PCM1 - PCM1

PCM1
Идентификаторы
Псевдонимы	PCM1, PTC4, RET / PCM-1, перицентриолярный материал 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600299 MGI: 1277958 ГомолоГен: 4518 Генные карты: PCM1
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[1] Группа 8 A4 | 8 23,89 см Начинать 41,239,752 бп[1] Конец 41,332,344 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цилиарное базальное тело • проекция клетки • не мембрана • мембрана • центр организации микротрубочек • центриоль • цитоскелет • ресничная переходная зона • центросома • центриолярный спутник • перицентриолярный материал • цитоплазма • цитозоль • апикальная часть клетки • неподвижная ресничка • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • положительная регуляция внутриклеточного транспорта белков • миграция нейронов • поддержание популяции нейрональных стволовых клеток • внутрибровный транспорт, участвующий в сборке ресничек • организация проекции клеток • G2 / M переход митотического клеточного цикла • организация цитоплазматических микротрубочек • отрицательная регуляция нейрогенеза • интеркинетическая ядерная миграция • закрепление микротрубочек на центросоме • локализация белка на центросоме • закрепление микротрубочек • поведение социального организма • морфогенез ресничек • стыковка цилиарного базального тела • неподвижная сборка ресничек • центросомный цикл • регуляция G2 / M перехода митотического клеточного цикла • локализация белка в органелле Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5108	18536
Ансамбль	ENSG00000078674	ENSMUSG00000031592
UniProt	Q15154	Q9R0L6
RefSeq (мРНК)	NM_006197 NM_001315507 NM_001315508	NM_023662
RefSeq (белок)	NP_001302436 NP_001302437 NP_006188 NP_001339561 NP_001339562 NP_001339563 NP_001339564 NP_001339565 NP_001339566 NP_001339567 NP_001339568 NP_001339569 NP_001339570 NP_001339571 NP_001339572 NP_001339573 NP_001339574 NP_001339575 NP_001339576 NP_001339577 NP_001339578 NP_001339579 NP_001339580 NP_001339581 NP_001339582 NP_001339583 NP_001339584 NP_001339585 NP_001339586 NP_001339587 NP_001339588 NP_001339589 NP_001302436.1	NP_076151
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 8: 41.24 - 41.33 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Перицентриолярный материал 1, также известный как PCM1, это белок который у человека кодируется PCM1 ген.^[4][5][6]

Функция

Белок PCM1 был первоначально идентифицирован на основании его отличного клеточный цикл -зависимая ассоциация с центросома сложный и микротрубочки. Белок, по-видимому, связан с комплексом центросом во время клеточного цикла. Диссоциация происходит во время митоза, когда PCM1 рассредоточен по клетке. Иммуномечение проведенные исследования показали, что PCM1 присутствует в центриолярных сателлитах и ​​в электронно-плотных гранулах диаметром от 70 до 100 нм. Первоначально считалось, что они разбросаны только вокруг центросом, но дальнейшие исследования показали, что PCM1 также обнаруживается по всей цитоплазме.

Было показано, что PCM1 необходим для деления клеток, потому что антитела PCM1 вызывают остановку клеточного цикла при микроинъекции в оплодотворенные яйца мышей. Ориентация на центрин, перицентрин и девять дюймов также резко снижалось после истощения PCM1 с использованием siRNA, сверхэкспрессии мутантов с делецией PCM1 и микроинъекции антитела PCM1.^[7] В результате этого истощения было обнаружено, что радиальная организация микротрубочек нарушена, но, по-видимому, не влияет на зарождение микротрубочек.

Структура

PCM1 имеет четыре известных транскрипта, самый длинный из которых имеет 39 экзонов. Открытая рамка считывания PCM1 кодирует белок из 2024 аминокислот. Белок содержит спиральная катушка регионы между районами низкой сложности, а также аденозинтрифосфат (АТФ ) / GTPase домен, а ядерная локализация домен и эукариотический домен молибдоптерина. Связывающий домен молибдоптерина эукариот в настоящее время обнаружен только в пяти других генах человека, ксантиндегидрогеназа, сульфитоксидаза (митохондриальный предшественник), альдегидоксидаза, рецептор эритропоэтина предшественник и АТФ-связывающая кассета, подсемейство A, член 2 (ABCA2 ).

