HAVCR1 - HAVCR1

HAVCR1
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5DZO, 5F70
Идентификаторы
Псевдонимы	HAVCR1, HAVCR, HAVCR-1, KIM-1, KIM1, TIM, TIM-1, TIM1, TIMD-1, TIMD1, CD365, клеточный рецептор 1 вируса гепатита А.
Внешние идентификаторы	OMIM: 606518 ГомолоГен: 134424 Генные карты: HAVCR1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q33.3 Начинать 157,029,413 бп[1] Конец 157,059,119 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность рецептора вируса Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • подвижная ресничка • мембрана Биологический процесс • GO: 0022415 вирусный процесс • вирусное проникновение Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26762	н / д
Ансамбль	ENSG00000113249	н / д
UniProt	Q96D42	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001099414 NM_001173393 NM_001308156 NM_012206	н / д
RefSeq (белок)	NP_001166864 NP_001295085 NP_036338	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 5: 157.03 - 157.06 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Клеточный рецептор 1 вируса гепатита А (HAVcr-1), также известный как Т-клеточный иммуноглобулин и муциновый домен 1 (ТИМ-1) - это белок что у людей кодируется HAVCR1 ген.^[3][4][5]

Он также известен как KIM-1 Kidney Injury Molecule -1, который является белком, который наиболее сильно активируется в поврежденных почках при различных типах повреждений. Его повышенная регуляция при повреждении почек была обнаружена в почках позвоночных, таких как рыбки данио и люди.

Клеточный рецептор 1 вируса гепатита A (HAVCR1 / TIM-1) является членом семейства генов TIM (трансмембранные Т-клетки, иммуноглобулин и муцин), которые играют важную роль в регулировании иммунная клетка активность, особенно в отношении ответа хоста на вирусная инфекция. ТИМ-1 также участвует в аллергический ответ, астма, и переносимость трансплантата.

Семейство генов TIM было впервые клонировано из мышиной модели астмы в 2001 году.^[4] Впоследствии было продемонстрировано, что члены семейства генов TIM, включая TIM-1, участвуют в организме хозяина. иммунная реакция. Семейство генов TIM мыши содержит восемь членов (TIM-1-8), тогда как только три гена TIM (TIM-1, ТИМ-3, и ТИМ-4 ) были обнаружены у людей.

Структура и функции

Гены ТИМ относятся к поверхностному типу I гликопротеины, которые включают N-терминал иммуноглобулин (Ig) -подобный домен, a муцин домен с разной длиной, один трансмембранный домен, а C-терминал короткая цитоплазматический хвост. Локализация и функции генов TIM различны для каждого члена. TIM-1 предпочтительно выражается на Клетки Th2 и был идентифицирован как молекула, стимулирующая Т-клетка активация.^[6] TIM-3 предпочтительно экспрессируется на клетках Th1 и Tc1 и функционирует как ингибирующая молекула, которая опосредует апоптоз клеток Th1 и Tc1.^[7] TIM-4 предпочтительно выражается на антигенпрезентирующие клетки, модулируя фагоцитоз из апоптотический ячеек, взаимодействуя с фосфатидилсерин (PS) экспонируются на поверхности апоптотических клеток.^[8]

Роль в вирусной инфекции

Гены TIM также участвуют во взаимодействии вируса-хозяина. В качестве рецепторов фосфатидилсерина белки TIM связывают многие семейства вирусов [филовирус, флавивирус, аренавирус Нового Света и альфавирус], включая такие вирусы, как лихорадка денге и лихорадка Эбола. На проникновение вируса лихорадки Ласса, вируса гриппа A и коронавируса SARS экспрессия TIM-1 не влияла. ТИМ-1 и ТИМ-4 увеличивали проникновение вирусов больше, чем ТИМ-3.^[9]

