GADD45A - GADD45A

GADD45A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2 кг4
Идентификаторы
Псевдонимы	GADD45A, DDIT1, GADD45, задержка роста и индуцируемое повреждение ДНК альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 126335 MGI: 107799 ГомолоГен: 1449 Генные карты: GADD45A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п31.3 Начните 67,685,201 бп[1] Конец 67,688,334 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 C1 Начните 67,035,096 бп[2] Конец 67,037,457 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание киназы • активность гомодимеризации белков • активность гетеродимеризации белков • связывание с N-концом белка • Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное пятнышко Биологический процесс • апоптотический процесс • остановка митотического клеточного цикла • центросомный цикл • регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • отрицательная регуляция активности протеинкиназы • передача сигнала в ответ на повреждение ДНК • реакция на стресс • положительное регулирование каскада JNK • регуляция клеточного цикла • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • клеточный ответ на механический раздражитель • положительная регуляция метаболических процессов активных форм кислорода • остановка клеточного цикла • положительная регуляция апоптотического процесса • клеточный ответ на ионизирующее излучение • клеточный цикл • активация активности MAPKKK • Ремонт ДНК • положительная регуляция каскада p38MAPK • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1647	13197
Ансамбль	ENSG00000116717	ENSMUSG00000036390
UniProt	P24522	P48316
RefSeq (мРНК)	NM_001924 NM_001199741 NM_001199742	NM_007836
RefSeq (белок)	NP_001186670 NP_001186671 NP_001915	NP_031862
Расположение (UCSC)	Chr 1: 67.69 - 67.69 Мб	Chr 6: 67.04 - 67.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Остановка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD45 alpha это белок что у людей кодируется GADD45A ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген является членом группы генов, GADD45 гены, уровни транскриптов которых увеличиваются после стрессовых условий остановки роста и лечения ДНК-повреждающими агентами (мутагены ). Транскрипция этого гена, вызванная повреждением ДНК, опосредуется как p53 -зависимые и -независимые механизмы. Белок, кодируемый этим геном, отвечает на стрессы окружающей среды, опосредуя активацию стр.38 /JNK путь через MTK1 / MEKK4 киназа.^[7]

Приложения

Тот факт, что экспрессия этого гена является индикатором повреждения ДНК, был использован для создания in vitro тест на мутагенность, анализ GADD45a-GFP GreenScreen HC.^[8] Этот анализ состоит из клеточной линии, которая была сконструирована так, чтобы экспрессия GADD45A приводила к экспрессии зеленый флуоресцентный белок, который легко обнаружить. Чтобы проверить вещество на мутагенность, его наносят на эти клетки и измеряют флуоресценцию.

Взаимодействия

GADD45A был показан взаимодействовать с участием:

• АУРКА,^[9]
• Cdk1,^{[10][11][12][13]}
• CCNB1,^[10][13]
• GADD45GIP1^[14]
• MAP3K4,^[15]
• P21,^[12][16] и
• PCNA.^{[12][17][18][19][20]}

