Z-РНК - Z-RNA

Z-РНК представляет собой левостороннюю альтернативную конформацию двойной спирали РНК. Как и для Z-ДНК, Z-РНК предпочтительна последовательность, состоящая из пуриновых / пиримидиновых повторов и особенно повторов CG.

Открытие

Способность дцРНК превращаться в левую спираль была продемонстрирована с использованием ЯМР и круговой дихроизм в 1984 г.[1] Было показано, что это преобразование требует высокой ионной силы и повышенных температур (35 градусов).

Структурные характеристики

Z-РНК должна напоминать, но не быть идентична Z-ДНК.[2] В состав комплекса входит Зальфа домен с Z-РНК при концентрациях соли, близких к физиологическим, однако предполагает структуру, намного более близкую к конформации Z-ДНК, и указывает на две формы Z-РНК (конформации низкой и высокой соли) [3]

Роль в биологии

Об образовании Z-РНК в живых клетках свидетельствовали эксперименты с использованием антител против Z-РНК для окрашивания фиксированных клеток простейших. [4] Дальнейшие доказательства были получены с открытием, что домен Zalpha фермента редактирования РНК ADAR1 связывается и распознает Z-РНК с высоким сродством.[5] Структурные особенности распознавания Z-РНК Zalpha-доменами были выявлены при кристаллографическом исследовании комплекса [3]

Рекомендации

  1. ^ Холл, К., П. Круз, И. Тиноко, младший, Т.М. Джовин и Дж. ван де Санде, «Z-РНК» - двойная спираль левой РНК. Nature, 1984. 311 (5986): p. 584-6.
  2. ^ Попенда, М., Дж. Милецки и Р. В. Адамиак, Структура высокого солевого раствора двойной левой РНК с. 4044-54.
  3. ^ а б Пласидо, Д., Б.А. Brown, 2nd, K. Lowenhaupt, A. Rich, and A. Athanasiadis, Левосторонняя двойная спираль РНК, связанная Z-альфа-доменом фермента, редактирующего РНК ADAR1. Структура, 2007. 15 (4): с. 395-404.
  4. ^ 1. Zarling, D.A., C.J. Calhoun, C.C. Хардин, А.Х. Зарлинг, Цитоплазматическая Z-РНК. Proc Natl Acad Sci U S. A., 1987. 84 (17): p. 6117-21.
  5. ^ Браун, Б.А., 2-й, К. Ловенгаупт, К.М. Уилберт, Э. Хэнлон и А. Рич, Zalpha-домен редактирующего фермента дцРНК аденозиндезаминаза связывает левую Z-РНК, а также Z-ДНК. Proc Natl Acad Sci U S A, 2000. 97 (25): p. 13532-6.