KLK8 - KLK8

KLK8
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1NPM
Идентификаторы
Псевдонимы	KLK8, HNP, NP, NRPN, PRSS19, TADG14, калликреин-родственная пептидаза 8
Внешние идентификаторы	OMIM: 605644 MGI: 1343327 ГомолоГен: 21410 Генные карты: KLK8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.41 Начните 50,996,007 бп[1] Конец 51,002,711 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 B3 | 7 28,26 см Начните 43,797,577 бп[2] Конец 43,803,826 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • активность пептидазы серинового типа • активность эндопептидазы серинового типа • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточная область • внеклеточный • комплекс ингибиторов сериновых протеаз • секреторная гранула Биологический процесс • организация синапсов • пролиферация кератиноцитов • отрицательная регуляция регенерации аксонов • морфогенез проекции нейронов • смерть клетки • объем памяти • ответ на ранение • отрицательная регуляция миелинизации • регулирование организации синапсов • протеолиз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	11202	259277
Ансамбль	ENSG00000129455	ENSMUSG00000064023
UniProt	O60259	Q61955
RefSeq (мРНК)	NM_001281431 NM_007196 NM_144505 NM_144506 NM_144507	NM_008940 NM_001324398
RefSeq (белок)	NP_001268360 NP_009127 NP_653088 NP_653089 NP_653090	NP_001311327 NP_032966
Расположение (UCSC)	Chr 19:51 - 51 Мб	Chr 7: 43,8 - 43,8 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Калликреин-8 это белок что у людей кодируется KLK8 ген.^{[5][6][7][8][9]}

Калликреины представляют собой подгруппу сериновых протеаз, выполняющих различные физиологические функции. Растет количество данных, свидетельствующих о том, что многие калликреины участвуют в канцерогенезе, а некоторые обладают потенциалом в качестве биомаркеров нового рака и других заболеваний. Этот ген является одним из пятнадцати членов подсемейства калликреинов, расположенных в кластере на хромосоме 19. Альтернативное сплайсинг этого гена приводит к четырем вариантам транскрипта, кодирующим четыре разные изоформы. Изоформы демонстрируют различные паттерны экспрессии, которые предполагают роль в пластичности мозга и раке яичников.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000129455 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064023 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мицуи С., Цуруока Н., Ямаширо К., Наказато Х., Ямагути Н. (май 1999 г.). «Новая форма человеческого нейропсина, связанная с мозгом сериновая протеаза, генерируется путем альтернативного сплайсинга и преимущественно экспрессируется в мозге взрослого человека». Eur J Biochem. 260 (3): 627–34. Дои:10.1046 / j.1432-1327.1999.00213.x. PMID  10102990.
6. Ёсида С., Танигучи М., Хирата А., Шиосака С. (август 1998 г.). «Анализ последовательности и экспрессия кДНК и гена нейропсина человека». Ген. 213 (1–2): 9–16. Дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00232-7. PMID  9714609.
7. Lundwall A, Band V, Blaber M, Clements JA, Courty Y, Diamandis EP, Fritz H, Lilja H, Malm J, Maltais LJ, Olsson AY, Petraki C, Scorilas A, Sotiropoulou G, Stenman UH, Stephan C, Talieri M , Юсеф GM (июнь 2006 г.). «Исчерпывающая номенклатура сериновых протеаз с гомологией тканевых калликреинов». Биол Хим. 387 (6): 637–41. Дои:10.1515 / BC.2006.082. PMID  16800724. S2CID  436200.
8. Diamandis, Eleftherios P ​​.; Депертес, Дэвид; Лундвалл, Оке (июнь 2006 г.). «Труды 1-го Международного симпозиума по калликрейнам, Лозанна, Швейцария, 1-3 сентября 2005 г.». Биол Хим. 387 (6): 635–824. Дои:10.1515 / BC.2006.081. PMID  16800723. S2CID  83910246.
9. «Ген Entrez: KLK8 калликреин-родственная пептидаза 8».

дальнейшее чтение

• Андервуд Л.Дж., Танимото Х., Ван И и др. (1999). «Клонирование ассоциированного с опухолью дифференциально экспрессируемого гена-14, новой сериновой протеазы, сверхэкспрессируемой карциномой яичника». Рак Res. 59 (17): 4435–9. PMID  10485494.
• Харви Т.Дж., Хупер Д.Д., Майерс С.А. и др. (2001). «Тканеспецифические паттерны экспрессии и точное картирование локуса калликреина человека (KLK) на проксимальном участке 19q13.4». J. Biol. Chem. 275 (48): 37397–406. Дои:10.1074 / jbc.M004525200. PMID  10969073.
• Ган Л., Ли И., Смит Р. и др. (2001). «Секвенирование и анализ экспрессии кластера генов сериновой протеазы, расположенного в области хромосомы 19q13». Ген. 257 (1): 119–30. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00382-6. PMID  11054574.
• Магклара А., Скорилас А., Катсарос Д. и др. (2001). «Ген KLK8 человека (нейропсин / овазин): идентификация двух новых вариантов сплайсинга и его прогностическое значение при раке яичников». Clin. Рак Res. 7 (4): 806–11. PMID  11309326.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Cané S, Bignotti E, Bellone S и др. (2004). «Новая сериновая протеаза, ассоциированная с опухолью, дифференциально экспрессируемый ген-14 (KLK8 / Neuropsin / Ovasin) сильно сверхэкспрессируется при раке шейки матки». Am. J. Obstet. Гинеколь. 190 (1): 60–6. Дои:10.1016 / j.ajog.2003.07.020. PMID  14749636.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы 19 человека». Природа. 428 (6982): 529–35. Дои:10.1038 / природа02399. PMID  15057824.
• Шигемаса К., Тиан Х, Гу Л. и др. (2004). «Экспрессия человеческого калликреина 8 (hK8 / TADG-14) связана с ранней клинической стадией и благоприятным прогнозом рака яичников». Онкол. Представитель. 11 (6): 1153–9. Дои:10.3892 / или 11.6.1153. PMID  15138549.
• Ли Y, Qian YP, Yu XJ и др. (2005). «Недавнее происхождение гоминоидной формы сплайсинга нейропсина, гена, участвующего в обучении и памяти». Мол. Биол. Evol. 21 (11): 2111–5. Дои:10.1093 / молбев / мш220. PMID  15282331.
• Раджапаксе С., Огивара К., Такано Н. и др. (2006). «Биохимическая характеристика калликреина 8 человека и его возможное участие в деградации белков внеклеточного матрикса». FEBS Lett. 579 (30): 6879–84. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.11.039. HDL:2115/985. PMID  16337200. S2CID  22439153.
• Киши Т., Клотье С.М., Кундиг С. и др. (2006). «Активация и ферментативная характеристика рекомбинантного калликреина 8 человека» (PDF). Биол. Chem. 387 (6): 723–31. Дои:10.1515 / BC.2006.091. PMID  16800733. S2CID  19299456.
• Шер Ю.П., Чжоу С.К., Чжоу Р.Х. и др. (2007). «Человеческая протеаза калликреина 8 обеспечивает благоприятный клинический исход при немелкоклеточном раке легкого за счет подавления инвазивности опухолевых клеток». Рак Res. 66 (24): 11763–70. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-3165. PMID  17178872.
• Лу Зи X, Пэн Дж, Су Б (2007). «Специфическая для человека мутация приводит к возникновению новой формы сплайсинга нейропсина (KLK8), гена, участвующего в обучении и памяти». Гм. Мутат. 28 (10): 978–84. Дои:10.1002 / humu.20547. PMID  17487847. S2CID  6001199.

внешняя ссылка

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: S01.244