Амира (программное обеспечение) - Amira (software)

Амира
Скриншот Amira с визуализацией Honeybee Brain visualization.png
Разработчики)Институт Цузе Берлин
Thermo Fisher Scientific
изначальный выпускОктябрь 1999 г.; 21 год назад (1999-10)
Стабильный выпуск
2019.2 / 13 июня 2019; 17 месяцев назад (2019-06-13)
Операционная системаWindows XP SP3, Виндоус виста, Windows 7
OS X 10.5, OS X 10.6, OS X 10.7
RHEL 5.5
ПлатформаIA-32, x64
Доступно ванглийский
Тип3D визуализация и обработка данных
ЛицензияПробная версия
Интернет сайтthermofisher.com/amira-avizo

Амира (произносится: Ah-meer-ah) - программная платформа для трехмерной и четырехмерной визуализации, обработки и анализа данных. Его активно развивают Thermo Fisher Scientific в сотрудничестве с Институт Цузе в Берлине (ZIB), и коммерчески распространяется Thermo Fisher Scientific.

Обзор

Амира[1] это расширяемая программная система для научная визуализация, анализ данных, а также представление данных 3D и 4D. Он используется тысячами исследователей и инженеров в академических и промышленных кругах по всему миру. Его гибкий пользовательский интерфейс и модульная архитектура делают его универсальным инструментом для обработки и анализа данных из различных форм; например микро-КТ,[2] ДОМАШНИЙ ПИТОМЕЦ,[3] УЗИ.[4] Его постоянно расширяющиеся функции сделали его универсальным решением для анализа и визуализации данных, применимым и используемым во многих областях, таких как микроскопия в биология[5] и материаловедение,[6] молекулярная биология,[7] квантовая физика,[8] астрофизика,[9] вычислительная гидродинамика (CFD),[10] конечно-элементное моделирование (МКЭ),[11] неразрушающий контроль (NDT),[12] и многое другое. Одной из ключевых функций, помимо визуализации данных, является набор инструментов Amira для сегментация изображения[13] и реконструкция геометрии.[14] Это позволяет пользователю отмечать (или сегментировать) структуры и интересующие области в объемах трехмерных изображений с помощью автоматических, полуавтоматических и ручных инструментов. Затем сегментация может использоваться для множества последующих задач, таких как объемный анализ,[4] анализ плотности,[15] анализ формы,[16] или создание 3D компьютерных моделей для визуализация,[17] численное моделирование,[18] или же быстрое прототипирование[19] или же 3D печать, назвать несколько. Другие ключевые особенности Amira: многоплоскостной и объем визуализация, регистрация изображения,[20] отслеживание нити,[21] разделение и анализ клеток,[16] создание тетраэдрической сетки,[22] отслеживание волокон из диффузионно-тензорная визуализация (DTI) данные,[23] скелетонизация,[24] анализ пространственного графа, и стереоскопический рендеринг[25] 3D-данных на нескольких дисплеях и в иммерсивных средах виртуальной реальности, включая Пещеры.[26]В качестве коммерческого продукта Amira требует покупки лицензии или академической подписки. Ограниченная по времени, но полнофункциональная ознакомительная версия доступна для бесплатной загрузки.

История

1993–1998: Исследовательское программное обеспечение

Корни Амиры уходят корнями в 1993 год, и отдел научной визуализации, возглавляемый Ганс-Кристиан Хеге на Институт Цузе в Берлине (ZIB). ZIB - это научно-исследовательский институт математика и информатика. Миссия отдела научной визуализации - помогать решать сложные вычислительные и научные задачи в лекарство, биология, инженерное дело и материаловедение. С этой целью компания разрабатывает алгоритмы и программное обеспечение для визуализации данных 2D, 3D и 4D, а также исследования и анализа с визуальной поддержкой. В то время у молодой группы визуализации в ZIB был опыт работы с расширяемыми, ориентированными на потоки данными визуализация среды apE,[27] IRIS Explorer,[28] и Advanced Visualization Studio (AVS), но не был удовлетворен этими продуктами » интерактивность, гибкость и простота использования для специалистов, не занимающихся информатикой.

