CAPZB - CAPZB

CAPZB
Идентификаторы
Псевдонимы	CAPZB, CAPB, CAPPB, CAPZ, кэпирующий белок актина бета-субъединицы Z-линии мышцы, кэпирующий белок актина бета-субъединицы Z-линии мышцы
Внешние идентификаторы	OMIM: 601572 MGI: 104652 ГомолоГен: 3620 Генные карты: CAPZB
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.13 Начинать 19,338,775 бп[1] Конец 19,485,539 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 D3 | 4 70,59 см Начинать 139,192,899 бп[2] Конец 139,291,818 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание актиновой нити • связывание кадгерина • связывание актина • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • саркомер • WASH комплекс • внеклеточная экзосома • цитоскелет • актиновая нить • актиновый цитоскелет • Белковый комплекс, блокирующий F-актин Биологический процесс • регулировка сборки ламеллиподиумов • колючий конец актинового филамента • регуляция морфогенеза клеток • движение клетки или субклеточного компонента • коагуляция крови • организация цитоскелета • организация актинового цитоскелета • покрытие актиновой нити • отрицательная регуляция сборки филоподия • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • клеточный морфогенез Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	832	12345
Ансамбль	ENSG00000077549	ENSMUSG00000028745
UniProt	P47756	P47757
RefSeq (мРНК)	NM_001313932 NM_001206540 NM_001206541 NM_001282162 NM_004930	NM_001037761 NM_001271405 NM_001271406 NM_009798
RefSeq (белок)	NP_001193469 NP_001193470 NP_001269091 NP_001300861 NP_004921	NP_001032850 NP_001258334 NP_033928
Расположение (UCSC)	Chr 1: 19.34 - 19.49 Мб	Chr 4: 139.19 - 139.29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

F-актин-кэпирующая белковая субъединица бета, также известный как CapZβ это белок что у людей кодируется CAPZB ген.^[5] CapZβ функционирует для ограничения актин нити на зазубренных концах в мышцах и других тканях.

Структура

CapZβ может существовать в виде 3 уникальных субъединиц β, в зависимости от альтернативных механизмов сплайсинга.^[6][7][8][9] CapZβ1 имеет длину 31,4 кДа и 277 аминокислот, CapZβ2 составляет 30,6 кДа и имеет длину 272 аминокислоты, а длина CapZβ3 составляет 301 аминокислоту (N-концевой удлинение на 29 аминокислот относительно субъединицы β2.^[7]). Напротив, 3 субъединицы α происходят из разных генов.^[10] CapZ представляет собой гетеродимер, состоящий из субъединицы α и β. В мышцах субъединица α1 и субъединица β1 кэпирующего белка локализуются на Z-диске и образуют CapZ.^[11] CapZ взаимодействует с α-актинин, туманность, небулин, HSC70.^[12] на Z-диске.

Функция

CAPZB является членом Белок, блокирующий F-актин семья. Этот ген кодирует бета-субъединицу актин-связывающего белка с зазубринами на конце. Белок регулирует рост актиновой нити, закрывая зазубренный конец растущих актиновых нитей.^[5]

