Семейство передачи генов, усиленных семенниками - Testis-enhanced gene transfer family

Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

Семейство транскриптов генов, усиленных семенниками
Идентификаторы
Символ	TEGT
Pfam	PF01027
TCDB	1.A.14
OPM суперсемейство	703
Белок OPM	4пгр
Доступные белковые структуры:
Pfam	структуры / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

В семейство транскриптов генов, усиленных семенниками (TEGT) включает усиленные семенниками генные транскрипционные белки млекопитающих, которые экспрессируются на высоком уровне в семенниках, предполагаемые связывающие глутамат / аспартат белки растений и животных, белок YccA кишечная палочка и белок ЙетJ Bacillus subtilis. Эти белки имеют длину около 200-250 остатков и содержат 7 ТМС.^[1]

Гомология

Гомологи встречаются во множестве Грамотрицательный и Грамположительные бактерии, дрожжи, грибы, растения, животные и вирусы. В Кишечная палочка геном кодирует три паралога, YbhL, YbhM и YccA. Отдаленные гомологи найдены в Дрозофилия меланогастер а крыса представляет собой белок, связанный с рецептором N-метил-D-аспартата (NMDARAI), и глутамат-связывающую цепь рецептора N-метил-D-аспартата, соответственно. Два других - белок нейральной мембраны крысы 35 и белок Arabidopsis thaliana Белок Bax-ингибитор-1 (BI-1), способный подавлять индуцированную Bax гибель клеток в дрожжи.

БИ-1

Один из этих белков, TEGT или Bax Inhibitor-1 (ТК № 1.A.14.1.1 ), имеет C-концевой домен, который образует Ca²⁺-проницаемый канал.^[2] БИ-1 - это ER -локализованный белок, защищающий от апоптоз и стресс ER. BI-1 был предложен для модуляции ER Ca²⁺ гомеостаз действуя как Ca²⁺-текущий канал. Эти белки отдаленно родственны ионотропному глутамат-связывающему белку рецептора N-метил-D-аспартата (NMDA) человека. Гомологи включают предполагаемый белок, индуцируемый холодовым шоком, и белок, стабилизирующий SecY.^[1]

Функция

Основываясь на экспериментальном определении топологии BI-1, Bultynck et al. предполагает, что его C-концевой α-спиральный пептид из 20 аминокислот катализирует Ca²⁺ поток как in vivo и in vitro.^[2] CA²⁺- свойства утечки были сохранены среди ортологов животных, но не растений и дрожжей. Мутировав один из критических остатков аспартата (D₂₁₃) в предложенном Ca²⁺-канальная пор в полноразмерном БИ-1, Д₂₁₃ оказалось важным для BI-1 зависимого ER Ca²⁺-утечка.

Структура

Чанг и другие. опубликовано кристаллические структуры бактериального гомолога YetJ (ТК № 1.A.14.2.3 ) с разрешением 1,9 Å и характеризовал активность по утечке кальция. Его складка из семи трансмембранных спиралей состоит из двух сэндвичей с тройной спиралью, обернутых вокруг центральной С-концевой спирали.^[3] Структуры, полученные в закрытой и открытой конформации, обратимо взаимопревращаемы при изменении pH. Связанная водородными связями нарушенная пара консервативных аспартильных остатков объясняет зависимость этого перехода от pH, а pH регулирует приток кальция в протеолипосомы. Гомологические модели человеческого BI-1 позволили понять его цитопротекторную активность.^[3]

Транспортная реакция

Обобщенная реакция, катализируемая каналами TEGT:

катионы (выход) ⇌ катионы (вход)

Рекомендации

^ ^а ^б ван Стелтен Дж., Сильва Ф., Белин Д., Силхави Т. Дж. (август 2009 г.). «Влияние антибиотиков и гомолога протоонкогена на разрушение транслокатора белка SecY». Наука. 325 (5941): 753–6. Bibcode:2009Наука ... 325..753В. Дои:10.1126 / science.1172221. ЧВК 2832214. PMID 19661432.
^ ^а ^б Bultynck G, Kiviluoto S, Henke N, Ivanova H, Schneider L, Rybalchenko V, Luyten T, Nuyts K, De Borggraeve W., Bezprozvanny I, Parys JB, De Smedt H, Missiaen L, Methner A (январь 2012 г.). «С-конец ингибитора Bax-1 образует поры канала, проницаемые для Ca2 +». Журнал биологической химии. 287 (4): 2544–57. Дои:10.1074 / jbc.M111.275354. ЧВК 3268414. PMID 22128171.
^ ^а ^б Чанг И, Бруни Р., Клосс Б., Ассур З., Клоппманн Э, Рост Б., Хендриксон В. А., Лю К. (июнь 2014 г.). «Структурная основа для утечки кальция через мембраны, чувствительной к pH». Наука. 344 (6188): 1131–5. Bibcode:2014 Наука ... 344.1131C. Дои:10.1126 / science.1252043. ЧВК 4119810. PMID 24904158.

По состоянию на это редактирование, в этой статье используется контент из "1.A.14 Семейство передачи генов, усиленных семенниками (TEGT)", который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Непортированная лицензия, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.

[:0-1] а ^б ван Стелтен Дж., Сильва Ф., Белин Д., Силхави Т. Дж. (август 2009 г.). «Влияние антибиотиков и гомолога протоонкогена на разрушение транслокатора белка SecY». Наука. 325 (5941): 753–6. Bibcode:2009Наука ... 325..753В. Дои:10.1126 / science.1172221. ЧВК 2832214. PMID 19661432.

[:1-2] а ^б Bultynck G, Kiviluoto S, Henke N, Ivanova H, Schneider L, Rybalchenko V, Luyten T, Nuyts K, De Borggraeve W., Bezprozvanny I, Parys JB, De Smedt H, Missiaen L, Methner A (январь 2012 г.). «С-конец ингибитора Bax-1 образует поры канала, проницаемые для Ca2 +». Журнал биологической химии. 287 (4): 2544–57. Дои:10.1074 / jbc.M111.275354. ЧВК 3268414. PMID 22128171.

[:2-3] а ^б Чанг И, Бруни Р., Клосс Б., Ассур З., Клоппманн Э, Рост Б., Хендриксон В. А., Лю К. (июнь 2014 г.). «Структурная основа для утечки кальция через мембраны, чувствительной к pH». Наука. 344 (6188): 1131–5. Bibcode:2014 Наука ... 344.1131C. Дои:10.1126 / science.1252043. ЧВК 4119810. PMID 24904158.

[1]

[2]

[3]