Гаплогруппа G-M406 - Haplogroup G-M406

Гаплогруппа G2a2b1
Возможное время происхождениявозможно, 4000 лет назад
Возможное место происхождениявозможно Анатолийское - Восточное Средиземное море
ПредокГаплогруппа G2a2b (L30 / PF3267 / S126)
ПотомкиG2a2b1a1a
Определение мутацийM406 (G2a2b1), L14 / S130 (G2a2b1a1a), L645 (G2a2b1a1b2a)

В генетика человека, Гаплогруппа G-M406 это Y-хромосома гаплогруппа. G-M406 является ветвью Гаплогруппа G Y-ДНК (M201). Более конкретно, в порядке убывания, G-M406 является дочерней ветвью также G2 (P287), G2a (P15) и, наконец, G2a2b (L30 / S126). Гаплогруппа G-M406 кажется наиболее распространенной в индюк и Греция. Вторичные концентрации G-M406 обнаружены в северной и восточной частях Средиземноморья, и в очень небольших количествах он обнаружен в более внутренних районах Европа, то Средний Восток, а южный Кавказские горы площадь.

Генетические особенности

Большое количество человек G-M406 имеет ценность 21 на короткий тандемный повтор (STR) маркер DYS390, и все мужчины G-M406 будут иметь M406 SNP мутация, которая характеризует эту группу. Число 21 в DYS390 необычно среди людей G за пределами группы G-M406. У людей G-M406 маркер DYS391 в основном имеет значение 10, но иногда и 11, а DYS392 почти всегда равно 11, за исключением одного отдельного кластера. Если образец соответствует критериям, указанным для этих трех маркеров, скорее всего, это G-M406.

Впервые об этом M406 SNP было сообщено в 2008 году.[1] Обозначение M указывает на то, что он был впервые идентифицирован в Стэндфордский Университет. M406 расположен на Y-хромосоме в позиции 2809995, ссылочный идентификатор SNP i4000120. Мутация включает изменение с Т на G.

Было обнаружено, что SNP L184 и L185 (соответственно 17586994 с мутацией от A до G и 20922998 с мутацией от C до G) существуют только у некоторых членов семейства M406 + и теперь считаются частными SNP, не имеющими практического применения за пределами этого семья.

Возраст происхождения G-M406

Исследования не касались возраста G-M406. Основываясь на доступных образцах STR с 67 маркерами, можно предположить, что мутация, определяющая G-M406, возникла, возможно, около 4000 лет назад.

Географическое распределение

Способность точно описать распределение G-M406 затруднена из-за недавней идентификации определяющего SNP G-M406 и, как следствие, небольшого количества образцов, протестированных на M406. Однако некоторая оценка процентного содержания G-M406 может быть сделана, если отметить процент мужчин с образцами STR-маркера G, которые имеют отличительное значение 21 в DYS390, обнаруженных почти исключительно среди G-людей в G-M406, и используя образцы, протестированные в коммерческих целях. лабораториях и в исследовательских работах.

Турция и Греция

Возможно около 5% мужчин в индюк являются G-M406, это самый высокий процент населения в любой стране, где проводилась выборка. Эта цифра в 5% основана на обнаружении значения 21 для маркера STR DYS390 в 21 из 57 образцов G со всей Турции. Среди лиц G значение 21 в подавляющем большинстве случаев наблюдается у лиц G-M406. Но значения, отличные от 21, в небольшой степени встречаются у людей G-M406. Таким образом, общий процент G-M406 в турецком G, вероятно, близок к 50 процентам, а 57 подтвержденных SNP образцов G представляют 11% из 523 турецких образцов, полученных в ходе крупнейшего исследования генетики турецкого населения.[2]

В соседних Греция, Тестирование SNP показало, что половина из восьми образцов G была G-M406. Образцы G представляют 5% из 171 греческой выборки. В отличие от соседних Крит, G-M406 составлял только 20% из 21 образцов G, а образцы G составляли 11% из 193 островных образцов.[1] Хотя в данном исследовании Крит рассматривается отдельно, Крит является частью Греции, но с другой историей поселений. Дальше в Средиземном море, в меньшей выборке от Кипр 4 из 7 образцов G имеют отличительное значение 21, которое в подавляющем большинстве случаев наблюдается у людей с G-M406.[3]

Средний Восток

К югу от Турции среди Курды из Ирак 7 из 14 вероятных образцов G STR в База данных YHRD имеют значение 21 при DYS390, что позволяет предположить, что половина населения G принадлежит к G-M406.[4] Этот относительно высокий процент G-M406 ограничен северным курдским регионом страны.