Поэтому разработка новой программной системы была начата в рамках исследовательского проекта.[29] в медицинско-ориентированном, многопрофильном центре совместных исследований.[30] На основе опыта, полученного Тобиасом Хёллерером в конце 1993 года с новой графической библиотекой. IRIS Inventor,[31] было решено использовать эту библиотеку. Разработкой системы медицинского планирования занимался Детлев Столлинг, который впоследствии стал главным архитектором программного обеспечения Amira. Новое программное обеспечение было названо «HyperPlan», что подчеркивало его первоначальное целевое приложение - систему планирования для лечение гипертермического рака. Система разрабатывалась на Силиконовая графика (SGI) компьютеры, которые в то время были стандартными рабочими станциями, используемыми для высокопроизводительных графических вычислений. Программное обеспечение было основано на таких библиотеках, как OpenGL (первоначально ИРИС GL ), Открыть Inventor (первоначально IRIS Inventor ), а графический интерфейс пользователя библиотеки X11, Motif (программное обеспечение), и ViewKit. В 1998 году X11 / Motif / Viewkit были заменены на Набор инструментов Qt.

Фреймворк HyperPlan служил основой для все большего числа проектов ZIB и использовался все большим числом исследователей в сотрудничающих учреждениях. Проекты включали приложения в обработка медицинских изображений, медицинская визуализация, нейробиология, конфокальная микроскопия, визуализация потока, молекулярная аналитика и вычислительная астрофизика.

1998 – настоящее время: коммерчески поддерживаемый продукт

Растущее число пользователей системы начало превышать возможности, которые ZIB мог выделить для распространения и поддержки программного обеспечения, поскольку основной задачей ZIB было алгоритмическое исследование. Следовательно дочерняя компания Действительно - компания Visual Concepts GmbH была основана Хансом-Кристианом Хеге, Детлевом Сталлингом и Мальте Вестерхофф с целью сделать широкие возможности программного обеспечения доступными для исследователей в промышленности и научных кругах по всему миру, а также обеспечить поддержку продукта и надежность, необходимые в сегодняшнем стремительном развитии. Пространственный и конкурентный мир.

В феврале 1998 года программному обеспечению HyperPlan было присвоено новое, не зависящее от приложений, название «Амира ». Это имя не является аббревиатурой, но было выбрано из-за того, что его можно произносить на разных языках и давать подходящую коннотацию, а именно «смотреть» или «удивляться», от латинский глагол «адмираре» (восхищаться), который отражает базовую ситуацию в визуализации данных.

Детлев Столлинг и Мальте Вестерхофф провели серьезную переработку программного обеспечения, чтобы сделать его коммерчески поддерживаемым продуктом, а также сделать его доступным на компьютерах сторонних производителей. В марте 1999 г. первая версия рекламного ролика Amira была выставлена ​​на выставке CeBIT выставка в Ганновер, Германия на SGI IRIX и Hewlett-Packard UniX (HP-UX) будки. Версии для Linux и Майкрософт Виндоус последовали в течение следующих двенадцати месяцев. Позже была добавлена ​​поддержка Mac OS X. Indeed - Visual Concepts GmbH выбрала Бордо, Франция и Сан Диего, Американская компания TGS, Inc. в качестве мирового дистрибьютора Amira и завершила пять основные выпуски (до версии 3.1) в последующие четыре года.

