5 МАРТА - MARCH5

МАРТF5
Идентификаторы
Псевдонимы	МАРТF5, MARCH-V, MITOL, RNF153, мембранно-ассоциированный кольцевой палец CH-типа 5, MARCH5
Внешние идентификаторы	OMIM: 610637 MGI: 1915207 ГомолоГен: 9862 Генные карты: МАРТF5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q23.32-q23.33 Начинать 92,291,167 бп[1] Конец 92,353,964 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание GTPase • связывание ионов цинка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • митохондриальная наружная мембрана • мембрана эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум • мембрана • митохондрия Биологический процесс • отрицательная регуляция старения клеток • локализация белка в митохондрии • полиубиквитинирование белков • регуляция митохондриального деления • положительная регуляция деления митохондрий • убиквитинирование белков • аутоубиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54708	69104
Ансамбль	ENSG00000198060	ENSMUSG00000023307
UniProt	Q9NX47	Q3KNM2
RefSeq (мРНК)	NM_017824	NM_001164336 NM_001164337 NM_027314
RefSeq (белок)	NP_060294	NP_001157808 NP_001157809 NP_081590 NP_001365726 NP_001365727
Расположение (UCSC)	Chr 10: 92.29 - 92.35 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза MARCH5, также известный как связанный с мембраной безымянный палец (C3HC4) 5, является фермент что у людей кодируется 5 МАРТА ген. Он локализован в митохондриальный наружная мембрана и имеет четыре трансмембранных домена.^[4][5][6]

Структура

Ген

Человеческий ген 5 МАРТА, также известный как MITOL или же RNF153, имеет 7 экзонов и располагается в полосе хромосомы 10q23.32-q23.33.^[5]

Протеин

Человеческий белок E3 убиквитин-протеинлигаза MARCH5, член семейства трансмембранных белков RING-finger^[7] имеет размер 31 кДа и состоит из 278 аминокислот с N-концом Цинковый палец домен с аминокислотной последовательностью 6-75 и четыре С-концевых трансмембранных участка.^[6] Теоретический ИП этого белка составляет 9,00.^[8]

Функция

Как Убиквитин-лигазы E3, фермент MARCH 5 катализирует перенос убиквитин из E2 убиквитин-конъюгированный фермент на идентифицированный белковый субстрат. MARCH5 впервые был идентифицирован как митофузин 2 - и Drp1 -связывающий белок.^[6] MARCH5 способствует убиквитинированию Drp1, а нокдаун MARCH5 с помощью РНКи приводит к аномальному слиянию митохондрий.^[9] Дальнейшие доказательства показывают, что 5 МАРТА специфически взаимодействует с митофузин 1, снижая его уровень во время определенных фаз клеточный цикл.^[10] Учитывая тот факт, что MARCH5 регулирует протеостаз белков Drp1, митофузин 1, и митофузин 2 которые являются основными регуляторами митохондриальной слияние и деление, MARCH5 имеет решающее значение для регуляции стандартной морфологии митохондрий, а его недостаток способствует клеточному старению.^[11]

Клиническое значение

Учитывая, что оба Drp1 и MAP1B являются субстратами для MITOL, считается, что MITOL играет защитную роль против вызванного нитрозативным стрессом нарушения митохондриальной динамики, такого как морфологическая стабильность и транспорт митохондрий. Поскольку в ответ на старение нормальных тканей происходит значительное снижение экспрессии MITOL, MITOL может контролировать старение, регулируя производство ROS в митохондриях.^[12] С точки зрения патологии, в модели нейрональных клеток доминантно-отрицательный MARCH5 предотвращает фрагментацию митохондрий во время нейродегенеративного стресса, вызванного нейрон-специфическим генератором реактивного кислорода 6-гидроксидофамином, ингибитором комплекса I ротеноном или связанным с болезнью Альцгеймера амилоидным бета-пептидом. MARCH5 также участвует в удалении белков, связанных со специфическими нейродегенеративными нарушениями, такими как атаксин-3 при болезни Мачадо-Джозефа или mSOD1 при боковом амиотрофическом склерозе, вероятно, поддерживая функцию митохондрий.^[13] MARCH5 также был связан с толл-подобные рецепторы (TLR), которые распознают разные возбудитель -ассоциированные молекулярные структуры и играют решающую роль в врожденный иммунный ответ.^[14]

