Перемежающийся повтор, распространяющийся на все млекопитающее - Mammalian-wide interspersed repeat

Перемежающиеся повторы на уровне млекопитающих (МИР) являются сменные элементы в геномах некоторых организмов и принадлежат к группе Короткие вкрапленные ядерные элементы (SINE).

Заболеваемость

МИР встречаются во всех млекопитающие (включая сумчатые ).[1]

В человеческом

По оценкам, в мире насчитывается около 368 000 MIR. человеческий геном.[2]

Структура

МИР консенсусная последовательность имеет длину 260 пар оснований и 3 '-конец A / T-rich.[1]

Распространение

Как и другие Короткие вкрапленные ядерные элементы (SINE), Элементы МИР использовали технику Элементы LINE для их распространения в геноме, которое имело место около 130 миллионов лет назад. Они не могут ретранспозиция больше с момента потери активности необходимого обратная транскриптаза.[3]

История открытия

Элементы MIR были впервые описаны в геноме человека 1989-1991 гг. [4][5][6] и сначала были названы повторами семейства MB1 (зеркальное отражение последовательностей мышиных повторов B1). Затем повторы этого семейства были обнаружены в геномах других млекопитающих.[7] Затем в 1992 году это семейство было переименовано в «Вкрапленные повторы млекопитающих». [8] Позже было показано, что это семейство является общим для геномов позвоночных.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б Смит, Ариан Ф. А .; Риггс, Артур Д. (1995). «MIR - это классические SINE, происходящие из тРНК, которые амплифицировались до облучения млекопитающих». Исследования нуклеиновых кислот. 23 (1): 98–102. Дои:10.1093 / nar / 23.1.98. ЧВК  306635. PMID  7870595.
  2. ^ Посадочный модуль; и другие. (2001). "Начальная последовательность и анализ человеческого генома" (PDF). Природа. 409 (6822): 860–921. Bibcode:2001Натура.409..860л. Дои:10.1038/35057062. PMID  11237011.
  3. ^ Krull, M; Петрусма, М; Макаловски, В; Brosius, J; Шмитц, Дж (август 2007 г.). «Функциональная персистенция экзонизированных вкрапленных повторяющихся элементов (MIR) в масштабе млекопитающих». Геномные исследования. 17 (8): 1139–45. Дои:10.1101 / гр.6320607. ЧВК  1933517. PMID  17623809.
  4. ^ Донхауэр, Лоуренс А .; Slagle, Betty L .; Уайльд, Маргарет; Дарлингтон, Гретхен; Бутель, Джанет С. (1989). «Идентификация консервативной последовательности в некодирующих областях многих генов человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (2): 699–722. Дои:10.1093 / nar / 17.2.699. ЧВК  331613. PMID  2536922.
  5. ^ Коротков, Евгений В. (1990). «Семейство зеркальных B1-подобных последовательностей из генома человека». Докл. Акад. АН СССР (на русском). 311 (1): 238–242. PMID  2357927.
  6. ^ Коротков, Евгений В. (1991). «Новое семейство широко распространенных MB1-повторов в геноме человека». Мол Биол (Моск) (на русском). 25 (1): 250–263. PMID  1896037.
  7. ^ Коротков, Евгений В. (1992). «Семейство повторов MB1 в клонах из геномов млекопитающих». Известия АН СССР Биол. (на русском). Июль-август (4): 546–557. PMID  1452902.
  8. ^ Юрка, Ежи; Валичевич, Иоланта; Милосавлевич, Александар (октябрь 1992 г.). «Прототипические последовательности для повторяющейся ДНК человека». Журнал молекулярной эволюции. 35 (4): 286–291. Bibcode:1992JMolE..35..286J. Дои:10.1007 / BF00161166. PMID  1404414.
  9. ^ Коротков, Евгений В .; Короткова Мария А .; Руденко, Валентина М. (2000). «МИР - семейство повторов, общих для геномов позвоночных». Мол Биол (Моск) (на русском). 34 (4): 553–559. Дои:10.1007 / BF02759556. PMID  11042848.