GoLoco мотив - GoLoco motif
| GoLoco мотив | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура человеческого gα i1, связанного с мотивом голоко rgs14 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | GoLoco | ||||||||
| Pfam | PF02188 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR003109 | ||||||||
| УМНАЯ | GoLoco | ||||||||
| SCOP2 | 1kjy / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
GoLoco мотив это белок структурный мотив.[1][2][3]
В гетеротримерный G-белок сигнализация, рецепторы клеточной поверхности (GPCR ) связаны с мембранно-ассоциированными гетеротримерами, содержащими GTP-гидролизующую субъединицу G-альфа и G-бета / G-гамма димер. Неактивная форма содержит альфа-субъединицу, связанную с GDP, и комплексы с бета- и гамма-субъединицами. Когда лиганд связан с рецептором, GDP вытесняется из G-альфа и GTP связывается. Комплекс GTP / G-альфа отделяется от тримера и связывается с эффектором до тех пор, пока внутренняя активность GTPase G-альфа не вернет белок в форму, связанную с GDP. Реассоциация GDP-связанного G-альфа с димером G-бета / G-гамма обрывает сигнал. Несколько механизмов регулируют выходной сигнал на разных стадиях каскада G-белков. Два класса внутриклеточных белков действуют как ингибиторы активации G-белка: белки, активирующие GTPase (GAP), которые усиливают гидролиз GTP (см. PDOC50132 ) и ингибиторы диссоциации гуанина (GDI), которые ингибируют диссоциацию GDP. GoLoco или мотив регулятора G-белка (GPR), обнаруженный в различных регуляторах G-белка.[1][4] действует как GDI на G-alpha (i).[2][5]
Структура
Кристаллическая структура мотива GoLoco в комплексе с G-альфа (i) была решена.[6] Он состоит из трех небольших альфа-спиралей. Высококонсервативная триада Asp-Gln-Arg в мотиве GoLoco непосредственно участвует в связывании GDP, расширяя боковую цепь аргинина в карман связывания нуклеотидов, что очень напоминает каталитический аргинин палец используется в белке, активирующем ГТФазу (см. PDOC50238 ). Это добавление аргинина в связывающий карман влияет на взаимодействие GDP с G-альфа и, следовательно, определенно важно для активности GoLoco GDI.[6]
Примеры
Некоторые белки, о которых известно, что они содержат мотив GoLoco, перечислены ниже:
- Млекопитающие регуляторы передачи сигналов G-белков 12 и 14 (RGS12 и RGS14), многогранные регуляторы передачи сигналов.
- Loco, гомолог RGS12 дрозофилы.
- Белок-2 клеток Пуркинье млекопитающих (Pcp2). Он может действовать как специфический модулятор клеточного типа для передачи клеточных сигналов, опосредованной G-белком. Он уникально экспрессируется в клетках Пуркинье мозжечка и биполярных нейронах сетчатки.
- Эукариотический Rap1GAP. Активатор ГТФазы для связанного с ядерным ras регуляторного белка RAP-1A.
- Белок дрозофилы Rapsynoid (также известный как Partner of Inscuteable, Pins) и его гомологи у млекопитающих, AGS3 и LGN. Они образуют семейство регуляторов G-белков, которое также содержит повторы TPR.
Белки человека, содержащие этот домен, включают:
Рекомендации
- ^ а б Сидеровски Д.П., Диверсе-Пьерлуиси М., Де Фриз Л. (сентябрь 1999 г.). «Мотив GoLoco: мотив связывания Galphai / o и потенциальный фактор обмена гуанин-нуклеотид». Trends Biochem. Наука. 24 (9): 340–1. Дои:10.1016 / s0968-0004 (99) 01441-3. PMID 10470031.
- ^ а б Де Врис Л., Фишер Т., Трончер Х., Братья Г.М., Строкбайн Б., Сидеровски Д.П., Фаркуар М.Г. (декабрь 2000 г.). «Активатор передачи сигналов 3 G-белка является ингибитором диссоциации гуанина для субъединиц Galpha i». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (26): 14364–9. Дои:10.1073 / пнас.97.26.14364. ЧВК 18924. PMID 11121039.
- ^ Кимпл Р.Дж., Кимпл М.Э., Беттс Л., Сондек Дж., Сидеровски Д.П. (апрель 2002 г.). «Структурные детерминанты GoLoco-индуцированного ингибирования высвобождения нуклеотидов субъединицами Galpha». Природа. 416 (6883): 878–81. Дои:10.1038 / 416878a. PMID 11976690.
- ^ Понтинг CP (1999). «Raf-подобные Ras / Rap-связывающие домены в сигнальных белках RGS12 и натюрмортах» (PDF). J. Mol. Med. 77 (10): 695–698. Дои:10.1007 / s001099900054. PMID 10606204.
- ^ Артемьев Н.О., Наточин М., Лестер Б., Петерсон Ю.К., Бернар М.Л., Ланье С.М. (2000). «AGS3 ингибирует диссоциацию GDP от субъединиц galpha семейства Gi и зависимую от родопсина активацию трансдуцина». J. Biol. Chem. 275 (52): 40981–40985. Дои:10.1074 / jbc.M006478200. PMID 11024022.
- ^ а б Сидеровски Д.П., Кимпл Р.Дж., Кимпл М.Э., Беттс Л., Сондек Дж. (2002). «Структурные детерминанты GoLoco-индуцированного ингибирования высвобождения нуклеотидов субъединицами Galpha». Природа. 416 (6883): 878–881. Дои:10.1038 / 416878a. PMID 11976690.
 | Этот мембранный белок –Связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |