ZFP36 - ZFP36

ZFP36
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4J8S
Идентификаторы
Псевдонимы	ZFP36, G0S24, GOS24, NUP475, RNF162A, TIS11, TTP, zfp-36, ZFP36 белок безымянного пальца
Внешние идентификаторы	OMIM: 190700 MGI: 99180 ГомолоГен: 2558 Генные карты: ZFP36
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.2 Начинать 39,406,847 бп[1] Конец 39,409,412 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • Связывание хемокинов C-C • 14-3-3 связывание с белками • Привязка элементов AU-rich • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание одноцепочечной РНК • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области • связывание ферментов • связывание мРНК • связывание протеинкиназы • Связывание РНК • связывание с белками теплового шока • Связывание РНК-полимеразы • Связывание мРНК 3'-UTR Сотовый компонент • цитоплазма • Гранула стресса • ядро клетки • RISC-погрузочный комплекс • рибонуклеопротеин • Dcp1-Dcp2 комплекс • экзосома (комплекс РНКазы) • П-боди • цитозоль • CCR4-НЕ комплекс Биологический процесс • укорочение поли (A) хвоста мРНК с ядерной транскрипцией • положительная регуляция укорочения поли (A) хвоста мРНК, транскрибируемой ядром • катаболический процесс мРНК • регулирование выработки фактора некроза опухоли • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, зависимый от деаденилирования распад • miRNA-опосредованное ингибирование трансляции • ответ на голод • 3'-UTR-опосредованная стабилизация мРНК • отрицательная регуляция дифференцировки эритроцитов • клеточный ответ на липополисахарид • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • положительная регуляция катаболического процесса транскрибируемой ядерной мРНК, зависимый от деаденилирования распад • положительное регулирование независимого от деаденилирования декапирования транскрибируемой ядерной мРНК • регуляция процесса апоптоза кератиноцитов • регуляция пролиферации кератиноцитов • положительное регулирование дифференцировки жировых клеток • клеточный ответ на стимул фактора роста фибробластов • клеточный ответ на стимул гранулоцитарного макрофагального колониестимулирующего фактора • отрицательная регуляция вирусной транскрипции • регуляция дифференцировки кератиноцитов • ответ на ранение • положительная регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • регуляция стабильности мРНК • Каскад MAPK • клеточный ответ на глюкокортикоидный стимул • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • положительная регуляция внутриклеточной локализации мРНК • каскад p38MAPK • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, независимый от деаденилирования распад • подавление гена с помощью РНК • транспорт мРНК • 3'-UTR-опосредованная дестабилизация мРНК • отрицательная регуляция активности полинуклеотид-аденилилтрансферазы • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7538	22695
Ансамбль	ENSG00000128016	ENSMUSG00000044786
UniProt	P26651	P22893
RefSeq (мРНК)	NM_003407	NM_011756
RefSeq (белок)	NP_003398	NP_035886
Расположение (UCSC)	Chr 19: 39.41 - 39.41 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тристетрапролин (TTP), также известный как Гомолог белка цинкового пальца 36 (ZFP36), является белок что у людей, мышей и крыс кодируется ZFP36 ген.^[4][5] Он является членом TIS11 (TPA -индуцированная последовательность), вместе с факторы отклика бутирата 1 и 2.^[6]

TTP связывается с Элементы с высоким содержанием Австралии (ARE) в 3'-нетранслируемых областях (UTR) мРНК некоторых цитокины и способствует их деградации. Например, TTP - это компонент цикла отрицательной обратной связи, который мешает TNF-альфа производство путем дестабилизации его мРНК.^[7] У мышей с дефицитом ТТП развивается комплексный синдром воспалительных заболеваний.^[7]

Взаимодействия

ZFP36 был показан взаимодействовать с 14-3-3 белок члены семьи, такие как YWHAH,^[8] и с NUP214, член ядерный поровый комплекс.^[9]

Регулирование

Посттранскрипционно, ВДП регулируется несколькими способами.^[6] В субклеточная локализация на TTP влияет взаимодействие с белками-партнерами, такими как семейство белков 14-3-3. На эти взаимодействия и, возможно, взаимодействия с мРНК-мишенями влияет состояние фосфорилирования ТТР, поскольку белок может быть посттрансляционно модифицирован большим количеством протеинкиназы.^[6] Есть некоторые свидетельства того, что транскрипт TTP также может быть целью микроРНК, Такие как miR-29a.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128016 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Дюбуа Р.Н., Маклейн М.В., Райдер К., Лау Л.Ф., Натанс Д. (декабрь 1990 г.). «Ядерный белок, индуцируемый фактором роста с новой повторяющейся последовательностью цистеин / гистидин». J Biol Chem. 265 (31): 19185–91. PMID  1699942.
5. «Ген Entrez: ZFP36, белок цинкового пальца 36, тип C3H, гомолог (мышь)».
6. Сандуджа С., Бланко Ф.Ф., Диксон Д.А. (2011). «Роль белков TTP и BRF в регулируемом распаде мРНК». РНК Wiley Interdiscip Rev. 2 (1): 42–57. Дои:10.1002 / wrna.28. ЧВК  3030256. PMID  21278925.
7. Карбалло Э., Лай В.С., Блэкшир П.Дж. (август 1998 г.). «Обратное подавление продукции фактора некроза опухоли макрофагами альфа тристетрапролином». Наука. 281 (5379): 1001–5. Дои:10.1126 / science.281.5379.1001. PMID  9703499.
8. Джонсон Б.А., Стен-младший, Яффе МБ, Блэквелл Т.К. (май 2002 г.). «Цитоплазматическая локализация тристетрапролина включает 14-3-3-зависимые и -независимые механизмы». J. Biol. Chem. 277 (20): 18029–36. Дои:10.1074 / jbc.M110465200. PMID  11886850.
9. Карман Дж. А., Надлер С. Г. (март 2004 г.). «Прямая ассоциация тристетрапролина с нуклеопорином CAN / Nup214». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 315 (2): 445–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.01.080. PMID  14766228.