В 2003 году Indeed - Visual Concepts GmbH, а также TGS, Inc. были приобретены компанией из Массачусетса. Mercury Computer Systems, Inc. (NASDAQ: MRCY) и стал частью недавно созданной компании Mercury Науки о жизни бизнес-подразделение, позднее получившее название Visage Imaging. В 2009 году компания Mercury Computer Systems, Inc. снова выделила Visage Imaging и продала ее компании Мельбурн, Австралийская компания Promedicus Ltd (ASX: PME), ведущий поставщик радиологических информационных систем и медицинских ИТ-решений. За это время Amira продолжала развиваться в Берлин, Германия и в тесном сотрудничестве с ZIB, который до сих пор возглавляют первоначальные создатели Amira. TGS, расположенный в Бордо, Франция, был продан Mercury Computer systems французскому инвестору и переименован в Visualization Sciences Group (VSG). VSG продолжила работу над дополнительным продуктом под названием Avizo, основанный на том же исходном коде, но адаптированный для материаловедения.

В августе 2012 г. FEI на тот момент крупнейший OEM-реселлер Amira приобрел VSG и бизнес Amira у Promedicus. Это вернуло двух программных сестер Амиру и Авизо в одни руки. В августе 2013 года Visualization Sciences Group (VSG) стала бизнес-единицей FEI. В 2016 году FEI была куплена Thermo Fisher Scientific и стала частью подразделения анализа материалов и конструкций в начале 2017 года.

Amira и Avizo по-прежнему продаются как два разных продукта; Amira для наук о жизни и Avizo для материаловедения, но теперь усилия по разработке снова объединены. Между тем, количество научных статей с использованием программного обеспечения Amira / Avizo составляет порядка 10 тысяч. Как и вначале, дорожная карта Amira по-прежнему основана на сложных научных вопросах, на которые пользователи Amira по всему миру пытаются ответить, часто на переднем крае в своих областях.

Варианты Amira

Вариант микроскопии

  • Специальные считыватели для данных микроскопии
  • Деконволюция изображения
  • Исследование 3D изображений, полученных практически с любого микроскопа
  • Извлечение и редактирование сетей волокон из микроскопических изображений

Считыватель DICOM

  • Импорт клинических и доклинических данных в формате DICOM

Вариант сетки

  • Создание трехмерных сеток конечных элементов (КЭ) из данных сегментированного изображения
  • Поддержка многих современных форматов решателей FE
  • Высококачественная визуализация результатов моделирования на основе сетки с использованием модулей отображения скалярных, векторных и тензорных полей

Вариант скелетонизации

  • Реконструкция и анализ нейронных и сосудистых сетей.
  • Визуализация каркасных сетей
  • Количественная оценка длины и диаметра сегментов сети
  • Упорядочивание сегментов в древовидном графе
  • Скелетонизация очень больших стопок изображений

Молекулярный вариант

  • Расширенные инструменты для визуализации моделей молекул
  • Объемный рендеринг с аппаратным ускорением
  • Мощный редактор молекул
  • Специальные инструменты для сложной молекулярной визуализации

Вариант разработчика

  • Создание новых пользовательских компонентов для визуализации или обработки данных
  • Внедрение новых файловых ридеров или писателей
  • Язык программирования C ++
  • Мастер разработки для быстрого начала работы

Нейро вариант

  • Анализ медицинских изображений для DTI и перфузии мозга
  • Отслеживание оптоволокна с поддержкой нескольких алгоритмов на основе потоковых линий
  • Разделение волокна на пучки волокон на основе определенных пользователем регионов источника и назначения
  • Вычисление тензорных полей, диффузионных карт.
  • Разложение тензорных полей по собственным значениям
  • Расчет среднего времени прохождения, мозговой кровоток, и объем церебральной крови

Вариант VR

  • Визуализация данных на больших плиточных дисплеях или в иммерсивных средах виртуальной реальности (VR)
  • Поддержка устройств 3D-навигации
  • Быстрый многопоточный и распределенный рендеринг

Вариант с очень большим объемом данных

  • Поддержка визуализации данных изображения, превышающих доступную основную память, с использованием эффективного внешнего управления данными
  • Расширения многих стандартных модулей, таких как ортогональная и наклонная срезка, объемный рендеринг и рендеринг изоповерхностей, для работы с данными вне ядра

