Бен Лэнгмид - Ben Langmead

Бен Лэнгмид
Родившийся
Бенджамин Томас Лэнгмид
Альма-матер
ИзвестенВыравниватель последовательности Bowtie
НаградыПремия Бенджамина Франклина (2016)
Научная карьера
ПоляВычислительная биология
УчрежденияУниверситет Джона Хопкинса
ТезисАлгоритмы и подходы к высокопроизводительным вычислениям для сравнительной геномики на основе секвенирования (2012)
ДокторантСтивен Зальцберг
Интернет сайтwww.cs.jhu.edu/факультет/ ben-langmead/

Бен Лэнгмид это компьютерный биолог и доцент группы вычислительной биологии и медицины в Университет Джона Хопкинса.[1][2]

Образование

Лангмид получил Бакалавр искусств степень в области Информатика из Колумбийский колледж, Колумбийский университет в 2003 году. Он получил оба Магистр естественных наук и докторские степени в области компьютерных наук от Университет Мэриленда, под руководством Стивен Зальцберг, в 2009 и 2012 годах соответственно.[3]

Карьера

Лангмид известен разработкой Галстук-бабочка выравнивание последовательностей алгоритм,[4] который реализует Преобразование Барроуза – Уиллера чтобы улучшить масштабируемость выравнивания последовательностей. По состоянию на 2017 год, оригинал Геномная биология статья, описывающая программный пакет Bowtie, цитировалась более 9000 раз.

Лэнгмид стал доцентом Университета Джонса Хопкинса в июле 2012 года.[3]

Награды

Лангмид был награжден Премия Бенджамина Франклина в 2016 году за продвижение бесплатных и открытых материалов для использования в науках о жизни.[5]

Рекомендации

  1. ^ «Бенджамин Лэнгмид - Департамент компьютерных наук». Департамент компьютерных наук. Получено 23 марта 2017.
  2. ^ Бен Лэнгмид публикации, проиндексированные Google ученый
  3. ^ а б "Langmead CV" (PDF). Получено 24 марта 2017.
  4. ^ Лэнгмид, Бен; Трапнелл, Коул; Поп, Михай; Зальцберг, Стивен Л. (2009). «Сверхбыстрое и эффективное с точки зрения памяти выравнивание коротких последовательностей ДНК с геномом человека». Геномная биология. 10 (3): R25. Дои:10.1186 / gb-2009-10-3-r25. ЧВК  2690996. PMID  19261174.
  5. ^ "Премия Бенджамина Франклина - Bioinformatics.org". www.bioinformatics.org. Получено 23 марта 2017.

внешняя ссылка

Бен Лэнгмид на Twitter Отредактируйте это в Викиданных