Вирус бессимптомной ослиной орхидеи - Donkey orchid symptomless virus

Вирус бессимптомной ослиной орхидеи
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область:	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Kitrinoviricota
Учебный класс:	Alsuviricetes
Заказ:	Tymovirales
Семья:	Alphaflexiviridae
Род:	Platypuvirus
Разновидность:	Вирус бессимптомной ослиной орхидеи

Вирус бессимптомной ослиной орхидеи (DOSV) был впервые обнаружен в Перт, Австралия который расположен на западной стороне Австралия. В Юго-западная австралийская флористическая область очень биоразнообразие и уединенный с пустыни с востока и северо-востока, а с юга - океан. Здесь проживает около 8000 человек. местные виды растений которые привыкли жить в средиземноморский климат. Такой климат означает, что растения приспособились к жизни в неплодородная почва, сухость, выдерживает частые пожары в области. Из 394 наземных орхидея видов, 76 из этих видов находятся под угрозой исчезновения. Причины, по которым растениям угрожает опасность в этой области, могут быть связаны со скоростью, с которой они воспроизводят плоды, опыляют или контактируют с людьми.^[1]

Экспериментальные данные

В 2011–2013 гг. Три исследователя провели исследование общих ослиные орхидеи. Статья, опубликованная в 2013 году, называется: Вирус ослиной орхидеи без симптомов: вирусный «утконос» из австралийских наземных орхидей. С помощью этого эксперимента исследователи смогли выполнить всю последовательность генома для Вирус бессимптомной ослиной орхидеи. Необычность этого вируса заключается в том, что он не вызывает видимых симптомов заражения орхидей, отсюда и название. Вирус бессимптомной ослиной орхидеи.^[1]

До сих пор он был замечен только у австралийских наземных орхидей. Диурис длиннолистный, обычно называемые «орхидеей обыкновенного осла» и другой наземной орхидеей, Caladenia latifolia (розовая сказочная орхидея). Эти растения росли на оставшейся части леса в Перте. Вирус был идентифицирован у 3 растений: 2 орхидеи обыкновенного осла (из них было протестировано 264 растения) и 1 растение из группы Caladenia latifolia (розовая сказочная орхидея), на которых было протестировано 129. У орхидеи осла лепестки в виде ушей, отсюда и название.^[1]

DOSV, скорее всего, эволюционировал в Западная Австралия потому что до сих пор он был найден только в орхидеях эндемичный в этот регион, но возможно, что он мог быть доставлен за границу из другого региона, но исследователи не уверены, откуда он пришел и как попал в Австралию. Следовательно, никто не знает вектора для Вирус бессимптомной ослиной орхидеи (насекомое, млекопитающее и др.).^[1]

На данный момент DOSV встречается реже, чем другие вирусы растений, потому что он был обнаружен только у 2 распространенных орхидей осла из 294, которые были протестированы. Необычность этого растительного вируса может быть связана с небольшим количеством протестированных растений в этом исследовании, конкретной областью, в которой были протестированы растения, или тем, что два вида орхидей, инфицированных DOSV, были недостаточно изучены. Орхидея обыкновенного осла не находится под угрозой, что может означать множество вещей, включая то, что сам вирус имеет плохой способ проникновения, репликации и т. Д. Редкость вируса также может быть связана с неэффективной передачей от растения к растению или неизвестным вектор может быть необычным в этом регионе Австралии.^[1]

В ходе экспериментов, проведенных в 2011, 2012 и 2013 годах, было доказано, что лиофилизация (замораживание листьев опытных растений) инактивирует репликацию вируса. В замороженных листьях орхидей вирус не обнаружен в РНК. В незамороженных листьях орхидей ДОСВ была обнаружена в вирусной РНК.

Чтобы оценить, как DOSV распространяется среди диких орхидей в Западной Австралии, ОТ-ПЦР был использован для анализа РНК, взятой из листьев орхидей обыкновенного осла, и «две пары праймеров, которые были использованы, были DOSV8F5200 и DOSV8R6100; DOSV10F6800 и DOSV10R7700) ».^[1] Таким образом, исследователи смогли выяснить, присутствует ли вирус в РНК тестируемых ослиных орхидей.^[1]

Структура классификации вирусов

Вирус бессимптомной ослиной орхидеи это одноцепочечный РНК-вирус с положительным смыслом. Вирус в порядке Tymovirales и репликаза происхождение Потексвирус -подобно. Считается, что вирион DOSV больше похож на «гибкий ’ форма стержня а не икосаэдр форма.

