SIAH1 - SIAH1

SIAH1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2A25, 4C9Z, 4CA1, 4I7B, 4I7C, 4I7D, 4X3G
Идентификаторы
Псевдонимы	SIAH1, SIAH1A, siah E3 убиквитин протеин лигаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602212 MGI: 108064 ГомолоГен: 20654 Генные карты: SIAH1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q12.1 Начинать 48,356,364 бп[1] Конец 48,448,402 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 C3 | 8 42,1 см Начинать 86,724,007 бп[2] Конец 86,745,934 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • идентичное связывание с белками • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов цинка • трансферазная активность • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание с С-концом белка • связывание конъюгированного с убиквитином фермента Сотовый компонент • комплекс разрушения бета-катенина • цитоплазма • ядро клетки • ранняя эндосома • цитозоль • клеточная мембрана Биологический процесс • клеточный цикл • сперматогенез • управление аксоном • метаболический процесс клеточного белка • развитие многоклеточного организма • морфогенез анатомической структуры • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути • апоптотический процесс • белковый катаболический процесс • положительная регуляция апоптотического процесса • развитие нервной системы • убиквитинирование белков • дифференциация клеток • полиубиквитинирование белков • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • дестабилизация белков • апоптотический процесс нейрона • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • отрицательная регуляция сигнального пути, активируемого нетрином Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6477	20437
Ансамбль	ENSG00000196470	ENSMUSG00000036840
UniProt	Q8IUQ4	P61092
RefSeq (мРНК)	NM_001006610 NM_003031	NM_009172
RefSeq (белок)	NP_001006611 NP_003022	NP_033198
Расположение (UCSC)	Chr 16: 48.36 - 48.45 Мб	Chr 8: 86,72 - 86,75 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза SIAH1 является фермент что у людей кодируется SIAH1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует структуру полипептида, который является членом семейства семи заочно гомологов (SIAH). Белок - это E3 лигаза и участвует в убиквитинирование и протеасома -опосредованная деградация определенных белков. Активность этой убиквитинлигазы была вовлечена в развитие определенных форм болезнь Паркинсона, регуляция клеточного ответа на гипоксия и индукция апоптоз. Альтернативная сварка приводит к нескольким дополнительным вариантам транскрипта, некоторые из которых кодируют разные изоформы, а другие не были полностью охарактеризованы.^[7]

Взаимодействия

Было показано, что SIAH1 взаимодействовать с:

• APC,^[8]
• BAG1,^[9]
• CACYBP,^[10]
• KHDRBS3,^[11][12]
• KIF22,^[13]
• ОНЕМЕВШИЙ,^[14]
• ПЭГ10,^[15]
• ПЭГ3^[16]
• POU2AF1,^[17]
• RBBP8,^[18] и
• TRIB3.^[19]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196470 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036840 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ху Г., Чанг Ю.Л., Гловер Т., Валентин В., Look AT, Fearon ER (ноябрь 1997 г.). «Характеристика человеческих гомологов дрозофилы seven in absentia (sina)». Геномика. 46 (1): 103–11. Дои:10.1006 / geno.1997.4997. PMID  9403064.
6. Ху Г, Чжан С., Видал М., Баер Дж. Л., Сюй Т., Фирон ER (октябрь 1997 г.). «Семь гомологов млекопитающих заочно регулируют DCC посредством пути убиквитин-протеасома». Гены и развитие. 11 (20): 2701–14. Дои:10.1101 / gad.11.20.2701. ЧВК  316613. PMID  9334332.
7. "Entrez Gene: SIAH1 семь заочно гомологов 1 (Drosophila)".
8. Лю Дж., Стивенс Дж., Роте CA, Йост Х. Дж., Ху Й., Нойфельд К.Л., Уайт Р.Л., Мацунами Н. (май 2001 г.). «Siah-1 опосредует новый путь деградации бета-катенина, связывающий p53 с белком аденоматозного полипоза coli». Молекулярная клетка. 7 (5): 927–36. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00241-6. PMID  11389840.
