Список химических баз данных - List of chemical databases
Это список веб-сайтов, содержащих списки химикатов или базы данных с химической информацией. Более подробная информация о содержании этих и других ресурсов представлена в Викибук источников информации.
| сокращение | полное имя | оператор | выбирает | содержит | префикс идентификатора | качественный | связь | записи |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3DMET | База данных природных метаболитов с трехмерной структурой | естественные метаболиты из опубликованных книг | КЕГГ ИНЧИ УЛЫБКИ | курировал и подтверждал | «3ДМЕТ». | 18,255 | ||
| Актер | Агентство по охране окружающей среды | токсикологическая информация; вхождение | "Актер". | 893,280 | ||||
| AtomWork | База данных неорганических материалов | Национальный институт материаловедения | кристаллические структуры | «АтомВорк». | 82,000 | |||
| Beilstein | База данных Beilstein | Эльзевир | органические соединения | характеристики | закрытый доступ | |||
| BIAdb | База данных бензилизохинолиновых алкалоидов | «BIAdb». | 846 | |||||
| BindingDB | База данных привязки | Школа фармации и фармацевтических наук Skaggs в Калифорнийском университете в Сан-Диего | нековалентная ассоциация молекул в растворе | ChEMBL УЛЫБАЕТСЯ InChiKey цели | "BindingDB". | |||
| BindingMOAD | Связывающая мать всех баз данных | белковые лигандные структуры | "BindingMOAD". | 36047 | ||||
| БМДБ | База данных метаболомов крупного рогатого скота | Совместное открытие лекарств | БМДБ | выбрано и проверено вручную | «БМДБ». | 7859 | ||
| BMRB | Банк данных биологического магнитного резонанса | Университет Висконсина | биологические молекулы, включая лиганды, кофакторы, пептиды, сахариды | ЯМР-спектроскопия | «БМРБ». | |||
| БРЕНДА | Технический университет Брауншвейга | ферменты-лиганды | «БРЕНДА». | |||||
| База данных каротиноидов | каротиноиды | CA | «Каротиноиды». | 1195 | ||||
| CCRIS | Информационная система исследования химического канцерогенеза | Национальная медицинская библиотека | вещества, влияющие на опухоли | CCRIS | из первичной литературы, проверенной экспертами | «Подмножество CCRIS в PubChem». | 9562[1][2] | |
| CDD Public | кандидаты на лекарства | ограниченный доступ | 3,000,000 | |||||
| ЧЭБИ | Химические объекты, представляющие биологический интерес | ЭЛИКСИР | небольшие химические соединения | от PDBeChem ChEMBL KEGG IntEnz | "ЧЭБИ". | 60,000 | ||
| Chematica | Merck | органические химикаты | расчет пути реакции; Beilstein CAS улыбается | проприетарный | 7,000,000 | |||
| ЧЭМБЛ | Химические вещества из Европейской лаборатории молекулярной биологии | EMBL | молекулы с лекарственными свойствами | «ЧЭМБЛ». | 1,961,000 | |||
| ChemDB | химическая база данных | маленькие молекулы | «ChemDB». | 5,000,000 | ||||
| ChemExper | Химический справочник Chemexper | каталог химикатов | CASno Структура УЛЫБКИ | «ХимЭкспер». | ||||
| Химическая книга | "Химическая книга". | |||||||
| Химический регистр | от 20000 поставщиков | CAS Нет в основном от крупных поставщиков | «Химический регистр». | 1,750,000 | ||||
| ChemSpider | Королевское химическое общество | из 275 источников данных | «ChemSpider». | 88,000,000 | ||||
| COD | Открытая база данных кристаллографии | Вильнюсский университет | маленькие молекулы (открытый исходный код) | координаты атомов кристаллической структуры | COD | кураторский | «ХПК». | 460,500 |