Области применения

Рекомендации

  1. ^ Сваливание, Д .; Westerhoff, M .; Hege, H.-C. (2005). CD. Хансен и К.Р. Джонсон (ред.). «Амира: высокоинтерактивная система для визуального анализа данных». Справочник по визуализации: 749–767. CiteSeerX  10.1.1.129.6785. Дои:10.1016 / B978-012387582-2 / 50040-X. ISBN  9780123875822.
  2. ^ Adam, R .; Smith, A.R .; Sieren, J.C .; Eggleston, T .; МакЛеннан, Г. (2010). «Характеристика дыхательных путей и легких для мыши с нокаутом FABP / CFTR с использованием микрокомпьютерной томографии и массива микроскопов с большим изображением» (PDF). Американский журнал респираторной медицины и реанимации. 181: A6264. Дои:10.1164 / ajrccm-conference.2010.181.1_meetingabstracts.a6264.
  3. ^ Awasthi, V .; Holter, J .; Thorp, K .; Андерсон, С .; Эпштейн, Р. (2010). «Оценка F-18-fluorothymidine-PET трансплантата костного мозга на модели крысы». Связь с ядерной медициной. 31 (2): 152–158. Дои:10,1097 / мм. 0b013e3283339f92. PMID  19966596. S2CID  44923538.
  4. ^ а б Ayers, G.D .; McKinley, E.T .; Zhao, P .; Fritz, J.M .; Metry, R.E .; Deal, B.C .; Adlerz, K.M .; Coffey, R.J .; Мэннинг, Х. (2010). «Объем доклинических опухолей ксенотрансплантата более точно оценивается с помощью ультразвуковой визуализации, чем ручные измерения штангенциркулем». Журнал ультразвука в медицине. 29 (6): 891–901. Дои:10.7863 / jum.2010.29.6.891. ЧВК  2925269. PMID  20498463.
  5. ^ Dlasková, A .; Spacek, T .; Santorová, J .; Plecitá-Hlavatá, L .; Berková, Z .; Saudek, F .; Lessard, M .; Bewersdorf, J .; Jezek, P. (2010). «4Pi-микроскопия выявляет нарушенную трехмерную митохондриальную сеть бета-клеток островков поджелудочной железы, экспериментальную модель диабета 2 типа». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1797 (6–7): 1327–1341. Дои:10.1016 / j.bbabio.2010.02.003. PMID  20144584.
  6. ^ Clark, N.D.L .; Дэли., С. (2010). «Использование конфокальной лазерной сканирующей микроскопии для изображения включений трихомов в янтаре» (PDF). Журнал палеонтологических методов. 8.
  7. ^ Amstalden van Hove, E.R .; Blackwell, T.R .; Klinkert, I .; Eijkel, G.B .; Heeren, R .; Глунде, К. (2010). «Мультимодальная масс-спектрометрическая визуализация малых молекул выявляет различные пространственно-молекулярные сигнатуры в моделях дифференциально метастатической опухоли молочной железы». Исследования рака. 70 (22): 9012–9021. Дои:10.1158 / 0008-5472.can-10-0360. ЧВК  5555163. PMID  21045154.
  8. ^ Шерман, Д. (2010). «Металлообразование и ассоциация ионов в гидротермальных флюидах: выводы из квантовой химии и молекулярной динамики». Границы в Geofluids. Геофлюиды. 10. С. 41–57. Дои:10.1002 / 9781444394900.ch4. ISBN  9781444394900. Архивировано из оригинал на 2013-01-06.
  9. ^ О'Нил, S.M .; Джонс, Т. (2010). «Трехмерное моделирование двунаправленных магнитогидродинамических струй, взаимодействующих с кластерной средой». Астрофизический журнал. 710 (1): 180–196. arXiv:1001.1747. Bibcode:2010ApJ ... 710..180O. Дои:10.1088 / 0004-637x / 710/1/180. S2CID  118617883.