9. Мацузава С., Такаяма С., Фроеш Б.А., Сапата Дж. М., Рид Дж. С. (май 1998 г.). "p53-индуцируемый человеческий гомолог Drosophila seven in absentia (Siah) ингибирует рост клеток: подавление BAG-1". Журнал EMBO. 17 (10): 2736–47. Дои:10.1093 / emboj / 17.10.2736. ЧВК  1170614. PMID  9582267.
10. Мацузава С.И., Рид Дж.С. (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi совместно работают над новым путем деградации бета-катенина, связанной с ответами p53». Молекулярная клетка. 7 (5): 915–26. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID  11389839.
11. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
12. Венейблс Дж. П., Дэлглиш С., Паронетто М. П., Скитт Л., Торнтон Дж. К., Сондерс П. Т., Сетте С., Джонс К. Т., Эллиотт Д. Д. (июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека. 13 (14): 1525–34. Дои:10,1093 / hmg / ddh165. PMID  15163637.
13. Germani A, Bruzzoni-Giovanelli H, Fellous A, Gisselbrecht S, Varin-Blank N, Calvo F (декабрь 2000 г.). «SIAH-1 взаимодействует с альфа-тубулином и разрушает кинезин Kid протеасомным путем во время митоза». Онкоген. 19 (52): 5997–6006. Дои:10.1038 / sj.onc.1204002. PMID  11146551.
14. Susini L, Passer BJ, Amzallag-Elbaz N, Juven-Gershon T., Prieur S, Privat N, Tuynder M, Gendron MC, Israël A, Amson R, Oren M, Telerman A (декабрь 2001 г.). «Сиах-1 связывает и регулирует функцию Numb». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (26): 15067–72. Дои:10.1073 / pnas.261571998. ЧВК  64984. PMID  11752454.
15. Окабе Х., Сато С., Фурукава Ю., Като Т., Хасегава С., Накадзима Ю., Ямаока Ю., Накамура И. (июнь 2003 г.). «Участие PEG10 в гепатоцеллюлярном канцерогенезе человека через взаимодействие с SIAH1». Исследования рака. 63 (12): 3043–8. PMID  12810624.
16. Relaix F, Wei Xj, Li W, Pan J, Lin Y, Bowtell DD, Sassoon DA, Wu X (февраль 2000 г.). «Pw1 / Peg3 является потенциальным медиатором клеточной смерти и взаимодействует с Siah1a при p53-опосредованном апоптозе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (5): 2105–10. Дои:10.1073 / pnas.040378897. ЧВК  15761. PMID  10681424.
17. Тидт Р., Бартольди Б.А., Маттиас Г., Ньюэлл Дж. В., Маттиас П. (август 2001 г.). «Белок RING finger Siah-1 регулирует уровень транскрипционного коактиватора OBF-1». Журнал EMBO. 20 (15): 4143–52. Дои:10.1093 / emboj / 20.15.4143. ЧВК  149178. PMID  11483517.
18. Германи А., Прабель А., Моура С., Подгорняк М. П., Ди Карло А., Эрлих Р., Гиссельбрехт С., Варин-Бланк Н., Кальво Ф., Бруццони-Джованелли Х (декабрь 2003 г.). «SIAH-1 взаимодействует с CtIP и способствует его деградации протеасомным путем». Онкоген. 22 (55): 8845–51. Дои:10.1038 / sj.onc.1206994. PMID  14654780.
