Собемовирус - Sobemovirus
| Собемовирус | |
|---|---|
 | |
| Геном вируса мозаики сесбании | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Учебный класс: | Pisoniviricetes |
| Заказ: | Собеливиралес |
| Семья: | Solemoviridae |
| Род: | Собемовирус |
Собемовирус это род вирусы. Растения служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роду 14 видов, включая типовые виды. Вирус мозаики южной фасоли. Заболевания, связанные с этим родом, включают: мозаику и крапинки.[1][2]
Структура
Вирусы Sobemovirus не имеют оболочки, имеют форму икосаэдра и симметрию T = 3. Диаметр около 30 нм.[1]
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Собемовирус | Икосаэдр | Т = 3 | Без оболочки | Линейный | Одночастный |
Геном
В геном представляет собой цельный кусок линейного, одноцепочечного, одноцепочечного РНК, 4100–5700 нуклеотиды в длину.[3] Геном кодирует пять открытых рамок считывания: ORF1, ORF 2a и 2b, ORF3 и ORFx.[4]
ORF1 кодирует P1, который играет роль в подавлении сайленсинга и движения вируса.
ORF 2a и 2b кодируют репликационные полипротеины P2a и P2ab. Трансляция ORF2a из геномной РНК зависит от механизма дырявого сканирования.[нужна цитата ]
ORF3 кодирует белок оболочки.[нужна цитата ]
ORFx консервативен у всех собемовирусов. Он перекрывает 5'-конец ORF2a в рамке считывания +2, а также простирается на некоторое расстояние выше ORF2a. В нем отсутствует инициирующий кодон AUG, и его экспрессия, по прогнозам, зависит от низкого уровня инициации в близких к родственных не-AUG кодонах, таких как CUG, частью рибосом, которые сканируют область между инициирующими кодонами ORF1 и ORF2a. Его функция неизвестна, но, по-видимому, важна для заражения.[нужна цитата ]
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Вхождение в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит за счет «утечки» сканирования и сдвига рамки рибосомы -1. Вирус покидает клетку-хозяина за счет движения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через вектор (CFMV: насекомые). Пути передачи являются векторными и семенными.[1]
| Род | Детали хоста | Тканевый тропизм | Детали входа | Детали выпуска | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача инфекции |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Собемовирус | Растения | Никто | Проникновение | Вирусное движение | Цитоплазма | Цитоплазма | Вектор, Семенной |
Таксономия
В род входят:
- Вирус черники
- Вирус крапчатости ежи
- Вирус желтой крапинки Imperata
- Вирус транзиторной полосы люцерны
- Смертельный вирус пожелтения папайи
- Вирус желтой крапчатости риса
- Вирус крапчатости Райграсс
- Вирус мозаики Сесбании
- Вирус крапчатости Solanum nodiflorum
- Вирус мозаики южной фасоли
- Вирус южной мозаики вигны
- Вирус мозаики Соубейн
- Вирус крапчатости клевера подземного
- Вирус розетки репы
- Вирус бархатной крапчатости табака
Рекомендации
- ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
- ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 15 июн 2015.
- ^ Индекс вирусов - Sobemovirus (2006). В: ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 4. Бюхен-Осмонд, К. (Эд), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.[страница нужна ]
- ^ Линг, Роджер; Пэйт, Эдриен Э; Карр, Джон П.; Ферт, Эндрю Э (2013). «Важная открытая рамка считывания пятой кодировки в собемовирусах». Вирусология. 446 (1–2): 397–408. Дои:10.1016 / j.virol.2013.05.033. ЧВК 3791421. PMID 23830075.