  10. ^ Baharoglu, M.I .; Schirmer, C.M .; Hoit, D.A .; Gao, B.L .; Малек, А. (2010). "Угол притока аневризмы как дискриминант разрыва боковых церебральных аневризм". Морфометрический и вычислительный гидродинамический анализ. Архивировано из оригинал на 2010-06-22. Получено 2012-05-17.
  11. ^ Бардын, Т .; Gédet, P .; Hallermann, W .; Бюхлер, П. (2010). «Прогнозирование крутящего момента зубного имплантата с помощью быстрого и автоматического анализа методом конечных элементов: пилотное исследование». Хирургия полости рта, стоматология, патология полости рта, радиология полости рта и эндодонтия. 109 (4): 594–603. Дои:10.1016 / j.tripleo.2009.11.010. PMID  20163974.
  12. ^ Стрижка, P.R .; Gelb, J .; Yi, J .; Lee, W.K .; Дракополус, М .; Брэндон, Н. (2010). «Анализ трехфазного контакта в микроструктурах Ni-YSZ с использованием неразрушающей рентгеновской томографии с синхротронным излучением». Электрохимические коммуникации. 12 (8): 1021–1024. Дои:10.1016 / j.elecom.2010.05.014.
  13. ^ Jährling, N .; Беккер, К .; Schönbauer, C .; Шноррер, Ф .; Додт, Х.У. (2010). «Трехмерная реконструкция и сегментация интактной дрозофилы с помощью ультрамикроскопии». Границы системной нейробиологии. 4: 1. Дои:10.3389 / нейро.06.001.2010. ЧВК  2831709. PMID  20204156.
  14. ^ Чжэн, Г. (2010). «Реконструкция на основе статистической модели формы масштабированной модели поверхности таза для конкретного пациента на основе единственной стандартной рентгеновской рентгенограммы в прямом смысле слова». Медицинская физика. 37 (4): 1424–1439. Bibcode:2010MedPh..37.1424Z. Дои:10.1118/1.3327453. PMID  20443464. Архивировано из оригинал на 2012-07-11. Получено 2019-05-15.
  15. ^ Rodriguez-Soto, A.E .; Fritscher, K.D .; Schuler, B .; Issever, A.S .; Roth, T .; Kamelger, F .; Kammerlander, C .; Blauth, M .; Schubert, R .; Линк, Т. (2010). «Анализ текстуры, минеральной плотности кости и толщины коры проксимального отдела бедренной кости: прогнозирование риска перелома». Журнал компьютерной томографии. 34 (6): 949–957. Дои:10.1097 / rct.0b013e3181ec05e4. PMID  21084915. S2CID  21196403.
  16. ^ а б Leischner, U .; Schierloh, A .; Zieglgänsberger, W .; Додт, Х.У. (2010). «Флуоресценция, индуцированная формалином, выявляет форму и морфологию клеток в образцах биологических тканей». PLOS ONE. 5 (4): e10391. Bibcode:2010PLoSO ... 510391L. Дои:10.1371 / journal.pone.0010391. ЧВК  2861007. PMID  20436930.
  17. ^ Felts, R.L .; Нараян, К .; Estes, J.D .; Ши, Д .; Trubey, C.M .; Fu, J .; Hartnell, L.M .; Ruthel, G.T .; Schneider, D.K .; Нагашима, К. (2010). «3D-визуализация передачи ВИЧ в вирусологическом синапсе между дендритными клетками и Т-клетками». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (30): 13336–13341. Bibcode:2010PNAS..10713336F. Дои:10.1073 / пнас.1003040107. ЧВК  2922156. PMID  20624966.
  18. ^ Тейлор, Д.Дж .; Дорли, Д.Дж .; Шротер, Р. (2010). «Назначение профиля границы притока для численного моделирования носового воздушного потока». Журнал интерфейса Королевского общества. 7 (44): 515–527. Дои:10.1098 / rsif.2009.0306. ЧВК  2842801. PMID  19740920.