19. Чжоу Ю., Ли Л., Лю Цюй, Син Г, Куай Х, Сунь Дж, Инь Х, Ван Дж, Чжан Л., Хэ Ф (май 2008 г.). «Убиквитинлигаза E3 SIAH1 опосредует убиквитинирование и деградацию TRB3». Сотовая связь. 20 (5): 942–8. Дои:10.1016 / j.cellsig.2008.01.010. PMID  18276110.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Nemani M, Linares-Cruz G, Bruzzoni-Giovanelli H, Roperch JP, Tuynder M, Bougueleret L, Cherif D, Medhioub M, Pasturaud P, Alvaro V, der Sarkissan H, Cazes L, Le Paslier D, Le Gall I, Израильский Д., Дауссе Дж., Сиго Ф., Чумаков И., Орен М., Кальво Ф., Амсон Р. Б., Коэн Д., Телерман А. (август 1996 г.). «Активация человеческого гомолога гена Drosophila sina при апоптозе и подавлении опухоли». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (17): 9039–42. Дои:10.1073 / пнас.93.17.9039. ЧВК  38591. PMID  8799150.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Block KL, Vornlocher HP, Hershey JW (ноябрь 1998 г.). «Характеристика кДНК, кодирующих субъединицы p44 и p35 человеческого фактора инициации трансляции eIF3». Журнал биологической химии. 273 (48): 31901–8. Дои:10.1074 / jbc.273.48.31901. PMID  9822659.
• Ху Г., Фирон ER (январь 1999 г.). «N-концевой RING-домен Siah-1 необходим для функции протеолиза, а С-концевые последовательности регулируют олигомеризацию и связывание с белками-мишенями». Молекулярная и клеточная биология. 19 (1): 724–32. Дои:10.1128 / mcb.19.1.724. ЧВК  83929. PMID  9858595.
• Таникава Дж., Итикава-Ивата Э., Каней-Исии Ч., Накаи А., Мацудзава С., Рид Дж. К., Исии С. (май 2000 г.). «p53 подавляет вызванную c-Myb активацию фактора транскрипции теплового шока 3». Журнал биологической химии. 275 (20): 15578–85. Дои:10.1074 / jbc.M000372200. PMID  10747903.
• Medhioub M, Vaury C, Hamelin R, Thomas G (сентябрь 2000 г.). «Отсутствие соматической мутации в кодирующей последовательности SIAH1 в опухолях, гемизиготных по этому кандидату гена-супрессора опухоли». Международный журнал рака. 87 (6): 794–7. Дои:10.1002 / 1097-0215 ​​(20000915) 87: 6 <794 :: AID-IJC5> 3.0.CO; 2-B. PMID  10956387.
• Мацузава С.И., Рид Дж.С. (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi совместно работают над новым путем деградации бета-катенина, связанной с ответами p53». Молекулярная клетка. 7 (5): 915–26. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID  11389839.
• Бём Дж., Хе Й., Грейнер А., Штаудт Л., Вирт Т. (август 2001 г.). «Регулирование стабильности BOB.1 / OBF.1 компанией SIAH». Журнал EMBO. 20 (15): 4153–62. Дои:10.1093 / emboj / 20.15.4153. ЧВК  149152. PMID  11483518.
• Уиллер Т.С., Чин Л.С., Ли Й, Роудабуш Флорида, Ли Л. (март 2002 г.). «Регулирование деградации синаптофизина семерыми гомологами млекопитающих заочно». Журнал биологической химии. 277 (12): 10273–82. Дои:10.1074 / jbc.M107857200. PMID  11786535.
• Маэда А., Йошида Т., Кусудзаки К., Сакаи Т. (февраль 2002 г.). «Характеристика человеческого промотора Siah-1 (1)». Письма FEBS. 512 (1–3): 223–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 02265-2. PMID  11852084. S2CID  24436936.
• Джармуз А., Честер А., Бейлисс Дж., Гисборн Дж., Данхэм И., Скотт Дж., Наваратнам Н. (март 2002 г.). «Антропоид-специфический локус орфанных C to U ферментов, редактирующих РНК, на хромосоме 22». Геномика. 79 (3): 285–96. Дои:10.1006 / geno.2002.6718. PMID  11863358.