Цитозольный фактор нейтрофилов 4 - Neutrophil cytosolic factor 4

NCF4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1H6H, 1OEY, 1W6X, 1W70, 1Z9Q, 2DYB
Идентификаторы
Псевдонимы	NCF4, NCF, P40PHOX, SH3PXD4, цитозольный фактор нейтрофилов 4, CGD3
Внешние идентификаторы	OMIM: 601488 MGI: 109186 ГомолоГен: 525 Генные карты: NCF4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q12.3 Начните 36,860,988 бп[1] Конец 36,878,017 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 E1 | 15 37,1 см Начните 78,244,801 бп[2] Конец 78,262,580 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность димеризации белков • связывание фосфатидилинозитол-3-фосфата • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилинозита • липидное связывание • ARF активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • супероксид-генерирующая активность активатора НАДФН-оксидазы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • эндосома • мембрана • фаголизосома • эндосомная мембрана • сеть транс-Гольджи • НАДФН оксидазный комплекс Биологический процесс • сигнальный путь рецептора фактора роста эндотелия сосудов • иммунная реакция • окислительно-восстановительный процесс • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности • везикулярный транспорт • фагоцитоз • респираторный взрыв • супероксидный метаболический процесс • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса I, TAP-зависимый • клеточный ответ на окислительный стресс • окислительно-восстановительный гомеостаз клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4689	17972
Ансамбль	ENSG00000275990 ENSG00000100365	ENSMUSG00000071715
UniProt	Q15080	P97369
RefSeq (мРНК)	NM_000631 NM_013416	NM_008677
RefSeq (белок)	NP_000622 NP_038202	NP_032703
Расположение (UCSC)	Chr 22: 36,86 - 36,88 Мб	Chr 15: 78.24 - 78.26 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор цитозоля нейтрофилов 4 это белок что у людей кодируется NCF4 ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является цитозольным регуляторным компонентом производящей супероксид фагоцитов НАДФН-оксидазы, многокомпонентной ферментной системы, важной для защиты хозяина. Этот белок преимущественно экспрессируется в клетках миелоидного происхождения. Он взаимодействует в первую очередь с цитозольным фактором 2 нейтрофилов (NCF2 / p67-phox) с образованием комплекса с цитозольным фактором 1 нейтрофилов (NCF1 / p47-phox), который далее взаимодействует с небольшим G-белком RAC1 и перемещается на мембрану при стимуляции клеток. Затем этот комплекс активирует флавоцитохром b, интегрированное в мембрану каталитическое ядро ​​ферментной системы. Домен PX этого белка может связывать фосфолипидные продукты киназы PI (3), что предполагает его роль в сигнальных событиях, опосредованных PI (3) киназой. Было обнаружено, что фосфорилирование этого белка отрицательно регулирует активность фермента. Наблюдались альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.

Клиническое значение

Исследования GWAS показали, что пациенты с болезнью Крона с определенными SNP в NCF4 более восприимчивы к болезни Крона.^[7] У пациента Крона с вариантами rs4821544 было обнаружено снижение количества активных форм кислорода после стимуляции GM-CSF, который является провоспалительным цитокином.^[8]

Взаимодействия

Фактор цитозоля 4 нейтрофилов может взаимодействовать с участием Ku70,^[9] Цитозольный фактор нейтрофилов 1^[10][11][12] и Moesin.^[13]

