Tubby протеин - Tubby protein

Табби Протеин
Табби-1c8z-pymol.png
Бактериальный белок, экспрессируемый в мозге мыши
Идентификаторы
СимволВанна
PfamPF01167
ИнтерПроIPR000007
PROSITEPDOC00923
SCOP21c8z / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство104
Белок OPM1i7e

В толстый белок кодируется ВАННА ген. Это восходящий поток клеточная сигнализация белок общий для многоклеточных эукариоты. Первый толстый ген был идентифицирован в мышей, и белки, которые гомологичный to tubby известны как «тубби-подобные белки» (TULP). У них есть общие и характерные третичная структура который состоит из бета-баррель упакованы вокруг альфа спираль в центральной поре. Ген получил свое название от его роли в метаболизме; у мышей с мутированным геном tubby развивается отсроченное начало ожирение, нейросенсорная потеря слуха и дегенерация сетчатки.[1][2][3]

Структура

Tubby белки классифицируются как α + β белки и имеют 12-бета-мель ствол, окружающий центральную альфа-спираль. Белки Tubby могут связывать маленькие клеточная сигнализация молекула фосфатидилинозитол, который обычно локализуется в клеточная мембрана. Подобная структурная складка для Tubby-подобных белков была идентифицирована в Scramblase семейство белков.[4]

Функция

Белки Tubby были задействованы как факторы транскрипции[5] и как потенциальные сигнальные факторы, связанные с G-белок Мероприятия.[6] Они связаны с нейронный дифференциация и разработка, И в млекопитающие вовлечены в три болезненных процесса, когда мутировавший: ожирение, сетчатка вырождение и потеря слуха.[5] Известно, что у мышей мутации в белках тубби влияют на срок жизни и толстый место хранения[7] а также углевод метаболизм.[8] Трубчатые домены связаны с цитоплазматической стороной клеточные мембраны путем связывания различных фосфоинозитиды[9]

Белки человека, содержащие этот домен

ВАННА; TULP1; TULP2; TULP3; TULP4;

внешняя ссылка

Рекомендации

  1. ^ Нобен-Траут, К .; Naggert, J. K .; North, M. A .; Нишина П. М. (1996). «Ген-кандидат на мутацию мышей тубби». Природа. 380 (6574): 534–538. Bibcode:1996Натура.380..534Н. Дои:10.1038 / 380534a0. PMID  8606774. S2CID  4272027.
  2. ^ Kleyn, P.W .; Fan, W .; Ковац, С.Г .; Ли, Дж. Дж .; Pulido, J.C .; Wu, Y .; Berkemeier, L.R .; Misumi, D. J .; Holmgren, L .; Шарлат, O .; Вульф, Э. А .; Тайбер, О .; Броды, Т .; Shu, P .; Hawkins, F .; Кеннеди, Б .; Baldini, L .; Ebeling, C .; Альперин, Г. Д .; Дело, J .; Lakey, N.D .; Culpepper, J .; Chen, H .; Glücksmann-Kuis, M.A .; Карлсон, Г. А .; Дуйк, Г. М .; Мур, К. Дж. (1996). «Идентификация и характеристика тубби гена ожирения мыши: член нового семейства генов». Клетка. 85 (2): 281–290. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81104-6. PMID  8612280. S2CID  15670925.
  3. ^ Олемиллер, К.К .; Хьюз, РМ; Мосингер-Огилви, Дж; Speck, JD; Grosof, DH; Сильверман, MS (1995). «Дегенерация улитки и сетчатки у пузатых мышей». NeuroReport. 6 (6): 845–9. Дои:10.1097/00001756-199504190-00005. PMID  7612867. S2CID  8311280.
  4. ^ Бейтман А., Финн Р. Д., Симс П. Дж., Видмер Т., Бигерт А., Сёдинг Дж. (Январь 2009 г.). «Фосфолипидные скрамблазы и Tubby-подобные белки принадлежат к новому суперсемейству связанных с мембраной факторов транскрипции». Биоинформатика. 25 (2): 159–62. Дои:10.1093 / биоинформатика / btn595. ЧВК  2639001. PMID  19010806.
  5. ^ а б Боггон, TJ; Шан, WS; Сантагата, S; Майерс, Южная Каролина; Шапиро, L (1999). «Влияние белков табби в качестве факторов транскрипции с помощью функционального анализа на основе структуры». Наука. 286 (5447): 2119–25. Дои:10.1126 / science.286.5447.2119. PMID  10591637.
  6. ^ Кэрролл, К; Гомес, К; Шапиро, Л. (2004). «Толстые белки: сюжет утолщается». Нат Рев Мол Cell Biol. 5 (1): 55–63. Дои:10.1038 / nrm1278. PMID  14708010. S2CID  7065010.
  7. ^ Мухопадхьяй, А; Депланке, В; Walhout, AJ; Тиссенбаум, HA (2005). «C. elegans tubby регулирует продолжительность жизни и накопление жира с помощью двух независимых механизмов». Cell Metab. 2 (1): 35–42. Дои:10.1016 / j.cmet.2005.06.004. PMID  16054097.
  8. ^ Ван, Y; Себурн, К; Bechtel, L; Ли, BY; Szatkiewicz, JP; Нишина, ПМ; Наггерт, Дж. К. (2006). «Нарушение углеводного обмена у мышей, гомозиготных по мутации tubby». Physiol Genomics. 27 (2): 131–40. Дои:10.1152 / физиолгеномика.00239.2005. PMID  16849632.
  9. ^ Чо, В., Стахелин, Р.В. (Июнь 2005 г.). «Мембранно-белковые взаимодействия в клеточной передаче сигналов и мембранном переносе». Ежегодный обзор биофизики и структуры биомолекул. 34: 119–151. Дои:10.1146 / annurev.biophys.33.110502.133337. PMID  15869386.