Андрей Шали - Andrej Šali

Андрей Шали
Андрей Сали.jpg
Андрей Шали выступает на ISMB 2012.
Альма-матерБиркбек-колледж, Лондонский университет
Научная карьера
УчрежденияКалифорнийский университет в Сан-Франциско
Гарвардский университет
Рокфеллеровский университет
Биркбек-колледж, Лондонский университет
Люблянский университет
ТезисМоделирование трехмерной структуры белка по его аминокислотной последовательности  (1991)
ДокторантТом Бланделл
Известные студентыИлья Ваксер
Роберто Санчес
Андраш Фисер
Бино Джон
Майя Топф
Франсиско Мело
РС. Мадхусудхан
Фрэнк Альбер
Рэйчел Карчин
Дмитрий Коркин
Дэвид Баркан
Интернет сайтwww.salilab.org

Андрей Шали (род.1963 г., Крань, Словения ) - вычислительная структурная биолог. С 2003 года он был профессором кафедры биоинженерии и терапевтических наук Калифорнийского университета в Сан-Франциско.[1] Он также является редактором журнала. Структура.

Образование

Шали получил Бакалавр степень по химии от Люблянский университет, 1987; его докторская степень. в Молекулярная биофизика из Биркбек колледж,[2] Лондонский университет, 1991 (работа с Том Бланделл ); и работал в докторантуре Гарвардский университет (работаю с Мартин Карплюс ).

Исследование

Сали поступил на факультет Рокфеллеровский университет в 1995 г., после его постдокторского исследования в Гарвардский университет. Он использует вычисления, основанные на законах физика и эволюция изучить структура и функция белков. Например, он разработал сравнительное моделирование структуры белков удовлетворением пространственных ограничений, реализованных в программе МОДЕЛЛЕР[3] интегративное определение структуры макромолекулярных ансамблей, реализованное в программе IMP.[4]

Влияние исследования

Сали вносит большой вклад в структурную биологию, разрабатывая и применяя вычислительные методы для структурного моделирования и анализа белков. Две наиболее часто используемые программы, разработанные его исследовательской группой, включают: МОДЕЛЛЕР для сравнительного моделирования структуры белков и IMP для определения интегративной структуры.

По состоянию на июнь 2017 года Шали опубликовал около 370 статей,[5] которые были процитированы примерно 56 000 раз в Google Scholar. Его Индекс Хирша составляет 104 (т.е. 104 публикации были процитированы не менее 104 раз).

В 2018 году Шали был избран членом Национальная Академия Наук в знак признания его вклада в биофизику и вычислительную биологию.[6]

Известные выпускники Šali Lab

ИмяПоложение лабораторииПродолжительностьТекущее местоположениеТекущая позиция
Фрэнк АльберСотрудник докторантурыКалифорнийский университет, Лос-Анджелес, Калифорния, СШАПрофессор
Андраш ФисерСотрудник докторантурыСентябрь 1997 г. - декабрь 2002 г.Медицинский колледж Альберта Эйнштейна, Бронкс, Нью-ЙоркПрофессор
Рэйчел КарчинСотрудник докторантурыС августа 2003 г. по август 2006 г.Университет Джона ХопкинсаДоцент
Марк А. Марти-РеномСотрудник докторантуры

Адъюнкт-профессор

С февраля 1999 г. по июнь 2006 г.Национальный центр геномного анализа (CNAG), Барселона, ИспанияЛидер группы
РС. МадхусудханПостдокторантС февраля 2000 г. по март 2008 г.IISER, Пуна, ИндияДоцент
Дэвид БарканКандидат наук. УченикСентябрь 2006 г. - октябрь 2011 г.Protagonist TherapeuticsНаучный сотрудник

Рекомендации

  1. ^ Список публикаций из Microsoft Academic
  2. ^ Сали, Андрей (1984). Моделирование трехмерной структуры белка по его аминокислотной последовательности (Кандидатская диссертация). Лондон, Биркбек-колледж.
  3. ^ Šali, A .; Бланделл, Т. (1993). "Сравнительное моделирование белков удовлетворением пространственных ограничений". Журнал молекулярной биологии. 234 (3): 779–815. Дои:10.1006 / jmbi.1993.1626. PMID  8254673.
  4. ^ Russel, D .; Lasker, K .; Webb, B .; Velázquez-Muriel, J .; Tjioe, E .; Шнейдман-Духовный, Д .; Петерсон, Б .; Сали, А. (2012). «Собираем части вместе: программное обеспечение платформы интегративного моделирования для определения структуры макромолекулярных сборок». PLoS Биология. 10 (1): e1001244. Дои:10.1371 / journal.pbio.1001244. ЧВК  3260315. PMID  22272186.
  5. ^ Публикации Андрея Шали
  6. ^ "Андрей Сали". Национальная Академия Наук. Получено 2018-07-23.

внешняя ссылка