ACOT13 - ACOT13

ACOT13
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2F0X, 2H4U, 3F5O
Идентификаторы
Псевдонимы	ACOT13, PNAS-27, THEM2, HT012, ацил-КоА тиоэстераза 13
Внешние идентификаторы	OMIM: 615652 MGI: 1914084 ГомолоГен: 41273 Генные карты: ACOT13
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.3 Начинать 24,667,035 бп[1] Конец 24,705,065 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A3.1 Начинать 24,817,948 бп[2] Конец 24,831,540 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • гидролазная активность • активность ацил-КоА гидролазы Сотовый компонент • цитозоль • шпиндель • внеклеточная экзосома • цитоскелет • митохондрия • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • гомотетрамеризация белков • метаболический процесс ацил-КоА • отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55856	66834
Ансамбль	ENSG00000112304	ENSMUSG00000006717
UniProt	Q9NPJ3	Q9CQR4
RefSeq (мРНК)	NM_018473 NM_001160094	NM_025790
RefSeq (белок)	NP_001153566 NP_060943	NP_080066
Расположение (UCSC)	Chr 6: 24,67 - 24,71 Мб	Chr 13: 24,82 - 24,83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ацил-КоА тиоэстераза 13 это белок что у человека кодируется ACOT13 ген.^[5] Этот ген кодирует член тиоэстераза надсемейство. У человека белок совмещен с микротрубочки и необходим для устойчивого распространение клеток.^[5]

Структура

Ортологичный белок мыши образует гомотетрамер и связан с митохондрии. Белок мыши функционирует как тиоэстераза ацил-КоА со средней и длинной цепью. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[5]

Функция

Белок, кодируемый геном ACOT13, является частью семейства Ацил-КоА тиоэстеразы, которые катализируют гидролиз различных Коэнзим А сложные эфиры различных молекул к свободной кислоте плюс КоА. Эти ферменты также упоминаются в литературе как гидролазы ацил-КоА, гидролазы тиоэфиров ацил-КоА и гидролазы пальмитоил-КоА. Реакция, проводимая этими ферменты как следует:

CoA эфир + H₂О → свободная кислота + кофермент А

Эти ферменты используют одинаковые субстраты как длинноцепочечные ацил-КоА-синтетазы, но имеют уникальное назначение, так как они генерируют свободную кислоту и КоА, в отличие от длинноцепочечных ацил-КоА-синтетаз, которые связывают жирные кислоты с КоА, с образованием сложного эфира КоА.^[6] Роль ферментов семейства ACOT не совсем понятна; однако было высказано предположение, что они играют решающую роль в регулировании внутриклеточных уровней сложных эфиров КоА, кофермента А и свободных жирных кислот. Недавние исследования показали, что сложные эфиры ацил-КоА имеют гораздо больше функций, чем просто источник энергии. Эти функции включают аллостерическая регуляция ферментов, таких как ацетил-КоА карбоксилаза,^[7] гексокиназа IV,^[8] и фермент, конденсирующий цитрат. Длинноцепочечные ацил-КоА также регулируют открытие АТФ-чувствительные калиевые каналы и активация Кальциевые АТФазы, тем самым регулируя инсулин секреция.^[9] Ряд других клеточных событий также опосредуется через ацил-КоА, например, передача сигнала через протеинкиназа C, ингибирование ретиноевая кислота -индуцированный апоптоз и участие в почковании и слиянии эндомембранная система.^[10][11][12] Ацил-КоА также опосредуют нацеливание белков на различные мембраны и регуляцию G протеин субъединицы α, поскольку они являются субстратами для ацилирования белков.^[13] в митохондрии, сложные эфиры ацил-КоА участвуют в ацилировании митохондриальных НАД + -зависимых дегидрогеназы; потому что эти ферменты отвечают за катаболизм аминокислот, это ацилирование делает весь процесс неактивным. Этот механизм может обеспечивать метаболические перекрестные помехи и регулировать НАДН / НАД + для поддержания оптимального митохондриального бета-окисление жирных кислот.^[14] Роль эфиров КоА в липидный обмен и многие другие внутриклеточные процессы хорошо определены, и, таким образом, предполагается, что ферменты ACOT играют роль в модуляции процессов, в которых участвуют эти метаболиты.^[15]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112304 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006717 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: Ацил-КоА тиоэстераза 13».
6. Mashek DG, Bornfeldt KE, Coleman RA, Berger J, Bernlohr DA, Black P, DiRusso CC, Farber SA, Guo W, Hashimoto N, Khodiyar V, Kuypers FA, Maltais LJ, Nebert DW, Renieri A, Schaffer JE, Stahl A , Уоткинс П.А., Василиу В., Ямамото Т.Т. (октябрь 2004 г.). «Пересмотренная номенклатура семейства генов длинноцепочечной ацил-КоА синтетазы млекопитающих». Журнал липидных исследований. 45 (10): 1958–61. Дои:10.1194 / мл. E400002-JLR200. PMID  15292367.
7. Огивара Х., Танабэ Т., Никава Дж., Нума С. (август 1978 г.). «Ингибирование ацетил-кофермент-карбоксилазы печени крысы с помощью пальмитоил-кофермента А. Формирование эквимолярного комплекса фермент-ингибитор». Европейский журнал биохимии / FEBS. 89 (1): 33–41. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1978.tb20893.x. PMID  29756.
8. Srere PA (декабрь 1965 г.). «Пальмитил-коэнзим А ингибирование цитрат-конденсирующего фермента». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - липиды и липидный метаболизм. 106 (3): 445–55. Дои:10.1016/0005-2760(65)90061-5. PMID  5881327.
9. Гриббл FM, Прокс П., Корки Б. Е., Эшкрофт FM (октябрь 1998 г.). «Механизм активации клонированного АТФ-чувствительного калиевого канала олеоил-КоА». Журнал биологической химии. 273 (41): 26383–7. Дои:10.1074 / jbc.273.41.26383. PMID  9756869.
10. Nishizuka Y (апрель 1995 г.). «Протеинкиназа С и передача сигналов липидов для устойчивых клеточных ответов». Журнал FASEB. 9 (7): 484–96. Дои:10.1096 / fasebj.9.7.7737456. PMID  7737456. S2CID  31065063.
11. Глик Б.С., Ротман Дж. Э. (март 1987 г.). «Возможная роль жирного ацил-кофермента А во внутриклеточном транспорте белка». Природа. 326 (6110): 309–12. Bibcode:1987Натура.326..309Г. Дои:10.1038 / 326309a0. PMID  3821906. S2CID  4306469.
12. Ван Й.Дж., Кай Й., Коуэн С., Маги Т.Р. (июнь 2000 г.). «Жирные ацил-КоА ингибируют апоптоз, вызванный ретиноевой кислотой в клетках Hep3B». Письма о раке. 154 (1): 19–27. Дои:10.1016 / s0304-3835 (00) 00341-4. PMID  10799735.
13. Дункан Дж. А., Гилман А. Г. (июнь 1998 г.). «Цитоплазматическая тиоэстераза ацил-протеина, которая удаляет пальмитат из альфа-субъединиц G-протеина и p21 (RAS)». Журнал биологической химии. 273 (25): 15830–7. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15830. PMID  9624183.
14. Berthiaume L, Deichaite I, Peseckis S, Resh MD (март 1994). «Регулирование ферментативной активности путем ацилирования жирных кислот в активном центре. Новая роль ацилирования белков с длинноцепочечными жирными кислотами». Журнал биологической химии. 269 (9): 6498–505. PMID  8120000.
15. Hunt MC, Alexson SE (март 2002 г.). «Роль ацил-КоА тиоэстеразы играет в посредничестве внутриклеточного липидного метаболизма». Прогресс в исследованиях липидов. 41 (2): 99–130. Дои:10.1016 / s0163-7827 (01) 00017-0. PMID  11755680.