| Сборник общепринятых названий пестицидов | Алан Вуд | Пестициды с ISO общие имена | структура, CASNo, название ИЮПАК, SMILES, InChI | кураторский | «Пестициды». | 1,800 | ||
| CompTox | Панель управления CompTox Chemicals | Агентство по охране окружающей среды США | химические вещества, оцененные на предмет потенциальных рисков для здоровья | «CompTox». | ||||
| CosIng | Косметические ингредиенты | Европейская комиссия | косметические ингредиенты | "CosIng". | ||||
| CrystalWorks | Совет по науке и технологиям | «CrystalWorks». | ||||||
| CSD | Кембриджская структурная база данных | Кембриджский центр структурных данных | «CSD». | 1,038,250 | ||||
| CSDB | База данных структуры углеводов | Институт органической химии им. Зелинского | углеводы | ссылки на структуры | ID CSDB | "CSDB". | ||
| CTD | База данных сравнительной токсикогеномики | Отделение биологических наук Государственного университета Северной Каролины | MeSH CAS Нет ChEBI PubChem гены, пути | "CTD". | ||||
| DDB | Дортмундский банк данных | чистые соединения, смеси, газовые гидраты | физические свойства | «DDB». | ||||
| DETHERM | DECHEMA | теплофизические свойства | "DETHERM". | 75,000 | ||||
| DrugBank | Университет Альберты | наркотики | «ДругБанк». | |||||
| DrugCentral | фармацевтические препараты | продукты, содержащие вещества | "DrugCentral". | |||||
| DTP / NCI | Коллекция DTP Open Compound | Национальный институт рака Программа развития терапии | Лечение рака | Номер национального сервисного центра химиотерапии рака | «АКДС / НКИ». | 250,000 | ||
| ECHA | База данных REACH | Европейское химическое агентство | EINECS ELINCS НЛП | Пиктограммы CASNo HPhrases тоннаж | "ECHA / REACH". | 23,000 | ||
| EAWAG-BBD | Биокатализ / База данных биодеградации | Eawag: Швейцарский федеральный институт водных наук и технологий | CAS SMILES pubchem pathways | "EAWAG-BBD". | 1396 | |||
| eMolecules | химические вещества для проверки на наркотики | список поставщиков и каталожные номера | "eMolecules". | 8,000,000[3] | ||||
| ENCS | Японский реестр существующих и новых химических веществ | регулируемые химикаты | «ENCS (на японском языке)». | |||||
| Оцененные кинетические данные | ИЮПАК | константы скорости | кураторский | «Оцененные кинетические данные». | ||||
| FDA SRS | Система регистрации веществ Управления по контролю за продуктами и лекарствами | Национальная медицинская библиотека США | ингредиенты в регулируемых FDA продуктах | UNII inchikey | «FDA SRS». | 781,000 | ||
| FEMA | Библиотека ингредиентов вкуса | Ассоциация производителей ароматизаторов и экстрактов | Номер CAS CFR FEMA | «ФЕМА». | ||||
| FooDB | База данных продуктов питания | Университет Альберты | Пищевые компоненты и добавки | "FooDB". | 70926 | |||
| GlyTouCan | международный репозиторий гликановых структур | Министерство образования, культуры, спорта, науки и технологий | гликаны | WURCS GlycoCT PubChem CID | грамм | "Репозиторий гликанов". | 122194 | |
| Гмелин | База данных Гмелина | Эльзевир | неорганические и металлоорганические соединения | закрытый доступ | 1,500,000 | |||
| G-SRS | Глобальная система регистрации веществ | CAS PubChem ChEMBL INN UNII | «Г-СРС». | 109,260 | ||||
| GMD | База данных метаболома Голма | ГХ / МС метаболитов | «ГМД». | |||||
| Путеводитель по ФАРМАКОЛОГИИ | ИУФАР | лекарства и мишени | ИНН КАС ЧЕБИ ЧЭМБЛ DrugBank PubChem | «Путеводитель по ФАРМАКОЛОГИИ». | ||||
