TBRG4 - TBRG4

TBRG4
Идентификаторы
Псевдонимы	TBRG4, CPR2, FASTKD4, бета-регулятор трансформирующего фактора роста 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 611325 MGI: 1100868 ГомолоГен: 31259 Генные карты: TBRG4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p13 Начинать 45,100,100 бп[1] Конец 45,112,047 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A1 Начинать 6,615,598 бп[2] Конец 6,626,067 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность протеинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондрия • митохондриальный матрикс Биологический процесс • клеточное дыхание • фосфорилирование белков • остановка клеточного цикла • положительное регулирование пролиферации клеток • метаболический процесс мРНК • регуляция стабильности митохондриальной мРНК • процессинг митохондриальной мРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9238	21379
Ансамбль	ENSG00000136270	ENSMUSG00000000384
UniProt	Q969Z0	Q91YM4
RefSeq (мРНК)	NM_199122 NM_001261834 NM_004749 NM_030900	NM_001130457 NM_134011 NM_001362713 NM_001362714 NM_001362715 NM_001362716
RefSeq (белок)	NP_001248763 NP_004740 NP_112162 NP_954573	NP_001123929 NP_598772 NP_001349642 NP_001349643 NP_001349644 NP_001349645
Расположение (UCSC)	Chr 7: 45.1 - 45.11 Мб	Chr 11: 6.62 - 6.63 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Трансформирующий бета-регулятор фактора роста 4 (TBRG4), также известный как белок 2 восстановления прогрессирования клеточного цикла (CPR2) и белок 4, содержащий киназный домен FAST (FASTKD4), представляет собой белок что у людей кодируется TBRG4 ген на хромосоме 7.^[5][6][7] Этот белок является частью семейства FASTKD, известного своей регуляцией энергетического баланса митохондрии под стрессом и клеточный цикл прогрессия.^[8][9] TBRG4 участвует в пролиферации клеток кроветворения и множественная миелома.^[10][11]

Структура

TBRG4 разделяет структурные характеристики семейства FASTKD, включая N-концевой митохондриальный целевой домен и три C-терминал домены: два FAST-киназоподобных домена (FAST_1 и FAST_2) и один РНК -связывающий домен (RAP).^[8][9] Митохондриальный целевой домен направляет TBRG4 для импорта в митохондрии. Хотя функции C-концевых доменов неизвестны, RAP, возможно, связывает РНК во время транс-сплайсинга.^[8] TBRG4 также содержит несколько предполагаемых доменов лейциновой молнии.^[6]

Функция

Как член семейства FASTKD, TBRG4 локализует в митохондрии, чтобы регулировать их энергетический баланс, особенно в условиях стресса. Хотя TBRG4 повсеместно экспрессируется во всех тканях, он чаще встречается в скелетные мышцы, сердце мышцы и другие ткани, обогащенные митохондриями.^[8] TBRG4 также локализуется на Костный мозг (BM), где он действует в гемопоэзе, индуцируя секрецию IL-6 и VEGF, которые затем стимулируют пролиферацию клеток и ангиогенез. Однако это тормозит иммуноглобулин выделения нормальным В-клетки.^[10]

Клиническое значение

Участие TBRG4 в кроветворение связывает его с множественная миелома (MM), который возникает в результате злокачественной пролиферации плазматических клеток в Костный мозг.^[10] Высокая экспрессия TBRG4 связана с усилением распространение клеток и худший результат; таким образом, подавление его экспрессии может способствовать уменьшению роста опухоли за счет остановки прогрессирования клеточного цикла.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136270 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000384 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. UniProt: Q969Z0
6. Эдвардс М.С., Льежуа Н., Хорека Дж., ДеПиньо Р.А., Спраг Г.Ф., Тайерс М., Элледж С.Дж. (ноябрь 1997 г.). «Человеческие гены CPR (восстановление клеточного цикла) придают фенотип Far- дрожжевым клеткам». Генетика. 147 (3): 1063–76. ЧВК  1208234. PMID  9383053.
7. «Ген Entrez: TBRG4, трансформирующий бета-регулятор фактора роста 4».
8. Симарро М., Хименес-Кассина А., Кедерша Н., Лазаро Дж. Б., Адельмант Г. О., Марто Дж. А., Ри К., Тисдейл С., Даниал Н., Бенарафа С., Ордунья А., Андерсон П. (октябрь 2010 г.). «Протеин 3, содержащий быстрый киназный домен, является митохондриальным белком, необходимым для клеточного дыхания». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 401 (3): 440–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. ЧВК  2963690. PMID  20869947.
9. Йунг К.Т., Дас С., Чжан Дж., Ломничи А., Охеда С.Р., Сюй К.Ф., Нойберт Т.А., Самуэльс Х.Х. (июнь 2011 г.). «Новый транскрипционный комплекс, который избирательно модулирует апоптоз клеток рака груди посредством регуляции FASTKD2». Молекулярная и клеточная биология. 31 (11): 2287–98. Дои:10.1128 / MCB.01381-10. ЧВК  3133243. PMID  21444724.
10. Севчикова С., Пашекова Х., Бессе Л., Седларикова Л., Кубачкова В., Алмаси М., Лью Л., Хайек Р. (апрель 2015 г.). «Экстрамедуллярный рецидив множественной миеломы, определенный как группа наивысшего риска на основании данных о нарушении регуляции экспрессии генов» (PDF). Биомедицинские документы медицинского факультета Университета Палацкого, Оломоуц, Чехословакия. 159 (2): 288–93. Дои:10.5507 / bp.2015.014. PMID  25877407.
11. Сараскете М.Э., Мартинес-Лопес Дж., Чильон М.С., Алкосеба М., Коркет Л.А., Пайва Б., Пуч Н., Себастьян Е., Хименес К., Матеос М. В., Ориоль А., Розиньол Л., Паломера Л., Теруэль А. И., Гонсалес И., Лахуэрта Дж. Дж., Бладе Дж., Гутьеррес Северная Каролина, Фернандес-Редондо Э., Гонсалес М., Сан-Мигель Дж. Ф., Гарсия-Санз Р. (октябрь 2013 г.). «Оценка профилей экспрессии генов с помощью количественной полимеразной цепной реакции для разработки клинически осуществимого теста для прогнозирования результатов при множественной миеломе». Британский журнал гематологии. 163 (2): 223–34. Дои:10.1111 / bjh.12519. PMID  23952215. S2CID  207081358.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (февраль 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 6 (1): 63–70. Дои:10.1093 / днарес / 6.1.63. PMID  10231032.
• Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». Отчеты EMBO. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Соперник-Жервье С., Тепо Д., Жоливе Г., Худебин Л. М. (май 2003 г.). «Ген кислого белка свиной сыворотки окружен двумя повсеместно экспрессируемыми генами». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1627 (1): 7–14. Дои:10.1016 / s0167-4781 (03) 00051-4. PMID  12759187.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.