Область холодного шока - Cold-shock domain
| CSD | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура раствора одноцепочечного ДНК-связывающего домена холодного шока (csd) человеческого y-бокса белка 1 (yb1), определенная с помощью ЯМР (10 низкоэнергетических структур) | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | CSD | ||||||||
| Pfam | PF00313 | ||||||||
| Pfam клан | CL0021 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002059 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00304 | ||||||||
| SCOP2 | 1mjc / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CDD | cd04458 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии область холодного шока (CSD) это белковый домен около 70 аминокислоты который был найден в прокариотический и эукариотический ДНК переплет белки.[1][2][3] Часть этого домена очень похожа на RNP-1. РНК переплет мотив.[4]
Когда кишечная палочка подвергается перепаду температуры с 37 до 10 градусов Цельсия, наступает фаза лага на 4–5 часов, после чего рост возобновляется по сокращенному ставка.[5] Во время лаг-фазы экспрессия примерно 13 белков, содержащих домены холодного шока, увеличивается в 2-10 раз.[6] Эти так называемыехолодный шок ' белки Считается, что помогают клетке выжить в температуры ниже оптимальной температуры роста, в отличие от тепловой удар белки, которые помогают клетка выжить при температурах выше оптимальных, возможно, за счет конденсации хромосома и организация прокариотический нуклеоид.[5]
Рекомендации
- ^ Донигер Дж., Ландсман Д., Гонда М.А., Вистоу Г. (апрель 1992 г.). «Продукт unr, высококонсервативного гена перед N-ras, содержит множество повторов, подобных домену холодового шока (CSD), предполагаемому ДНК-связывающему мотиву». Новый Биол. 4 (4): 389–95. PMID 1622933.
- ^ Wistow G (апрель 1990 г.). «Холодовой шок и связывание ДНК». Природа. 344 (6269): 823–4. Дои:10.1038 / 344823c0. PMID 2184368. S2CID 4307500.
- ^ Джонс П.Г., Иноуе М. (март 1994 г.). «Реакция на холодовой шок - горячая тема». Мол. Микробиол. 11 (5): 811–8. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1994.tb00359.x. PMID 8022259.
- ^ Ландсман Д. (июнь 1992 г.). «РНП-1, РНК-связывающий мотив, консервативен в ДНК-связывающем домене холодового шока». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (11): 2861–4. Дои:10.1093 / nar / 20.11.2861. ЧВК 336933. PMID 1614871.
- ^ а б Обоката Дж., Оме М., Хаясида Н. (октябрь 1991 г.). «Нуклеотидная последовательность клона кДНК, кодирующего предполагаемый богатый глицином белок массой 19,7 кДа у Nicotiana sylvestris». Завод Мол. Биол. 17 (4): 953–5. Дои:10.1007 / bf00037080. PMID 1912512. S2CID 11927654.
- ^ Тафури С.Р., Вольф А.П. (ноябрь 1990 г.). «Факторы транскрипции Xenopus Y-box: молекулярное клонирование, функциональный анализ и регуляция развития». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (22): 9028–32. Дои:10.1073 / пнас.87.22.9028. ЧВК 55094. PMID 2247479.