SUV39H1 - SUV39H1

SUV39H1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3МТС
Идентификаторы
Псевдонимы	SUV39H1, H3-K9-HMTase 1, KMT1A, MG44, SUV39H, супрессор пестролистности 3-9, гомолог 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 300254 MGI: 1099440 ГомолоГен: 2388 Генные карты: SUV39H1
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xp11.23 Начинать 48,695,554 бп[1] Конец 48,709,012 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X A1.1 | X 3.64 см Начинать 8,061,171 бп[2] Конец 8,074,760 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность метилтрансферазы • трансферазная активность • гистон-метилтрансферазная активность • активность гистонметилтрансферазы (специфическая для H3-K9) • Активность S-аденозилметионин-зависимой метилтрансферазы • связывание с N-концом белка • связывание ионов цинка • связывание хроматина • связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • активность гистон-лизин N-метилтрансферазы Сотовый компонент • ядерная пластинка • нуклеоплазма • хромосома • гетерохроматин • конденсированная ядерная хромосома • рДНК гетерохроматин • комплекс подавления хроматина • хромосома, центромерная область • ядро клетки Биологический процесс • дифференциация клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • диметилирование гистона H3-K9 • ритмический процесс • отрицательная регуляция циркадного ритма • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • триметилирование гистона H3-K9 • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • метилирование • подавление хроматина на рДНК • обработка рРНК • метилирование гистонового лизина • клеточный цикл • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на гипоксию • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6839	20937
Ансамбль	ENSG00000101945	ENSMUSG00000039231
UniProt	O43463	O54864
RefSeq (мРНК)	NM_003173 NM_001282166	NM_001290716 NM_011514 NM_001358237
RefSeq (белок)	NP_001269095 NP_003164	NP_001277645 NP_035644 NP_001345166
Расположение (UCSC)	Chr X: 48,7 - 48,71 Мб	Chr X: 8.06 - 8.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон-лизин-N-метилтрансфераза SUV39H1 является фермент что у людей кодируется SUV39H1 ген.^[5]

Функция

Этот ген является членом семейства супрессоров гомологов вариегации 3-9 и кодирует белок с хромодомен и C-концевой домен SET. Этот ядерный белок перемещается к центромерам во время митоза и функционирует как гистон-метилтрансфераза, метилируя Lys-9 гистона H3. В целом, он играет жизненно важную роль в организации гетерохроматина, сегрегации хромосом и митотической прогрессии.^[6]

Взаимодействия

SUV39H1 был показан на взаимодействовать с:

• CBX1,^[5]
• CBX5,^[7][8][9]
• DNMT3A,^[10]
• HDAC1,^[11]
• HDAC3,^[11]
• HDAC9,^[7]
• Гистоновая деацетилаза 2,^[11]
• MBD1,^[8]
• RUNX1,^[12]
• Белок ретинобластомы,^[13][14] и
• SBF1.^[15]

