Цианофаг N-1 - Cyanophage N-1

Цианофаг N-1
Классификация вирусов
Группа:
Группа I (дцДНК )
Заказ:
Caudovirales
Семья:
Myoviridae
Род:
Цианомиовирус (предлагается)
Разновидность:
Цианофаг N-1

Цианофаг N-1 это миовирус бактериофаг поражающий пресноводные нитчатые цианобактерии из Носток род.[1] Вирус был впервые выделен Кеннетом Адольфом и Робертом Хазелкорном в 1971 году в США из азотфиксирующий цианобактерии, Носток Muscorum.[2][3] N-1 тесно связан с цианофагом A-1, но только отдаленно от других цианофаги пресноводного или морского происхождения.[1]

Структура

Вирус имеет многогранную головку диаметром около 61 нм. Сократительный хвост имеет длину 100 нм и прикрепляется к голове через хвостовую часть. В области шеи есть волокна. Зрелая вирусная частица содержит не менее 19 белков.[2][4][5]

Геном

Линейная двухцепочечная ДНК геном имеет длину 64 960 пар оснований - это только половина размера большинства фагов с сократительными хвостами, которые обычно находятся в диапазоне 161–231 т.п.н. Оно имеет GC-контент 35,4%. Из 91 открытые рамки для чтения (ORF), только 33 обнаруживают сходство с другими известными последовательностями. Примечательно, что геном Cyanophage N1 кодирует функциональную CRISPR array, который был предложен для защиты хозяина от заражения конкурирующими вирусами.[1]

Жизненный цикл и взаимодействие с хозяином

Оптимальный pH для вирусная адсорбция к N. muscorum составляет 7,6–8,1. Скорость адсорбции снижается с увеличением возраста клеток-хозяев. Вирусный Инкубационный период составляет 7 часов, что аналогично цианофагам LPP-1 группа. Размер пакета 100бляшкообразователи на ячейку.[6]

Хозяин фотосинтез требуется для репликации вируса, при этом фотосинтез требуется на протяжении всего жизненного цикла, а не в какой-либо конкретный момент. Репликация вирусов обеспечивается циклическое фотофосфорилирование и использование углевод магазины; фотосистема II активность не требуется.[7][8] Инфекция цианофагом N-1 N. muscorum связан с несколькими изменениями в метаболизме углерода и азота в организме хозяина, включая увеличение глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа концентрация фермента и снижение глютамин синтетаза Мероприятия.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c Chénard C, Wirth JF, Suttle CA (2016), «Вирусы, заражающие пресноводные нитчатые цианобактерии (Носток sp.) кодируют функциональную матрицу CRISPR и протеобактериальную ДНК-полимеразу B », мБио, 7: e00667-16, Дои:10,1128 / мBio.00667-16, ЧВК  4916379, PMID  27302758
  2. ^ а б Адольф К.В., Хазелкорн Р. (1971), "Выделение и характеристика вируса, инфицирующего сине-зеленые водоросли. Nostoc muscorum", Вирусология, 46: 200–208, Дои:10.1016/0042-6822(71)90023-7
  3. ^ Сарма 2012, с. 420, 423
  4. ^ Сарма 2012, стр. 423
  5. ^ Адольф К.В., Хаселкорн Р. (1973), "Вирус сине-зеленых водорослей N-1: Физические свойства и разборка на структурные части", Вирусология, 53: 427–40, Дои:10.1016/0042-6822(73)90222-5
  6. ^ Сарма 2012, стр. 427, 429
  7. ^ Сарма 2012, стр. 430
  8. ^ Календарь на 2006 год, стр. 524
  9. ^ Сарма 2012, стр. 433

Источники

  • Календарь R. Бактериофаги (Oxford University Press; 2006) (ISBN  0195148509)
  • Сарма ТА. Справочник по цианобактериям (CRC Press; 2012) (ISBN  1466559411)