SH3KBP1 - SH3KBP1

SH3KBP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2BZ8, 2K6D, 2K9G, 2O2O, 2YDL, 5ABS, 2N64
Идентификаторы
Псевдонимы	SH3KBP1, CD2BP3, CIN85, GIG10, HSB-1, HSB1, MIG18, домен SH3, содержащий киназо-связывающий белок 1, IMD61, AGMX2
Внешние идентификаторы	OMIM: 300374 MGI: 1889583 ГомолоГен: 10971 Генные карты: SH3KBP1
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp22.12 Начинать 19,533,977 бп[1] Конец 19,887,600 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X F4 Начинать 159,627,272 бп[2] Конец 159,978,069 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка домена SH3 • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитозоль • мембрана • межклеточное соединение • очаговая адгезия • клеточная мембрана • эндоцитарный пузырек • синапс • соединение клеток • проекция нейрона • цитоскелет • мембрана цитоплазматических везикул • цитоплазматический пузырек • цитоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста • эндоцитоз • передача сигналов от клетки к клетке • организация цитоскелета • регулировка формы клеток • миграция клеток • апоптотический процесс • мембранная организация • управление аксоном • организация актиновых филаментов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	30011	58194
Ансамбль	ENSG00000147010	ENSMUSG00000040990
UniProt	Q96B97 Q5JPT2	Q8R550
RefSeq (мРНК)	NM_001024666 NM_001184960 NM_031892 NM_001353890 NM_001353891 NM_001353892 NM_001353893 NM_001353894 NM_001353895 NM_001353897	NM_001135727 NM_001135728 NM_001290661 NM_001290664 NM_021389 NM_001374701
RefSeq (белок)	NP_001019837 NP_001171889 NP_114098 NP_001340819 NP_001340820 NP_001340821 NP_001340822 NP_001340823 NP_001340824 NP_001340826	NP_001129199 NP_001129200 NP_001277590 NP_001277593 NP_067364 NP_001361630
Расположение (UCSC)	Chr X: 19,53 - 19,89 Мб	Chr X: 159.63 - 159.98 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SH3-домен, содержащий киназу-связывающий белок 1 (синонимы - CIN85^[5], у грызунов - Рук^[6]) является адаптерный белок что у людей кодируется SH3KBP1 ген.^[7][8]

Функция

CBL (MIM 165360) конститутивно взаимодействует с белками, содержащими домен SH3, и, при фосфорилировании тирозина, с белками, содержащими домен SH2. Ген SH3KBP1 кодирует CBL-взаимодействующий белок массой 85 кДа, который усиливает апоптотическую гибель клеток, опосредованную фактором некроза опухоли (MIM 191160) (Narita et al., 2001) [предоставлено OMIM].^[9]

