SKI протеин - SKI protein

ЛЫЖИ
Протеин SKI PDB 1mr1.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыЛЫЖИ, Протоонкоген SKI, SGS, SKV
Внешние идентификаторыOMIM: 164780 MGI: 98310 ГомолоГен: 31124 Генные карты: ЛЫЖИ
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномная локация для SKI
Геномная локация для SKI
Группа1п36.33-п36.32Начните2,228,319 бп[1]
Конец2,310,213 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SKI 204270 на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

6497

20481

Ансамбль

ENSG00000157933

ENSMUSG00000029050

UniProt

P12755

Q60698

RefSeq (мРНК)

NM_003036

NM_011385
NM_001357191

RefSeq (белок)

NP_003027

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 2.23 - 2.31 МбChr 4: 155.15 - 155.22 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

В SKI протеин ядерный протоонкоген это связано с опухолями при высоких клеточных концентрациях.[5] Было показано, что SKI вмешивается в нормальное функционирование клеток, напрямую препятствуя экспрессия определенных генов внутри ядра клетки, а также нарушая сигнальные белки, активирующие гены.[6]

SKI отрицательно регулирует трансформирующий фактор роста бета (TGF-бета ) путем прямого взаимодействия с Smads и подавление транскрипции генов, чувствительных к TGF-бета.[7] Это было связано с раком из-за большого количества ролей, которые факторы роста пептидов, подсемейством которых является TGF-бета, играют в регуляции клеточных функций, таких как распространение клеток, апоптоз, спецификация и судьба развития.[8]

Название SKI происходит от Институт Слоана-Кеттеринга где белок был первоначально обнаружен.

Структура

Ген

Протоонкоген SKI расположен в районе, близком к стр. 73 ген-супрессор опухоли в локусе 1p36.3 гена, что предполагает аналогичную функцию гена p73.[9]

Протеин

Кристаллическая структура домена гомологии таксы SKI человека.[10]

Белок SKI имеет 728 аминокислота последовательность, с несколькими домены. Выражается как внутри ядра, так и вне его.[9] Он находится в той же семье, что и SnoN белок. Различные домены имеют разные функции, причем первичные домены взаимодействуют с белками Smad. Белок имеет спираль-поворот-спираль мотив, а цистеин и гистидин богатая территория, которая дает начало цинковый палец мотив, область основной аминокислоты и лейциновая молния. Все эти домены, включая пролин богатая область, согласуются с тем фактом, что белок должен иметь домены, которые позволяют ему взаимодействовать с другими белками.[9] Белок также имеет гидрофобные области, которые вступают в контакт с белками Smad, богатыми лейцин и фенилаланин аминокислотные области.[11] Недавние исследования предложили домен, похожий на Такса белок. Домен гомологии SKI-Dachshund (SKI-DHD) содержит домены спирали витка спирали белка и мотивы поворота бета-альфа-бета.[7]

Функция

Онкоген SKI присутствует во всех клетках и обычно активен во время развития. В частности, птичий фибробласты зависят от белка SKI как от корегулятор транскрипции индуцирование трансформации.[9] Вышеупомянутая область DHD специально используется для белок-белковых взаимодействий, в то время как 191 аминокислота Конечная точка C посредник олигомеризация.[7] Недавние исследования показывают, что белок SKI в раковых клетках действует как супрессор, подавляя трансформирующий передачу сигналов фактора роста β (TGF- β). TGF-β - это белок, регулирующий рост клеток. Передача сигналов регулируется семейством белков, называемых белками Smad. ЛЫЖИ присутствует во всех взрослых и эмбриональные клетки на низких уровнях, однако для опухолевых клеток характерна избыточная экспрессия белка.[11] Считается, что высокие уровни белка SKI инактивируют подавление опухоли путем вытеснения других белков и вмешательства в сигнальный путь TGF-β.[9] Белок SKI и белок CPB конкурируют за связывание с белками Smad, специфически конкурируя с белками Смад-3 и CReB -связывающие белковые взаимодействия. SKI также напрямую взаимодействует с R-Smad ∙ Смад-4 комплекс, который напрямую подавляет нормальную транскрипцию генов, отвечающих за TGF-β, инактивируя способность клетки останавливать рост и деление, создавая раковые клетки.[11]

