COPS2 - COPS2

COPS2
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4D10, 4D18, 4WSN
Идентификаторы
Псевдонимы	COPS2, ALIEN, CSN2, SGN2, TRIP15, COP9 сигнальная субъединица 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 604508 ГомолоГен: 134283 Генные карты: COPS2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q21.1 Начните 49,106,068 бп[1] Конец 49,155,661 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность преобразователя сигнала • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • Сигналосома COP9 • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • эксцизионная репарация нуклеотидов, распознавание повреждений ДНК • дифференциация нейронов • клеточная пролиферация • преобразование сигнала • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты • дифференциация клеток скелетных мышц • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • нейрогенез • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • белковое денддилирование • посттрансляционная модификация • фосфорилирование белков • пролиферация клеток внутренней клеточной массы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9318	н / д
Ансамбль	ENSG00000166200	н / д
UniProt	P61201	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_004236 NM_001143887	н / д
RefSeq (белок)	NP_001137359 NP_004227	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 15: 49.11 - 49.16 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Сигналосомный комплекс COP9 субъединица 2 это белок что у людей кодируется COPS2 ген.^[3][4][5] Он кодирует субъединицу Сигналосома COP9.

Взаимодействия

COPS2 был показан взаимодействовать с участием:

• DAX1,^[6]
• IRF8,^[7]
• NIF3L1,^[8] и
• THRA.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166200 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Ли Дж. У., Чой Х. С., Гьюрис Дж., Брент Р., Мур Д. Д. (июль 1995 г.). «Два класса белков, которые зависят от наличия или отсутствия тироидного гормона для взаимодействия с рецептором тироидного гормона». Мол Эндокринол. 9 (2): 243–54. Дои:10.1210 / me.9.2.243. PMID  7776974.
4. Сигер М., Крафт Р., Феррелл К., Беч-Отсшир Д., Дамди Р., Шаде Р., Гордон С., Науманн М., Дубиль В. (апрель 1998 г.). «Новый белковый комплекс, участвующий в передаче сигнала, обладающий сходством с субъединицами 26S протеасомы». FASEB J. 12 (6): 469–78. Дои:10.1096 / fasebj.12.6.469. PMID  9535219.
5. «Ген Entrez: субъединица 2 конститутивного фотоморфогенного гомолога COPS2 COP9 (Arabidopsis)».
6. Altincicek B, Tenbaum SP, Dressel U, Thormeyer D, Renkawitz R, Baniahmad A (март 2000 г.). «Взаимодействие корепрессора Alien с DAX-1 отменяется мутациями DAX-1, участвующими в врожденной гипоплазии надпочечников». J. Biol. Chem. 275 (11): 7662–7. Дои:10.1074 / jbc.275.11.7662. PMID  10713076.
7. Коэн Х., Азриэль А., Коэн Т., Мераро Д., Хашмуэли С., Бех-Отсчир Д., Крафт Р., Дубиль В., Леви Б.З. (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие между связывающим консенсусную последовательность интерферона белком и COP9 / субъединицей CSN2 (Trip15). Возможная связь между передачей сигналов фактора регуляции интерферона и COP9 / сигнаносомой». J. Biol. Chem. 275 (50): 39081–9. Дои:10.1074 / jbc.M004900200. PMID  10991940.
8. Акияма Х., Фудзисава Н., Таширо Ю., Таканабэ Н., Сугияма А., Таширо Ф. (март 2003 г.). «Роль транскрипционного корепрессора Nif3l1 на ранней стадии нейральной дифференцировки через сотрудничество с Trip15 / CSN2». J. Biol. Chem. 278 (12): 10752–62. Дои:10.1074 / jbc.M209856200. PMID  12522100.
9. Dressel U, Thormeyer D, Altincicek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (май 1999 г.). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных гормонов». Мол. Cell. Биол. 19 (5): 3383–94. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3383. ЧВК  84131. PMID  10207062.

