CCR4-Нет - CCR4-Not
Структура человеческого модуля CNOT1-CNOT2-CNOT3 (PDB 4C0D).[1]
Cарбон Cатаболит рдепрессияNотважный Оп ТБез ATA или CCR4-Нет, это мультипротеиновый комплекс это функционирует в экспрессии генов.[2][3] Комплекс обладает множественной ферментативной активностью, как поли (А) 3′-5′ экзонуклеаза и убиквитинлигаза.[4][5][6][7] Комплекс присутствует как в ядро где он регулирует транскрипцию и в цитоплазма где это связано с переводом рибосом и Обработка РНК тела.[2][3]
Подразделения
Комплекс CCR4-Not человека состоит из структурных (некаталитических) субъединиц и субъединиц, которые имеют экзонуклеаза и E3 лигаза Мероприятия. Некоторые, но не все субъединицы человека сохраняются в бутоньерки.[8]
| Субъединица | МВт (кДа)[A] | Ключевая особенность |
|---|---|---|
| CNOT1 | 267 | «Эшафот» с некаталитической функцией. Связан с обслуживанием эмбриональные стволовые клетки.[9] |
| CNOT2 | 60 | Структурная составляющая. Связан с обслуживанием эмбриональные стволовые клетки.[9] |
| CNOT3 | 82 | Структурная составляющая. Связан с обслуживанием эмбриональные стволовые клетки.[10][9] |
| CNOT4 | 64 | Активен как E3 убиквитин лигаза.[7] |
| CNOT6 | 63 | 3′-5′ экзонуклеаза с предпочтением полиаденилированный подсостояния мРНК.[5] Имеет человеческий паралог CNOT6L. |
| CNOT7 | 33 | 3′-5′ экзонуклеаза это частично дублирует CNOT7.[4] |
| CNOT8 | 34 | 3′-5′ экзонуклеаза.[4] |
| CNOT9 | 34 | Выполняет некаталитическую функцию.[11] |
| CNOT10 | 82 | Некаталитическая субъединица, образующая модуль с CNOT11, отсутствующий у грибов.[12] |
| CNOT11 | 55 | Некаталитическая субъединица, образующая модуль с CNOT10, отсутствующий у грибов.[12] |
А Молекулярный вес человеческих субъединиц от Uniprot.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Боланд, Андреас; Чен, Инь; Райш, Тобиас; Йонас, Стефани; Кузуоглу-Озтюрк, Дуйгу; Вольболд, Лара; Weichenrieder, Оливер; Изаурральде, Элиза (13.10.2013). «Строение и сборка модуля НЕ человеческого комплекса CCR4 – НЕ». Структурная и молекулярная биология природы. ООО "Спрингер Сайенс энд Бизнес Медиа". 20 (11): 1289–1297. Дои:10.1038 / nsmb.2681. ISSN 1545-9993. PMID 24121232.
- ^ а б Колларт, Мартина А. (29 января 2016 г.). «Комплекс Ccr4-Not является ключевым регулятором экспрессии эукариотических генов». Междисциплинарные обзоры Wiley: РНК. Вайли. 7 (4): 438–454. Дои:10.1002 / wrna.1332. ISSN 1757-7004. ЧВК 5066686. PMID 26821858.
- ^ а б Миллер, Джейсон Э .; Риз, Джозеф К. (15 марта 2012 г.). «Ccr4-Not complex: уродство контроля над эукариотическими клетками». Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии. Informa UK Limited. 47 (4): 315–333. Дои:10.3109/10409238.2012.667214. ISSN 1040-9238. ЧВК 3376659. PMID 22416820.
- ^ а б c Аслам, Ахмед; Mittal, Saloni; Кох, Фредерик; Андрау, Жан-Кристоф; Винклер, Г. Себастьян (2009). Виккенс, Марвин (ред.). «Ccr4 – недеаденилазные субъединицы CNOT7 и CNOT8 имеют перекрывающиеся роли и модулируют пролиферацию клеток». Молекулярная биология клетки. Американское общество клеточной биологии (ASCB). 20 (17): 3840–3850. Дои:10.1091 / mbc.e09-02-0146. ISSN 1059-1524. ЧВК 2735483. PMID 19605561.
- ^ а б Чен Дж., Чанг Ю.С., Денис К.Л. (март 2002 г.). «CCR4, 3'-5'-поли (A) РНК и экзонуклеаза оцДНК, является каталитическим компонентом цитоплазматической деаденилазы». EMBO J. 21 (6): 1414–26. Дои:10.1093 / emboj / 21.6.1414. ЧВК 125924. PMID 11889047.
- ^ «Ген Entrez: транскрипционный комплекс CNOT6 CCR4-NOT, субъединица 6».
- ^ а б Альберт, Томас К .; Ханзава, Хироюки; Legtenberg, Yvonne I.A .; de Ruwe, Marjolein J .; van den Heuvel, Fiona A.J .; Collart, Martine A .; Боеленс, Рольф; Тиммерс, Х.Т. Марк (01.02.2002). «Идентификация субъединицы убиквитин-протеин-лигаза в репрессорном комплексе транскрипции CCR4-NOT». Журнал EMBO. Вайли. 21 (3): 355–364. Дои:10.1093 / emboj / 21.3.355. ISSN 0261-4189. ЧВК 125831. PMID 11823428.
- ^ Альберт, Т. К. (2000-02-01). «Выделение и характеристика человеческих ортологов субъединиц дрожжевого комплекса CCR4-NOT». Исследования нуклеиновых кислот. Издательство Оксфордского университета (ОУП). 28 (3): 809–817. Дои:10.1093 / nar / 28.3.809. ISSN 1362-4962. ЧВК 102560. PMID 10637334.
- ^ а б c Чжэн, Сяофэн; Думитру, Ралука; Lackford, Brad L .; Freudenberg, Johannes M .; Singh, Ajeet P .; Арчер, Тревор К .; Джоти, Раджа; Ху, Гуан (2012-04-09). «Cnot1, Cnot2 и Cnot3 поддерживают идентичность ESC мыши и человека и подавляют экстраэмбриональную дифференцировку». Стволовые клетки. Вайли. 30 (5): 910–922. Дои:10.1002 / стержень.1070. ISSN 1066-5099. ЧВК 3787717. PMID 22367759.
- ^ Обнимать.; Kim, J .; Xu, Q .; Ленг, Y .; Оркин, С. Х .; Элледж, С. Дж. (1 апреля 2009 г.). «Скрининг РНКи всего генома определяет новый модуль транскрипции, необходимый для самообновления». Гены и развитие. Лаборатория Колд-Спринг-Харбор. 23 (7): 837–848. Дои:10.1101 / gad.1769609. ISSN 0890-9369. ЧВК 2666338. PMID 19339689.
- ^ Паванелло, Лоренцо; Холл, Бенджамин; Airhihen, Благословение; Винклер, Герлоф Себастьян (2018-11-09). «Центральная область CNOT1 и CNOT9 стимулирует деаденилирование с помощью модуля нуклеазы Ccr4-Not». Биохимический журнал. Portland Press Ltd. 475 (21): 3437–3450. Дои:10.1042 / bcj20180456. ISSN 0264-6021. PMID 30309886.
- ^ а б Mauxion, Fabienne; Прев, Бриджит; Серафин, Бертран (2013). «C2ORF29 / CNOT11 и CNOT10 образуют новый модуль комплекса CCR4-NOT». РНК Биология. Informa UK Limited. 10 (2): 267–276. Дои:10.4161 / rna.23065. ISSN 1547-6286. PMID 23232451.