использованная литература

1. ENSG00000100365 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000275990, ENSG00000100365 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000071715 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Zhan S, Vazquez N, Zhan S, Wientjes FB, Budarf ML, Schrock E, Ried T, Green ED, Chanock SJ (ноябрь 1996 г.). «Геномная структура, хромосомная локализация, начало транскрипции и тканевая экспрессия человеческого p40-phox, нового компонента никотинамидадениндинуклеотидфосфатоксидазного комплекса». Кровь. 88 (7): 2714–21. Дои:10.1182 / blood.V88.7.2714.bloodjournal8872714. PMID  8839867.
6. «Ген Entrez: цитозольный фактор 4 нейтрофилов NCF4, 40 кДа».
7. Muise AM, Xu W, Guo CH, Walters TD, Wolters VM, Fattouh R, Lam GY, Hu P, Murchie R, Sherlock M, Gana JC, Russell RK, Glogauer M, Duerr RH, Cho JH, Lees CW, Satsangi J , Уилсон Д.К., Патерсон А.Д., Гриффитс А.М., Сильверберг М.С., Брюмелл Дж. Х. (2012). «Исследования комплекса НАДФН-оксидазы и гена-кандидата IBD: идентификация редкого варианта NCF2, который приводит к снижению связывания с RAC2». Кишечник. 61 (7): 1028–35. Дои:10.1136 / gutjnl-2011-300078. ЧВК  3806486. PMID  21900546.
8. Somasundaram R, Deuring JJ, van der Woude CJ, Peppelenbosch MP, Fuhler GM (2012). «Связывание риска мутации в NCF4 с функциональными последствиями болезни Крона». Кишечник. 61 (7): 1097, ответ автора 1097–8. Дои:10.1136 / gutjnl-2011-301344. PMID  22027479. S2CID  5315006.
9. Гранво Н., Гризо С., Винье П.В., Дагер М.С. (февраль 1999 г.). «Аутоантиген Ku70 взаимодействует с p40phox в B-лимфоцитах». J. Cell Sci. 112 (Pt 4) (4): 503–13. PMID  9914162.
10. Lapouge K, Smith SJ, Groemping Y, Rittinger K (март 2002 г.). «Архитектура комплекса p40-p47-p67phox в состоянии покоя НАДФН-оксидазы. Центральная роль p67phox». J. Biol. Chem. 277 (12): 10121–8. Дои:10.1074 / jbc.M112065200. PMID  11796733.
11. Grizot S, Grandvaux N, Fieschi F, Fauré J, Massenet C, Andrieu JP, Fuchs A, Vignais PV, Timmins PA, Dagher MC, Pebay-Peyroula E (март 2001 г.). «Анализы малоуглового рассеяния нейтронов и гель-фильтрации цитозольных факторов НАДФН-оксидазы нейтрофилов подчеркивают роль С-конца p47phox в ассоциации с p40phox». Биохимия. 40 (10): 3127–33. Дои:10.1021 / bi0028439. PMID  11258927.
12. Сатьямурти М., де Мендес И., Адамс А.Г., Лето Т.Л. (апрель 1997 г.). «p40 (phox) подавляет активность НАДФН-оксидазы за счет взаимодействия с его доменом SH3». J. Biol. Chem. 272 (14): 9141–6. Дои:10.1074 / jbc.272.14.9141. PMID  9083043.
13. Wientjes FB, Reeves EP, Soskic V, Furthmayr H, Segal AW (ноябрь 2001 г.). «Компоненты НАДФН-оксидазы p47 (phox) и p40 (phox) связываются с моэзином через свой домен PX». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 289 (2): 382–8. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5982. PMID  11716484.