Ливан, Иордания и Палестина также имеют значительные популяции G-M406, хотя небольшие размеры выборки затрудняют общие выводы. В одном исследовании 4 из 5 палестинских образцов G имеют отличительное значение DYS390 = 21.[5] В Ливане по крайней мере 10 из 37 образцов G имеют свойства G-M406 и встречаются среди всех основных религий.[6] В Иордании 7 из 15 доступных образцов G имеют 21 маркер DYS390.[3] Ни один из образцов G среди Друзы Люди в этих местах имеют значения маркера STR, типичные для людей G-M406, согласно недавним исследованиям.[7] Тем не менее, недавнее тестирование Family TreeDNA указывает на некоторые семьи, происхождение которых лежит в Палестине / Израиле, но которые переехали в Ливан или Сирию до периода 1500-1700 годов, которые являются носителями около 50-60% друзов среди гаплогруппы. G населения в друзах. Первоначально имеется разумная уверенность в том, что образцы принадлежат подгруппе DYS459 = 8 (что также отрицательно для его собственной подгруппы DYS392 = 12). В целом, эти наборы связанных подгрупп составляют основную часть мужчин G-M406 и отрицательны для подгрупп, определенных SNP L14 и L645. В образце есть несколько значений маркера, которые немного отличаются, а образцы друзов имеют 22 на DYS390 по сравнению с более типичным 21 в большинстве образцов G-M406. Так что это хорошее косвенное свидетельство того, что по крайней мере половина G среди друзов - это G-M406. В Сирия, G-M406 кажется менее распространенным, чем в странах, расположенных ближе к Средиземному морю. Только 3 из 17 образцов G имеют обсуждаемое значение 21.[3]

Другие области

Самый большой источник образцов G STR из Иран это База данных YHRD где только 1 из 340 иранских образцов имеет значение 21 для DYS390 вместе с другими значениями маркера, соответствующими образцам G-M406.[4] Возможно, люди G-M406 в Иране имеют разные значения маркеров STR. Страны, разделяющие Персидский залив и Оманский залив с Ираном были предметом отдельного небольшого исследования, в ходе которого были предоставлены образцы STR с G-образцами, аналогичными образцам в Иране. Но процент G-M406 (исходя из значения 21) кажется выше, чем в Иране в Дубай с половиной из 6 образцов G с 21. Ни один из трех образцов G из Йемен и Саудовская Аравия имел это значение DYS390.[8]

В исследовании Насидзе[9] из Кавказские горы области, его 87 вероятных образцов G STR теперь в База данных YHRD есть только 8 образцов с отличительным значением DYS390, равным 21, что является отличительной чертой группы G-M406. Только в Грузия где в 3 из 16 вероятных образцов G содержится 21, очевидно ли, что G-M406 присутствует в значительной степени.[4]

Информационный бюллетень проекта Haplogroup G[10] постепенно подводит итоги процента мужчин G-M406 в другие области основан на вероятных или проверенных образцах G-M406 из большой базы данных проекта G.[11] Этот источник более надежен при идентификации совокупности образцов G-M406, поскольку он не полагается на значение маркера STR DYS390 в качестве единственного критерия.

Информационный бюллетень указывает (в порядке убывания) в Италия 20% образцов 156 G ......Испания 15% образцов 56 G .....Нидерланды 15% образцов 20 G ......Швейцария 8% образцов 51 G .....Иран 6% образцов 34 G ....Польша 4% образцов 75 G ......Франция 4% образцов 46 G ......Ирландия 3% из 29 образцов G .......Индия 3% образцов 18 G.