Взаимодействия

SH3KBP1 был показан взаимодействовать с Линкер B-клеток,^[10] Grb2,^[11][12] SH3GLB2,^[13][14] SH3GL3,^[13] SH3GL2,^[14] BCAR1,^[10] Рецептор эпидермального фактора роста,^[14][15] CBLB,^[15] Ген cbl,^{[10][12][13][14][15]} SOS1,^[10] CRK^[10] и PAK2.^[16]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000147010 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040990 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. База данных, генокарты Human Gene. «Ген SH3KBP1 - GeneCards | Белок SH3K1 | Антитело SH3K1». www.genecards.org. Получено 2017-12-28.
6. Подагра I, Миддлтон Г., Аду Дж., Нинкина Н.Н., Дробот Л.Б., Филоненко В., Мацука Г., Дэвис А.М., Уотерфилд М., Бухман В.Л. (август 2000 г.). «Отрицательная регуляция PI 3-киназы Ruk, новым адаптерным белком». Журнал EMBO. 19 (15): 4015–25. Дои:10.1093 / emboj / 19.15.4015. ЧВК  306608. PMID  10921882.
7. Хиллиер Л.Д., Леннон Г., Беккер М., Боналдо М.Ф., Чиапелли Б., Чиссо С. и др. (Сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Геномные исследования. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID  8889549.
8. Адамс, доктор медицины, Керлавадж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Булт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Е.Ф., Вайншток К.Г., Гокейн Д.Д., Уайт О. (сентябрь 1995 г.). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF). Природа. 377 (6547 Прил.): 3–174. PMID  7566098.
9. «Ген Entrez: SH3KBP1 SH3-домен киназосвязывающий белок 1».
10. Watanabe S, Take H, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S (ноябрь 2000 г.). «Характеристика адапторного белка CIN85 и идентификация компонентов, участвующих в комплексах CIN85». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 278 (1): 167–74. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3760. PMID  11071869.
11. Подагра I, Миддлтон Г., Аду Дж., Нинкина Н.Н., Дробот Л.Б., Филоненко В., Мацука Г., Дэвис А.М., Уотерфилд М., Бухман В.Л. (август 2000 г.). «Отрицательная регуляция PI 3-киназы Ruk, новым адаптерным белком». Журнал EMBO. 19 (15): 4015–25. Дои:10.1093 / emboj / 19.15.4015. ЧВК  306608. PMID  10921882.
12. Borinstein SC, Hyatt MA, Sykes VW, Straub RE, Lipkowitz S, Boulter J, Bogler O (декабрь 2000 г.). «SETA - это многофункциональный адаптерный белок с тремя доменами SH3, который связывает Grb2, Cbl и новые белки SB1». Сотовая связь. 12 (11–12): 769–79. Дои:10.1016 / S0898-6568 (00) 00129-7. PMID  11152963.
13. Петрелли А., Гилестро Г.Ф., Ланцардо С., Комольо П.М., Мигоне Н., Джордано С. (март 2002 г.). «Комплекс эндофилин-CIN85-Cbl опосредует лиганд-зависимое подавление c-Met». Природа. 416 (6877): 187–90. Дои:10.1038 / 416187a. PMID  11894096.
14. Субейран П., Кованец К., Шимкевич И., Лэнгдон В. Ю., Дикич И. (март 2002 г.). «Комплекс Cbl-CIN85-эндофилин опосредует лиганд-индуцированное подавление рецепторов EGF». Природа. 416 (6877): 183–7. Дои:10.1038 / 416183a. PMID  11894095.
15. Шимкевич И., Кованец К., Субейран П., Динарина А., Липковиц С., Дикич И. (октябрь 2002 г.). «CIN85 участвует в Cbl-b-опосредованном подавлении рецепторных тирозинкиназ». Журнал биологической химии. 277 (42): 39666–72. Дои:10.1074 / jbc.M205535200. PMID  12177062.
16. Куракин А.В., Ву С., Бредесен Д.Е. (сентябрь 2003 г.). «Консенсус об атипичном распознавании доменов CIN85 / SETA / Ruk SH3, выявленный с помощью целевого итеративного скрининга». Журнал биологической химии. 278 (36): 34102–9. Дои:10.1074 / jbc.M305264200. PMID  12829691.