• PIN1^[16]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101945 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039231 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Aagaard L, Laible G, Selenko P, Schmid M, Dorn R, Schotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (июнь 1999 г.). «Функциональные гомологи млекопитающих модификатора PEV Su (var) 3-9 дрозофилы кодируют ассоциированные с центромерой белки, которые образуют комплекс с гетерохроматиновым компонентом M31». EMBO J. 18 (7): 1923–38. Дои:10.1093 / emboj / 18.7.1923. ЧВК  1171278. PMID  10202156.
6. "Ген Entrez: SUV39H1 супрессор пестроты 3-9 гомолог 1 (Drosophila)".
7. Чжан С.Л., МакКинси Т.А., Олсон Э.Н. (октябрь 2002 г.). «Ассоциация гистоновых деацетилаз класса II с гетерохроматиновым белком 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц». Мол. Клетка. Биол. 22 (20): 7302–12. Дои:10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002. ЧВК  139799. PMID  12242305.
8. Fujita N, Watanabe S, Ichimura T, Tsuruzoe S, Shinkai Y, Tachibana M, Chiba T, Nakao M (июнь 2003 г.). «Метил-CpG-связывающий домен 1 (MBD1) взаимодействует с гетерохроматическим комплексом Suv39h1-HP1 для репрессии транскрипции на основе метилирования ДНК». J. Biol. Chem. 278 (26): 24132–8. Дои:10.1074 / jbc.M302283200. PMID  12711603.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
10. Фукс Ф., Херд П.Дж., Деплюс Р., Кузаридес Т. (май 2003 г.). «ДНК-метилтрансферазы связываются с HP1 и гистон-метилтрансферазой SUV39H1». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (9): 2305–12. Дои:10.1093 / нар / gkg332. ЧВК  154218. PMID  12711675.
11. Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (январь 2002 г.). «Функциональное и физическое взаимодействие между гистонметилтрансферазой Suv39H1 и гистондеацетилазами». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (2): 475–81. Дои:10.1093 / nar / 30.2.475. ЧВК  99834. PMID  11788710.
12. Чакраборти С., Синха К.К., Сенюк В., Нуцифора Г. (август 2003 г.). «SUV39H1 взаимодействует с AML1 и отменяет трансактивность AML1. AML1 метилирован in vivo». Онкоген. 22 (34): 5229–37. Дои:10.1038 / sj.onc.1206600. PMID  12917624.
13. Nielsen SJ, Schneider R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Carroll D, Firestein R, Cleary M, Jenuwein T, Herrera RE, Kouzarides T (август 2001 г.). «Rb нацелен на метилирование гистона H3 и HP1 на промоторы». Природа. 412 (6846): 561–5. Bibcode:2001Натура 412..561Н. Дои:10.1038/35087620. PMID  11484059. S2CID  4378296.
14. Вандель Л., Николас Э., Воте О, Феррейра Р., Айт-Си-Али С., Труш Д. (октябрь 2001 г.). «Репрессия транскрипции белком ретинобластомы за счет привлечения гистон-метилтрансферазы». Мол. Клетка. Биол. 21 (19): 6484–94. Дои:10.1128 / mcb.21.19.6484-6494.2001. ЧВК  99795. PMID  11533237.
15. Файрстейн Р., Цуй Х, Хуйе П., Клири М.Л. (июль 2000 г.). «Установить зависимую от домена регуляцию подавления транскрипции и контроля роста с помощью SUV39H1, ортолога млекопитающих Drosophila Su (var) 3-9». Мол. Клетка. Биол. 20 (13): 4900–9. Дои:10.1128 / mcb.20.13.4900-4909.2000. ЧВК  85941. PMID  10848615.
16. Ханал, Прем; Ким, Гарам; Лим, Сунг-Чул; Юн, Хё-Чжон; Ли, Кван Юл; Чой, Ху-Кюн; Чой, Хонг Сок (2013). «Пролилизомераза Pin1 отрицательно регулирует стабильность SUV39H1, способствуя онкогенезу при раке груди». Журнал FASEB. 27 (11): 4606–4618. Дои:10.1096 / fj.13-236851. PMID  23934277. S2CID  5259616.