Кроме того, исследование, в ходе которого были представлены образцы STR-маркеров из Индии и Пакистана, не обнаружило, что какой-либо из образцов 20 G из различных групп содержал значение DYS390 = 21, столь типичное для G-M406.[12] И исследование Сардиния обнаружено, что 7% из 51 G STR образцов имели характеристическое значение 21.[13] Возможно, имеет значение то, что половина из этих «21» образцов была обнаружена в стране убежища древнего сардинского населения в изолированном центральном нагорье, которое не имеет свидетельств оккупации внешними колониальными державами, начиная с Финикийский период.[14] На испанских островах к западу от Сардинии в другом исследовании ни один из образцов 7 G STR из Ибица являются G-M406, но 2 из 4 образцов G в Майорка имеют значение DSY390, равное 21. Это же исследование обнаружило одно значение 21 среди 25 G Сефардские евреи чья история переплетается с Испанией.[15] Из 291 STR-образца всех типов в База данных YHRD[4] от Египет Ни один из образцов DYS390 = 21 не обладает такими же характеристиками, как известные образцы G-M406 из других районов Средиземноморья.

Подгруппы G-M406

L14 G2a2b1a1a

G2a2b1a1a характеризуется наличием мутации SNP, обозначенной как L14 или S130. Люди G2a2b1a1a обычно имеют значения DYF395S1 16,16 и значение DYS565 11.

L14 и S130 - разные обозначения одной и той же мутации SNP. Версия L14 была разработана в Семейное древо ДНК, а S130 был разработан в компании Ethnoancestry. Но впервые эта мутация была обнаружена в Университет Центральной Флориды в 2006 году как U16 и задолго до того, как ассоциированные исследователи опубликовали в 2009 году формальное описание его местоположения по адресу 21327383 на Y-хромосоме, номер ссылки rs35474563. Мутация включает изменение C на T.[16]

Еще один интересный SNP - S133, который впервые был идентифицирован в 2008 г. в компании Ethnoancestry в г. Лондон, Англия в лице G-M406, но он также доступен как L90 в другом месте. Его расположение на Y-хромосоме указано как 20087688, номер ссылки rs35169834. Мутация представляет собой изменение с G на A. У нескольких человек, у которых была обнаружена эта мутация, она не образует отдельную категорию от G2a2b1a1a, потому что у испытуемых также была мутация, которая определяет G2a2b1a1a (L14 или S130). Возможно, есть люди, которые являются положительными (производными) для L14 / S130 и отрицательными (наследственными) для L90 / S133, и такая ситуация потребует создания отдельной категории G-M406.

L645 G2a2b1a1b2a

G2a2b1a1b2a характеризуется наличием мутации SNP, обозначенной как L645. G2a2b1a1b2a пока что все люди имеют значение 9 на маркере STR DYS578. Были определены как европейские, так и ближневосточные члены этой подгруппы. L645 был впервые идентифицирован в Семейное древо ДНК летом 2011 года. Он был обнаружен в позиции хромосомы 2948673 и представляет собой мутацию от A до C.

Кластер DYS454 = 12

Есть скопление мужчин G-M406 не принадлежащих к подгруппе G2a2b1a1a, которые (1) имеют необычное (для мужчин G-M406) значение 12 по STR-маркеру DYS454 вместо предкового значения 11 (2) и имеют относительно близкое генетическая дистанция при сравнении 67 маркеров. Общий общий предок мог жить около 2000 лет назад. Этот STR-маркер DYS454 не так надежен, как мутация SNP для классификации мужчин, но значение 12 плюс другие необычные особенности и близкая генетическая дистанция делают эту подгруппу уверенной. Некоторые люди, принадлежащие к этому кластеру, могли иметь более недавних предков, которые мутировали до значения, отличного от 12, но такие образцы не обнаружены.

Многие мужчины в этом кластере развили одну или две другие мутации в маркерах STR, которые делают кластер еще проще идентифицировать. Наибольшее количество людей из группы имеют мутацию в DYS459a от предковых 9 до 8. И многие имеют мутацию от предковых 11 до 12 по DYS392. Значение DYS392 = 12 наблюдается почти исключительно у лиц G1, причем этот кластер G-M406 является главным исключением.

