Белковый домен VHS - VHS protein domain
| VHS | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура тандемных доменов vhs и fyve hrs, белка, участвующего в мембранном переносе и передаче сигнала | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | VHS | ||||||||
| Pfam | PF00790 | ||||||||
| Pfam клан | CL0009 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002014 | ||||||||
| УМНАЯ | VHS | ||||||||
| SCOP2 | 1елк / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии VHS белковый домен примерно 140 остатки длинный. Его имя акроним происходит от его появления в VПС-27, ЧАСRS и SТАМ. Это домен, обычно встречающийся в N-конец многих белков.[1]
Функция
Домены VHS считаются очень важными в везикулярном переносе, в частности, в содействии нацеливанию на мембраны и роли распознавания грузов.[1]
Структура
Разрешение кристалла структура домена VHS Дрозофила Hrs и человек Tom1 показали, что он состоит из восьми спирали расположены в виде двухслойной суперспирали.[2] Существование консервированный участки остатки на поверхности домена свидетельствует о том, что VHS домены может быть вовлечен в белок-протеин распознавание и стыковка. Общий, последовательность сходство среди членов семейства доменов низкое (около 25%).
Классификация
По регионам, окружающим домен, VHS-белки можно разделить на 4 группы:[1]
- STAM / EAST / Hbp, которые все разделяют состав домена VHS-SH3-ITAM и несут один или два убиквитин-взаимодействующие мотивы
- Белки с FYVE домен (ИНТЕРПРО ) C-конец к VHS, который также несет один или два мотива, взаимодействующих с убиквитином
- Белки GGA с доменным составом VHS-GAT (GGA и Tom1) гомология домен
- Домен VHS сам по себе или в комбинации с доменами, отличными от перечисленных выше. Домен VHS всегда находится на N-конце белков, что позволяет предположить, что такая топология важна для функционирования. Домен считается имеющим общий мембрана роль наведения / распознавания груза в везикулярный торговля людьми.[3]
Рекомендации
- ^ а б c Лохи О, Пуссу А, Мао Й, Куиочо Ф, Лехто В.П. (2002). «Домен VHS - грузчик пузырьковых линий». FEBS Lett. 513 (1): 19–23. Дои:10.1016 / s0014-5793 (01) 03287-2. PMID 11911875. S2CID 10894998.
- ^ Мао Ю., Никитенко А., Дуан Х, Ллойд Т.Э., Ву М.Н., Беллен Х., Куиочо Ф.А. (февраль 2000 г.). «Кристаллическая структура тандемных доменов VHS и FYVE Hrs, белка, участвующего в мембранном переносе и передаче сигнала». Клетка. 100 (4): 447–56. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80680-7. PMID 10693761. S2CID 4979735.
- ^ Мисра С., Бич Б.М., Херли Дж. Х. (сентябрь 2000 г.). «Структура домена VHS человека Tom1 (мишень myb 1): понимание взаимодействий с белками и мембранами». Биохимия. 39 (37): 11282–90. Дои:10.1021 / bi0013546. PMID 10985773.