внешние ссылки

• Человек COPS2 расположение генома и COPS2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Человек CSN2 расположение генома и CSN2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Вольф Д.А., Чжоу С., Ви С. (2004). «Сигналосома COP9: платформа для сборки и обслуживания лигаз убиквитина cullin?». Nat. Cell Biol. 5 (12): 1029–33. Дои:10.1038 / ncb1203-1029. PMID  14647295.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Вэй Н, Цуге Т., Серино Дж., Дохмае Н., Такио К., Мацуи М., Дэн XW (1998). «Комплекс COP9 сохраняется у растений и млекопитающих и связан с регуляторным комплексом протеасомы 26S». Curr. Биол. 8 (16): 919–22. Дои:10.1016 / S0960-9822 (07) 00372-7. PMID  9707402.
• Шефер Л., Берманн М.Л., Миллер Дж. Б. (1999). «Кодирующая последовательность, геномная организация, хромосомная локализация и паттерн экспрессии сигнального компонента Cops2: мышиный гомолог чужеродной дрозофилы». Геномика. 56 (3): 310–6. Дои:10.1006 / geno.1998.5728. PMID  10087198.
• Dressel U, Thormeyer D, Altincicek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (1999). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных гормонов». Мол. Cell. Биол. 19 (5): 3383–94. Дои:10.1128 / mcb.19.5.3383. ЧВК  84131. PMID  10207062.
• Науманн М., Бех-Отсшир Д., Хуанг Х, Феррелл К., Дубиль В. (2000). «Направленная сигнаносомой COP9 активация / стабилизация c-Jun не зависит от JNK». J. Biol. Chem. 274 (50): 35297–300. Дои:10.1074 / jbc.274.50.35297. PMID  10585392.
• Алтинчичек Б., Тенбаум С.П., Дрессел Ю., Тормейер Д., Ренкавиц Р., Баниахмад А. (2000). «Взаимодействие корепрессора Alien с DAX-1 отменяется мутациями DAX-1, участвующими в врожденной гипоплазии надпочечников». J. Biol. Chem. 275 (11): 7662–7. Дои:10.1074 / jbc.275.11.7662. PMID  10713076.
• Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Е М., Чжоу Дж., Сюй Ш., Гу Дж., Ши Дж. Х, Джин В. Р., Чжан СК, Ву TM, Хуан Г. Ю., Чен З, Чен М. Д., Чен Дж. Л. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Коэн Х., Азриэль А., Коэн Т., Мераро Д., Хашмуэли С., Бех-Отсчир Д., Крафт Р., Дубиль В., Леви Б.З. (2001). «Взаимодействие между связывающим консенсусную последовательность интерферона белком и COP9 / субъединицей CSN2 (Trip15). Возможная связь между передачей сигналов фактора регуляции интерферона и COP9 / сигнаносомой». J. Biol. Chem. 275 (50): 39081–9. Дои:10.1074 / jbc.M004900200. PMID  10991940.
• Цугэ Т., Мацуи М., Вэй Н. (2001). «Субъединица 1 сигнаносомы COP9 подавляет экспрессию гена через свой N-концевой домен и включается в комплекс через домен PCI». J. Mol. Биол. 305 (1): 1–9. Дои:10.1006 / jmbi.2000.4288. PMID  11114242. S2CID  14434381.
• Бех-Отсчир Д., Крафт Р., Хуанг Х, Хенкляйн П., Капелари Б., Поллманн С., Дубиль В. (2001). «Фосфорилирование, специфичное для сигнаносомы COP9, направлено на деградацию p53 под действием убиквитиновой системы». EMBO J. 20 (7): 1630–9. Дои:10.1093 / emboj / 20.7.1630. ЧВК  145508. PMID  11285227.
• Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цуге Т., Чжоу С., Вольф Д.А., Вей Н., Шевченко А., Дешайс Р.Дж. (2001). «Содействие расщеплению конъюгата NEDD-CUL1 сигнаносомой COP9». Наука. 292 (5520): 1382–5. Дои:10.1126 / science.1059780. PMID  11337588.
• Хоро Алвес К., Бочард В., Рети С., Жалино П. (2002). «Ассоциация протоонкопротеина Int-6 млекопитающих с тремя белковыми комплексами eIF3, сигнаносомой COP9 и протеасомой 26S». FEBS Lett. 527 (1–3): 15–21. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03147-2. PMID  12220626.
• Акияма Х, Фудзисава Н, Таширо Й, Таканабэ Н, Сугияма А, Таширо Ф (2003). «Роль транскрипционного корепрессора Nif3l1 на ранней стадии нейральной дифференцировки через сотрудничество с Trip15 / CSN2». J. Biol. Chem. 278 (12): 10752–62. Дои:10.1074 / jbc.M209856200. PMID  12522100.
• Серино Дж., Су Х, Пэн З., Цугэ Т., Вэй Н, Гу Х, Дэн XW (2003). «Характеристика последней субъединицы сигнаносомы Arabidopsis COP9: значение для общей структуры и происхождения комплекса». Растительная клетка. 15 (3): 719–31. Дои:10.1105 / tpc.009092. ЧВК  150025. PMID  12615944.
• Uhle S, Medalia O, Waldron R, Dumdey R, Henklein P, Bech-Otschir D, Huang X, Berse M, Sperling J, Schade R, Dubiel W (2003). «Протеинкиназа CK2 и протеинкиназа D связаны с сигнаносомой COP9». EMBO J. 22 (6): 1302–12. Дои:10.1093 / emboj / cdg127. ЧВК  151059. PMID  12628923.