Распределение тканей

Экспрессия мРНК PCM1 в мозг мыши оказался самым высоким в гиппокамп.^[8] У людей он экспрессируется выше среднего уровня экспрессии центральной нервной системы (ЦНС) в большинстве частей мозга.^[9]

Клиническое значение

Мутации в PCM1 было показано, что ген вызывает генетическую предрасположенность к шизофрения. Если изменение изолейцина в аминокислоте в PCM1 наследуется, риск развития шизофрении составил 68% в двух независимых выборках из южной Англии и Шотландии. Это означает, что теперь возможно предложить очень ограниченные генетическое консультирование небольшой части людей с шизофренией, которые также являются носителями этой мутации.^[10][11]

ПКМ1 образует комплекс на центросома с нарушенной шизофренией 1 (ДИСК1 ) и белок 4 синдрома Барде-Бидля (BBS4 ), который обеспечивает связь между аберрантным PCM1 и аномальным кортикальным развитием, связанным с патологией шизофрении.^[12]

Взаимодействия

PCM1 показал себя взаимодействовать с PCNT.^[13]

Рекомендации

1. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031592 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Энтрез Ген: перицентриолярный материал PCM1 1».
5. Balczon R, Bao L, Zimmer WE (март 1994). "PCM-1, аутоантиген центросомы массой 228 кДа с отчетливым распределением клеточного цикла". J. Cell Biol. 124 (5): 783–93. Дои:10.1083 / jcb.124.5.783. ЧВК  2119948. PMID  8120099.
6. Hames RS, Crookes RE, Straatman KR, Merdes A, Hayes MJ, Faragher AJ, Fry AM (апрель 2005 г.). «Динамическое привлечение киназы Nek2 в центросому включает микротрубочки, PCM-1 и локальную протеасомную деградацию». Мол. Биол. Клетка. 16 (4): 1711–24. Дои:10.1091 / mbc.E04-08-0688. ЧВК  1073654. PMID  15659651.
7. Dammermann, A .; Мердес, А. (2002). «Сборка центросомных белков и организация микротрубочек зависит от PCM-1». Журнал клеточной биологии. 159 (2): 255–266. Дои:10.1083 / jcb.200204023. ЧВК  2173044. PMID  12403812.
8. «Сводка экспрессии генов для Pcm1; перицентриолярный материал 1». Институт изучения мозга Аллена. Получено 2009-04-30.
9. "PCM1, Набор датчиков 202174_s_at". BioGPS - ваша система генного портала. Получено 2009-04-30.
10. Datta SR, McQuillin A, Rizig M, Blaveri E, Thirumalai S, Kalsi G, Lawrence J, Bass NJ, Puri V, Choudhury K, Pimm J, Crombie C, Fraser G, Walker N, Curtis D, Zvelebil M, Pereira A , Кандасвами Р., Сент-Клер Д., Гурлинг Х.М. (декабрь 2008 г.). «Миссенс-мутация треонина в изолейцин в гене перицентриолярного материала 1 тесно связана с шизофренией». Мол. Психиатрия. 15 (6): 615–28. Дои:10.1038 / mp.2008.128. PMID  19048012.
11. Gurling HM, Critchley H, Datta SR, McQuillin A, Blaveri E, Thirumalai S, Pimm J, Krasucki R, Kalsi G, Quested D, Lawrence J, Bass N, Choudhury K, Puri V, O'Daly O, Curtis D, Blackwood D, Muir W., Malhotra AK, Buchanan RW, Good CD, Frackowiak RS, Dolan RJ (август 2006 г.). «Исследования генетической ассоциации и морфологии мозга и ген перицентриолярного материала 1 (PCM1) хромосомы 8p22 в восприимчивости к шизофрении». Arch. Генеральная психиатрия. 63 (8): 844–54. Дои:10.1001 / archpsyc.63.8.844. ЧВК  2634866. PMID  16894060.
12. Камия А., Тан П.Л., Кубо К., Энгельхард К., Исидзука К., Кубо А., Цукита С., Пульвер А.Э., Накадзима К., Каселла Н.Г., Катсанис Н., Сава А. (сентябрь 2008 г.). «PCM1 рекрутируется в центросому совместным действием DISC1 и BBS4 и является кандидатом на психическое заболевание». Arch. Генеральная психиатрия. 65 (9): 996–1006. Дои:10.1001 / archpsyc.65.9.996. ЧВК  2727928. PMID  18762586.
13. Ли, Q; Hansen D; Киллилея А; Joshi H C; Palazzo R E; Balczon R (февраль 2001 г.). «Кендрин / перицентрин-B, белок центросомы, гомологичный перицентрину, который образует комплекс с PCM-1». J. Cell Sci. 114 (Pt 4): 797–809. ISSN  0021-9533. PMID  11171385.