| Закон Генри константы | Институт химии Макса Планка | летучие соединения | Константы закона Генри | из литературы | «Константы закона Генри». | 17350 | ||
| HMDB | База данных метаболома человека | Геном Канада | метаболиты найдено в человеческом теле | биохимические данные, клинические данные | HMDB | "HMDB". | 114,222[4] | |
| ICSC | Международные карты химической безопасности МОТ | Международная организация труда | CAS, номер ЕС, номер UN | «ICSC». | 1784 | |||
| ICSD | База данных неорганических кристаллов | FIZ Karlsruhe GmbH | «МКУР». | 161,030 | ||||
| IEDB | База данных иммунных эпитопов | Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний | Эпитопы в основном пептиды и углеводы | «IEDB». | 3002 непептида | |||
| JECDB | Существующая химическая база данных Японии | CAS EINECS RTECS SDBS TSCA график количества статей в год | «JECDB». | |||||
| J-GLOBAL | Nikaji | Японское агентство науки и технологий | "J-GLOBAL". | |||||
| КЕГГ | Киотская энциклопедия генов и геномов | Центр биоинформатики Киотского университета | Соединения Гликаны (также ферменты, реакции, метаболические пути) | КАС ЧЕБИ ЧЕМБЛ МАССБАНК НИККАДЖИ PubChem PDB-CCD | «КЕГГ». | |||
| Kя База данных | PDSP | связывание лиганда | «База данных Ki». | |||||
| KNApSAcK | Институт науки и технологий Нара | InChI CAS улыбается организмам | C00 | «КНАпСАцК». | ||||
| LINCS | Библиотека интегрированных сетевых сотовых подписей | маленькие молекулы | PubChem ChEMBL улыбается ИнЧИ | LSM | «СВЯЗИ». | 43,700 | ||
| LipidBank | Японская конференция по биохимии липидов | липиды | «ЛипидБанк». | 7,009 | ||||
| LMSD | База данных структуры LIPID MAPS | Липиды | ББМБ ЧЭБИ ПабХим ИнЧИ | LMFA | «LMSD». | 44701 | ||
| LOLI | Список списков | паспорта безопасности, правила | "ЛОЛИ". | |||||
| Mcule | поставляемые химикаты | ИнЧИ, СМИЛЕС, СДФ, физико-химические свойства. | «Мкуле». | 45,000,000 | ||||
| MediaDB | Институт системной биологии | ростовые среды | «MediaDB». | 288 | ||||
| Индекс Merck | Королевское химическое общество | наркотики | «Мерк-Индекс». | 11,500 | ||||
| MeSH | Рубрики медицинской тематики | Национальная медицинская библиотека США | биомедицинский тезаурус | иерархия дескрипторов литературы с MeSH ID | «МеШ». | |||
| MetaCyc | SRI International | метаболические пути; метаболиты | "MetaCyc". | |||||
| MetaboLights | EMBL-EBI | MTBL | «MetaboLights». | |||||
| MetaNetX | метаболические сети | MNXM | «MetaNetX». | |||||
| МЕТЛИН | База данных по метаболитам и химическим веществам | тандемная масс-спектрометрия метаболитов | «МЕТЛИН». | 960,000 | ||||
| МодельSeed | КЕГГ MetaCyc метаболические пути | CPD | "ModelSeed". | |||||
| МолПорт | каталог химикатов | «МолПорт». | ||||||
| MoNA | Mass Bank of North America | масс-спектры | Всплеск ноги Chemspider pubchem chebi CAS | «МоНА». | 200,000 | |||
| Карманный справочник NIOSH | Карманный справочник NIOSH по химической опасности | Национальный институт охраны труда и здоровья | часто используемые химические вещества | пределы воздействия | «НИОШ». | 677 | ||
| Интернет-книга NIST | Интернет-книга NIST по химии | Национальный институт стандартов и технологий | спектры Энергия ионизации КАС масс-спектр, InChI | C + CAS | "Интернет-книга NIST". | |||
| NMRShiftDB | Кельнский университет | органический | спектры ядерного магнитного резонанса | "NMRShiftDB". | 43,581 | |||
| NORMAN SLE | NORMAN Обмен списками подозреваемых | мониторинг окружающей среды | «НОРМАНСКАЯ СЛЭ». | 110,000 | ||||