Гепатит А

TIM-1 был определен как фактор прикрепления для экзосома -в упаковке вирус гепатита А (HAV).^[10] Инфекционные HAV-содержащие экзосомы интернализуются HAVCR1, но истинное проникновение в цитозоль достигается за счет слияния с NPC1. Также было показано, что неэкзосомная инфекция HAV (инкапсидируемая) происходит независимо от экспрессии HAVCR1. Используя библиотеку клонирования выражений, IgA был продемонстрирован как специфический лиганд TIM-1. Объединение ТИМ-1 и IgA смог усилить взаимодействие вирус-рецептор.^[11]

Эбола

Недавно было показано, что TIM-1 является рецептором или кофактором для Вирус Эбола Вход. TIM-1 связывается с гликопротеинами (GP) вируса Эбола и опосредует проникновение вируса Эбола в клетки, увеличивая инфекционность вируса Эбола в клеточных линиях с низкой чувствительностью. Более того, снижение экспрессии эндогенного TIM-1 в высокопермиссивных клеточных линиях снижает инфекционность вируса Эбола.^[12] Кроме того, специфичное к домену TIM-1 IgV антитело ARD5 ингибировало инфекционность вируса Эбола, что указывает на то, что TIM-1 имеет решающее значение для проникновения вируса Эбола. Кроме того, экспрессия TIM-1 на эпителиальных клетках слизистой оболочки человека из трахеи, роговицы и конъюнктивы продемонстрировала корреляцию функции экспрессии TIM-1 и путей проникновения вируса.