SKI был связан с различными видами рака, включая человеческий меланомы, плоскоклеточный рак пищевода, рак шейки матки и процесс прогрессирования опухоли. Связь SKI с меланомой человека была наиболее изученной областью связи белка с раком. В настоящее время считается, что белок SKI предотвращает ответ на уровни TFG-β, вызывая образование опухоли.[9]

Связанные исследования

Другое исследование выявило белки, похожие на Ski. В SnoN белок был идентифицирован как аналогичный белок и часто обсуждается в публикациях в связи с белком Ski. Недавние исследования показывают, что роль SnoN может быть несколько иной и потенциально даже может играть антагонистическую роль.[12]

Другие недавние исследования определили, что Fussel-15 и Fussel-18 гомологичны семейству белков Ski / Sno. Было обнаружено, что Fussel-15 играет во многом ту же роль, что и белки Ski / Sno, однако его экспрессия не так распространена, как белки Ski / Sno. Было обнаружено, что Fussel-18 играет ингибирующую роль в передаче сигналов TGF-бета.[13]

Такса и SKIDA1 также относятся к семейству Ski / Sno / Dac.[14]

Взаимодействия

Было показано, что белок SKI взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157933 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029050 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Vignais ML (февраль 2000 г.). «[Ski и SnoN: антагонистические белки передачи сигналов TGFbeta]». Бык-рак (На французском). 87 (2): 135–7. PMID  10705283.
  6. ^ Cell 2002; 111: 1-20.
  7. ^ а б c Уилсон Дж. Дж., Малахова М., Чжан Р., Иоахимиак А., Хегде Р. С. (май 2004 г.). «Кристаллическая структура домена гомологии таксы SKI человека». Структура. 12 (5): 785–92. Дои:10.1016 / j.str.2004.02.035. PMID  15130471.
  8. ^ Whitman M (август 1998 г.). «Smads и ранняя передача сигналов от суперсемейства TGFbeta». Genes Dev. 12 (16): 2445–62. Дои:10.1101 / gad.12.16.2445. PMID  9716398.
  9. ^ а б c d е ж Рид Дж. А., Линь К., Чен Д., Миан И. С., Медрано Э. Э. (июнь 2005 г.). «SKI пути, вызывающие прогрессирование меланомы человека». Раковые метастазы Rev. 24 (2): 265–72. Дои:10.1007 / s10555-005-1576-х. PMID  15986136.
  10. ^ PDB: 1SBX​; Уилсон Дж. Дж., Малахова М., Чжан Р., Иоахимиак А., Хегде Р. С. (май 2004 г.). «Кристаллическая структура домена гомологии таксы SKI человека». Структура. 12 (5): 785–92. Дои:10.1016 / j.str.2004.02.035. PMID  15130471.
  11. ^ а б c Чен В., Лам С.С., Сринатх Х., Шиффер К.А., Ройер В.Е., Лин К. (апрель 2007 г.). «Конкуренция между Ski и CREB-связывающим белком за связывание с белками Smad в трансформации передачи сигналов фактора роста-бета». J. Biol. Chem. 282 (15): 11365–76. Дои:10.1074 / jbc.M700186200. PMID  17283070.
  12. ^ Рамель М.С., Эмери С.М., Эмери С.С., Фулгер Р., Гобердхан, округ Колумбия, ван ден Хеувель М., Уилсон С. (апрель 2007 г.). «Drosophila SnoN модулирует рост и формирование паттерна, антагонизируя передачу сигналов TGF-бета». Мех. Dev. 124 (4): 304–17. Дои:10.1016 / j.mod.2006.12.006. PMID  17289352.
  13. ^ Арндт С., Позер I, Мозер М., Боссерхофф А.К. (апрель 2007 г.). «Fussel-15, новый белок-гомолог Ski / Sno, противодействует передаче сигналов BMP». Мол. Cell. Неврологи. 34 (4): 603–11. Дои:10.1016 / j.mcn.2007.01.002. PMID  17292623.
