WIPI2 - WIPI2

WIPI2
Идентификаторы
ПсевдонимыWIPI2, ATG18B, Atg21, WIPI-2, CGI-50, домен повтора WD, фосфоинозитид, взаимодействующий 2, IDDSSA
Внешние идентификаторыOMIM: 609225 MGI: 1923831 ГомолоГен: 90887 Генные карты: WIPI2
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение для WIPI2
Геномное расположение для WIPI2
Группа7p22.1Начинать5,190,196 бп[1]
Конец5,233,840 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE WIPI2 202031 s на fs.png

PBB GE WIPI2 214699 x at fs.png

PBB GE WIPI2 204710 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_178398

RefSeq (белок)

NP_848485

Расположение (UCSC)Chr 7: 5.19 - 5.23 МбChr 5: 142,63 - 142,67 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок 2, взаимодействующий с фосфоинозитидом с повторяющимся доменом WD это белок что у людей кодируется WIPI2 ген.[5][6]

Функция

WD40 повторить белки являются ключевыми компонентами многих важных биологических функций. Они регулируют сборку мультибелковых комплексов, представляя платформу бета-пропеллера для одновременных и обратимых белок-белковых взаимодействий. Члены подсемейства WIPI белков с повторами WD40, такие как WIPI2, имеют структуру с 7 лопастями и содержат консервативный мотив для взаимодействия с фосфолипидами.[5][6]

WIPI2 является гомологом Atg18 у млекопитающих, а не Atg21, вместе с близкородственным белком, WIPI1. МРНК WIPI2 легко обнаруживается в нескольких широко используемых лабораторных клеточных линиях (HEK293A, HeLa, A431) и нескольких линиях раковых клеток, в то время как экспрессия WIPI1 ограничена раковыми клетками [необходима цитата] (но также обнаруживается во многих тканях человека).

Белки Atg регулируют аутофагия, который является лизосомный путь деградации, необходимый для поддержания здоровья клеток, выживания в периоды дефицита питательных веществ, а также играет роль в развитии рака, нейродегенерации и иммунных ответах на широкий спектр патогенов.[7] WIPI2 рекрутируется на раннем этапе в формирующуюся аутофагосому вместе с DFCP-1, ULK-1 и Atg16, где он положительно регулирует липидирование Atg8 (LC3). Это не относится к WIPI1.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157954 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000029578 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Пройкас-Сезанн Т., Уодделл С., Гаугель А., Фрике Т., Лупас А., Нордхайм А. (декабрь 2004 г.). «WIPI-1alpha (WIPI49), член нового семейства белков WIPI с 7 лопастями, аномально экспрессируется при раке человека и связан с аутофагией, вызванной голоданием». Онкоген. 23 (58): 9314–25. Дои:10.1038 / sj.onc.1208331. PMID  15602573.
  6. ^ а б «Ген Entrez: домен повтора WIPI2 WD, фосфоинозитид взаимодействует 2».
  7. ^ Орси А., Полсон Х. Э., Туз С. А. (декабрь 2009 г.). «События оборота мембран, которые участвуют в аутофагии». Curr Opin Cell Biol. 22 (2): 150–6. Дои:10.1016 / j.ceb.2009.11.013. PMID  20036114.
* Polson HE, de Lartigue J, Rigden DJ, Reedijk M, Urbé S, Clague MJ, Tooze SA (2010). «Atg18 млекопитающих (WIPI2) локализуется в фагофорах, закрепленных на омегасомах, и положительно регулирует липидирование LC3». Аутофагия. 6 (4): 506–22. Дои:10.4161 / авто.6.4.11863. PMID  20505359.

дальнейшее чтение