Антуан Данчен - Antoine Danchin

Антуан Данчен
Родившийся (1944-05-07) 7 мая 1944 г. (76 лет)[1]
НациональностьФранция
Альма-матерÉcole Normale Supérieure
Institut Henri Poincaré
Institut de Biologie Physico-Chimique
Научная карьера
ПоляБиоинформатика
УчрежденияInstitut de Biologie Physico-Chimique
École Polytechnique
Институт Пастера
Университет Гонконга
Интернет сайтwww.normalesup.org/ ~ аданчин/

Антуан Данчен (родился 7 мая 1944 года), француз генетик известен своими исследованиями в нескольких областях биологии, от структуры и функции аденилатциклаза, к моделированию обучения в нервной системе и раннему развитию геномика и биоинформатика. Он председатель стартапа AMAbiotics. [1], специализируется на метаболической биоремедиации и синтетической биологии [2]. Он был директором отдела геномов и генетики в Институт Пастера в Париже, где он возглавил Отдел генетики бактериальных геномов.

Жизнь

Он получил образование математика в Institut Henri Poincaré и физик в École Normale Supérieure. Сначала работаем с Милдред Кон, Марианна Грюнберг-Манаго и Ионел Соломон[постоянная мертвая ссылка ] в Ядерный магнитный резонанс, Данчин стал экспериментальным микробиолог в начале семидесятых. Филипп Курреж и Жан-Пьер Шенжу на Institut de Biologie Physico-Chimique в Париже, Франция, рабочий семинар, на котором они вместе работали над построением математических моделей обучения и памяти.[2]Заинтересован в университетском обучении, которое он создал, с Морис Герон, первый семестр биологии в École Polytechnique, и развивал свое учение в течение четырех лет. Среди его первых учеников можно найти Даниэль Кан, Патрик Чарней, и много других. Основная цель его исследования состояла в том, чтобы попытаться понять, как гены могут коллективно функционировать в клетке. Это привело его к работе над системами регуляции, которые контролируют глобальную экспрессию генов у бактерий. Часть его работ была посвящена изучению ферментов, синтезирующих циклический АМФ. Он установил справочную классификацию аденилатциклаз.[3] после того, как его лаборатория успешно клонировала и секвенировала гены аденилатциклазы токсины от захлебывающийся кашель агент[4] а также от агента сибирская язва.[5] Эта работа привела его к этическим размышлениям о методах молекулярной генетики и геномики в то время, когда это не считалось важным.[6]

Данчин начал в 1985 году сотрудничество с компьютерными учеными для оценки искусственный интеллект методы исследования комплексных проблем в молекулярная генетика.[7] Это убедило его в том, что пришло время исследовать геномы как единое целое, при условии, что параллельно будут начаты важные усилия в области компьютерных наук (in silico биология). В начале 1987 года он предложил провести программу секвенирования для Bacillus subtilis. Это предложение было реализовано совместными европейскими усилиями по этому геному, начиная с 1988 года. Полная последовательность была опубликована в 1997 году.[8] Первым значительным и неожиданным открытием этой работы стало в 1991 году то, что многие гены (в то время половина генов) имели совершенно неизвестную функцию. Это побудило его попытаться организовать биоинформатика во Франции с помощью нескольких коллег из университетов, CNRS и INRIA через создание общенациональной группы GDR 1029 (1991–1995) и впоследствии через координацию программы биоинформатики Groupement de Recherche et d'Etudes des Genomes (1992–1996), а затем в Комитете координации наук дю Виван (1998–2000). Повторное секвенирование и повторная аннотация генома B. subtilis были завершены в 2009 году, чтобы обновить последовательность и аннотацию этого эталонный геном.[9]

В 2000 году Данчин создал Исследовательский центр HKU-Pasteur в Гонконге, предназначенный для разработки микробной геномики в регионе с помощью Комиссии по инновациям и технологиям правительства САР Гонконг для разработки биоинформатики (программа Биоподдержка ).

Данчин сейчас развивает теоретические размышления и эксперименты в области синтетическая биология,[10] пытаясь разъяснить идею о том, что клетки ведут себя как компьютеры (Машины Тьюринга ) изготовление компьютеров.[11] Вместе с Виктор де Лоренцо он создал журнал свободного и открытого доступа Симплектическая биология, посвященная публикации инновационных идей в области системной и синтетической биологии. [3]

Антуан Данчен - отец Рафаэль Данчин.

Рекомендации

  1. ^ "L'ACADÉMIE DES SCIENCES ÉLIT 17 NOUVEAUX MEMBRES" (PDF). Académie des Sciences. 10 декабря 2013 г.. Получено 13 июн 2014.
  2. ^ Changeux JP, Courrège P, Danchin A. (1973) Теория эпигенеза нейронных сетей путем избирательной стабилизации синапсов. Proc Natl Acad Sci U S. A. 70: 2974–2978.
  3. ^ Данчин А. (1993) Филогения аденилатциклаз. Adv Second Messenger Phosphoprotein Res. 27: 109–162
  4. ^ Glaser P, Ladant D, Sezer O, Pichot F, Ullmann A, Danchin A. (1988) Кальмодулин-чувствительная аденилатциклаза Bordetella pertussis: клонирование и экспрессия в Escherichia coli. Mol Microbiol. 2: 19–30
  5. ^ Glaser P, Ladant D, Sezer O, Pichot F, Ullmann A, Danchin A. (1988) Структурная гомология между бактериальными аденилатциклазами, ассоциированными с вирулентностью. Ген. 71: 293–298
  6. ^ Данчин А. (2002) Не всякая правда хороша. Опасности публикации информации о потенциальном биологическом оружии. EMBO Rep. 3: 102–104
  7. ^ Gascuel O, Danchin A. (1986) Экспорт белка в прокариотах и ​​эукариотах: признаки различия в механизме экспорта. J Mol Evol. 24: 130–142.
  8. ^ Кунст Ф., Огасавара Н., Мозер I, Альбертини А.М., Аллони Дж., Азеведо В., Бертеро М.Г., Бессьер П., Болотин А., Борхерт С., Боррисс Р., Бурсье Л., Бранс А., Браун М., Бриннель СК, Брон С., Брюйе С. , Bruschi CV, Caldwell B, Capuano V, Carter NM, Choi SK, Codani JJ, Connerton IF, Danchin A и др. (1997) Полная последовательность генома грамположительной бактерии Bacillus subtilis. Nature 390: 249–256.
  9. ^ Barbe V, Cruveiller S, Kunst F, Lenoble P, Meurice G, Sekowska A, Vallenet D, Wang T, Moszer I, Médigue C, Danchin A. (2009) От последовательности консорциума к унифицированной последовательности: ссылка на Bacillus subtilis 168 геном десять лет спустя. Микробиология. 155: 1758–1775.
  10. ^ де Лоренцо V, Данчин А. (2009) Синтетическая биология: открытие новых миров и новых слов. EMBO Rep. 9: 822–827
  11. ^ Данчин А. (2009) Бактерии как компьютеры, делающие компьютеры. FEMS Microbiol. Откр. 33: 3–26

Избранные работы

внешняя ссылка