Этот кластер, кажется, в подавляющем большинстве состоит из трех идентифицируемых этнических групп (а) Евреи ашкенази на основе отличительных фамилий вместе с предками в северо-восточной Европе к югу от Скандинавии, (б) Conversos с латиноамериканскими фамилиями и (c) Мужчины итальянского происхождения. Однако доступный образец из Ирана, вероятно, также принадлежит к этому кластеру. Евреи-ашкенази до сих пор не входят в группу с предковыми 11 по DYS392. И латиноамериканцы пока не входят в группу DYS392 = 12. (См. Также покрытие страницы Евреи с гаплогруппой G (Y-ДНК) ).

Кластер DYS459b = 10

Мужчины в этой группе мужчин G-M406 делают не принадлежат к подгруппе G2a2b1a1a и имеют (1) необычное (для мужчин G-M406) значение 10 для STR-маркера DYS459b вместо предкового значения 9 (2) и имеют относительно близкое генетическая дистанция при сравнении 67 маркеров. Это пока относительно небольшой кластер с французской и британской историей предков. Доступно слишком мало образцов, чтобы с некоторой степенью достоверности оценить, когда, возможно, жил общий предок этого кластера по мужской линии.

Кластер DYS436 = 14

Мужчины в этой группе мужчин G-M406 делают не принадлежат к подгруппе G2a2b1a1a и имеют необычное (для мужчин G-M406) значение 14 на STR-маркере DYS436 вместо наследственного значения 12. Это пока относительно небольшой кластер, предки которого относятся к Галиции и Стране Басков в Испании и различные части Португалии. Доступно слишком мало образцов, чтобы с некоторой степенью достоверности оценить, когда, возможно, жил общий предок этого кластера по мужской линии.

Миграции G-M406 человек

Логично, что G-M406 распространился на запад вдоль Средиземного моря из области, где он наиболее сконцентрирован сегодня (Турция и страны Восточного Средиземноморья), в связи с торговлей, продажей рабов и другими миграционными событиями, происходящими на этих землях. Первой великой торговой империей, соединившей оба берега Средиземного моря, была Финикийская, которая возникла в районе Израиль-Ливан-Иордания. После гибели финикийцев греки, римляне, византийцы и некоторые «варвары» могли распространить G-M406 из восточного Средиземноморья на запад.

В сравнении 67-маркерных образцов G-M406 STR[11] доступны во внутренней Европе с аналогичными образцами из (1) Турции (2) Ливана-Иордании и (3) Армении, можно сделать определенные выводы. У большинства европейцев G-M406 армяне являются ближайшими родственниками. Судя по количеству наблюдаемых мутаций, некоторые из них, вероятно, имеют общих мужских предков еще недавно, как Темные времена. Только один европеец показал образцы из Иордании / Ливана в качестве ближайших родственников G. Точно так же никто из европейцев не показал одних турок как ближайших родственников, скорее, в некоторых европейских образцах турки и армяне были в равной степени родственны.

Наличие общих предков гораздо более давних времен (возможно, 3500 лет назад) среди некоторых из этих образцов не дает такой полезной информации, поскольку миграция на запад могла произойти в любое время в более ранний период. Однако обнаружение вероятных образцов G-M406 в древних изолированных горных районах Сардинии предполагает прибытие G-M406 на этот остров до прибытия Финикийцы. Последние начали свое присутствие на побережье Сардинии около 3000 лет назад.

В настоящее время нет информации, объясняющей распространение G-M406 в южной части Индии.