Денге

TIM-1 был идентифицирован как клеточный фактор для Вирус денге проникновение за счет сверхэкспрессии TIM-1 в линиях малочувствительных клеток к инфекции вируса денге. TIM-1 увеличил инфекционность вируса денге в 500 раз, в частности, увеличил интернализацию вируса. TIM-1 напрямую взаимодействовал с частицей вируса денге, узнавая PS на поверхности вириона.^[13] Кроме того, чувствительность различных клеточных линий к вирусу Денге соответствовала уровню эндогенной экспрессии гена TIM-1 в таких клеточных линиях, что позволяет предположить, что TIM-1 имеет решающее значение для проникновения вируса Денге.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113249 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Фейгельсток Д., Томпсон П., Матту П., Чжан Ю., Каплан Г. Г. (август 1998 г.). «Человеческий гомолог HAVcr-1 кодирует клеточный рецептор вируса гепатита А». Журнал вирусологии. 72 (8): 6621–6628. Дои:10.1128 / JVI.72.8.6621-6628.1998. ЧВК  109848. PMID  9658108.
4. Макинтайр Дж. Дж., Умецу С. Е., Акбари О., Поттер М., Кучро В. К., Барш Г. С., Фриман Г. Дж., Умецу Д. Т., ДеКрюфф Р. Х. (ноябрь 2001 г.). «Идентификация Tapr (регуляторный локус гиперреактивности дыхательных путей) и связанное семейство генов Tim». Иммунология природы. 2 (12): 1109–1116. Дои:10.1038 / ni739. PMID  11725301. S2CID  7243788.
5. «Ген Entrez: клеточный рецептор 1 вируса гепатита A HAVCR1».
6. Умецу С.Е., Ли В.Л., Макинтайр Дж.Дж., Дауни Л., Санджанвала Б., Акбари О., Берри Г.Дж., Нагумо Х., Фриман Г.Дж., Умецу Д.Т., ДеКрюфф Р.Х. (май 2005 г.). «TIM-1 индуцирует активацию Т-лимфоцитов и подавляет развитие периферической толерантности». Иммунология природы. 6 (5): 447–454. Дои:10.1038 / ni1186. PMID  15793575. S2CID  29071338.
7. Чжу С., Андерсон А.С., Шубарт А., Сюн Х., Имитола Дж., Хури С.Дж., Чжэн ХХ, Стром Т.Б., Кучру В.К. (декабрь 2005 г.). «Лиганд Tim-3 галектин-9 отрицательно регулирует иммунитет Т-хелперов 1 типа». Иммунология природы. 6 (12): 1245–1252. Дои:10.1038 / ni1271. PMID  16286920. S2CID  24886582.
8. Кобаяши Н., Карисола П., Пенья-Крус В., Дорфман Д. М., Дзинуши М., Умецу С.Е., Бьютт М.Дж., Нагумо Х., Чернова И., Чжу Б., Шарп А.Х., Ито С., Дранофф Г., Каплан Г.Г., Касасновас Д.М., Умецу Д.Т., Декрюфф Р.Х., Фриман Г.Дж. (декабрь 2007 г.). «Гликопротеины TIM-1 и TIM-4 связывают фосфатидилсерин и опосредуют захват апоптозных клеток». Иммунитет. 27 (6): 927–940. Дои:10.1016 / j.immuni.2007.11.011. ЧВК  2757006. PMID  18082433.
9. Джемилити С., Ван Дж. Дж., Чан Ю. К., Ахмед А. А., Ли В., Монахан С., Бу Икс, Фарзан М., Фриман Г. Дж., Умецу Д. Т., Декрюфф Р. Х., Чо Х (март 2013 г.). «Белки семейства TIM способствуют инфицированию множества вирусов в оболочке через связанный с вирионом фосфатидилсерин». Патогены PLOS. 9 (3): e1003232. Дои:10.1371 / journal.ppat.1003232. ЧВК  3610696. PMID  23555248.
10. Костафреда, Мария Изабель; Аббаси, Абдолрахим; Лу, Синьи; Каплан, Херардо (сентябрь 2020 г.). «Мимикрия экзосом путем эндосомного слияния HAVCR1-NPC1 опосредует вирусную инфекцию гепатита А». Природная микробиология. 5 (9): 1096–1106. Дои:10.1038 / с41564-020-0740-у. ISSN  2058-5276. ЧВК  7483988. PMID  32541946.
11. Тами С., Зильберштейн Э, Манангисваран М., Фриман Дж. Дж., Умецу С. Е., ДеКрюфф Р. Х., Умецу Д. Т., Каплан Г. Г. (апрель 2007 г.). «Иммуноглобулин A (IgA) является естественным лигандом клеточного рецептора 1 вируса гепатита A (HAVCR1), и ассоциация IgA с HAVCR1 усиливает взаимодействия вирус-рецептор». Журнал вирусологии. 81 (7): 3437–3446. Дои:10.1128 / JVI.01585-06. ЧВК  1866050. PMID  17229699.
12. Кондратович А.С., Леннеманн Нью-Джерси, Шинн П.Л., Дэйви Р.А., Хант К.Л., Моллер-Танк S, Мейерхольц DK, Реннер П., Маллинз Р.Ф., Бриндли М., Сандерсфельд Л.М., Куинн К., Веллер М., МакКрей П.Б., Кьорини Дж., Мори В. (май 2011 г.). «Т-клеточный иммуноглобулин и муциновый домен 1 (TIM-1) является рецептором для Заирского эболавируса и вируса Марбургского озера Виктория». Труды Национальной академии наук США. 108 (20): 8426–8431. Bibcode:2011PNAS..108.8426K. Дои:10.1073 / pnas.1019030108. ЧВК  3100998. PMID  21536871.
13. Меертенс Л., Карнек Х, Лекойн М.П., ​​Рамдаси Р., Гивель-Бенхассин Ф., Лью Э., Лемке Дж., Шварц О., Амара А. (октябрь 2012 г.). «Семейства TIM и TAM рецепторов фосфатидилсерина опосредуют проникновение вируса денге». Клеточный микроб-хозяин. 12 (4): 544–557. Дои:10.1016 / j.chom.2012.08.009. ЧВК  3572209. PMID  23084921.