дальнейшее чтение

• Шотта Г., Эберт А., Рейтер Г. (2003). «SU (VAR) 3-9 - консервативная ключевая функция в подавлении гетерохроматического гена». Genetica. 117 (2–3): 149–58. Дои:10.1023 / А: 1022923508198. PMID  12723694. S2CID  39517859.
• Хиджманс Э.М., Вурхове П.М., Бейерсберген Р.Л., ван 'Вир Л.Дж., Бернардс Р. (1995). «E2F-5, новый член семейства E2F, который взаимодействует с p130 in vivo». Мол. Клетка. Биол. 15 (6): 3082–9. Дои:10.1128 / mcb.15.6.3082. ЧВК  230539. PMID  7760804.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Aagaard L, Schmid M, Warburton P, Jenuwein T (2000). «Митотическое фосфорилирование SUV39H1, нового компонента активных центромер, совпадает с временным накоплением в центромерах млекопитающих». J. Cell Sci. 113 (5): 817–29. PMID  10671371.
• Мельчер М., Шмид М., Аагард Л., Селенко П., Лайбл Г., Йенувейн Т. (2000). «Структурно-функциональный анализ SUV39H1 показывает доминирующую роль в организации гетерохроматина, сегрегации хромосом и митотической прогрессии». Мол. Клетка. Биол. 20 (10): 3728–41. Дои:10.1128 / MCB.20.10.3728-3741.2000. ЧВК  85674. PMID  10779362.
• Файрстейн Р., Цуй Х, Хьюи П., Клири М.Л. (2000). «Установить зависимую от домена регуляцию подавления транскрипции и контроля роста с помощью SUV39H1, ортолога млекопитающих Drosophila Su (var) 3-9». Мол. Клетка. Биол. 20 (13): 4900–9. Дои:10.1128 / MCB.20.13.4900-4909.2000. ЧВК  85941. PMID  10848615.
• Фрейзер М.Э., Джеймс М.Н., Бриджер В.А., Володко В.Т. (2000). «Фосфорилированные и дефосфорилированные структуры сердца свиньи, GTP-специфическая сукцинил-КоА синтетаза». J. Mol. Биол. 299 (5): 1325–39. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3807. PMID  10873456.
• Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D, Strahl BD, Sun ZW, Schmid M, Opravil S, Mechtler K, Ponting CP, Allis CD, Jenuwein T (2000). «Регуляция структуры хроматина с помощью сайт-специфичных гистоновых H3-метилтрансфераз». Природа. 406 (6796): 593–9. Bibcode:2000Натура.406..593р. Дои:10.1038/35020506. PMID  10949293. S2CID  205008015.
• Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (2001). «Метилирование гистона H3 лизином 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 Натур.410..116л. Дои:10.1038/35065132. PMID  11242053. S2CID  4331863.
• Вандель Л., Труш Д. (2001). «Физическая ассоциация между CBP гистонацетилтрансферазы и гистон-метилтрансферазой». EMBO Rep. 2 (1): 21–6. Дои:10.1093 / embo-reports / kve002. ЧВК  1083799. PMID  11252719.
• Nielsen SJ, Schneider R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Carroll D, Firestein R, Cleary M, Jenuwein T, Herrera RE, Kouzarides T (2001). «Rb нацелен на метилирование гистона H3 и HP1 на промоторы». Природа. 412 (6846): 561–5. Bibcode:2001Натура 412..561Н. Дои:10.1038/35087620. PMID  11484059. S2CID  4378296.
• Вандель Л., Николас Е., Воте О, Феррейра Р., Айт-Си-Али С., Труш Д. (2001). «Репрессия транскрипции белком ретинобластомы за счет привлечения гистон-метилтрансферазы». Мол. Клетка. Биол. 21 (19): 6484–94. Дои:10.1128 / MCB.21.19.6484-6494.2001. ЧВК  99795. PMID  11533237.
• Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (2002). «Функциональное и физическое взаимодействие между гистонметилтрансферазой Suv39H1 и гистондеацетилазами». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (2): 475–81. Дои:10.1093 / nar / 30.2.475. ЧВК  99834. PMID  11788710.
• Шотта Г., Эберт А., Краусс В., Фишер А., Хоффманн Дж., Ри С., Йенувейн Т., Дорн Р., Рейтер Г. (2002). «Центральная роль SU (VAR) 3-9 дрозофилы в метилировании гистона H3-K9 и подавлении гетерохроматического гена». EMBO J. 21 (5): 1121–31. Дои:10.1093 / emboj / 21.5.1121. ЧВК  125909. PMID  11867540.
• Sewalt RG, Lachner M, Vargas M, Hamer KM, den Blaauwen JL, Hendrix T, Melcher M, Schweizer D, Jenuwein T, Otte AP (2002). «Избирательные взаимодействия между гомологами polycomb позвоночных и гистон-лизинметилтрансферазой SUV39H1 позволяют предположить, что метилирование гистона H3-K9 способствует хромосомному нацеливанию белков группы Polycomb». Мол. Клетка. Биол. 22 (15): 5539–53. Дои:10.1128 / MCB.22.15.5539-5553.2002. ЧВК  133945. PMID  12101246.
• Чжан CL, McKinsey TA, Olson EN (2002). «Ассоциация гистоновых деацетилаз класса II с гетерохроматиновым белком 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц». Мол. Клетка. Биол. 22 (20): 7302–12. Дои:10.1128 / MCB.22.20.7302-7312.2002. ЧВК  139799. PMID  12242305.
• Ямамото К., Сонода М. (2003). «Самовзаимодействие гетерохроматинового белка 1 необходимо для прямого связывания с гистон-метилтрансферазой, SUV39H1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 301 (2): 287–92. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 03021-8. PMID  12565857.