дальнейшее чтение

• Blackshear PJ (2003). «Тристетрапролин и другие тандемные белки« цинковые пальцы »CCCH в регуляции обмена мРНК». Biochem. Soc. Транс. 30 (Pt 6): 945–52. Дои:10.1042 / bst0300945. PMID  12440952.
• Каррик Д.М., Лай В.С., Блэкшир П.Дж. (2005). «Тандемный CCCH цинковый палец протеин тристетрапролин и его значение для обмена мРНК цитокинов и артрита». Исследования и лечение артрита. 6 (6): 248–64. Дои:10.1186 / ar1441. ЧВК  1064869. PMID  15535838.
• Тейлор Г.А., Лай В.С., Оки Р.Дж. и др. (1991). «Белок ТТР человека: последовательность, выравнивание с родственными белками и хромосомная локализация генов мыши и человека». Нуклеиновые кислоты Res. 19 (12): 3454. Дои:10.1093 / nar / 19.12.3454. ЧВК  328350. PMID  2062660.
• Лай WS, Stumpo DJ, Blackshear PJ (1990). «Быстрое стимулированное инсулином накопление мРНК, кодирующей белок, богатый пролином». J. Biol. Chem. 265 (27): 16556–63. PMID  2204625.
• Тейлор Г.А., Томпсон М.Дж., Лай В.С., Блэкшир П.Дж. (1995). «Фосфорилирование тристетрапролина, потенциального фактора транскрипции цинкового пальца, путем стимуляции митогена в интактных клетках и митоген-активируемой протеинкиназой in vitro». J. Biol. Chem. 270 (22): 13341–7. Дои:10.1074 / jbc.270.22.13341. PMID  7768935.
• Гексимер СП, Форсдайк Д.Р. (1993). «Предполагаемый ген переключения G0 / G1 лимфоцитов человека, гомологичный гену грызунов, кодирующему фактор транскрипции с потенциалом связывания цинка». ДНК клетки биол. 12 (1): 73–88. Дои:10.1089 / dna.1993.12.73. PMID  8422274.
• Хюбнер К., Друк Т., ЛаФорджиа С. и др. (1993). «Хромосомная локализация четырех кДНК цинкового пальца человека». Гм. Genet. 91 (3): 217–22. Дои:10.1007 / BF00218259. PMID  8478004. S2CID  35926610.
• Лай В.С., Карбалло Э., Торн Дж. М. и др. (2000). «Взаимодействие белков цинкового пальца CCCH с мРНК. Связывание связанных с тристетрапролином белков цинкового пальца с элементами, богатыми золотом, и дестабилизация мРНК». J. Biol. Chem. 275 (23): 17827–37. Дои:10.1074 / jbc.M001696200. PMID  10751406.
• Dintilhac A, Bernués J (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности». J. Biol. Chem. 277 (9): 7021–8. Дои:10.1074 / jbc.M108417200. PMID  11748221.
• Лай В.С., Кеннингтон EA, Blackshear PJ (2002). «Взаимодействие белков цинковых пальцев CCCH с мРНК: несвязывающие мутанты тристетрапролина оказывают ингибирующее действие на деградацию мРНК, содержащих богатые AU элементы». J. Biol. Chem. 277 (11): 9606–13. Дои:10.1074 / jbc.M110395200. PMID  11782475.
• Джонсон Б.А., Стен-младший, Яффе МБ, Блэквелл Т.К. (2002). «Цитоплазматическая локализация тристетрапролина включает 14-3-3-зависимые и -независимые механизмы». J. Biol. Chem. 277 (20): 18029–36. Дои:10.1074 / jbc.M110465200. PMID  11886850.
• Брукс С.А., Коннолли Дж. Э., Дигель Р. Дж. И др. (2002). «Анализ функции, экспрессии и субклеточного распределения человеческого тристетрапролина». Ревматоидный артрит. 46 (5): 1362–70. Дои:10.1002 / арт.10235. PMID  12115244.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Аманн Б.Т., Уортингтон М.Т., Берг Дж. М. (2003). «Цинк-связывающий домен Cys3His из Nup475 / тристетрапролин: новая складка с дискообразной структурой». Биохимия. 42 (1): 217–21. Дои:10.1021 / bi026988m. PMID  12515557.
• Ю Х, Стасинопулос С., Лидман П., Медкалф Р.Л. (2003). «Врожденная нестабильность мРНК ингибитора активатора плазминогена типа 2 регулируется тристетрапролином». J. Biol. Chem. 278 (16): 13912–8. Дои:10.1074 / jbc.M213027200. PMID  12578825.
• Саваока Х., Диксон Д.А., Оутс Дж. А., Буто О. (2003). «Тристетрапролин связывается с 3'-нетранслируемой областью мРНК циклооксигеназы-2. Вариант полиаденилирования в линии раковых клеток лишен сайта связывания». J. Biol. Chem. 278 (16): 13928–35. Дои:10.1074 / jbc.M300016200. PMID  12578839.