TIMP1 - TIMP1

TIMP1
Белок TIMP1 PDB 1d2b.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTIMP1, CLGI, EPA, EPO, HCI, TIMP, TIMP-1, ингибитор металлопептидазы TIMP 1
Внешние идентификаторыOMIM: 305370 MGI: 98752 ГомолоГен: 36321 Генные карты: TIMP1
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение TIMP1
Геномное расположение TIMP1
ГруппаXp11.3Начинать47,582,408 бп[1]
Конец47,586,789 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TIMP1 201666 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003254

NM_001044384
NM_001294280
NM_011593

RefSeq (белок)

NP_003245
NP_003245.1

NP_001037849
NP_001281209
NP_035723

Расположение (UCSC)Chr X: 47,58 - 47,59 МбChr X: 20,87 - 20,87 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ингибитор ТИМП-металлопептидазы 1, также известный как TIMP1, а тканевый ингибитор металлопротеиназ, представляет собой гликопротеин, который экспрессируется в нескольких тканях организмов.

Этот белок входит в состав Семья ТИМП. В гликопротеин это естественный ингибитор из матричные металлопротеиназы (MMP), группа пептидаз, участвующих в деградации внеклеточный матрикс. В дополнение к своей ингибирующей роли против большинства известных ММП, кодируемый белок способен стимулировать клетка пролиферация в широком диапазоне типов клеток, а также может иметь антиапоптотическую функцию.

Функция

TIMP1 представляет собой ингибирующую молекулу, которая регулирует матриксные металлопротеиназы (MMP) и дезинтегрин-металлопротеиназы (ADAM и ADAMTS).[5] В регуляции MMPs, TIMP1 играет решающую роль в составе внеклеточного матрикса (ECM), заживлении ран,[6] и беременность.[7][8][9]

Нарушение регуляции активности TIMP1 приводит к развитию рака.[10] Во время беременности TIMP1 играет регулирующую роль в процессе имплантации, особенно в инвазии цитотрофобластов в эндометрий матки.[11] Кроме того, он играет роль в регулировании транскрипционного профиля тканей плода и плаценты, связанных с ранними стадиями беременности.[12] Исследования приписывают эту роль механизму, включающему структуру хроматина в промоторной области TIMP1, что открывает новые фармацевтические возможности для терапевтической регуляции TIMP1. Соответственно, TIMP1 можно манипулировать in vitro используя методы, такие как нокаут TIMP1.[13][14][15]

Другие имена

  • Эритроидная потенцирующая активность (EPA)
  • Ингибитор коллагеназы человека (HCI)

Регулирование экспрессии TIMP

Транскрипция этого ген очень индуцируется в ответ на многие цитокины и гормоны. Кроме того, выражение из некоторых, но не всех неактивных Х-хромосомы предполагает, что инактивация этого гена полиморфна в человек самки. Этот ген расположен в интроне 6 синапсин I ген и транскрибируется в обратном направлении.[16]

В клетках надпочечников трофический гормон АКТГ индуцирует экспрессию ТИМП-1, и увеличение экспрессии ТИМП также связано со снижением активности коллагеназы.[17]