Пути убиквитин-зависимой деградации имеют очевидное значение для рака из-за их неотъемлемого участия в контроле качества белка, регуляции иммунных ответов, передаче сигналов и регуляции клеточного цикла.^[15]

Ошибка имени гена в Excel

Основная статья: Microsoft Excel § Проблемы с преобразованием

Как и другие МАРТ и септин генов, следует проявлять осторожность при анализе генетических данных, содержащих ген MARCH5 в Майкрософт Эксель.^[16] Это связано с тем, что функция автозамены Excel обрабатывает ген MARCH как дату и преобразует ее в стандартный формат даты. Исходный текст не может быть восстановлен в результате преобразования. Исследование 2016 года показало, что до 19,6% всех статей в выбранных журналах были затронуты ошибкой в ​​названии гена.^[17] Эту проблему можно предотвратить, используя псевдоним, например MARCHF5, добавив в начале апостроф (') или предварительно отформатировав ячейку как текст.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198060 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Барти Э., Мансури М., Хови Неренберг Б.Т., Гувейя К., Фрю К. (февраль 2004 г.). «Подавление главного комплекса гистосовместимости класса I убиквитинлигазами человека, связанными с вирусными белками уклонения от иммунитета». Журнал вирусологии. 78 (3): 1109–20. Дои:10.1128 / JVI.78.3.1109-1120.2004. ЧВК  321412. PMID  14722266.
5. «Ген Entrez: MARCH5, связанный с мембраной безымянный палец (C3HC4) 5».
6. Накамура Н., Кимура Ю., Токуда М., Хонда С., Хиросе С. (октябрь 2006 г.). «MARCH-V - это новый связывающий митофузин 2 и Drp1 белок, способный изменять морфологию митохондрий». Отчеты EMBO. 7 (10): 1019–22. Дои:10.1038 / sj.embor.7400790. ЧВК  1618377. PMID  16936636.
7. Ленер П.Дж., Хоер С., Додд Р., Дункан Л.М. (октябрь 2005 г.). «Подавление рецепторов клеточной поверхности семейством K3 вирусных и клеточных лигаз убиквитина E3». Иммунологические обзоры. 207: 112–25. Дои:10.1111 / j.0105-2896.2005.00314.x. PMID  16181331. S2CID  25567313.
8. "Uniprot: Q9NX47 - MARH5_HUMAN".
9. Йонаширо Р., Исидо С., Кио С., Фукуда Т., Гото Е., Мацуки Ю., Омура-Хосино М., Сада К., Хотта Х, Ямамура Х, Инатоме Р., Янаги С. (август 2006 г.). «Новая митохондриальная убиквитинлигаза играет решающую роль в митохондриальной динамике». Журнал EMBO. 25 (15): 3618–26. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601249. ЧВК  1538564. PMID  16874301.
10. Пак Й.Й., Чо Х (2012). «Митофузин 1 разлагается в фазе G2 / M за счет убиквитилирования с помощью MARCH5». Отделение клеток. 7 (1): 25. Дои:10.1186/1747-1028-7-25. ЧВК  3542011. PMID  23253261.
11. Park YY, Lee S, Karbowski M, Neutzner A, Youle RJ, Cho H (февраль 2010 г.). «Потеря митохондриальной E3 убиквитинлигазы MARCH5 вызывает клеточное старение через связанный с динамином белок 1 и митофузин 1». Журнал клеточной науки. 123 (Пт 4): 619–26. Дои:10.1242 / jcs.061481. ЧВК  2818198. PMID  20103533.
12. Нагашима С., Токуяма Т., Йонаширо Р., Инатом Р., Янаги С. (май 2014 г.). «Роль митохондриальной убиквитинлигазы MITOL / MARCH5 в митохондриальной динамике и заболеваниях». Журнал биохимии. 155 (5): 273–9. Дои:10.1093 / jb / mvu016. PMID  24616159.
13. Фанг Л., Ли Дж., Фламмер Дж., Нойцнер А. (2013). «Инактивация MARCH5 поддерживает функцию митохондрий во время нейродегенеративного стресса». Границы клеточной неврологии. 7: 176. Дои:10.3389 / fncel.2013.00176. ЧВК  3794199. PMID  24133412.
14. Ши Х.X., Лю Х., Ван Ц., Тан П.П., Лю Х.Й., Шань Й.Ф., Ван С. (май 2011 г.). «Митохондриальная убиквитинлигаза MARCH5 способствует передаче сигналов TLR7, ослабляя действие TANK». Патогены PLOS. 7 (5): e1002057. Дои:10.1371 / journal.ppat.1002057. ЧВК  3098239. PMID  21625535.
15. Ван Х, господин Р.А., Хансен Т. (декабрь 2008 г.). «Вирусные и клеточные убиквитинлигазы MARCH и рак». Семинары по биологии рака. 18 (6): 441–50. Дои:10.1016 / j.semcancer.2008.09.002. ЧВК  2636702. PMID  18948196.
16. Zeeberg BR, Riss J, Kane DW, Bussey KJ, Uchio E, Linehan WM и др. (Июнь 2004 г.). «Ошибочные идентификаторы: ошибки в названии генов могут быть непреднамеренно внесены при использовании Excel в биоинформатике». BMC Bioinformatics. 5 (1): 80. Дои:10.1186/1471-2105-5-80. ЧВК  459209. PMID  15214961.
17. Ziemann M, Eren Y, El-Osta A (август 2016 г.). «Ошибки в названиях генов широко распространены в научной литературе». Геномная биология. 17 (1): 177. Дои:10.1186 / s13059-016-1044-7. ЧВК  4994289. PMID  27552985.