| OrgSyn | Органический синтез | Organic Syntheses, Inc. | Надежные химические реакции | Доступные для поиска экспериментальные процедуры | Экспертная оценка | "Поиск OrgSyn". | ||
| PDB PDBe | Банк данных о белках в Европе | EMBL-EBI | содержит некоторые химические вещества, а также белки | «PDBe». | ||||
| PATENTSCOPE | ВОИС | «ПАТЕНТСКОП». | 16,000,000 | |||||
| PDB | Банк данных белков RSCB | «PDB». | 166,891 | |||||
| ФармГКБ | Шрирам Центр биоинженерии и Химическая инженерия | цели наркотиков | информация о назначении | кураторский | «ФармГКБ». | |||
| Фенол-Эксплорер | полифенолы, содержащиеся в пище | «Фенол-Эксплорер». | 500 | |||||
| Фосида | Фосфорилирование SIte DAtabase | модификации белков | «Фосида». | |||||
| PoLyInfo | База данных полимеров | Национальный институт материаловедения | физические свойства | «ПолыИнфо». | 26,000 | |||
| PPDB | База данных свойств пестицидов | Отдел исследований сельского хозяйства и окружающей среды, Университет Хартфордшира | Пестициды и их метаболиты | Химическая структура, физико-химические свойства, здоровье человека и экотоксикологические данные | кураторский | «ППДБ». | 2000[5] | |
| ProCarDB | База данных о прокариотических бактериальных каротиноидах | IMTECH | эталонные спектры | «ProCarDB». | 1800 | |||
| PubChem | Национальная медицинская библиотека Национальный центр биотехнологической информации | из 748 источников данных | Структуры, названия и идентификаторы, химические и физические свойства, спектральная информация, соответствующие записи, поставщики химикатов, фармакология и биохимия, использование и производство, безопасность и опасности, токсичность, литература, патенты, биомолекулярные взаимодействия и пути, результаты биологических тестов | «ПабХим». | 103,000,000 | |||
| Reaxys | Эльзевир | химические соединения | Доступные для поиска химические реакции | «О Reaxys». | 118,000,000 | |||
| Ref-DB | База данных химического сдвига белков с повторной ссылкой | белки от BioMagResBank | Повторно привязанный сдвиг ЯМР | "Реф-БД". | 2162 | |||
| Рея | Швейцарский институт биоинформатики | биохимические реакции | ЧЭБИ | кураторский | "Рея". | |||
| RÖMPP | Thieme Gruppe | «РЁМПП». | ||||||
| RTECS | Реестр токсического действия химических веществ | Dassault Systèmes | Токсичность, Литература | «Биовиа-РТЭКС». | 160,000 | |||
| RxNav | Национальная медицинская библиотека США | наркотики | взаимодействия | "RxNav". | ||||
| SciFinder | Химическая служба рефератов из Американское химическое общество | органические, неорганические химические вещества, белки | CASNo | только платный доступ | 130,000,000 | |||
| СкрабХим | скопировано из PubChem | «СкрабХим». | 2,282,992 | |||||
| SDBS | Спектральная база данных для Органические соединения | Национальный институт передовых промышленных наук и технологий (AIST), Япония | Японский | Спектры: ИК-комбинация MASS ESR 1H ЯМР 13C ЯМР | «СДБС». | |||
| База данных метаболомов сыворотки | Центр инноваций метаболомики | найдено в сыворотке крови | «БД сывороточного метаболома». | 4,651 | ||||
| Инструмент выбора растворителя | ACS Green Chemistry Institute | Растворители | Анализ основных компонентов физических свойств | кураторский | «Инструмент выбора растворителя». | 272[6] | ||
| SPRESIсеть | InfoChem Gesellschaft für chemische Information mbH | органические молекулы и реакции | органические структуры | из литературы | "СПРЕСИ". | 5,800,000 | ||
