CACYBP - CACYBP

CACYBP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X5M, 2A25, 2A26
Идентификаторы
Псевдонимы	CACYBP, GIG5, S100A6BP, SIP, PNAS-107, кальциклин-связывающий белок
Внешние идентификаторы	OMIM: 606186 MGI: 1270839 ГомолоГен: 7649 Генные карты: CACYBP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q25.1 Начните 174,999,163 бп[1] Конец 175,012,027 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 H2.1 Начните 160,202,367 бп[2] Конец 160,212,875 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность гомодимеризации белков • специфическое связывание белкового домена • связывание убиквитин-протеин-лигазы • связывание тубулина • Связывание с белком S100 Сотовый компонент • просвет ядерной оболочки • внеклеточная экзосома • комплекс разрушения бета-катенина • ядро клетки • нуклеоплазма • проекция нейрона • Тело клетки • цитоплазма • цитозоль • SCF убиквитин-лигазный комплекс Биологический процесс • дифференцировка клеток сердечной мышцы • положительная регуляция репликации ДНК • старение • отрицательная регуляция гибели клеток • клеточный ответ на ион кальция • развитие сердца • ответ на гормон роста • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27101	12301
Ансамбль	ENSG00000116161	ENSMUSG00000014226
UniProt	Q9HB71	Q9CXW3
RefSeq (мРНК)	NM_014412 NM_001007214	NM_009786
RefSeq (белок)	NP_001007215 NP_055227	NP_033916
Расположение (UCSC)	Chr 1: 175 - 175,01 Мб	Chr 1: 160.2 - 160.21 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кальциклин-связывающий белок это белок что у людей кодируется CACYBP ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок, связывающий кальциклин. Он может быть вовлечен в кальций-зависимое убиквитинирование и последующую протеосомную деградацию целевых белков. Вероятно, он служит молекулярным мостиком в комплексах убиквитина E3 и участвует в опосредованной убиквитином деградации бета-катенина. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7]

Белковые взаимодействия

CACYBP был показан взаимодействовать с SKP1A^[8] и SIAH1.^[5]

Комплекс CacyBP / SIP, напротив, известен как часть реакции на стресс, поскольку он взаимодействует с шапероном. HSP90.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116161 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014226 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мацузава С.И., Рид Дж.С. (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в разработке нового пути деградации бета-катенина, связанного с реакциями p53». Молекулярная клетка. 7 (5): 915–26. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID  11389839.
6. Мацузава С., Ли С., Ни Ч.З., Такаяма С., Рид Дж. К., Эли КР (январь 2003 г.). «Структурный анализ Siah1 и его взаимодействия с Siah-взаимодействующим белком (SIP)». Журнал биологической химии. 278 (3): 1837–40. Дои:10.1074 / jbc.M210263200. PMID  12421809.
7. «Ген Entrez: белок, связывающий кальциклин CACYBP».
8. Мацузава С.И., Рид Дж.С. (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в разработке нового пути деградации бета-катенина, связанного с реакциями p53». Молекулярная клетка. 7 (5): 915–26. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00242-8. PMID  11389839.
9. Филипек, Анна; Лесняк, Веслава (29.12.2018). "Актуальный водопользование на удобной функции S100A6 и его лигандов, CacyBP / SIP и Sgt1". Postępy Biochemii (по польски). 64 (3): 242–252. Дои:10.18388 / pb.2018_136. ISSN  0032-5422.

внешняя ссылка

• Человек CACYBP расположение генома и CACYBP страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Филипек А., Ястшебска Б., Новотны М., Квятковская К., Гетман М., Сурмач Л. и др. (Июнь 2002 г.). «Са2 + -зависимая транслокация кальциклин-связывающего белка в нейронах и клетках нейробластомы NB-2a». Журнал биологической химии. 277 (23): 21103–9. Дои:10.1074 / jbc.M111010200. PMID  11927578.
• Лю В.Х., Ву Дж., Чжао З., Чжоу Ю., Пэн XZ, Юань Дж. Г., Цян Б.К. (март 2002 г.). «[Клонирование и экспрессия гена человеческого белка, связывающего кальциклин (hCacyBP)]». Шэн Ву Хуа Сюэ Ю Шэн Ву Ву Ли Сюэ Бао Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 34 (2): 181–6. PMID  12006993.
• Филипек А., Ястшебска Б., Новотны М., Кузницкий Ю. (август 2002 г.). «CacyBP / SIP, кальциклин и белок, взаимодействующий с Siah-1, связывает белки EF-hand семейства S100». Журнал биологической химии. 277 (32): 28848–52. Дои:10.1074 / jbc.M203602200. PMID  12042313.
• Ву Дж, Тан X, Пэн X, Юань Дж, Цян Б. (июль 2003 г.). «Транслокация и фосфорилирование кальциклин-связывающего белка во время индуцированной ретиноевой кислотой нейрональной дифференцировки клеток нейробластомы SH-SY5Y». Журнал биохимии и молекулярной биологии. 36 (4): 354–8. Дои:10.5483 / bmbrep.2003.36.4.354. PMID  12895292.
• Сантелли Э., Леоне М., Ли К., Фукусима Т., Прис, Нью-Йорк, Олсон А.Дж. и др. (Октябрь 2005 г.). «Структурный анализ взаимодействующих белков Siah1-Siah и понимание сборки мультипротеинового комплекса лигазы E3». Журнал биологической химии. 280 (40): 34278–87. Дои:10.1074 / jbc.M506707200. PMID  16085652.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Sun S, Ning X, Liu J, Liu L, Chen Y, Han S и др. (Май 2007 г.). «Сверхэкспрессия CacyBP / SIP приводит к подавлению роста почечно-клеточной карциномы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 356 (4): 864–71. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.03.080. PMID  17400182.