CLK3 (ген) - CLK3 (gene)

CLK3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EU9, 2EXE, 2WU6, 2WU7, 3RAW
Идентификаторы
Псевдонимы	CLK3, PHPHCLK3 / 152, CDC-подобная киназа 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 602990 MGI: 1098670 ГомолоГен: 101534 Генные карты: CLK3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q24.1 Начните 74,598,500 бп[1] Конец 74,645,414 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 млрд Начните 57,750,624 бп[2] Конец 57,765,860 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • киназная активность • активность протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • протеин-серин / треонин / тирозинкиназная активность • активность протеинтирозинкиназы • Связывание АТФ • идентичное связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • ядерное пятнышко • мембрана • нуклеоплазма • Акросома • цитоскелет промежуточных филаментов • цитоплазматический пузырек • ядро клетки Биологический процесс • фосфорилирование • фосфорилирование белков • регуляция сплайсинга РНК • аутофосфорилирование • фосфорилирование пептидил-тирозина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1198	102414
Ансамбль	ENSG00000179335	ENSMUSG00000032316
UniProt	P49761	O35492
RefSeq (мРНК)	NM_001130028 NM_001292 NM_003992	NM_007713
RefSeq (белок)	NP_001123500 NP_003983	NP_031739
Расположение (UCSC)	Chr 15: 74,6 - 74,65 Мб	Chr 9: 57.75 - 57.77 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеинкиназа двойной специфичности CLK3 является фермент что у людей кодируется CLK3 ген.^[5][6]Ген CLK3 кодирует серин / треонин тип белок киназа с несохраняемым N-концевой домен. Длинная и короткая изоформы (phclk3 и pclk3 / 152) являются результатом альтернативное сращивание и сосуществуют в разных тканях. Изоформа phclk3 / 152 лишена киназного домена.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000179335 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032316 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Hanes J, von der Kammer H, Klaudiny J, Scheit KH (январь 1995 г.). «Характеристика путем клонирования кДНК двух новых протеинкиназ человека. Доказательства путем сравнения последовательностей нового семейства протеинкиназ млекопитающих». Дж Мол Биол. 244 (5): 665–72. Дои:10.1006 / jmbi.1994.1763. PMID  7990150.
6. Talmadge CB, Finkernagel S, Sumegi J, Sciorra L, Rabinow L (декабрь 1998 г.). «Хромосомное картирование трех генов, кодирующих протеинкиназу LAMMER человека». Hum Genet. 103 (4): 523–4. Дои:10.1007 / s004390050861. PMID  9856501.
7. «Ген Entrez: CDC-подобная киназа 3 CLK3».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Дункан П.И., Стойдл Д.Ф., Мариус Р.М. и др. (1998). «Протеинкиназы двойной специфичности Clk2 и Clk3 регулируют внутриядерное распределение белков SR и влияют на сплайсинг пре-мРНК». Exp. Cell Res. 241 (2): 300–8. Дои:10.1006 / excr.1998.4083. PMID  9637771.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК». Геном Биол. 5 (2): R8. Дои:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. ЧВК  395752. PMID  14759258.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.
• Виссинг Дж., Янш Л., Нимц М. и др. (2007). «Протеомический анализ протеинкиназ с помощью селективного по целевым классам префракционирования и тандемной масс-спектрометрии». Мол. Клетка. Протеомика. 6 (3): 537–47. Дои:10.1074 / mcp.T600062-MCP200. PMID  17192257.

внешняя ссылка

• Киназы двойной специфичности Clk в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек CLK3 расположение генома и CLK3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.