  14. ^ «Консервированный белковый домен Ski_Sno». NCBI.
  15. ^ а б c d Харада Дж., Кокура К., Каней-Исии К., Номура Т., Хан М.М., Ким Й., Исии С. (октябрь 2003 г.). «Необходимость корепрессорной гомеодомен-взаимодействующей протеинкиназы 2 для опосредованного лыжами ингибирования транскрипционной активации, индуцированной морфогенетическим белком кости». J. Biol. Chem. 278 (40): 38998–9005. Дои:10.1074 / jbc.M307112200. PMID  12874272.
  16. ^ Кокура К., Каул С.К., Вадхва Р., Номура Т., Хан М.М., Синагава Т., Ясукава Т., Кольменарес К., Исии С. (сентябрь 2001 г.). «Семейство белков Ski требуется для репрессии транскрипции, опосредованной MeCP2». J. Biol. Chem. 276 (36): 34115–21. Дои:10.1074 / jbc.M105747200. PMID  11441023.
  17. ^ Луо К., Строшейн С.Л., Ван В., Чен Д., Мартенс Э., Чжоу С., Чжоу К. (сентябрь 1999 г.). «Онкопротеин Ski взаимодействует с белками Smad, подавляя передачу сигналов TGFbeta». Genes Dev. 13 (17): 2196–206. Дои:10.1101 / gad.13.17.2196. ЧВК  316985. PMID  10485843.
  18. ^ Уэки Н., Хейман MJ (август 2003 г.). «Прямое взаимодействие Ski с Smad3 или Smad4 необходимо и достаточно для Ski-опосредованной репрессии передачи сигналов трансформирующего фактора роста-бета». J. Biol. Chem. 278 (35): 32489–92. Дои:10.1074 / jbc.C300276200. PMID  12857746.
  19. ^ Тарапор П., Ричмонд С., Чжэн Дж., Коэн С.Б., Келдер Б., Копчик Дж., Круз Ю., Сиппель А. Е., Кольменарес С., Ставнезер Е. (октябрь 1997 г.). «Связывание ДНК и активация транскрипции онкобелком Ski, опосредованная взаимодействием с NFI». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (19): 3895–903. Дои:10.1093 / nar / 25.19.3895. ЧВК  146989. PMID  9380514.
  20. ^ Хан М.М., Номура Т., Ким Х., Каул С.К., Вадхва Р., Синагава Т., Итикава-Ивата Э., Чжун С., Пандольфи П.П., Исии С. (июнь 2001 г.). «Роль PML и PML-RARalpha в Mad-опосредованной репрессии транскрипции». Мол. Ячейка. 7 (6): 1233–43. Дои:10.1016 / с1097-2765 (01) 00257-х. PMID  11430826.
  21. ^ Коэн С.Б., Чжэн Г., Хейман Х.С., Ставнезер Э. (февраль 1999 г.). «Гетеродимеры онкопротеинов SnoN и Ski образуются преимущественно над гомодимерами и являются более мощными трансформирующими агентами». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (4): 1006–14. Дои:10.1093 / nar / 27.4.1006. ЧВК  148280. PMID  9927733.
  22. ^ Пратапам Т., Кюне С., Хейман М., Бэнкс Л. (сентябрь 2001 г.). «Ski взаимодействует с эволюционно консервативным доменом SNW Skip». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (17): 3469–76. Дои:10.1093 / nar / 29.17.3469. ЧВК  55893. PMID  11522815.
  23. ^ Даль Р., Вани Б., Хейман М.Дж. (март 1998 г.). «Онкопротеин Ski взаимодействует с Skip, человеческим гомологом Drosophila Bx42». Онкоген. 16 (12): 1579–86. Дои:10.1038 / sj.onc.1201687. PMID  9569025.
  24. ^ Леонг Г.М., Субраманиам Н., Фигероа Дж., Фланаган Дж. Л., Хейман М.Дж., Эйсман Дж. А., Кузьменко А.П. (май 2001 г.). «Белок, взаимодействующий с лыжами, взаимодействует с белками Smad, усиливая трансформирующую бета-зависимую транскрипцию фактора роста». J. Biol. Chem. 276 (21): 18243–8. Дои:10.1074 / jbc.M010815200. PMID  11278756.

дальнейшее чтение