| SpringerМатериалы | Springer | твердые материалы | CAS InChI физические свойства | из литературы | "SpringerMaterials". | 155,165 + 494,942 | ||
| СТРОЧКА | EMBL | от Biocarta, BioCyc, GO, KEGG и Reactome | Химико-белковые взаимодействия | кураторский и предсказанный | "СТЕЖКА". | 500,000 | ||
| SuperDRUG2 | Группа структурной биоинформатики | цели наркотиков | цели, доза, побочные эффекты, Canonical SMILES, Standard InChI, Standard InChIKey, DrugBank, ChEMBL, DrugCentral, KEGG, PubChem, CASRN | SD | «SuperDRUG2». | 4,600 | ||
| Супер натуральный II | химикаты натуральных продуктов | SMILES продавцы | SN00 | «Супер Натуральный II». | 325,508 | |||
| УверенЧЕМБЛ | Европейская лаборатория молекулярной биологии | вещества в патентах | патентный текст | "СурЧЕМБЛ". | ||||
| SwissLipids | Швейцарский институт биоинформатики | липиды | SLM: | "SwissLipids". | ||||
| Цели TDR | Исследования тропических болезней | Лаборатория трипаносоматики | лекарства и мишени | «Цели TDR». | 2,000,000 | |||
| TTD | База данных терапевтических целей | Чжэцзянский университет | лекарства и мишени | УЛЫБКИ InChI CAS PubChem | «ТТД». | 37,316 | ||
| T3DB | База данных токсинов и токсинов-мишеней База данных токсичных экспосом | Университет Альберты | токсины и целевые токсины | T3D | «T3DB». | 3,678 | ||
| UniProt | База знаний UniProt | белки | последовательность, модификации, расположение, организм, подобное | «ЮниПрот». | ||||
| ТОЧКА США | Министерство транспорта США | Руководство по реагированию на чрезвычайные ситуации DOT + другие | перевозимые навалом химикаты | UNnumber Идентификационный номер Организации Объединенных Наций, руководство по реагированию на опасности | «Руководство по реагированию на чрезвычайные ситуации» (PDF). | 3000 | ||
| УФ / видимый спектральный атлас | Атлас спектра газообразных молекул, представляющих интерес для атмосферы, MPI-Mainz UV / VIS | Институт химии Макса Планка | газообразные молекулы | сечения поглощения | из литературы | "УФ / видимый спектральный атлас". | 7313 | |
| YMDB | База данных метаболомов дрожжей | Центр инноваций метаболомики | метаболиты дрожжей | 48 полей данных | YMDB | «ЯМДБ». | 16042 | |
| ЦИНК | ЦИНК не является коммерческим | Калифорнийский университет в Сан-Франциско | покупные вещества | EPA DSS TOX, ChEMBL, HMDB, KEGG, PDB, SMILES | "ЦИНК". | 200,000,000 |
Рекомендации
- ^ «Информационная система исследования химического канцерогенеза (CCRIS) - Источник данных PubChem». pubchem.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2020-08-07.
- ^ "Загрузить данные CCRIS (Информационная система исследований химического канцерогенеза)". www.nlm.nih.gov. Получено 2020-08-07.
- ^ "Vision - eMolecules". www.emolecules.com. Получено 2020-07-27.
- ^ "База данных человеческого метаболома: о базе данных человеческого метаболома". hmdb.ca. Получено 2020-07-27.
- ^ Льюис, Кэтлин А .; Циливакис, Джон; Уорнер, Дуглас Дж .; Грин, Эндрю (2016). «Международная база данных для оценки и управления рисками, связанными с пестицидами». Оценка рисков для человека и окружающей среды: международный журнал. 22 (4): 1050–1064. Дои:10.1080/10807039.2015.1133242. HDL:2299/17565. S2CID 87599872.
- ^ Diorazio, Louis J .; Хосе, Дэвид Р. Дж .; Адлингтон, Нил К. (2016). «На пути к более целостной структуре выбора растворителя». Исследования и разработки в области органических процессов. 20 (4): 760–773. Дои:10.1021 / acs.oprd.6b00015.