дальнейшее чтение

• Сальваторе П., Ханаш С.Р., Кидо Й., Имаи Ю., Ачили Д. (март 1998 г.). «Идентификация sirm, нового регулируемого инсулином SH3-связывающего белка, который связывается с Grb-2 и FYN». Журнал биологической химии. 273 (12): 6989–97. Дои:10.1074 / jbc.273.12.6989. PMID  9507006.
• Ли Дж., Нисидзава К., Ан В., Хасси Р. Э., Лиалиос Ф. Е., Салгия Р., Сандер-Плассманн Р., Рейнхерц Е. Л. (декабрь 1998 г.). «Cdc15-подобный адаптерный белок (CD2BP1) взаимодействует с цитоплазматическим доменом CD2 и регулирует адгезию, запускаемую CD2». Журнал EMBO. 17 (24): 7320–36. Дои:10.1093 / emboj / 17.24.7320. ЧВК  1171078. PMID  9857189.
• Возьмем H, Watanabe S, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S (февраль 2000 г.). «Клонирование и характеристика нового адапторного белка, CIN85, который взаимодействует с c-Cbl». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 268 (2): 321–8. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2147. PMID  10679202.
• Чен Б., Боринштейн С. К., Гиллис Дж., Сайкс В. В., Боглер О. (июнь 2000 г.). «Связанный с глиомой белок SETA взаимодействует с AIP1 / Alix и ALG-2 и модулирует апоптоз в астроцитах». Журнал биологической химии. 275 (25): 19275–81. Дои:10.1074 / jbc.M908994199. PMID  10858458.
• Подагра I, Миддлтон Г., Аду Дж., Нинкина Н.Н., Дробот Л.Б., Филоненко В., Мацука Г., Дэвис А.М., Уотерфилд М., Бухман В.Л. (август 2000 г.). «Отрицательная регуляция PI 3-киназы Ruk, новым адаптерным белком». Журнал EMBO. 19 (15): 4015–25. Дои:10.1093 / emboj / 19.15.4015. ЧВК  306608. PMID  10921882.
• Watanabe S, Take H, Takeda K, Yu ZX, Iwata N, Kajigaya S (ноябрь 2000 г.). «Характеристика адапторного белка CIN85 и идентификация компонентов, участвующих в комплексах CIN85». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 278 (1): 167–74. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3760. PMID  11071869.
• Borinstein SC, Hyatt MA, Sykes VW, Straub RE, Lipkowitz S, Boulter J, Bogler O (декабрь 2000 г.). «SETA - это многофункциональный адаптерный белок с тремя доменами SH3, который связывает Grb2, Cbl и новые белки SB1». Сотовая связь. 12 (11–12): 769–79. Дои:10.1016 / S0898-6568 (00) 00129-7. PMID  11152963.
• Нарита Т., Амано Ф., Йошизаки К., Нисимото Н., Нисимура Т., Тадзима Т., Намики Х., Танияма Т. (2001). «Отнесение SH3KBP1 к полосе хромосомы человека Xp22.1 -> p21.3 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 93 (1–2): 133–4. Дои:10.1159/000056966. PMID  11474197.
• Субейран П., Кованец К., Шимкевич И., Лэнгдон В. Ю., Дикич И. (март 2002 г.). «Комплекс Cbl-CIN85-эндофилин опосредует лиганд-индуцированное подавление рецепторов EGF». Природа. 416 (6877): 183–7. Дои:10.1038 / 416183a. PMID  11894095.
• Петрелли А., Гилестро Г.Ф., Ланцардо С., Комольо П.М., Мигоне Н., Джордано С. (март 2002 г.). «Комплекс эндофилин-CIN85-Cbl опосредует лиганд-зависимое подавление c-Met». Природа. 416 (6877): 187–90. Дои:10.1038 / 416187a. PMID  11894096.
• Скотт М.П., ​​Заппакоста Ф., Ким Е.Ю., Аннан Р.С., Миллер В.Т. (август 2002 г.). «Идентификация новых лигандов домена SH3 для киназы Hck семейства Src. Синдромный белок Вискотта-Олдрича (WASP), WASP-взаимодействующий белок (WIP) и ELMO1». Журнал биологической химии. 277 (31): 28238–46. Дои:10.1074 / jbc.M202783200. PMID  12029088.
• Вердье Ф, Валовка Т., Живолуп А., Дробот Л.Б., Бухман В., Уотерфилд М., Подагра I (июль 2002 г.). «Ruk убиквитинирован, но не разлагается протеасомой». Европейский журнал биохимии. 269 (14): 3402–8. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2002.03031.x. PMID  12135478.
• Шимкевич И., Кованец К., Субейран П., Динарина А., Липковиц С., Дикич И. (октябрь 2002 г.). «CIN85 участвует в Cbl-b-опосредованном подавлении рецепторных тирозинкиназ». Журнал биологической химии. 277 (42): 39666–72. Дои:10.1074 / jbc.M205535200. PMID  12177062.
• Хаглунд К., Шимокава Н., Шимкевич И., Дикич И. (сентябрь 2002 г.). «Cbl-направленное моноубиквитинирование CIN85 участвует в регуляции лиганд-индуцированной деградации рецепторов EGF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (19): 12191–6. Дои:10.1073 / пнас.192462299. ЧВК  129420. PMID  12218189.
• Бакман В.Л., Люк С., Бортвик Е.Б., Подагра I, Нинкина Н. (июль 2002 г.). «Организация мышиного локуса Ruk и экспрессия изоформ в тканях мыши». Ген. 295 (1): 13–17. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00821-1. PMID  12242006.
• Тибальди Э.В., Райнгерц Э.Л. (март 2003 г.). «CD2BP3, CIN85 и структурно родственный адаптерный белок CMS связываются с одним и тем же цитоплазматическим сегментом CD2, но вызывают различные функциональные активности». Международная иммунология. 15 (3): 313–29. Дои:10.1093 / intimm / dxg032. PMID  12618476.
• Хатчингс, штат Нью-Джерси, Кларксон Н., Чолкли Р., Барклай А.Н., Браун М.Х. (июнь 2003 г.). «Связывание поверхностного белка Т-клеток CD2 с актин-кэпирующим белком CAPZ через CMS и CIN85». Журнал биологической химии. 278 (25): 22396–403. Дои:10.1074 / jbc.M302540200. PMID  12690097.