  19. ^ Лукас, Британская Колумбия; Bogovic, J.A .; Carass, A .; Базин П.Л .; Prince, J.L .; Pham, D.L .; Ландман, Б.А. (2010). «Набор инструментов Java Image Science Toolkit (JIST) для быстрого прототипирования и публикации программного обеспечения для нейровизуализации». Нейроинформатика. 8 (1): 5–17. Дои:10.1007 / s12021-009-9061-2. ЧВК  2860951. PMID  20077162.
  20. ^ Dasgupta, S .; Feleppa, E .; Ramachandran, S .; Ketterling, J .; Калиш, А .; Haker, S .; Tempany, C .; Портер, С .; Lacrampe, M .; Исаксон, К. (2007). «8A-4 Пространственная совместная регистрация магнитно-резонансных и ультразвуковых изображений простаты как основа для многомодальной визуализации тканевого типа». Материалы симпозиума по ультразвуковому оборудованию 2007 г.. С. 641–643. Дои:10.1109 / ULTSYM.2007.166. ISBN  978-1-4244-1383-6. S2CID  23656040.
  21. ^ Оберлендер, М .; Bruno, R.M .; Sakmann, B .; Брозер, П.Дж. (2007). «Мозаичная микроскопия в светлом поле в проходящем свете для трехмерного отслеживания морфологии отдельных нейронов». Журнал биомедицинской оптики. 12 (6): 064029. Bibcode:2007JBO .... 12f4029O. Дои:10.1117/1.2815693. PMID  18163845. Архивировано из оригинал на 2012-07-18. Получено 2019-05-15.
  22. ^ Lamecker, H .; Манси, т .; Relan, J .; Billet, F .; Sermesant, M .; Ayache, N .; Делингетт., Х. (2009). «Адаптивная тетраэдрическая сетка для персонализированного моделирования сердца». CiteSeerX  10.1.1.698.4292. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  23. ^ Boretius, S .; Михаэлис, Т .; Tammer, R .; Ashery-Padan, R .; Frahm, J .; Стойкова, А. (2009). «In vivo МРТ измененной анатомии мозга и волоконной связи у взрослых мышей с дефицитом pax6». Кора головного мозга. 19 (12): 2838–2847. Дои:10.1093 / cercor / bhp057. PMID  19329571.
  24. ^ Kohjiya, S .; Katoh, A .; Суда, Т .; Shimanuki, J .; Икеда, Ю. (2006). «Визуализация сетей технического углерода в резиновой матрице путем скелетонизации изображения 3D-TEM». Полимер. 47 (10): 3298–3301. Дои:10.1016 / я.полимер.2006.03.008.
  25. ^ Clements, R.J .; Mintz, E.M .; Бланк, J.L. (2009). «Стереоскопическая объемная визуализация с высоким разрешением аргинин-вазопрессиновой системы мышей». Журнал методов неврологии. 187 (1): 41–45. Дои:10.1016 / j.jneumeth.2009.12.011. PMID  20036282. S2CID  25746441.
  26. ^ Оно, N .; Кагеяма., А. (2009). «Визуализация области интереса системой CAVE VR с автоматическим контролем детализации». Компьютерная физика Коммуникации. 181 (4): 720–725. Bibcode:2010CoPhC.181..720O. Дои:10.1016 / j.cpc.2009.12.002.
  27. ^ Дайер, Д.С. (1990). «Инструментарий потока данных для визуализации». Компьютерная графика и приложения. 10 (4): 60–69. Дои:10.1109/38.56300. S2CID  14426676.
  28. ^ Фоулзер, Д. (1995). «IRIS Explorer: основа для расследования». Компьютерная графика. 29 (2): 13–16. Дои:10.1145/204362.204365. S2CID  16324076.
  29. ^ "Проект DFG: Algorithmen zur Planung und Kontrolle von Hyperthermiebehandlungen". DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft. Получено 28 января 2015.