дальнейшее чтение

• Матуте Дж.Д., Ариас А.А., Динауэр М.К., Патиньо П.Дж. (2006). «p40phox: последняя субъединица НАДФН-оксидазы». Blood Cells Mol. Дис. 35 (2): 291–302. Дои:10.1016 / j.bcmd.2005.06.010. PMID  16102984.
• Джонс Дж. Х. (1977). «Суть ухода за операционной. Средний медперсонал». Медсестры австралас J. 7 (1): 44–5, 63–4. PMID  243433.
• Лето Т.Л., Адамс А.Г., де Мендес I (1994). «Сборка НАДФН-оксидазы фагоцитов: связывание доменов гомологии 3 Src с богатыми пролином мишенями». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (22): 10650–4. Bibcode:1994PNAS ... 9110650L. Дои:10.1073 / пнас.91.22.10650. ЧВК  45079. PMID  7938008.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Цунаваки С., Мидзунари Х., Нагата М., Тацудзава О., Курацудзи Т. (1994). «Новый цитозольный компонент, p40phox, оксидазы респираторного взрыва ассоциируется с p67phox и отсутствует у пациентов с хронической гранулематозной болезнью, у которых отсутствует p67phox». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 199 (3): 1378–87. Дои:10.1006 / bbrc.1994.1383. PMID  8147882.
• Wientjes FB, Hsuan JJ, Totty NF, Segal AW (1993). «p40phox, третий цитозольный компонент активационного комплекса НАДФН-оксидазы, содержащий 3 домена src гомологии». Biochem. J. 296 (Pt 3) (3): 557–61. Дои:10.1042 / bj2960557. ЧВК  1137734. PMID  8280052.
• Дуси С, Донини М, Росси Ф (1996). «Механизмы активации НАДФН-оксидазы: перемещение p40phox, Rac1 и Rac2 из цитозоля на мембраны нейтрофилов человека, лишенных p47phox или p67phox». Biochem. J. 314 (Pt 2) (2): 409–12. Дои:10.1042 / bj3140409. ЧВК  1217064. PMID  8670049.
• Someya A, Nagaoka I, Nunoi H, Yamashita T (1996). «Транслокация p40-phox морской свинки при активации НАДФН оксидазы». Биохим. Биофиз. Acta. 1277 (3): 217–25. Дои:10.1016 / с0005-2728 (96) 00099-0. PMID  8982388.
• Сатьямуурти М., де Мендес И., Адамс А.Г., Лето Т.Л. (1997). «p40 (phox) подавляет активность НАДФН-оксидазы за счет взаимодействия с его доменом SH3». J. Biol. Chem. 272 (14): 9141–6. Дои:10.1074 / jbc.272.14.9141. PMID  9083043.
• Гроган А., Ривз Е., Кип Н., Вентджес Ф, Тотти Н. Ф., Бурлингем А. Л., Сюань Дж. Дж., Сегал А. В. (1997). «Цитозольные фокс-белки взаимодействуют и регулируют сборку коронина в нейтрофилах». J. Cell Sci. 110 (Pt 24) (24): 3071–81. PMID  9365277.
• Fuchs A, Bouin AP, Rabilloud T, Vignais PV (1997). «Компонент NADPH-оксидазы фагоцитов (p40phox) массой 40 кДа фосфорилируется во время активации в дифференцированных клетках HL60». Евро. J. Biochem. 249 (2): 531–9. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1997.00531.x. PMID  9370364.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Буэн А.П., Гранво Н., Винье П.В., Фукс А. (1998). «p40 (phox) фосфорилируется по треонину 154 и серину 315 во время активации НАДФН оксидазы фагоцитов. Участие киназы протеинкиназы c-типа в процессе фосфорилирования». J. Biol. Chem. 273 (46): 30097–103. Дои:10.1074 / jbc.273.46.30097. PMID  9804763.
• Гранво Н., Гризо С., Винье П.В., Дагер М.С. (1999). «Аутоантиген Ku70 взаимодействует с p40phox в B-лимфоцитах». J. Cell Sci. 112 (Pt 4) (4): 503–13. PMID  9914162.
• Нишияма А., Оно Т, Ивата С., Мацуи М., Хирота К., Масутани Х., Накамура Х., Йодой Дж. (1999). «Демонстрация взаимодействия тиоредоксина с p40phox, компонентом оксидазы фагоцитов, с использованием двухгибридной системы дрожжей». Иммунол. Латыш. 68 (1): 155–9. Дои:10.1016 / S0165-2478 (99) 00045-0. PMID  10397171.
• Хасебе Т., Сомея А., Нагаока I (1999). «Идентификация варианта сплайсинга мРНК p40phox, компонента НАДФН-оксидазы фагоцитов». FEBS Lett. 455 (3): 257–61. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00905-9. PMID  10437784. S2CID  23509959.
• Данхэм I, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Натура.402..489D. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Верно С., Пакле М. Х., Эль Бенна Дж., Посидало М. А., Морель Ф. (2000). «Комплементация НАДФН оксидазы в p67-phox-дефицитных пациентах с CGD взаимодействие p67-phox / p40-phox». Евро. J. Biochem. 267 (4): 1059–67. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01097.x. PMID  10672014.
• Grizot S, Grandvaux N, Fieschi F, Fauré J, Massenet C, Andrieu JP, Fuchs A, Vignais PV, Timmins PA, Dagher MC, Pebay-Peyroula E (2001). «Анализ малоуглового рассеяния нейтронов и гель-фильтрации цитозольных факторов НАДФН-оксидазы нейтрофилов подчеркивает роль С-конца p47phox в ассоциации с p40phox». Биохимия. 40 (10): 3127–33. Дои:10.1021 / bi0028439. PMID  11258927.