Смотрите также

• Gadd45

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116717 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036390 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Папатанасиу М.А., Керр Н.С., Роббинс Дж. Х., Макбрайд О. В., Аламо I-младший, Барретт С.Ф., Хиксон И.Д., Форнас А.Дж. младший (март 1991 г.). «Индукция ионизирующим излучением гена gadd45 в культивируемых клетках человека: отсутствие посредничества протеинкиназой C». Mol Cell Biol. 11 (2): 1009–16. Дои:10.1128 / MCB.11.2.1009. ЧВК  359769. PMID  1990262.
6. Холландер М.С., Аламо И., Джекман Дж., Ван М.Г., Макбрайд О.В., Форнас А.Дж. младший (декабрь 1993 г.). «Анализ гена gadd45 млекопитающих и его ответ на повреждение ДНК». J Biol Chem. 268 (32): 24385–93. PMID  8226988.
7. «Ген Entrez: задержка роста GADD45A и индуцируемое повреждением ДНК, альфа».
8. Уолмсли Р.М., Тейт М. (2012). «Анализ GADD45a-GFP GreenScreen HC». Методы Мол. Биол. Методы молекулярной биологии. 817: 231–50. Дои:10.1007/978-1-61779-421-6_12. ISBN  978-1-61779-420-9. PMID  22147576.
9. Санчес Р., Пантоха-Учеда Д., Прието Дж., Диркс Т., Маркаида М.Дж., Монтойя Дж., Кампос-Оливас Р., Бланко Ф.Дж. (июль 2010 г.). "Структура раствора остановки роста человека и повреждения ДНК 45alpha (Gadd45alpha) и его взаимодействия с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA) и киназой Aurora A". J. Biol. Chem. 285 (29): 22196–201. Дои:10.1074 / jbc.M109.069344. ЧВК  2903397. PMID  20460379.
10. Чжан К., Антиноре MJ, Ван XW, Carrier F, Smith ML, Harris CC, Fornace AJ (май 1999 г.). «Ассоциация с Cdc2 и ингибирование активности киназы Cdc2 / Cyclin B1 с помощью p53-регулируемого белка Gadd45». Онкоген. 18 (18): 2892–900. Дои:10.1038 / sj.onc.1202667. PMID  10362260.
11. Jin S, Antinore MJ, Lung FD, Dong X, Zhao H, Fan F, Colchagie AB, Blanck P, Roller PP, Fornace AJ, Zhan Q (июнь 2000 г.). «Ингибирование GADD45 киназы Cdc2 коррелирует с GADD45-опосредованным подавлением роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16602–8. Дои:10.1074 / jbc.M000284200. PMID  10747892.
12. Ян К., Маниконе А., Курсен Дж. Д., Линке С. П., Нагашима М., Форгес М., Ван XW (ноябрь 2000 г.). «Идентификация функционального домена в GADD45-опосредованной контрольной точке G2 / M». J. Biol. Chem. 275 (47): 36892–8. Дои:10.1074 / jbc.M005319200. PMID  10973963.
13. Вайрапанди М., Баллиет А.Г., Хоффман Б., Либерман Д.А. (сентябрь 2002 г.). «GADD45b и GADD45g являются ингибиторами киназы cdc2 / cyclinB1, играющими роль в контрольных точках клеточного цикла S и G2 / M, вызванных генотоксическим стрессом». J. Cell. Физиол. 192 (3): 327–38. Дои:10.1002 / jcp.10140. PMID  12124778.
14. Chung HK, Yi YW, Jung NC, Kim D, Suh JM, Kim H, Park KC, Song JH, Kim DW, Hwang ES, Yoon SH, Bae YS, Kim JM, Bae I, Shong M (июль 2003 г.). «CR6-взаимодействующий фактор 1 взаимодействует с белками семейства Gadd45 и модулирует клеточный цикл». J. Biol. Chem. 278 (30): 28079–88. Дои:10.1074 / jbc.M212835200. PMID  12716909.
15. Такекава М., Сайто Х. (ноябрь 1998 г.). «Семейство стресс-индуцируемых GADD45-подобных белков опосредует активацию стресс-зависимого MTK1 / MEKK4 MAPKKK». Ячейка. 95 (4): 521–30. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 81619-0. PMID  9827804.
16. Чжао Х, Цзинь С., Антиноре MJ, Lung FD, Fan F, Blanck P, Roller P, Fornace AJ, Zhan Q (июль 2000 г.). «Центральная область Gadd45 необходима для его взаимодействия с p21 / WAF1». Exp. Cell Res. 258 (1): 92–100. Дои:10.1006 / exc.2000.4906. PMID  10912791.
17. Смит М.Л., Чен И.Т., Чжан К., Бэ И., Чен С.Й., Гилмер TM, Кастан М.Б., О'Коннор П.М., Форнас А.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Взаимодействие p53-регулируемого белка Gadd45 с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Наука. 266 (5189): 1376–80. Дои:10.1126 / science.7973727. PMID  7973727.
18. Чен ИТ, Смит М.Л., О'Коннор П.М., Форнейс А.Дж. (ноябрь 1995 г.). «Прямое взаимодействие Gadd45 с PCNA и свидетельства конкурентного взаимодействия Gadd45 и p21Waf1 / Cip1 с PCNA». Онкоген. 11 (10): 1931–7. PMID  7478510.
19. Вайрапанди М., Азам Н., Баллиет А.Г., Хоффман Б., Либерманн Д.А. (июнь 2000 г.). «Характеристика MyD118, Gadd45 и доменов, взаимодействующих с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA). PCNA препятствует MyD118 И Gadd45-опосредованному отрицательному контролю роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16810–9. Дои:10.1074 / jbc.275.22.16810. PMID  10828065.
20. Холл PA, Кирси JM, Коутс PJ, Norman DG, Warbrick E, Cox LS (июнь 1995 г.). «Характеристика взаимодействия между PCNA и Gadd45». Онкоген. 10 (12): 2427–33. PMID  7784094.

