SOD3 - SOD3

SOD3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2JLP
Идентификаторы
Псевдонимы	SOD3, EC-SOD, супероксиддисмутаза 3, внеклеточная, супероксиддисмутаза 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 185490 MGI: 103181 ГомолоГен: 2334 Генные карты: SOD3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4п15.2 Начинать 24,789,912 бп[1] Конец 24,800,842 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гепарина • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • антиоксидантная активность • GO: 0001948 связывание с белками • оксидоредуктазная активность • связывание ионов меди • активность супероксиддисмутазы • активность шаперона меди супероксиддисмутазы Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточный матрикс • Просвет Гольджи • внеклеточная экзосома • ядро клетки • внеклеточный • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • ответ на гипоксию • реакция на ион меди • ответ на окислительный стресс • окислительно-восстановительный процесс • супероксидный метаболический процесс • клеточный ответ на окислительный стресс • удаление супероксидных радикалов • клеточная детоксикация окислителей • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6649	20657
Ансамбль	ENSG00000109610	ENSMUSG00000072941
UniProt	P08294	O09164
RefSeq (мРНК)	NM_003102	NM_011435
RefSeq (белок)	NP_003093	NP_035565
Расположение (UCSC)	Chr 4: 24,79 - 24,8 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Внеклеточная супероксиддисмутаза [Cu-Zn] является фермент что в люди кодируется SOD3 ген.

Этот ген кодирует член супероксиддисмутаза (SOD) семейство белков. SOD антиоксидант ферменты который катализировать в дисмутация из двух супероксид радикалы в пероксид водорода и кислород. Считается, что продукт этого гена защищает мозг, легкие, и другие ткани из окислительный стресс. Белок секретируется в внеклеточное пространство и образует гликозилированный гомотетрамер который привязан к внеклеточный матрикс (ECM) и клеточные поверхности через взаимодействие с гепарансульфат протеогликан и коллаген. Часть белка расщепляется около C-конец перед секрецией для образования циркулирующих тетрамеров, которые не взаимодействуют с ЕСМ.^[4]

Среди черные садовые муравьи (Ласиус нигер), продолжительность жизни королевы на порядок больше, чем у рабочих, несмотря на отсутствие систематических различий в нуклеотидных последовательностях между ними.^[5] В SOD3 Было обнаружено, что ген является наиболее дифференциально сверхэкспрессируемым геном в мозге королевы и рабочих муравьев. Это открытие повышает вероятность того, что антиоксидантная активность SOD3 играет ключевую роль в поразительном долголетии социальных маток насекомых.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109610 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Энтрез Ген: супероксиддисмутаза 3 SOD3, внеклеточный».
5. Лукас Э. Р., Келлер Л. Повышенная экспрессия генов старения и иммунитета у королев черных садовых муравьев. Exp Gerontol. 2018 15 июля; 108: 92-98. DOI: 10.1016 / j.exger.2018.03.020. Epub 2018 3 апреля. PMID: 29625209