Было обнаружено, что повышенная экспрессия TIMP1 связана с худшим прогнозом различных опухолей, таких как рак гортани [18] или же меланома.[19]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102265 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001131 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Brew K, Nagase H (январь 2010 г.). «Тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМП): древнее семейство со структурным и функциональным разнообразием». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1803 (1): 55–71. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2010.01.003. ЧВК  2853873. PMID  20080133.
  6. ^ Brew K, Dinakarpandian D, Nagase H (март 2000 г.). «Тканевые ингибиторы металлопротеиназ: эволюция, структура и функции». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология. 1477 (1–2): 267–83. Дои:10.1016 / S0167-4838 (99) 00279-4. PMID  10708863.
  7. ^ Грэм Ч., Лала П. К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобластов in situ». Журнал клеточной физиологии. 148 (2): 228–34. Дои:10.1002 / jcp.1041480207. PMID  1652588.
  8. ^ Нотник У. Б., Солоуэй П., Карри Т. Е. (май 1997 г.). «Оценка роли тканевого ингибитора металлопротеиназы-1 (ТИМП-1) в периовуляторный период у самок мышей, лишенных функционального гена ТИМП-1». Биология размножения. 56 (5): 1181–8. Дои:10.1095 / биолрепрод56.5.1181. PMID  9160717.
  9. ^ Nothnick WB (сентябрь 2000 г.). «Нарушение тканевого ингибитора гена металлопротеиназы-1 приводит к изменению репродуктивной цикличности и морфологии матки у самок мышей репродуктивного возраста». Биология размножения. 63 (3): 905–12. Дои:10.1095 / биолрепрод63.3.905. PMID  10952938.
  10. ^ Ким Ю.С., Ким Ш., Кан Дж. Г., Ко Дж. Х. (2012). «Уровень экспрессии и динамика гликанов определяют чистое влияние ТИМП-1 на прогрессирование рака». Отчеты BMB. 45 (11): 623–8. Дои:10.5483 / BMBRep.2012.45.11.233. ЧВК  4133808. PMID  23187000.
  11. ^ Грэм Ч., Лала П. К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобластов in situ». Журнал клеточной физиологии. 148 (2): 228–34. Дои:10.1002 / jcp.1041480207. PMID  1652588.
  12. ^ Винсент З.Л., Митчелл, доктор медицины, Поннампалам А.П. (декабрь 2015 г.). «Регулирование ТИМП-1 в плаценте человека и мембранах плода липополисахаридом и деметилирующим агентом 5-аза-2'-дезоксицитидином». Репродуктивная биология и эндокринология. 13: 136. Дои:10.1186 / s12958-015-0132-у. ЧВК  4687108. PMID  26691525.
  13. ^ Гонг И, Скотт Э, Лу Р, Сюй И, О WK, Ю Q (2013-10-15). «ТИМП-1 способствует накоплению фибробластов, связанных с раком, и прогрессированию рака». PLOS ONE. 8 (10): e77366. Дои:10.1371 / journal.pone.0077366. ЧВК  3797040. PMID  24143225.
  14. ^ Журкен Дж., Трембле Э., Бернард А., Чартон Дж., Чейллан Ф. А., Маркетти Э., Роман Ф. С., Солоуэй П. Д., Дайв V, Йотакис А., Хрестчатский М., Ривера С. (ноябрь 2005 г.). «Тканевый ингибитор металлопротеиназы-1 (ТИМП-1) модулирует гибель нейронов, пластичность аксонов, а также обучение и память». Европейский журнал нейробиологии. 22 (10): 2569–78. Дои:10.1111 / j.1460-9568.2005.04426.x. PMID  16307599.
  15. ^ Грэм СН, Лала П.К. (август 1991 г.). «Механизм контроля инвазии трофобластов in situ». Журнал клеточной физиологии. 148 (2): 228–34. Дои:10.1002 / jcp.1041480207. PMID  1652588.
  16. ^ «Ген Entrez: TIMP1, ингибитор TIMP-металлопептидазы 1».
  17. ^ Reichenstein M, Reich R, LeHoux JG, Hanukoglu I (февраль 2004 г.). «АКТГ индуцирует экспрессию ТИМП-1 и ингибирует коллагеназу в клетках коры надпочечников». Молекулярная и клеточная эндокринология. 215 (1–2): 109–14. CiteSeerX  10.1.1.538.7614. Дои:10.1016 / j.mce.2003.11.011. PMID  15026182.
  18. ^ Ма Дж, Ван Дж, Фан В, Пу Х, Чжан Д., Фан С, Сюн Л., Чжу Х, Сю Н, Чен Р., Лю С. (декабрь 2013 г.). «Повышенная регуляция TIMP-1 коррелирует с плохим прогнозом плоскоклеточного рака гортани». Международный журнал клинической и экспериментальной патологии. 7 (1): 246–54. ЧВК  3885479. PMID  24427345.
  19. ^ Tarhini AA, Lin Y, Yeku O, LaFramboise WA, Ashraf M, Sander C, Lee S, Kirkwood JM (январь 2014 г.). «Четырехмаркерная сигнатура TNF-RII, TGF-α, TIMP-1 и CRP является прогностическим признаком худшей выживаемости при хирургической резекции меланомы высокого риска». Журнал трансляционной медицины. 12: 19. Дои:10.1186/1479-5876-12-19. ЧВК  3909384. PMID  24457057.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: I35.001
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P01033 (Ингибитор металлопротеиназы 1) на PDBe-KB.