^{[мертвая ссылка ]}

дальнейшее чтение

• Карбовски М., Нойцнер А., Юл Р. Дж. (Июль 2007 г.). «Митохондриальная убиквитинлигаза E3 MARCH5 необходима для Drp1-зависимого деления митохондрий». Журнал клеточной биологии. 178 (1): 71–84. Дои:10.1083 / jcb.200611064. ЧВК  2064424. PMID  17606867.
• Накамура Н., Кимура Ю., Токуда М., Хонда С., Хиросе С. (октябрь 2006 г.). «MARCH-V - это новый связывающий митофузин 2 и Drp1 белок, способный изменять морфологию митохондрий». Отчеты EMBO. 7 (10): 1019–22. Дои:10.1038 / sj.embor.7400790. ЧВК  1618377. PMID  16936636.
• Йонаширо Р., Исидо С., Кио С., Фукуда Т., Гото Е., Мацуки Ю., Омура-Хосино М., Сада К., Хотта Х, Ямамура Х, Инатоме Р., Янаги С. (август 2006 г.). «Новая митохондриальная убиквитинлигаза играет решающую роль в митохондриальной динамике». Журнал EMBO. 25 (15): 3618–26. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601249. ЧВК  1538564. PMID  16874301.
• Субраманиан А., Андронах А., Ли Ю.С., Уэйд М. (февраль 2016 г.). «Ингибирование убиквитинлигазы MARCH5 устраняет MCL1-зависимую устойчивость к миметикам BH3 через NOXA». Oncotarget. 7 (13): 15986–6002. Дои:10.18632 / oncotarget.7558. ЧВК  4941292. PMID  26910119.