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б King, R.J .; Özcan, S. S .; Картер, Т .; Kalfolu, E .; Атасой, С .; Triantaphyllidis, C .; Kouvatsi, A .; Lin, A. A .; и другие. (2008). "Дифференциальные анатолийские влияния Y-хромосомы на греческий и критский неолит". Анналы генетики человека. 72 (2): 205–214. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2007.00414.x. PMID  18269686. S2CID  22406638.
  2. ^ Cinnioglu, C .; King, R; Кивисилд, Т; Kalfoğlu, E; Атасой, С; Cavalleri, GL; Lillie, AS; Roseman, CC; и другие. (Январь 2004 г.). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии» (PDF). Генетика человека. 114 (2): 127–48. Дои:10.1007 / s00439-003-1031-4. PMID  14586639. S2CID  10763736. Архивировано из оригинал (PDF) 19 июня 2006 г.
  3. ^ а б c Эль Сибай, М .; и другие. (2009). «Географическая структура генетического ландшафта Y-хромосомы Леванта: контраст между прибрежными и внутренними районами». Анналы генетики человека. 73 (6): 568–81. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2009.00538.x. ЧВК  3312577. PMID  19686289.
  4. ^ а б c d "YHRD: Справочная база данных STR гаплотипов Y-хромосомы". yhrd.org.
  5. ^ Zalloua, P .; и другие. (2008). «Выявление генетических следов исторической экспансии: финикийские следы в Средиземноморье». Американский журнал генетики человека. 83 (5): 633–42. Дои:10.1016 / j.ajhg.2008.10.012. ЧВК  2668035. PMID  18976729.
  6. ^ Zalloua, P .; и другие. (2008). «Разнообразие Y-хромосомы в Ливане определяется недавними историческими событиями». Американский журнал генетики человека. 82 (4): 873–82. Дои:10.1016 / j.ajhg.2008.01.020. ЧВК  2427286. PMID  18374297.
  7. ^ Шлуш, Л .; Скорецкий, Карл; Юдковский, Геннадий; Темплтон, Алан; Хадид, Ярин; Базис, Фуад; Хаммер, Майкл; Ицковиц, Шалев; и другие. (2008). Геммелл, Нил Джон (ред.). "Друзы: популяционный генетический рефугиум Ближнего Востока". PLOS ONE. 3 (5): e2105. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2105S. Дои:10.1371 / journal.pone.0002105. ЧВК  2324201. PMID  18461126.
  8. ^ Alshamali, F; и другие. (2009). «Структура местного населения Аравийского полуострова, выявленная разнообразием Y-STR». Человеческая наследственность. 68 (1): 45–54. Дои:10.1159/000210448. PMID  19339785.
  9. ^ Насидзе, И .; и другие. (2003). «Проверка гипотез языковой замены на Кавказе: данные по Y-хромосоме» (PDF). Генетика человека. 112 (3): 255–61. Дои:10.1007 / s00439-002-0874-4. PMID  12596050. S2CID  13232436. Архивировано из оригинал (PDF) на 2010-12-27. Получено 2009-11-17.
  10. ^ "Yahoo! Группы". tech.groups.yahoo.com.
  11. ^ а б "..Рестры проектов - Проект Гаплогруппа G". sites.google.com.
  12. ^ Senpugta, S .; и другие. (2006). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как аборигенное, так и экзогенное расширение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека. 78 (2): 202–21. Дои:10.1086/499411. ЧВК  1380230. PMID  16400607.
  13. ^ Contu, D .; Кукка, Франческо; Сантони, Федерико; Фостер, Джейми У .; Франкалаччи, Паоло; и другие. (2008). Ястребы, Джон (ред.). «Доказательства на основе Y-хромосомы для донеолитического происхождения генетически однородного, но разнообразного населения Сардинии: выводы для ассоциативного сканирования». PLOS ONE. 3 (1): e1430. Bibcode:2008PLoSO ... 3.1430C. Дои:10.1371 / journal.pone.0001430. ЧВК  2174525. PMID  18183308.
  14. ^ Zei, G .; и другие. (2003). «От фамилий к истории Y-хромосомы: население Сардинии как парадигма». Европейский журнал генетики человека. 11 (10): 802–07. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201040. PMID  14512971.
  15. ^ Адамс, Ф .; и другие. (2009). «Генетическое наследие религиозного разнообразия и нетерпимости: отцовское происхождение христиан, евреев и мусульман на Пиренейском полуострове». Американский журнал генетики человека. 83 (6): 725–36. Дои:10.1016 / j.ajhg.2008.11.007. ЧВК  2668061. PMID  19061982.
  16. ^ Sims, L .; Баллантайн, Джек; и другие. (2009). Батцер, Марк А. (ред.). «Филогения гаплогруппы G с улучшенным разрешением в Y-хромосоме, выявленная набором недавно охарактеризованных SNP». PLOS ONE. 4 (6): e5792. Bibcode:2009PLoSO ... 4.5792S. Дои:10.1371 / journal.pone.0005792. ЧВК  2686153. PMID  19495413.