дальнейшее чтение

• Tollenaere M.A.X .; Mailand N; Беккер-Йенсен С (2014). «Центриолярные спутники: ключевые медиаторы функций центросом». Клетка. Мол. Life Sci. 72 (1): 11–23. Дои:10.1007 / s00018-014-1711-3. PMID  25173771. S2CID  2243856.
• Охата Х, Фудзивара Й, Кояма К., Накамура Й (1995). «Картирование гена аутоантигенного перицентриолярного материала 1 (PCM1) человека на хромосоме 8p21.3-p22». Геномика. 24 (2): 404–6. Дои:10.1006 / geno.1994.1640. PMID  7698772.
• Balczon R, Bao L, Zimmer WE (1994). "PCM-1, аутоантиген центросомы массой 228 кДа с отчетливым распределением клеточного цикла". J. Cell Biol. 124 (5): 783–93. Дои:10.1083 / jcb.124.5.783. ЧВК  2119948. PMID  8120099.
• Engelender S, Sharp AH, Colomer V и др. (1998). «Связанный с гентингтином белок 1 (HAP1) взаимодействует с p150Glued субъединицей динактина». Гм. Мол. Genet. 6 (13): 2205–12. Дои:10.1093 / hmg / 6.13.2205. PMID  9361024.
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Bibcode:2000PNAS ... 97.3491D. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Корви Р., Бергер Н., Балцон Р., Ромео Дж. (2000). «RET / PCM-1: новый гибридный ген при папиллярной карциноме щитовидной железы». Онкоген. 19 (37): 4236–42. Дои:10.1038 / sj.onc.1203772. PMID  10980597.
• Ли Кью, Хансен Д., Киллилея А. и др. (2001). «Кендрин / перицентрин-B, белок центросомы, гомологичный перицентрину, который образует комплекс с PCM-1». J. Cell Sci. 114 (Pt 4): 797–809. PMID  11171385.
• Кумар С., Коннор Дж. Р., Доддс Р. А. и др. (2001). «Идентификация и начальная характеристика 5000 экспрессируемых секвенированных меток (EST), каждый из библиотек кДНК нормального и остеоартрозного хряща взрослого человека». Osteoarthr. Хрящ. 9 (7): 641–53. Дои:10.1053 / joca.2001.0421. PMID  11597177.
• Даммерманн А, Мердес А (2002). «Сборка центросомных белков и организация микротрубочек зависит от PCM-1». J. Cell Biol. 159 (2): 255–66. Дои:10.1083 / jcb.200204023. ЧВК  2173044. PMID  12403812.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ансли С.Дж., Бадано Дж.Л., Блак О.Е. и др. (2003). «Дисфункция базального тела - вероятная причина плейотропного синдрома Барде-Бидля». Природа. 425 (6958): 628–33. Bibcode:2003Натура.425..628А. Дои:10.1038 / природа02030. PMID  14520415. S2CID  4310157.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ким Дж. К., Бадано Дж. Л., Сибольд С. и др. (2004). «Белок Барде-Бидла BBS4 направляет груз в перицентриолярную область и необходим для закрепления микротрубочек и развития клеточного цикла». Nat. Genet. 36 (5): 462–70. Дои:10,1038 / ng1352. PMID  15107855.
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Армес Дж. Э., Хаммет Ф., де Сильва М. и др. (2004). «Гены-кандидаты в опухолевые супрессоры на плече 8p хромосомы при раннем и тяжелом раке молочной железы». Онкоген. 23 (33): 5697–702. Дои:10.1038 / sj.onc.1207740. PMID  15184884.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Клетка. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Hames RS, Crookes RE, Straatman KR и др. (2005). «Динамическое привлечение киназы Nek2 в центросому включает микротрубочки, PCM-1 и локальную протеасомную деградацию». Мол. Биол. Клетка. 16 (4): 1711–24. Дои:10.1091 / mbc.E04-08-0688. ЧВК  1073654. PMID  15659651.
• Reiter A, Walz C, Watmore A и др. (2005). «T (8; 9) (p22; p24) - это рецидивирующая аномалия при хроническом и остром лейкозе, которая сливает PCM1 с JAK2». Рак Res. 65 (7): 2662–7. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-4263. PMID  15805263.
• Мурати А., Гелси-Бойер В., Аделаида Дж и др. (2005). «Слияние PCM1-JAK2 при миелопролиферативных заболеваниях и остром эритроидном лейкозе с транслокацией t (8; 9)». Лейкемия. 19 (9): 1692–6. Дои:10.1038 / sj.leu.2403879. PMID  16034466.