RHOT2 - RHOT2

RHOT2
Идентификаторы
Псевдонимы	RHOT2, ARHT2, C16orf39, MIRO-2, MIRO2, RASL, член семейства гомологов ras Т2
Внешние идентификаторы	OMIM: 613889 MGI: 2384892 ГомолоГен: 56038 Генные карты: RHOT2
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[1] Группа 17 A3.3 | 17 12,93 см Начинать 25,838,457 бп[1] Конец 25,844,851 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • связывание ионов кальция • Связывание GTP • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • ГТФазная активность • гидролазная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • цитозоль • мембрана • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент внешней мембраны митохондрий • митохондриальная наружная мембрана • митохондрия • внеклеточная экзосома Биологический процесс • митохондриальная организация • клеточный гомеостаз • транспорт митохондрий по микротрубочкам • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • проницаемость внешней мембраны митохондрий • Передача сигнала белка Rho • регуляция митохондриальной организации Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	89941	214952
Ансамбль	ENSG00000140983	ENSMUSG00000025733
UniProt	Q8IXI1	Q8JZN7
RefSeq (мРНК)	NM_138769	NM_145999 NM_001364950
RefSeq (белок)	NP_620124 NP_001339204 NP_001339205 NP_001339206 NP_001339207 NP_001339209 NP_001339210 NP_001339211 NP_001339212 NP_001339213 NP_001339214 NP_001339215 NP_001339216 NP_001339217 NP_001339218 NP_001339219 NP_001339220 NP_001339221 NP_001339222 NP_001339223 NP_001339208	NP_666111 NP_001351879
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 17: 25,84 - 25,84 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Митохондриальная Rho GTPase 2 является фермент что у людей кодируется RHOT2 ген.^[4][5] Как Миро белок изоформа, белок облегчает митохондриальный транспорт, прикрепляя митохондрии к моторно-переходному комплексу.^[6] Благодаря своей ключевой роли в митохондриальном транспорте RHOT2 участвует в митохондриальном транспорте. гомеостаз и апоптоз, а также Болезнь Паркинсона (PD).^[6][7]

Структура

У млекопитающих RHOT2 является одной из двух изоформ Miro. Обе изоформы имеют общую структуру, состоящую из двух мотивов EF-hand, связывающих два GTP-связывающих домена и C-концевой трансмембранный домен, который прикрепляет белок к внешняя митохондриальная мембрана (OMM).^[6][8] Мотивы EF-hand служат сайтами связывания для адапторного белка Milton и тяжелая цепь кинезина.^[9] Эти домены могут также связывать ионы кальция, и это связывание приводит к конформационному изменению, которое отделяет поверхность митохондрий от кинезина.^[6][8]

Функция

RHOT2 является членом Семейство Rho GTPase и одна из двух изоформ белка Miro: RHOT1 (Miro1) и RHOT2 (Miro2).^[6][9] По сравнению с остальной частью семейства Rho GTPase изоформы Miro считаются атипичными из-за их различной регуляции.^[10] Более того, изоформы Miro экспрессируются только в митохондриях.^[11]

Миро сотрудничает с Милтоном (TRAK1 /2 ) и моторные белки кинезин и динеин с образованием митохондриального моторно-адапторного комплекса. Функция Miro связывает комплекс с митохондрией, в то время как комплекс транспортирует митохондрию через микротрубочки внутри клеток.^[6][7] Хотя Миро в основном учился в нейроны, белок также участвует в транспорте митохондрий в лимфоциты к воспаленный эндотелия.^[9]

Комплекс мотор / адаптер регулируется уровнем ионов кальция. В высоких концентрациях ионы кальция останавливают митохондриальный транспорт, связывая Миро, в результате чего комплекс отделяется от органеллы. Учитывая, что физиологические факторы, такие как активация рецепторы глутамата в дендритах, потенциалы действия в аксонах, и нейромодуляторы могут повышать уровни ионов кальция, этот регуляторный механизм, вероятно, служит для удержания митохондрий в таких областях, чтобы обеспечить буферизацию ионов кальция и активный экспорт и, таким образом, поддерживать гомеостаз.^[6]

Кроме того, Миро регулирует митохондриальное слияние и митофагия в сочетании с митофузин. Согласно одной модели, поврежденные митохондрии отделяются от здоровых митохондрий в результате деградации Miro и митофузина. Деградация миро останавливает их движение, в то время как деградация митофузинов препятствует их слиянию со здоровыми митохондриями, тем самым облегчая их очищение аутофагосомами. ^[6]

Клиническое значение

Исследования показывают, что Миро может быть вовлечен в болезнь Паркинсона.^[7] В нейронах Miro взаимодействует с двумя ключевыми белками, участвующими в PD, PINK1 и Parkin.^[6] После деполяризации митохондрий PINK1 фосфорилирует Miro по множеству сайтов, включая S156, а Parkin убиквитинирует Miro, направляя его на протеасомную деградацию.^[6][7] Затем распад Miro останавливает митохондриальный транспорт.^[6]

Хотя семейство Rho GTPase тесно связано с рак прогрессирования, есть несколько исследований, демонстрирующих такую ​​связь с атипичными белками Miro.^[10]