  30. ^ «Проект DFG SFB 273: Гипертермия: методика и клиника». DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft. Получено 28 января 2015.
  31. ^ Штраус, П.С. (1993). «IRIS Inventor, набор инструментов для трехмерной графики». Уведомления ACM SIGPLAN. 28 (10): 192–200. Дои:10.1145/167962.165889.
  32. ^ а б c de Boer, B.A .; Soufan, A.T .; Hagoort, J .; Mohun, T.J .; ван ден Хофф, M.J.B; Hasman, A .; Voorbraak, F.P.J.M .; Moorman, A.F.M .; Руйтер, Дж. М. (2011). «Интерактивное представление трехмерной информации, полученной из реконструированных наборов данных, и трехмерное размещение отдельных гистологических срезов в формате переносимого трехмерного документа». Разработка. 138 (1): 159–167. Дои:10.1242 / dev.051086. ЧВК  2998169. PMID  21138978.
  33. ^ Specht, M .; Lebrun, R .; Золликофер, C.P.E. (2007). «Визуализация трансформации формы мозга шимпанзе и человека» (PDF). Визуальный компьютер: Международный архив компьютерной графики. 23 (9): 743–751. CiteSeerX  10.1.1.108.7163. Дои:10.1007 / s00371-007-0156-1. S2CID  17472003.
  34. ^ а б c Gaemers, I.C .; Stallen, J.M .; Kunne, C .; Wallner, C .; van Werven, J .; Nederveen, A .; Ламерс, W.H. (2011). «Липотоксичность и стеатогепатит в модели неалкогольной жировой болезни печени на перекормленных мышах» (PDF). Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1812 (4): 447–458. Дои:10.1016 / j.bbadis.2011.01.003. PMID  21216282.
  35. ^ а б Кудряшев, М; Cyrklaff, M .; Алекс, Б .; Lemgruber, L .; Baumeister, W .; Wallich, R .; Фришкнехт, Ф. (2011). «Доказательства прямого клеточного слияния у Borrelia с помощью криогенной электронной томографии». Клеточная микробиология. 13 (5): 731–741. Дои:10.1111 / j.1462-5822.2011.01571.x. PMID  21276171. S2CID  34114766.
  36. ^ Meisslitzer-Ruppitsch, C .; Röhrl, C .; Ranftler, C .; Neumüller, J .; Vetterlein, M .; Ellinger, A .; Павелка, М. (2011). «Компартменты транс-Гольджи, обогащенные керамидами, реорганизуются вместе с другими частями аппарата Гольджи в ответ на истощение АТФ». Гистохимия и клеточная биология. 135 (2): 159–171. Дои:10.1007 / s00418-010-0773-z. PMID  21225431. S2CID  30748663.
  37. ^ Bevan, R.L.T .; Сазонов, И .; Saksono, P.H .; Nithiarasu, P .; van Loon, R .; Luckraz, H .; Ашрал, С. (2011). «Индивидуальное моделирование кровотока через аневризму грудной аорты со свернутой проксимальной шейкой». Численные методы в биомедицинской инженерии. 27 (8): 1167–1184. Дои:10.1002 / cnm.1425.
  38. ^ Jiang, Y .; Джонсон, Г.А. (2010). "Микроскопическая диффузионная тензорная визуализация мозга мыши". Нейроизображение. 50 (2): 465–471. Дои:10.1016 / j.neuroimage.2009.12.057. ЧВК  2826147. PMID  20034583.
  39. ^ Bujotzek, A .; Shan, M .; Haag, R .; Вебер М. (2011). «На пути к рациональной конструкции спейсера для бивалентного ингибирования рецептора эстрогена». Журнал компьютерного молекулярного дизайна. 25 (3): 253–262. Bibcode:2011JCAMD..25..253B. Дои:10.1007 / s10822-011-9417-1. PMID  21331802. S2CID  29015240.