CapZβ функционирует для ограничения актин нити на зазубренных (+) концах, таким образом контролируя скорость G-актин полимеризация F-актин и соответствующая длина нити. CapZ работает совместно с тропомодулин, который покрывает актин заостренными концами. В мышцах взаимодействие CapZ с актин является критическим во время миофибрилогенеза, так как введение моноклонального антитела CapZ или экспрессия мутантного белка CapZ нарушает образование актиновых филаментов и сборку миофибрилл.^[13] Изоформы CapZβ (β1 и β2) имеют разные функции, поскольку CapZβ1 якоря актин в Z-диски и CapZβ2 при вставные диски.^[14][15] Сверхэкспрессия CapZβ2 (и сопутствующая отрицательная регуляция CapZβ1) у мышей приводила к патологическому фенотипу с задержкой роста, нерегулярной походкой, затрудненным дыханием и ювенильной летальностью. Ультраструктурные измерения показали серьезное нарушение миофибриллярной архитектуры.^[15] Функция CapZβ в трансдукции протеинкиназа C сигнализация в сердечные миоциты была прояснена исследованием сердечных волокон с кожурой, которое продемонстрировало, что частичное трансгенное снижение CapZβ ослабляет функциональный эффект протеинкиназа C при сокращении и нарушении нормальных паттернов транслокации изоформ PKC после фенилэфрин или же эндотелин-1 лечение.^[16] Более позднее исследование показало, что частичное снижение CapZβ оказывает кардиопротекторное действие во время ишемического реперфузионного повреждения, сопутствующего измененной транслокации изоформы PKC в миофиламенты.^[17] Что касается обмена CapZβ, недавно было продемонстрировано, что оборот белка CapZβ1 частично регулируется атаногеном, ассоциированным с Bcl-2, BAG3, через механизм, включающий связь между HSC70 и CapZβ1.^[12]

Клиническое значение

В настоящее время практически нет данных о взаимосвязи между CAPZB ген и болезнь человека.

Модельные организмы

Capzb нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Аномальный
Рецессивный смертельное исследование	Аномальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Беспокойство	Аномальный[18]
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Аномальный[19]
Гематология	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология мозга	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный[20]
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный[21]
Все тесты и анализы от[22][23]

Модельные организмы были использованы при изучении функции CAPZB. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Capzb^{tm1a (EUCOMM) Wtsi[24][25]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[26][27][28]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[22][29] Было проведено 23 испытания на мутант мышей и четыре значительных отклонения от нормы.^[22] Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши и снижение циркуляции триглицерид уровни наблюдались у самок животных, в то время как самцы демонстрировали ненормальное поведение в открытое поле.^[22]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077549 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028745 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: кэпирующий белок CAPZB (актиновая нить) Z-линия мышцы, бета».
6. Шафер Д.А., Коршунова Ю.О., Шроер Т.А., Купер Я.А. (октябрь 1994 г.). «Дифференциальная локализация и анализ последовательности изоформ кэпирующей бета-субъединицы белка позвоночных». Журнал клеточной биологии. 127 (2): 453–65. Дои:10.1083 / jcb.127.2.453. ЧВК  2120197. PMID  7929588.
7. фон Бюлов М., Раквиц Х.Р., Цимбельманн Р., Франке В.В. (май 1997 г.). «CP beta3, новая изоформа актин-связывающего белка, является компонентом цитоскелетной чашечки головки сперматозоида млекопитающих». Экспериментальные исследования клеток. 233 (1): 216–24. Дои:10.1006 / excr.1997.3564. PMID  9184090.
8. "F-актин-кэпирующая белковая субъединица бета". COPaKB.
9. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йейтс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
10. Харт М.С., Коршунова Ю.О., Купер Дж. А. (1997). «Позвоночные имеют консервативные альфа-изоформы кэпирующего белка со специфическими паттернами экспрессии». Подвижность клеток и цитоскелет. 38 (2): 120–32. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0169 (1997) 38: 2 <120 :: AID-CM2> 3.0.CO; 2-B. PMID  9331217.
11. Casella JF, Craig SW, Maack DJ, Brown AE (июль 1987 г.). «Cap Z (36/32), белок, улавливающий актин на конце с зазубринами, является компонентом Z-линии скелетных мышц». Журнал клеточной биологии. 105 (1): 371–9. Дои:10.1083 / jcb.105.1.371. ЧВК  2114938. PMID  3301868.
12. Хишия А., Китадзава Т., Такаяма С. (ноябрь 2010 г.). «BAG3 и Hsc70 взаимодействуют с белком, кэпирующим актин CapZ, чтобы поддерживать целостность миофибрилл при механическом стрессе». Циркуляционные исследования. 107 (10): 1220–31. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.110.225649. ЧВК  2980587. PMID  20884878.
13. Шафер Д.А., Хуг С., Купер Дж. А. (январь 1995 г.). «Ингибирование CapZ во время миофибриллогенеза изменяет сборку актиновых филаментов». Журнал клеточной биологии. 128 (1–2): 61–70. Дои:10.1083 / jcb.128.1.61. ЧВК  2120327. PMID  7822423.
14. Папа I, Астье С., Квятек О, Рейно Ф., Боннал С., Лебарт М.С., Рустан С., Беньямин Y (февраль 1999 г.). «Альфа-актинин-CapZ, комплекс для закрепления тонких волокон в Z-линии». Журнал исследований мышц и подвижности клеток. 20 (2): 187–97. Дои:10.1023 / А: 1005489319058. PMID  10412090.
15. Харт М.С., Купер Дж. А. (декабрь 1999 г.). «Изоформы актин-кэпирующего белка бета у позвоночных имеют различные функции In vivo». Журнал клеточной биологии. 147 (6): 1287–98. Дои:10.1083 / jcb.147.6.1287. ЧВК  2168092. PMID  10601341.
16. Pyle WG, Hart MC, Cooper JA, Sumandea MP, de Tombe PP, Solaro RJ (июнь 2002 г.). «Белок, блокирующий актин: важный элемент в передаче сигналов протеинкиназы миофиламентам». Циркуляционные исследования. 90 (12): 1299–306. Дои:10.1161 / 01.res.0000024389.03152.22. PMID  12089068.
17. Ян Ф.Х., Пайл РГ (март 2012 г.). «Пониженный сердечный белок CapZ защищает сердце от острого ишемического реперфузионного повреждения и улучшает предварительное кондиционирование». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии. 52 (3): 761–72. Дои:10.1016 / j.yjmcc.2011.11.013. PMID  22155006.
18. "Данные о тревоге для Capzb". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
19. «Данные клинической химии для Capzb». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
20. "Сальмонелла данные о заражении Capzb ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
21. "Citrobacter данные о заражении Capzb ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
22. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
23. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
24. «Международный консорциум нокаут-мышей».
25. "Информатика генома мыши".
26. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
27. Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
28. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
29. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (июнь 2011 г.). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение

• Barron-Casella EA, Torres MA, Scherer SW, Heng HH, Tsui LC, Casella JF (сентябрь 1995 г.). «Анализ последовательности и хромосомная локализация человеческого Cap Z. Консервативные остатки в актин-связывающем домене могут связывать Cap Z с семействами белков гельсолин / северин и профилин». Журнал биологической химии. 270 (37): 21472–9. Дои:10.1074 / jbc.270.37.21472. PMID  7665558.
• Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природа Биотехнологии. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природа клеточной биологии. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216.
• Брунель А., Лабас В., Майю А., Шарма С., Ройер Н., Вин Дж, Перне П., Вобурдоль М., Боден Б. (октябрь 2005 г.). «Протеомика эндотелиальных клеток пупочной вены человека применительно к апоптозу, вызванному этопозидом». Протеомика. 5 (15): 3876–84. Дои:10.1002 / pmic.200401239. PMID  16130169.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070.
• Wells CD, Fawcett JP, Traweger A, Yamanaka Y, Goudreault M, Elder K, Kulkarni S, Gish G, Virag C, Lim C, Colwill K, Starostine A, Metalnikov P, Pawson T. (май 2006 г.). «Комплекс Rich1 / Amot регулирует Cdc42 GTPase и белки апикальной полярности в эпителиальных клетках». Клетка. 125 (3): 535–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.02.045. PMID  16678097.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

внешняя ссылка

• Масс-спектрометрическая характеристика человеческого CAPZB на COPaKB
• Человек CAPZB расположение генома и CAPZB страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.