Взаимодействия

RHOT1 был показан взаимодействовать с:

• ALEX3,^[6]
• ДИСК1,^[11]
• Дайнейн,^[6]
• HUMMR,^[6]
• тяжелая цепь кинезина (KHC),^[6]
• Митофузин (MFN1 /MFN2 ),^[6]
• Милтон (TRAK1 /TRAK2 ),^[6]
• Паркин,^[6]
• РОЗОВЫЙ1,^[6] и
• OGT.^[6]

Рекомендации

1. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000025733 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Франссон А., Руусала А., Аспенстрём П. (февраль 2003 г.). «Атипичные Rho GTPases играют роль в митохондриальном гомеостазе и апоптозе». Журнал биологической химии. 278 (8): 6495–502. Дои:10.1074 / jbc.M208609200. PMID  12482879.
5. «Ген Entrez: семейство гомологов RHOT2 ras, член Т2».
6. Schwarz TL (июнь 2013 г.). «Митохондриальный трафик в нейронах». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 5 (6): a011304. Дои:10.1101 / cshperspect.a011304. ЧВК  3660831. PMID  23732472.
7. ван дер Мерве К., Джалали Сефид Дашти З., Кристоффельс А., Лоос Б., Бардиен С. (май 2015 г.). «Доказательства общего биологического пути, связывающего три гена, вызывающих болезнь Паркинсона: паркин, PINK1 и DJ-1». Европейский журнал нейробиологии. 41 (9): 1113–25. Дои:10.1111 / ejn.12872. PMID  25761903.
8. Франссон С., Руусала А., Аспенстрём П. (июнь 2006 г.). «Атипичные Rho GTPases Miro-1 и Miro-2 играют важную роль в митохондриальном движении». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 344 (2): 500–10. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.03.163. PMID  16630562.
9. Морлино Дж., Баррейро О, Байшаули Ф., Роблес-Валеро Дж., Гонсалес-Гранадо Дж. М., Вилла-Беллоста Р., Куэнка Дж., Санчес-Сорзано, Колорадо, Вейга Е., Мартин-Кофресес, Северная Каролина, Санчес-Мадрид, Ф (апрель 2014 г.). «Miro-1 связывает митохондрии и моторы Dynein микротрубочек для контроля миграции и полярности лимфоцитов» (PDF). Молекулярная и клеточная биология. 34 (8): 1412–26. Дои:10.1128 / MCB.01177-13. ЧВК  3993592. PMID  24492963.
10. Цзян Х, Хе Ц, Гэн С., Шэн Х, Шен Х, Чжан Х, Ли Х, Чжу С., Чен Х, Ян Ц., Гао Х (2012). «RhoT1 и Smad4 коррелируют с метастазами в лимфатические узлы и общей выживаемостью при раке поджелудочной железы». PLOS ONE. 7 (7): e42234. Bibcode:2012PLoSO ... 742234J. Дои:10.1371 / journal.pone.0042234. ЧВК  3409151. PMID  22860091.
11. Огава Ф., Малаваси Э.Л., Крамми Д.К., Эйкеленбум Дж.Э., Соарес, округ Колумбия, Маки С., Портеус DJ, Миллар Д.К. (февраль 2014 г.). «Комплексы DISC1 с TRAK1 и Miro1 для модуляции антероградного аксонального митохондриального транспорта». Молекулярная генетика человека. 23 (4): 906–19. Дои:10.1093 / hmg / ddt485. ЧВК  3900104. PMID  24092329.

дальнейшее чтение

• Дэниэлс Р.Дж., Педен Дж.Ф., Ллойд С., Хорсли С.В., Кларк К., Туфарелли С., Кирни Л., Бакл В.Дж., Доггетт Н.А., Флинт Дж., Хиггс Д.Р. (февраль 2001 г.). «Последовательность, структура и патология полностью аннотированного терминала 2 Mb короткого плеча хромосомы 16 человека». Молекулярная генетика человека. 10 (4): 339–52. Дои:10.1093 / hmg / 10.4.339. PMID  11157797.
• Аспенстрём П., Франссон А., Сарас Дж. (Январь 2004 г.). «Rho GTPases оказывают разнообразное влияние на организацию системы актиновых филаментов». Биохимический журнал. 377 (Pt 2): 327–37. Дои:10.1042 / BJ20031041. ЧВК  1223866. PMID  14521508.
• Шан Й., Хексиге С., Го З., Ван Б., Чен К., Чен Х, Ма Л., Хуанг С., Чжао С., Ю Л. (2004). «Клонирование и характеристика гена Arht2 мыши, который кодирует предполагаемую атипичную GTPase». Цитогенетические и геномные исследования. 106 (1): 91–7. Дои:10.1159/000078568. PMID  15218247. S2CID  34129201.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Франссон С., Руусала А., Аспенстрём П. (июнь 2006 г.). «Атипичные Rho GTPases Miro-1 и Miro-2 играют важную роль в митохондриальном движении». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 344 (2): 500–10. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.03.163. PMID  16630562.