дальнейшее чтение

• Хильдесхайм Дж, Форнас А. Дж. (2003). «Gadd45a: неуловимый, но привлекательный ген-кандидат при раке поджелудочной железы». Clin. Рак Res. 8 (8): 2475–9. PMID  12171872.
• Чен ИТ, Смит М.Л., О'Коннор П.М., Форнас А.Дж. (1995). «Прямое взаимодействие Gadd45 с PCNA и свидетельства конкурентного взаимодействия Gadd45 и p21Waf1 / Cip1 с PCNA». Онкоген. 11 (10): 1931–7. PMID  7478510.
• Кирси Дж. М., Коутс П. Дж., Прескотт А. Р. и др. (1995). «Gadd45 - это белок, регулируемый ядерным клеточным циклом, который взаимодействует с p21Cip1». Онкоген. 11 (9): 1675–83. PMID  7478594.
• Холл П.А., Кирси Дж. М., Коутс П. Дж. И др. (1995). «Характеристика взаимодействия между PCNA и Gadd45». Онкоген. 10 (12): 2427–33. PMID  7784094.
• Carrier F, Smith ML, Bae I, et al. (1995). «Характеристика человеческого Gadd45, белка, регулируемого р53». J. Biol. Chem. 269 (51): 32672–7. PMID  7798274.
• Смит М.Л., Чен И.Т., Чжан Кью и др. (1994). «Взаимодействие p53-регулируемого белка Gadd45 с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Наука. 266 (5189): 1376–80. Дои:10.1126 / science.7973727. PMID  7973727.
• Варбрик Э., Лейн Д.П., Гловер Д.М., Кокс Л.С. (1997). «Гомологичные области Fen1 и p21Cip1 конкурируют за связывание с одним и тем же сайтом на PCNA: потенциальный механизм для координации репликации и репарации ДНК». Онкоген. 14 (19): 2313–21. Дои:10.1038 / sj.onc.1201072. PMID  9178907.
• Warbrick E, Хезерингтон W, Lane DP, Glover DM (1998). «PCNA-связывающие белки в Drosophila melanogaster: анализ консервативного связывающего домена PCNA». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (17): 3925–32. Дои:10.1093 / nar / 26.17.3925. ЧВК  147798. PMID  9705499.
• Такекава М., Сайто Х (1998). «Семейство стресс-индуцируемых GADD45-подобных белков опосредует активацию стресс-зависимого MTK1 / MEKK4 MAPKKK». Ячейка. 95 (4): 521–30. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81619-0. PMID  9827804.
• Carrier F, Georgel PT, Pourquier P и др. (1999). «Gadd45, стрессовый белок, чувствительный к р53, изменяет доступность ДНК на поврежденном хроматине». Мол. Cell. Биол. 19 (3): 1673–85. Дои:10.1128 / MCB.19.3.1673. ЧВК  83961. PMID  10022855.
• Zhan Q, Antinore MJ, Wang XW и др. (1999). «Ассоциация с Cdc2 и ингибирование активности киназы Cdc2 / Cyclin B1 с помощью p53-регулируемого белка Gadd45». Онкоген. 18 (18): 2892–900. Дои:10.1038 / sj.onc.1202667. PMID  10362260.
• Джин С., Антиноре М.Дж., Лунг Ф.Д. и др. (2000). «Ингибирование GADD45 киназы Cdc2 коррелирует с GADD45-опосредованным подавлением роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16602–8. Дои:10.1074 / jbc.M000284200. PMID  10747892.
• Вайрапанди М., Азам Н., Баллиет А.Г. и др. (2000). «Характеристика MyD118, Gadd45 и доменов, взаимодействующих с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA). PCNA препятствует MyD118 И Gadd45-опосредованному отрицательному контролю роста». J. Biol. Chem. 275 (22): 16810–9. Дои:10.1074 / jbc.275.22.16810. PMID  10828065.
• Йи Ю.В., Ким Д., Юнг Н. и др. (2000). «Белки семейства Gadd45 являются коактиваторами рецепторов ядерных гормонов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 272 (1): 193–8. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2760. PMID  10872826.
• Чжао Х., Цзинь С., Антиноре М.Дж. и др. (2000). «Центральная область Gadd45 необходима для его взаимодействия с p21 / WAF1». Exp. Cell Res. 258 (1): 92–100. Дои:10.1006 / exc.2000.4906. PMID  10912791.
• Ян К., Маниконе А., Курсен Дж. Д. и др. (2001). «Идентификация функционального домена в GADD45-опосредованной контрольной точке G2 / M». J. Biol. Chem. 275 (47): 36892–8. Дои:10.1074 / jbc.M005319200. PMID  10973963.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Ковальский O, Lung FD, Roller PP, Fornace AJ (2001). «Олигомеризация человеческого белка Gadd45a». J. Biol. Chem. 276 (42): 39330–9. Дои:10.1074 / jbc.M105115200. PMID  11498536.

внешние ссылки

• СМИ, связанные с GADD45A в Wikimedia Commons