внешняя ссылка

• Человек ACOT13 расположение генома и ACOT13 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9NPJ3 (Ацил-кофермент А тиоэстераза 13) в PDBe-KB.

дальнейшее чтение

• Пинель П., Фошеро Ф., Морено А., Барбот А., Латроп М., Зеленика Д., Ле Бихан Д., Полин Дж. Б., Буржерон Т., Дехаен С. (январь 2012 г.). «Генетические варианты локуса FOXP2 и KIAA0319 / TTRAP / THEM2 связаны с измененной активацией мозга в различных областях, связанных с языком». Журнал неврологии. 32 (3): 817–25. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.5996-10.2012. ЧВК  6621137. PMID  22262880.
• Венкатеш С.К., Сиддая А., Падаканная П., Рамачандра Н.Б. (октябрь 2013 г.). «Отсутствие связи между генетическими полиморфизмами ROBO1, MRPL19 / C2ORF3 и THEM2 с дислексией развития». Ген. 529 (2): 215–9. Дои:10.1016 / j.gene.2013.08.017. PMID  23954868.
• Cheng Z, Bao S, Shan X, Xu H, Gong W. (декабрь 2006 г.). «Член суперсемейства 2 тиоэстеразы человека (hTHEM2) совместно локализуется с бета-тубулином на микротрубочке». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 350 (4): 850–3. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.09.105. PMID  17045243.
• Канно К., Ву М.К., Агат Д.С., Фанелли Б.Дж., Уэгл Н., Скапа Е.Ф., Укомаду К., Коэн Д.Е. (октябрь 2007 г.). «Взаимодействующие белки определяют функцию белка-переносчика фосфатидилхолина с минимальным СТАРТ-доменом / StarD2». Журнал биологической химии. 282 (42): 30728–36. Дои:10.1074 / jbc.M703745200. PMID  17704541.
• Walker LC, Waddell N, Ten Haaf A, Grimmond S, Spurdle AB (ноябрь 2008 г.). «Использование данных экспрессии и исследования ассоциации рака груди по всему геному CGEMS для выявления генов, которые могут изменять риск у носителей мутации BRCA1 / 2». Исследования и лечение рака груди. 112 (2): 229–36. Дои:10.1007 / s10549-007-9848-5. PMID  18095154. S2CID  795870.
• Цао Дж, Сюй Х, Чжао Х, Гонг В., Данауэй-Мариано Д. (февраль 2009 г.). «Механизмы распознавания и катализа субстрата тиоэстеразы 2 (hTHEM2) человека хот-дог» освещены анализом на основе структуры и функций ». Биохимия. 48 (6): 1293–304. Дои:10.1021 / bi801879z. ЧВК  2929599. PMID  19170545.
• Вэй Дж., Кан Х.В., Коэн Д.Е. (июль 2009 г.). «Член суперсемейства тиоэстеразы 2 (Them2) / ацил-КоА тиоэстераза 13 (Acot13): гомотетрамерная тиоэстераза хот-дог с селективностью в отношении длинноцепочечных жирных ацил-КоА». Биохимический журнал. 421 (2): 311–22. Дои:10.1042 / BJ20090039. ЧВК  3086008. PMID  19405909.
• Cheng Z, Song F, Shan X, Wei Z, Wang Y, Dunaway-Mariano D, Gong W. (октябрь 2006 г.). "Кристаллическая структура члена суперсемейства тиоэстераз человека 2". Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 349 (1): 172–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.08.025. PMID  16934754.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.