  40. ^ а б Cai, W .; Ли, E.Y .; Vij, A .; Mahmood, S.A .; Йошида, Х. (2011). «MDCT для компьютерного волюметрии пневмотораксов у педиатрических пациентов». Академическая радиология. 18 (3): 315–23. Дои:10.1016 / j.acra.2010.11.008. ЧВК  3072076. PMID  21216160.
  41. ^ а б Irving, S .; Мур, Д.Р .; Liberman, M.C .; Самнер, С.Дж. (2011). «Olivocochlear Efferent Control в локализации звука и обучении, зависящем от опыта». Журнал неврологии. 31 (7): 2493–2501. Дои:10.1523 / jneurosci.2679-10.2011. ЧВК  3292219. PMID  21325517.
  42. ^ Kübel, C .; Voigt, A .; Schoenmakers, R .; Оттен, М .; Вс, Д .; Ли, ТС; Carlsson, A .; Брэдли, Дж. (2005). «Последние достижения в электронной томографии: TEM и HAADF-STEM томография для материаловедения и полупроводниковых приложений». Microsc. Микроанал. 11: 378–400. Дои:10.1017 / S1431927605050361.
  43. ^ Chan, S .; Li, P .; Locketz, G .; Salisbury, K .; Блевинс, Н.Х. (2016). «Высококачественная тактильная и визуальная визуализация для моделирования хирургии височной кости с учетом специфики пациента». Компьютерная хирургия. 11 (1): 85–101. Дои:10.1080/24699322.2016.1189966. PMID  2797394.
  44. ^ а б Obenaus, A .; Хейс, П. (2011). Дефекты просверленных отверстий: индукция, визуализация и анализ на грызунах. Методы молекулярной биологии. 690. С. 301–314. Дои:10.1007/978-1-60761-962-8_20. ISBN  978-1-60761-961-1. PMID  21043001.
  45. ^ Ertürk, A .; Mauch, C.P .; Hellal, F .; Förstner, F .; Keck, T .; Беккер, К .; Jährling, N .; Steffens, H .; Richter, M .; Hübener, M .; Kramer, E .; Кирхгоф, Ф .; Додт; Брадке, Ф. (2011). «Трехмерное изображение неразрезанного спинного мозга взрослого человека для оценки регенерации аксонов и глиальных реакций после травмы». Природа Медицина. 18 (1): 166–171. Дои:10,1038 / нм 2600. PMID  22198277. S2CID  16100638.
  46. ^ Карлсон, К.Дж .; Wrangham, R.W .; Muller, M.N .; Самнер, Д.Р .; Morbeck, M.E .; Nishida, T .; Яманака, А .; Бош, К. (2011). Сравнение структурных свойств конечностей у шимпанзе, живущих на свободном выгуле, из общин Кибале, Гомбе, Махале и Тай. Передвижение приматов. С. 155–182. Дои:10.1007/978-1-4419-1420-0_9. ISBN  978-1-4419-1419-4.
  47. ^ Hartwig, T .; Streitparth, F .; Gro, C .; Мюллер, М .; Perka, C .; Putzier, M .; Штрубе, П. (2011). «Цифровой трехмерный анализ паравертебральных поясничных мышц после кольцевого одноуровневого слияния». Журнал заболеваний и методов позвоночника. 30 (6): E702 – E706. Дои:10.1097 / BSD.0000000000000249. PMID  28632556. S2CID  4401218.
  48. ^ Lee, J .; Эддингтон, Д.К .; Надоль, Дж. Б. (2011). «Гистопатология ревизионной кохлеарной имплантации». Аудиология и невротология. 16 (5): 336–346. Дои:10.1159/000322307. ЧВК  7265424. PMID  21196725.
  49. ^ Han, M .; Kim, C .; Мозер, П .; Schafer, F .; Badaan, S .; Вигару, Б .; Tseng, K .; Petrisor, D .; Trock, B .; Стоянович, Д. (2011). «Тандем-роботизированная лапароскопическая радикальная простатэктомия для улучшения визуализации нервно-сосудистого пучка: технико-экономическое обоснование» (PDF). Урология. 77 (2): 502–6. Дои:10.1016 / j.urology.2010.06.064. ЧВК  3051397. PMID  21067797.

внешняя ссылка