В белки движения вируса, похоже, тесно связаны с Фуровирус, который является вирусом в семье Virgaviridae. Этот вирус также использует растения в качестве хозяин и имеет двудольный геном, прямо как ДОСВ.

Геном

Вирус имеет двудольный геном, что означает, что геном сегментирован на две части вместо одной части, а размер генома составляет 7,8. kb по размеру.^{[нужна цитата ]}

РНК из растений была предварительно экстрагирована, чтобы увидеть, содержит ли РНК вирус. Отсюда исследователи смогли определить последовательность геном вируса. Результаты секвенирования пришли к выводу, что геном содержит «7 открытые рамки для чтения вместе с 5 ’нетранслируемой областью и 3’ UTR »(непереведенной областью).^[1] 5’UTR и 3’UTR (146–147 нт в длину) не идентичны каким-либо другим известным вирусам, поэтому эти области генома специфичны для DOSV.^[1]

Вирус бессимптомной ослиной орхидеи также есть предполагаемый белок оболочки и белок движения. Белок движения в DOSV помогает вирусу перейти от инфицированной клетки к полностью здоровой. Затем это позволяет вирусу инфицировать здоровую клетку, проникая в клеточные механизмы и управляя ими, выполняя трансляцию вирусного вируса. мРНК наряду с репликацией вирусного генома. Как только вирус реплицируется в клетке, он может захватить клетку и вызвать ее гибель.

Вход в камеру

Исследования проникновения вируса в клетки растений не проводились, но поскольку он тесно связан с Фуровирус, возможно, вирус имеет аналогичный способ проникновения. Фуровирус проникает в растительную клетку, проникая в плазматическая мембрана а затем вирусная РНК попадает в цитоплазма ячейки. С этого момента вирус использует собственный механизм клетки для выполнения транскрипция и репликация.

Репликация и транскрипция

Информации о репликации и транскрипции Вирус бессимптомной ослиной орхидеи потому что не было проведено много исследований. Однако, как упоминалось ранее, DOSV тесно связан с Фуровирус который осуществляет транскрипцию и репликацию с использованием собственных механизмов растительной клетки.

Репликаза в DOSV имеет сходную идентичность с вирусами растений этого семейства, Alphaflexiviridae, которые также являются (+) ssRNA-вирусами, которые используют растения в качестве хозяев. Вирусы в Alphaflexiviridae семья проникает в клетки растений и размножается так же, как Фуровирус.

Другой вирус, который находится в Alphaflexiviridae и очень похож на DOSV. Platypuvirus. Этот вирус реплицируется аналогично другому упомянутому вирусу (Фуровирус) в том смысле, что он проникает в клетку, а репликация происходит с использованием «вирусных фабрик» в клетке.

Модуляция хост-процессов / взаимодействие с хостом

Не было проведено много исследований, посвященных точному взаимодействию с хостом или влиянию на процессы хоста. Это могло быть связано с тем, что вирусы растений не так хорошо изучены, как вирусы животных. Однако исследователи обнаружили, что вирус заставляет листья становиться некротический. Само растение не обязательно проявляет видимые симптомы снаружи, но они есть внутри.^[1]

Сопутствующие заболевания

Когда вирус размножается в растении, он может вызвать инфекцию, которая привела к следующим видимым симптомам: деформация листьев, мозаика на листьях и задержка роста.

Тропизм

Хотя исследования реакции орхидеи обыкновенного осла на ДОСВ не проводились, исследователи имеют заметили, что большинство орхидей в регионе Западной Австралии кажутся здоровыми. Это может быть связано с тем, что переносчик вируса (который неизвестен) оказался неэффективным при заражении орхидей, типом окружающей среды, в которой находятся орхидеи, или это могло быть связано с выживанием наиболее приспособленных среди популяции орхидей.^[1]