть HLA-B ) | ||
| Символ (ы) | HLA-B | |
| EBI-HLA | В * 4601 | |
| Locus | chr.6 6п21.31 | |
HLA-B46 (B46) - это HLA -B серотип. Серотип определяет генные продукты аллеля HLA-B * 4601.[1]B * 4601 возник в результате редкого интерлокуса, преобразование гена между B62, вероятно, B * 1501, а HLA-C аллель.[2] B * 4601 является наиболее распространенным аллелем HLA-B, который не имеет происхождения в Африке, и, по оценкам, 400 миллионов человек в Восточной Азии являются носителями аллеля B46. При обнаружении B * 4601 отделяется только от 2 HLA-Cw аллели, ограниченное количество HLA-A и HLA-DRB1 аллели, предполагающие, что аллель недавно расширился из группы ограниченного размера в Юго-Восточной Азии. Чрезвычайно низкие частоты за пределами Восточной Азии являются показателями недавнего распространения B46 из недавно небольшой популяции. Распределение частот предполагает, что предковая популяция B46 проживала на юго-востоке Китая или, возможно, в Бирме (Мьянма или Лаос, не проверено). B46 в Азии коррелирует с выращивание влажного риса. Исключения примечательны: он был обнаружен в нивхах на северо-востоке острова Сакалин, у айнов и родственной нивхам (генетически) тлинглетной популяции на Аляске на незначительных уровнях.
Серотип
| В * 46 | B46 | Другой | Образец |
| аллель | % | % | размер (N) |
| 4601 | 59 | 29 | 1487 |
Серотипирование для B * 4601 плохое, и предпочтительнее использовать SSP-ПЦР. B * 46: 01 - один из четырех аллелей B, который не реагирует ни с Bw4, ни с Bw6. Остальные В * 18: 06, В * 55: 03 и В * 73: 01.[4]
B * 4601 Частоты аллелей
| частота | ||
| исх. | численность населения | (%) |
| [5] | Buyei (Китай ) | 21.6 |
| [5] | Мяо (Китай) | 18.4 |
| [6] | Хан (2) (Юньнань, Китай ) | 17.9 |
| [6] | Тайский (в Сингапуре) | 17.2 |
| [6] | Южный китайский (на Тайване) | 17.2 |
| [6] | Китайский (в Гонконг ) | 16.3 |
| [6] | Хакка (2) (Тайвань) | 15.6 |
| [6] | Гуанчжоу (Китай) | 15.5 |
| [6] | Северо-восточный Таиланд | 15.1 |
| [6] | Миннан (В среднем 1 и 2) (Тайвань) | 15.0 |
| [6] | Средне-китайский (на Тайване) | 15.0 |
| [6] | Хакка (Тайвань) | 13.6 |
| [6] | Ухань (Китай ) | 13.5 |
| [6] | Маонан (Гуанси, Китай) | 13.4 |
| [6] | Китайский (в Сингапуре) | 13.4 |
| [5] | вьетнамский | 13.2 |
| [6] | Южный Хань (Китай) | 11.5 |
| [6] | Шанхай, Китай) | 11.2 |
| [6] | Мэйчжоу Хан (Гуандун, Китай) | 10.0 |
| [6] | Шицзячжуан Тяньцзянь Хан (Пекин) | 9.6 |
| [6] | Гуанчжоу Хан (Китай) | 9.4 |
| [6] | Таиланд | 9.2 |
| [6] | Nu (Юньнань, Китай) | 9.0 |
| [6] | Северный китайский (на Тайване) | 8.6 |
| [6] | Пазех (Тайвань) | 8.2 |
| [6] | Аичи (Япония ) | 7.6 |
| [6] | Лису (Юньнань, Китай) | 7.2 |
| [6] | Пекин, Китай) | 6.8 |
| [6] | Наси (Юньнань, Китай) | 6.1 |
| [6] | Хуэй (Цинхай, Китай) | 5.9 |
| [6] | Северная Хань (Китай) | 5.7 |
| [6] | Япония (3) | 5.0 |
| [6] | Хиого (Япония) | 4.7 |
| [6] | Южная Корея (3) | 4.4 |
| [6] | Мужчина (Харбин, Китай) | 4.1 |
| [6] | Сирая (Тайвань) | 3.9 |
| [6] | Центральная Япония | 3.6 |
| [6] | Linqu County (Шаньдун, Китай) | 3.3 |
| [6] | Тиморцы | 2.6 |
| [6] | Внутренняя Монголия (Китай) | 2.0 |
| [6] | Яванский (в Сингапуре) | 2.0 |
| [6] | Oold (Монголия) | 1.9 |
| [6] | Нивхи (Сахалин I, Россия) остров | 1.9 |
| [6] | Тао (Тайвань) | 1.7 |
| [6] | Риау малайский (в Сингапуре) | 1.5 |
| [6] | Тува (2) (Россия) | 1.4 |
| [6] | Тибетский (Китай) | 1.3 |
| [6] | Халх (Улан-Батор, Монголия ) | 1.2 |
| [6] | Айны (Хоккайдо, Япония) | 1.0 |
| [6] | Окинава (на Гавайях, США) | 1.0 |
| [6] | Коренное население (Тайвань) | 0.9 |
| [6] | Халха (Монголия) | 0.5 |
| [6] | Брахуи (Пакистан) | 0.5 |
Темно-красный = 7% или больше
Красный = от 3 до 7%
Оранжевый = от 1 до 3%
Зеленый = от 0 до 1%
Черный = регионы не введены
A2-Cw11 (1) -B46
Этот гаплотип уникален в нескольких отношениях, во-первых, и, что наиболее важно, серотип B46 не из Африки, это отличает его от всех других известных серотипов B. Это результат события рекомбинации между B62 (B * 1501) и аллелем HLA-C в Азии. Это событие произошло недавно, так как есть только один основной аллель, а второстепенные аллели находятся на частотах следов. Между этим гаплотипом, аллелями, несущими A24 и A11, произошла некоторая рекомбинация, вероятно, в местной (или племенной популяции). B46 встречается везде, где бывают азиатские народы, занимающиеся выращиванием влажного риса, и редко встречается в группах коренных народов, не занимающихся сельским хозяйством. Единственным исключением являются Нинхвет Сибири и Восточный тлинглет на Аляске. Этот вклад B46, по-видимому, был недавним. Из-за количества людей, представленных в группах выборки, и его относительной высокой частоты в этой группе, A2-B46 является одним из наиболее частых, если не самым частым гаплотипом AB в мире, даже несмотря на то, что он отсутствует у коренного населения. большинства народов мира.