дальнейшее чтение

• Зелко И.Н., Мариани Т.Дж., Фольц Р.Дж. (август 2002 г.). «Мультигенное семейство супероксиддисмутазы: сравнение структур, эволюции и экспрессии генов CuZn-SOD (SOD1), Mn-SOD (SOD2) и EC-SOD (SOD3)». Свободная радикальная биология и медицина. 33 (3): 337–49. Дои:10.1016 / S0891-5849 (02) 00905-X. PMID  12126755.
• Фарачи FM, Дидион SP (август 2004 г.). «Защита сосудов: изоформы супероксиддисмутазы в стенке сосуда». Артериосклероз, тромбоз и биология сосудов. 24 (8): 1367–73. Дои:10.1161 / 01.ATV.0000133604.20182.cf. PMID  15166009.
• Адачи Т., Охта Х, Ямада Х, Футенма А, Като К., Хирано К. (ноябрь 1992 г.). «Количественный анализ внеклеточной супероксиддисмутазы в сыворотке и моче с помощью ELISA с моноклональными антителами». Clinica Chimica Acta; Международный журнал клинической химии. 212 (3): 89–102. Дои:10.1016 / 0009-8981 (92) 90176-Q. PMID  1477980.
• Адачи Т., Охта Х, Хаяши К., Хирано К., Марклунд С.Л. (сентябрь 1992 г.). «Сайт неферментативного гликирования внеклеточной супероксиддисмутазы человека in vitro». Свободная радикальная биология и медицина. 13 (3): 205–10. Дои:10.1016 / 0891-5849 (92) 90016-А. PMID  1505778.
• Marklund SL (февраль 1990 г.). «Экспрессия внеклеточной супероксиддисмутазы линиями клеток человека». Биохимический журнал. 266 (1): 213–9. Дои:10.1042 / bj2660213. ЧВК  1131117. PMID  2106874.
• Хендриксон DJ, Фишер JH, Джонс C, Хо YS (декабрь 1990). «Региональная локализация гена внеклеточной супероксиддисмутазы человека на 4pter-q21». Геномика. 8 (4): 736–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90264-У. PMID  2276747.
• Hjalmarsson K, Marklund SL, Engström A, Edlund T (сентябрь 1987 г.). «Выделение и последовательность комплементарной ДНК, кодирующей внеклеточную супероксиддисмутазу человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 84 (18): 6340–4. Дои:10.1073 / пнас.84.18.6340. ЧВК  299071. PMID  3476950.
• Марклунд С.Л. (октябрь 1984 г.). «Внеклеточная супероксиддисмутаза в тканях человека и линиях клеток человека». Журнал клинических исследований. 74 (4): 1398–403. Дои:10.1172 / JCI111550. ЧВК  425307. PMID  6541229.
• Ямада Х., Ямада Й., Адачи Т., Гото Х., Огасавара Н., Футенма А., Китано М., Хирано К., Като К. (июнь 1995 г.). «Молекулярный анализ гена внеклеточной супероксиддисмутазы, связанный с высоким уровнем в сыворотке». Японский журнал генетики человека. 40 (2): 177–84. Дои:10.1007 / BF01883574. PMID  7662997.
• Фольц Р.Дж., Крапо Д.Д. (июль 1994 г.). «Внеклеточная супероксиддисмутаза (SOD3): тканеспецифическая экспрессия, геномная характеристика и компьютерный анализ последовательности гена EC SOD человека». Геномика. 22 (1): 162–71. Дои:10.1006 / geno.1994.1357. PMID  7959763.
• Сандстрём Дж., Нильссон П., Карлссон К., Марклунд С.Л. (июль 1994 г.). «10-кратное увеличение содержания внеклеточной супероксиддисмутазы в плазме человека, вызванное мутацией в гепарин-связывающем домене». Журнал биологической химии. 269 (29): 19163–6. PMID  8034674.
• Адачи Т., Ямада Х., Ямада Й., Морихара Н., Ямазаки Н., Мураками Т., Футенма А., Като К., Хирано К. (январь 1996 г.). «Замена глицина на аргинин-213 во внеклеточной супероксиддисмутазе снижает сродство к гепарину и поверхности эндотелиальных клеток». Биохимический журнал. 313 (Pt 1) (1): 235–9. Дои:10.1042 / bj3130235. ЧВК  1216888. PMID  8546689.
• Ури Т.Д., Крапо Дж. Д., Вальникова З., Энгильд Дж. Дж. (Июль 1996 г.). «Внеклеточная супероксиддисмутаза человека представляет собой тетрамер, состоящий из двух дисульфидно-связанных димеров: упрощенная высокопроизводительная очистка внеклеточной супероксиддисмутазы». Биохимический журнал. 317 (Pt 1) (1): 51–7. Дои:10.1042 / bj3170051. ЧВК  1217485. PMID  8694786.
• Адачи Т., Морихара Н., Ямазаки Н., Ямада Х., Футенма А., Като К., Хирано К. (июль 1996 г.). «Мутация аргинина-213 в глицин во внеклеточной супероксиддисмутазе человека снижает восприимчивость к трипсиноподобным протеиназам». Журнал биохимии. 120 (1): 184–8. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021383. PMID  8864862.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Энгильд Дж. Дж., Тогерсен И. Б., Ури Т. Д., Вальникова З., Хойруп П., Крапо Дж. Д. (май 1999 г.). «Гепарин-связывающий домен внеклеточной супероксиддисмутазы протеолитически процессируется внутриклеточно во время биосинтеза». Журнал биологической химии. 274 (21): 14818–22. Дои:10.1074 / jbc.274.21.14818. PMID  10329680.
• Bowler RP, Nicks M, Olsen DA, Thøgersen IB, Valnickova Z, Højrup P, Franzusoff A, Enghild JJ, Crapo JD (май 2002 г.). «Фурин протеолитически обрабатывает гепарин-связывающий участок внеклеточной супероксиддисмутазы». Журнал биологической химии. 277 (19): 16505–11. Дои:10.1074 / jbc.M105409200. PMID  11861638.
• Ямамото М., Хара Х, Адачи Т. (август 2002 г.). «Экспрессия внеклеточной супероксиддисмутазы увеличивается за счет лизофосфатидилхолина в моноцитарных клетках U937 человека». Атеросклероз. 163 (2): 223–8. Дои:10.1016 / S0021-9150 (02) 00007-2. PMID  12052468.
• Серра В., фон Зглиницки Т., Лоренц М., Сарецки Г. (февраль 2003 г.). «Внеклеточная супероксиддисмутаза является основным антиоксидантом фибробластов человека и замедляет укорочение теломер». Журнал биологической химии. 278 (9): 6824–30. Дои:10.1074 / jbc.M207939200. PMID  12475988.