TRAF3IP2 - TRAF3IP2

TRAF3IP2
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAF3IP2, ACT1, C6orf2, C6orf4, C6orf5, C6orf6, CANDF8, CIKS, PSORS13, TRAF3 взаимодействующий белок 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607043 MGI: 2143599 ГомолоГен: 15885 Генные карты: TRAF3IP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q21 Начинать 111,555,381 бп[1] Конец 111,606,906 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B1 Начинать 39,612,934 бп[2] Конец 39,655,307 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • рецепторное связывание • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внутриклеточный • клеточный компонент Биологический процесс • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • секреция иммуноглобулина • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • гуморальный иммунный ответ • Процесс апоптоза В-клеток • положительное регулирование защитного ответа на вирус со стороны хозяина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10758	103213
Ансамбль	ENSG00000056972	ENSMUSG00000019842
UniProt	O43734	Q8N7N6
RefSeq (мРНК)	NM_001164281 NM_001164282 NM_001164283 NM_147200 NM_147686	NM_134000
RefSeq (белок)	NP_001157753 NP_001157755 NP_671733 NP_679211	NP_598761
Расположение (UCSC)	Chr 6: 111,56 - 111,61 Мб	Chr 10: 39.61 - 39.66 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Адаптерный белок CIKS это белок что у людей кодируется TRAF3IP2 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует белок, участвующий в регуляции ответов на цитокины членами семейства факторов транскрипции Rel / NF-kappaB. Эти факторы играют центральную роль в врожденном иммунитете в ответ на патогены, воспалительные сигналы и стресс. Этот генный продукт взаимодействует с белками TRAF (факторами, связанными с рецептором фактора некроза опухоли) и либо киназой I-kappaB, либо киназой MAP, чтобы активировать либо NF-kappaB, либо киназу Jun. Идентифицированы два альтернативных транскрипта, кодирующие разные белки. Был идентифицирован третий транскрипт, который не кодирует белок и транскрибируется в противоположной ориентации. Было показано, что сверхэкспрессия этого транскрипта снижает экспрессию по крайней мере одного из транскриптов, кодирующих белок, что позволяет предположить, что он играет регулирующую роль в экспрессии этого гена.^[7]

Взаимодействия

TRAF3IP2 был показан взаимодействовать с ИКБКГ.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000056972 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019842 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Леонарди А., Колесница А, Клаудио Е., Каннингем К., Зибенлист Ю. (октябрь 2000 г.). «CIKS, связь с киназой Ikappa B и протеинкиназой, активируемой стрессом». Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (19): 10494–9. Bibcode:2000PNAS ... 9710494L. Дои:10.1073 / pnas.190245697. ЧВК  27052. PMID  10962033.
6. Ли X, Комман М., Не Х., Хуа Х, Чаттерджи-Кишор М., Уолд Д., Хааг М., Старк Г. Р. (октябрь 2000 г.). «Act1, белок, активирующий NF-каппа B». Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (19): 10489–93. Bibcode:2000PNAS ... 9710489L. Дои:10.1073 / pnas.160265197. ЧВК  27051. PMID  10962024.
7. "Ген Entrez: TRAF3IP2 TRAF3 взаимодействующий белок 2".

дальнейшее чтение

• Морелли С., Магнанини С., Мунгалл А.Дж. и др. (2000). «Клонирование и характеристика двух перекрывающихся генов в субрегионе 6q21, участвующих в репликативном старении и шизофрении». Ген. 252 (1–2): 217–25. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00231-6. PMID  10903453.
• Цянь И, Чжао Цз, Цзян Цз, Ли Х (2002). «Роль активатора NF каппа B Act1 в CD40-опосредованной передаче сигналов в эпителиальных клетках». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (14): 9386–91. Bibcode:2002PNAS ... 99.9386Q. Дои:10.1073 / pnas.142294499. ЧВК  123150. PMID  12089335.
• Колесница А, Леонарди А., Мюллер Дж. И др. (2002). «Ассоциация адаптера TANK с регулятором киназы I kappa B (IKK) NEMO связывает комплексы IKK с киназами IKK epsilon и TBK1». J. Biol. Chem. 277 (40): 37029–36. Дои:10.1074 / jbc.M205069200. PMID  12133833.
• Ся Ю.Ф., Ли Ю.Д., Ли Х, Гэн Дж. Г. (2002). «Идентификация альтернативно сплайсированного Act1 и значение его роли в онкогенезе». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 296 (2): 406–12. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00887-2. PMID  12163033.
• Канамори М., Кай С., Хаяшизаки Ю., Сузуки Н. (2003). «Активатор NF-kappaB Act1 связывается с адаптерной молекулой пути IL-1 / Toll TRAF6». FEBS Lett. 532 (1–2): 241–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03688-8. PMID  12459498. S2CID  83623149.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мацуда А, Сузуки У, Хонда Дж и др. (2003). «Крупномасштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген. 22 (21): 3307–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID  12761501.
• Мауро С., Вито П., Меллон С. и др. (2003). «Роль адаптивного белка CIKS в активации комплекса IKK». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 309 (1): 84–90. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01532-8. PMID  12943667.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.