| частота | Ранг в | |||
| исх. | численность населения | (%) | Поп. | |
| [5] | Буй | 16.6 | 1 | 1 |
| [5] | Мяо | 13.6 | 1 | |
| [5] | Сингапур (Китайский) | 11.4 | 2 | |
| [7] | Хаошань | 10.1 | 1 | |
| [5] | Южный Хань | 7.8 | 2 | |
| [5] | Вьетнам | 7.8 | 1 | |
| [5] | Тайский | 7.2 | 1 | |
| [5] | Тайский китайский | 4.0 | ||
| [5] | Японский | 3.3 | 4 | |
| [5] | Ли | 3.0 | ||
| [5] | Корея | 2.8 | ||
| [5] | Уйгар | 2.7 | ||
| [5] | Маньчжурский | 2.6 | ||
| [5] | Внутренний Монг. | 1.9 | ||
| [5] | Северная Хань | 1.8 | ||
| 1 самая высокая частота. А-Б в Азии. | ||||
Этот гаплотип уникален в нескольких отношениях, во-первых, и, что наиболее важно, серотип B46 не из Африки, это отличает его от всех других основных серотипов B, кроме В * 48. Это результат события рекомбинации между B62 (В * 1501 ) и HLA-C аллель в Азии. Это событие произошло недавно, так как есть только один основной аллель, а второстепенные аллели находятся на частотах следов. Между этим гаплотипом, аллелями, несущими A24 и A11, произошла некоторая рекомбинация, вероятно, в местной (или племенной популяции). B46 встречается везде, где бывают азиатские народы, занимающиеся выращиванием влажного риса, и редко встречается в группах коренных народов, не занимающихся сельским хозяйством. Единственным исключением являются Нинхвет Сибири и Восточный тлинглет на Аляске. Этот вклад B46, по-видимому, был недавним. Из-за количества людей, представленных в группах выборки, и его относительной высокой частоты в этой группе, A2-B46 является одним из наиболее частых, если не самым частым гаплотипом AB в мире, даже несмотря на то, что он отсутствует у коренного населения. большинства народов мира.
Наиболее распространенный гаплотип и, вероятно, наследственный гаплотип, учитывая его распространение от Нинхивета до Индонезии:
А*0207 : C*0102 : B*4601 : DRB1*0901 : DQA1*0302 : DQB1*0303
Другой гаплотип, более распространенный в Корее и Японии, - это
А*0207 : C*0102 : B*4601 : DRB1*0803 : DQA1*0103 : DQB1*0601
B46 или тесно связанный аллель, возможно, находились в процессе положительного отбора у рисоводелов в Азии.
Рекомендации
- ^ Marsh, S.G .; Альберт, Э. Д .; Bodmer, W. F .; Bontrop, R.E .; Dupont, B .; Erlich, H.A .; Fernández-Viña, M .; Герати, Д. Э .; Holdsworth, R .; Hurley, C.K .; Lau, M .; Lee, K. W .; Мах, Б .; Maiers, M .; Mayr, W. R .; Müller, C.R .; Parham, P .; Petersdorf, E.W .; Сасадзуки, Т .; Strominger, J. L .; Svejgaard, A .; Terasaki, P. I .; Tiercy, J.M .; Троусдейл, Дж. (2010). «Номенклатура факторов системы HLA, 2010». Тканевые антигены. 75 (4): 291–455. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2010.01466.x. ЧВК 2848993. PMID 20356336.
- ^ Hildebrand WH, Domena JD, Shen SY и др. (1994). «HLA-B15: широко распространенное и разнообразное семейство аллелей HLA-B». Тканевые антигены. 43 (4): 209–18. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1994.tb02327.x. PMID 7521976.
- ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA – Европейский институт биоинформатики
- ^ Voorter, CE; van der Vlies, S; Кик, М; ван ден Берг-Лунен, EM (октябрь 2000 г.). «Неожиданные паттерны реактивности Bw4 и Bw6 в новых аллелях». Тканевые антигены. 56 (4): 363–70. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2000.560409.x. PMID 11098937.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q Сасадзуки, Такехико; Цудзи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: материалы одиннадцатого Международного семинара и конференции по гистосовместимости, состоявшихся в Иокогаме, Япония, 6–13 ноября 1991 г.. Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-262390-4.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный ар в качестве в au средний ау топор Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Н., Комеровски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net ". Тканевые антигены. 61 (5): 403–7. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660. Внешняя ссылка в
| название =(помощь) - ^ Ху С.П., Луан Дж. А., Ли Б. и др. (2007). «Генетическая связь между Chaoshan и другими китайскими ханьскими популяциями: данные распределения частот аллелей HLA-A и HLA-B». Являюсь. J. Phys. Антрополь. 132 (1): 140–50. Дои:10.1002 / ajpa.20460. PMID 16883565.