дальнейшее чтение

• Куманого А, Кикутани Х (2004). «Иммунные семафорины: новое направление исследований семафоринов». Журнал клеточной науки. 116 (Pt 17): 3463–3470. Дои:10.1242 / jcs.00674. PMID  12893810.
• Макинтайр Дж. Дж., Умецу Д. Т., ДеКрюфф Р. Х. (2004). «TIM-1, новый ген восприимчивости к аллергии и астме». Семинары Springer по иммунопатологии. 25 (3–4): 335–348. Дои:10.1007 / s00281-003-0141-3. PMID  15007635. S2CID  24297235.
• Томпсон П., Лу Дж., Каплан Г.Г. (1998). «Богатая Cys область клеточного рецептора 1 вируса гепатита А требуется для связывания вируса гепатита А и защитного моноклонального антитела 190/4». Журнал вирусологии. 72 (5): 3751–3761. Дои:10.1128 / JVI.72.5.3751-3761.1998. ЧВК  109597. PMID  9557657.
• Байи В., Чжан З., Мейер В., Кейт Р., Саникола М., Бонвентре СП (2002). «Отключение молекулы-1 повреждения почек, предполагаемого белка адгезии, участвующего в регенерации почек». Журнал биологической химии. 277 (42): 39739–39748. Дои:10.1074 / jbc.M200562200. PMID  12138159.
• Ногути Э., Накаяма Дж., Камиока М., Итикава К., Шибасаки М., Аринами Т. (2003). «Кодирующие вставки / делеции полиморфизмы в hHAVcr-1 не связаны с атопической астмой у населения Японии». Гены и иммунитет. 4 (2): 170–173. Дои:10.1038 / sj.gene.6363935. PMID  12618867.
• Макинтайр Дж. Дж., Умецу С. Е., Макаубас К., Хойте Е. Г., Цинниоглу С., Кавалли-Сфорца Л. Л., Барш Г. С., Халлмайер Дж. Ф., Андерхилл, Пенсильвания, Риш, Нью-Джерси, Фриман Дж. Дж., ДеКрюфф Р. Х., Умецу Д. Т. (2003). «Иммунология: связь вируса гепатита А с атопическим заболеванием». Природа. 425 (6958): 576. Bibcode:2003Натура.425..576М. Дои:10.1038 / 425576a. PMID  14534576. S2CID  4430747.
• Чае С.К., Сон Дж. Х., Хео Дж. К., Ли Ю. К., Ким Дж. В., Чанг Х. «Молекулярные вариации в промоторных и кодирующих областях человеческого гена Tim-1 и их связь у корейцев с астмой». Иммунология человека. 64 (12): 1177–1182. Дои:10.1016 / j.humimm.2003.09.011. PMID  14630400.
• Чае С.К., Сон Дж. Х., Ли Ю. К., Ким Дж. В., Чанг Х. Т. (2004). «Связь вариаций экзона 4 гена Tim-1 с аллергическими заболеваниями в корейской популяции». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 312 (2): 346–350. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.10.125. PMID  14637143.
• Вила М.Р., Каплан Г.Г., Фейгельшток Д., Надаль М., Мороте Дж., Порта Р., Беллмант Дж., Месегер А. (2004). «Рецептор вируса гепатита А блокирует дифференцировку клеток и сверхэкспрессируется в светлоклеточной почечно-клеточной карциноме». Kidney International. 65 (5): 1761–1773. Дои:10.1111 / j.1523-1755.2004.00601.x. PMID  15086915.
• Месри М., Смитсон Дж., Гхатпанд А., Чаповал А., Шеной С., Болдог Ф., Хакетт С., Пена К.Э., Берджесс С., Бендел А., Шимкетс Р.А., Старлинг Г.С. (2006). «Ингибирование Т-клеточных ответов in vitro и in vivo рекомбинантными белками внеклеточного домена Tim-1 человека». Международная иммунология. 18 (3): 473–484. Дои:10.1093 / intimm / dxh388. PMID  16481347.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–814. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Kotsis F, Nitschke R, Boehlke C, Башкуров M, Walz G, Kuehn EW (2007). «Передача сигналов цилиарного кальция модулируется молекулой повреждения почек-1 (Kim1)». Pflügers Archiv. 453 (6): 819–829. Дои:10.1007 / s00424-006-0168-0. PMID  17205356. S2CID  20769028.