УЧЛ3 - UCHL3

УЧЛ3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1UCH, 1XD3
Идентификаторы
Псевдонимы	УЧЛ3, UCH-L3, убиквитин C-концевая гидролаза L3
Внешние идентификаторы	OMIM: 603090 MGI: 1355274 ГомолоГен: 4377 Генные карты: УЧЛ3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q22.2 Начинать 75,549,480 бп[1] Конец 75,606,020 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 E2.3 | 14 50,9 см Начинать 101,653,967 бп[2] Конец 101,696,125 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность пептидазы цистеинового типа • гидролазная активность • пептидазная активность • связывание убиквитина • NEDD8-специфическая протеазная активность • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность Сотовый компонент • ядро клетки • внутриклеточный • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • белковый катаболический процесс • протеолиз • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • посттрансляционная модификация • деубиквитинирование белков • убиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7347	50933
Ансамбль	ENSG00000118939	ENSMUSG00000022111
UniProt	P15374	Q9JKB1
RefSeq (мРНК)	NM_001270952 NM_006002	NM_016723
RefSeq (белок)	NP_001257881 NP_005993	NP_057932
Расположение (UCSC)	Chr 13: 75,55 - 75,61 Мб	Chr 14: 101,65 - 101,7 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Изофермент L3 убиквитинкарбоксил-концевой гидролазы является фермент что у людей кодируется УЧЛ3 ген.^[5][6]

Взаимодействия

УЧЛ3 показали взаимодействовать с NEDD8 и таупатия и синуклеинопатия ассоциированная мутированная молекула убиквитина УББ + 1.^[7][8]

Смотрите также

• Убиквитин карбоксиконцевая гидролаза L1 - фермент

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000118939 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022111 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Уилкинсон К.Д., Ли К.М., Дешпанде С., Дюрксен-Хьюз П., Босс Дж. М., Пол Дж. (Декабрь 1989 г.). «Нейрон-специфический белок PGP 9.5 представляет собой убиквитинкарбоксиконцевую гидролазу». Наука. 246 (4930): 670–3. Дои:10.1126 / science.2530630. PMID  2530630.
6. «Ген Entrez: UCHL3 убиквитинкарбоксил-концевая эстераза L3 (убиквитинтиолестераза)».
7. Dennissen FJ, Kholod N, Hermes DJ, Kemmerling N, Steinbusch HW, Dantuma NP, van Leeuwen FW (июль 2011 г.). «Мутантный убиквитин (UBB (+1)), связанный с нейродегенеративными нарушениями, гидролизуется убиквитин-С-концевой гидролазой L3 (UCH-L3)». FEBS Lett. 585 (16): 2568–74. Дои:10.1016 / j.febslet.2011.06.037. PMID  21762696.
8. Вада Х, Кито К., Каски Л.С., Йе Е.Т., Камитани Т. (октябрь 1998 г.). «Расщепление C-конца NEDD8 посредством UCH-L3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 251 (3): 688–92. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9532. PMID  9790970.

дальнейшее чтение

• Джонстон С.К., Ларсен С.Н., Кук В.Дж. и др. (1997). «Кристаллическая структура деубиквитинирующего фермента (UCH-L3 человека) при разрешении 1,8 A». EMBO J. 16 (13): 3787–96. Дои:10.1093 / emboj / 16.13.3787. ЧВК  1170002. PMID  9233788.
• Уилкинсон К.Д., Лалели-Сахин Э., Урбауэр Дж. И др. (1999). «Сайт связывания UCH-L3 на убиквитине: мутагенез и исследования ЯМР комплекса между убиквитином и UCH-L3». J. Mol. Биол. 291 (5): 1067–77. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3038. PMID  10518943.
• Пэк Ш., Ю Й. Дж., Танака К., Чунг Ч. (1999). «Молекулярное клонирование куриного UCH-6, который имеет большое сходство с человеческим UCH-L3: его необычная субстратная специфичность и распределение в тканях». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 264 (1): 235–40. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1492. PMID  10527871.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сайто С., Иида А., Секин А. и др. (2003). «Каталог из 680 вариаций среди восьми генов цитохрома p450 (CYP), девяти генов эстеразы и двух других генов в популяции Японии». J. Hum. Genet. 48 (5): 249–70. Дои:10.1007 / s10038-003-0021-7. PMID  12721789.
• Нам М.Дж., Мадоз-Гурпид Дж., Ван Х. и др. (2004). «Молекулярное профилирование иммунного ответа при раке толстой кишки с использованием белковых микрочипов: появление аутоантител к убиквитин-С-концевой гидролазе L3». Протеомика. 3 (11): 2108–15. Дои:10.1002 / pmic.200300594. PMID  14595809.
• Данэм А., Мэтьюз Л.Х., Бертон Дж. И др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 13 человека». Природа. 428 (6982): 522–8. Дои:10.1038 / природа02379. ЧВК  2665288. PMID  15057823.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Мисаги С., Галарди П.Дж., Мистер В.Дж. и др. (2005). «Структура убиквитингидролазы UCH-L3 в комплексе с суицидным субстратом». J. Biol. Chem. 280 (2): 1512–20. Дои:10.1074 / jbc.M410770200. PMID  15531586.
• Ролен У., Кобзева В., Гаспарян Н. и др. (2006). «Профилирование активности деубиквитинирующих ферментов в биоптатах карциномы шейки матки и клеточных линиях». Мол. Канцероген. 45 (4): 260–9. Дои:10.1002 / mc.20177. PMID  16402389.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569.